区间作图法的方法介绍

Lander 和Botstein(1989)等提出,建立在个体数量性状观测值与双侧标记基因型变量的线性模型的基础上,利用最大似然法对相邻标记构成的区间内任意一点可能存在的QTL 进行似然比检测,进而获得其效应的极大似然估计。其遗传假设是,数量性状遗传变异只受一对基因控制,表型变异受遗传效应(固定效应) 和剩余误差(随机效应) 控制,不存在基因型与环境的互作。区间作图法可以估算QTL加性和显性效应值。与单标记分析法相比,区间作图法具有以下特点:能从支撑区间推断QTL 的可能位置;可利用标记连锁图在全染色体组系统地搜索QTL,如果一条染色体上只有一个QTL,则QTL的位置和效应估计趋于渐进无偏;QTL检测所需的个体数大大减少。但IM也存在不足: QTL 回归效应为固定效应;无法估算基因型与环境间的互作(Q×E),无法检测复杂的遗传效应(如上位效应等);当相邻QTLs 相距较近时,由于其作图精度不高,QTLs间相互干扰导致出现Ghos......阅读全文

区间作图法的方法介绍

Lander 和Botstein(1989)等提出,建立在个体数量性状观测值与双侧标记基因型变量的线性模型的基础上,利用最大似然法对相邻标记构成的区间内任意一点可能存在的QTL 进行似然比检测,进而获得其效应的极大似然估计。其遗传假设是,数量性状遗传变异只受一对基因控制,表型变异受遗传效应(固定效应

基于混合线性模型的复合区间作图法

朱军(1998)提出了用随机效应的预测方法获得基因型效应及基因型与环境互作效应,然后再用区间作图法或复合区间作图法进行遗传主效应及基因型与环境互作效应的QTL 定位分析。该方法的遗传假定是数量性状受多基因控制,它将群体均值及QTL 的各项遗传效应看作为固定效应,而将环境、QTL 与环境、分子标记等效

QTL定位的作图方法介绍

QTL 定位就是采用类似单基因定位的方法将QTL 定位在遗传图谱上,确定QTL 与遗传标记间的距离(以重组率表示)。根据标记数目的不同,可分为单标记、双标记和多标记几种方法。根据统计分析方法的不同,可分为方差与均值分析法、回归及相关分析法、矩估计及最大似然法等。根据标记区间数可分为零区间作图、单区间

希尔作图法的用途

中文名称希尔作图法英文名称Hill plotting定  义对希尔方程的数据图解表示法,可用于酶动力学、蛋白质与配体结合等分析。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)

QTL定位的作图方法功能介绍

QTL 定位就是采用类似单基因定位的方法将QTL 定位在遗传图谱上,确定QTL 与遗传标记间的距离(以重组率表示)。根据标记数目的不同,可分为单标记、双标记和多标记几种方法。根据统计分析方法的不同,可分为方差与均值分析法、回归及相关分析法、矩估计及最大似然法等。根据标记区间数可分为零区间作图、单区间

QTL定位的作图方法分类及介绍

区间作图法(interval mapping,IM)Lander 和Botstein(1989) 等提出,建立在个体数量性状观测值与双侧标记基因型变量的线性模型的基础上,利用最大似然法对相邻标记构成的区间内任意一点可能存在的QTL 进行似然比检测,进而获得其效应的极大似然估计。其遗传假设是,数量性状

基因作图的方法特点

基因作图(英文gene mapping)是一种遗传学作图,用来定位染色体中特定的DNA片段。是基因组研究的成果之一,主要分为以重组率为定位依据的遗传舆图,以及以DNA片段实际位置为依据的物理舆图,两这各有不同用途与优缺点。

方案16-SDSPAGE-肽谱作图方法(Cleveland法)

实验材料纯化后的蛋白质样品试剂、试剂盒进行 SDS-PAGE所必需的缓冲液和聚丙烯酰胺使蛋白质显现的固定液 染色液 脱色液β-巯基乙醇SDS样品缓冲液中已知分子量的蛋白质标准品选定的蛋白酶SDSSDS-PAGE样品缓冲液仪器、耗材聚丙烯小管平板凝胶电泳仪沸水浴实验步骤展开

方案17-原位-SDSPAGE-肽谱作图方法(Cleveland法)

实验材料含有已分离蛋白质的聚丙烯酰胺平板凝胶试剂、试剂盒化学切割剂考马斯亮蓝含1mol L Tris-Cl 的乙醇聚丙烯酰胺平板凝胶蛋白酶消化缓冲液蛋白酶溶液仪器、耗材白光盒和手术刀聚丙烯试管平板凝胶电泳仪SpeedVac 浓缩器实验步骤方法 1: 酶催化的蛋白质片段化1.固定聚丙烯酰胺凝胶中分离的

临床化学定量测定方法的可报告区间

  自2005年中国合格评定国家认可委员会(CNAS)开始进行医学实验室认可工作以来,参与并通过医学实验室认可逐渐成为医学实验室检测能力的表征。越来越多的临床实验室开始关注认可要求并着手开展相关工作,对检验程序进行验证与确认则是其中的重要环节。CNAS-CL02-2012规定“在常规应用前,应由实验

qpcr数据分析及作图方法

荧光定量PCR(qPCR)就是在PCR扩增过程中,通过荧光信号,对PCR进程进行实时检测。由于在PCR扩增的指数时期,模板的Ct值和该模板的起始拷贝数存在线性关系,所以成为定量的依据。由于常规的PCR的缺点,荧光定量PCR( qPCR)由于其操作简便,灵敏度高,重复性好等优点发展非常迅速。设在已经涉

