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Nature里程碑成果:世界上最大的人类基因组变异目录

由千人基因组计划协会领导的一个国际科学家小组,构建出了世界上最大的人类基因组变异目录,可为研究人员提供有价值的线索帮助他们确立一些人容易罹患各种疾病的原因。尽管大多数的人类基因组变异都是无害的,一些甚至是有益的,但也有些变异却可导致疾病,造成认知障碍,影响癌症、肥胖、糖尿病、心脏病和其他疾病的易感性。了解基因组变异导致疾病的机制或可帮助临床医生改进诊断及治疗方法及开发出新的防治对策。 在发表于《自然》(Nature)杂志上的两篇研究论文中,研究人员检测了跨越非洲、亚洲和南亚、欧洲与美洲26个种族2,504人的基因组。 在第一篇Nature文章中,研究人员鉴别出了人类基因组中因人而异的大约8800万个位点,建立了一个数据库提供给研究人员作为标准参考,确定在种群中及世界各地人类基因组组成的变异。这一目录将人类基因组中已知变异位点增加了一倍多,现可用于广泛的人类生物学和医学研究中,为深入认识DNA遗传变异促成疾病风险及药物反应......阅读全文

确定生物芯片实验研究目标

目前生物芯片尤其是基因芯片已广泛用于医学研究之中,已有很多商业化生产的生物芯片产品销售,研究者直接可以选择成型的产品使用,不需要自己制备芯片,因此如何正确使用芯片解决研究中的生物学问题是研究者更关注的。     基因芯片设计是最重要的部分,它关系到最终结果能否

5万人基因组+电子病历数据揭示基因与疾病重大关联

  2012年,基因产业界暗流涌动,制药巨头安进(Amgen)斥资4.15亿美元全资收购deCODE genetics,这个拥有「世界上最有价值基因组数据库之一」的公司,坐落在冰岛,拥有近40万人的基因组数据。  同样在那一年,业界很多人开始意识到,产业界的发展趋势要变了,以后合作的大门有可能逐一关

首个大规模中国人群孤独症基因测序研究出炉

  孤独症谱系障碍,简称“孤独症”,又称“自闭症”。其核心症状表现为社会沟通和社会交往的缺陷和局限的、重复性行为、兴趣或活动,是一种严重影响儿童健康的神经发育障碍性疾病。  据最新统计数据显示,目前,中国孤独症患者已超过1000万,其中0~14岁的患儿超过200万。不仅如此,中国孤独症发病率依然在不

Nature:格陵兰人糖尿病遗传密码得以破译

  格陵兰人口是一个很小的、历史隔离的建立者群体,包括大约57000居民,在过去的25年里,2型糖尿病的患病率显著增加。2014年6月18日《Nature》杂志发表的一项研究,发现了格陵兰人的一个特殊基因变异,这个基因变异在2型糖尿病的发展中起着特别重要的作用。这项研究结果,可用于提高具有遗传风险的

英研究确认一种新肥胖基因 揭示新陈代谢与肥胖关系

  英国帝国理工学院日前发布新闻公报称,该校研究人员与国外同行合作,最新确认了一种与肥胖相关基因,该基因副本数量与肥胖风险成反比。研究人员表示,这一发现揭示了新陈代谢与肥胖间的新遗传关系,比以往一些肥胖遗传因素研究成果更具普遍意义,有助于科学家找到更好的办法来解决肥胖问题。   这一新确认的肥胖基

Science发文:RNA测序有助于发现罕见基因变异

  近日,来自纽约基因组中心、哥伦比亚大学等机构的研究团队在Science发表了RNA测序应用的最新研究成果,文章题为“Genetic regulatory variation in populations informs transcriptome analysis in rare disease

基因与疾病治疗相关领域研究进展一览

  1. Retrovirology:整合到人基因组中的古老逆转录病毒有助抵抗HIV-1感染  doi:10.1186/s12977-017-0351-8  在我们的进化过程中,病毒持续地感染人体。一些早期的病毒已整合到我们的基因组中,如今它们被称作为人内源性逆转录病毒(human endogeno

转移肿瘤驱动致癌基因的变异同质性

  《科学》杂志发表了一篇哈佛和斯坦福大学科学家有关未经治疗转移肿瘤中驱动基因变异情况的分析(DOI: 10.1126/science