糖作图的概念

中文名称糖作图英文名称carbohydrate mapping定  义利用各种分析方法(如层析、电泳、质谱、核磁共振等)研究糖的组成时所得到结果的图示化。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)

粒度分析的作图

粒度分析的结果,可按表6-3所示的格式整理,然后作出直方图、频率曲线图、累积曲线图和概率累积曲线图(图6-5,图6-6)。图的横坐标表示颗粒大小,纵坐标表示百分数或累积百分数。直方图是广泛使用的一种粒度分布的图解形式,以并排高低不同的矩形表示各粒级百分比。如果把每个矩形顶连点连接成一平滑曲线,即成频

DNA作图实验

实验材料 DNA试剂、试剂盒 限制酶缓冲液仪器、耗材 电泳仪实验步骤   用低频率切割的不同限制性内切酶分别完全消化DNA。2.  从每个反应取小份样品作电泳分析,用已知的分子量标准作对照。剩余的样品置于冰浴。3.  比较分子量标准估算出DNA片段的长度,推导出每种限制性内切酶的酶切位点数目。4. 

DNA作图实验

多种酶消化 限制酶部分消化             实验方法原理 应用遗传学技术构建能显示基因以及其他序列待征在基因组上位置的图。

什么是转录作图?

中文名称转录作图英文名称transcription mapping定  义标明转录物序列在基因组上的位置。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)

什么是基因作图?

基因作图(英文gene mapping)是一种遗传学作图,用来定位染色体中特定的DNA片段。是基因组研究的成果之一,主要分为以重组率为定位依据的遗传舆图,以及以DNA片段实际位置为依据的物理舆图,两这各有不同用途与优缺点。

什么是RNA作图?

中文名称RNA作图英文名称RNA mapping定  义对RNA分子在基因上的定位分析。将RNA与相应的DNA杂交后,用单链特异性核酸酶(常用的如S1核酸酶)切去不发生杂交的单链部分,用以分析RNA与相应DNA的关系,包括确定RNA的5′和3′端、外显子和内含子在DNA上的相应位置等。应用学科生物化

S1核酸酶作图的方法和原理

三种不同的核酸酶——S1核酸酶、RNA酶、外切核酸酶Ⅶ被用来进行RNA定量,确定内含子位置,以及用来鉴定在克隆的DNA模板上的mRNA 5′端和3′端的位置。当检测RNA被杂交到DNA模板上时,用核酸酶S1进行保护试验的分析;当检测RNA被杂交到来自DNA模板的RNA上时用RNA酶。外切核酸酶Ⅶ有更

温度区间控制电路

电路工作原理:220 V市电经变压器T降压、VD2一VD5桥式整流、C2滤波后供给整个电路。开关S闭合后,由于此时M点电位低于1/3 Vcc,555电路被置位,输出端3脚为高电平,继电器K吸合,触点K-1接通所控加热电路,使温度卜升,同时发光二极管LED指示。

基因组作图的定义

中文名称基因组作图英文名称genome mapping;genomic mapping定  义确定界标或基因在构成基因组的各条染色体上的位置,以及染色体上各个界标或基因之间的相对距离,绘制遗传连锁图或物理图。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)

基因作图的应用和特点

基因作图(英文gene mapping)是一种遗传学作图,用来定位染色体中特定的DNA片段。是基因组研究的成果之一,主要分为以重组率为定位依据的遗传舆图,以及以DNA片段实际位置为依据的物理舆图,两这各有不同用途与优缺点。

辐射杂种细胞作图的定义

中文名称辐射杂种细胞作图英文名称radiation hybrid mapping定  义运用辐射杂种细胞进行人类基因定位或基因组作图的技术。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)

置信区间的求解过程

第一步:求一个样本的均值第二步:计算出抽样误差。经过实践,通常认为调查:100个样本的抽样误差为±10%;500个样本的抽样误差为±5%;1200个样本时的抽样误差为±3%。第三步:用第一步求出的“样本均值”加、减第二步计算的“抽样误差”,得出置信区间的两个端点 。

置信区间的理论描述

置信区间是一种常用的区间估计方法,所谓置信区间就是分别以统计量的置信上限和置信下限为上下界构成的区间。对于一组给定的样本数据,其平均值为μ,标准偏差为σ,则其整体数据的平均值的100(1-α)%置信区间为(μ-Ζα/2σ , μ+Ζα/2σ) ,其中α为非置信水平在正态分布内的覆盖面积 ,Ζα/2即

砝码水平调整区间

砝码水平调整区间 水平调整:水平调整有两个方面的内容。一是单只传感器安装底座的安装平面要用水平仪调整水平:另-方面是指多个传感器的安装底座的安装平面要尽量调整到一个水平面上(用水准仪),尤其足传感器数多于3个的称重系统中,更应注意这一点,这样做的主要目的是为了使各传感器承受的负载基本一致。

什么是置信区间?

置信区间是指由样本统计量所构造的总体参数的估计区间。在统计学中,一个概率样本的置信区间(Confidence interval)是对这个样本的某个总体参数的区间估计。置信区间展现的是这个参数的真实值有一定概率落在测量结果的周围的程度,其给出的是被测量参数的测量值的可信程度,即前面所要求的“一个概率”

蛋白质作图的定义

中文名称蛋白质作图英文名称protein mapping定  义对某种组织或细胞全部蛋白质进行分析所作的图谱。如蛋白质双向电泳图谱。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)

重叠群作图的技术特点

中文名称重叠群作图英文名称contig mapping定  义依靠重叠群单元序列的叠加以确定染色体DNA物理图的技术。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)

异源双链作图的定义

中文名称异源双链作图英文名称heteroduplex mapping定  义不同来源的双链DNA分子的单链间进行杂交,绘制出同源区和非同源区的遗传图。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)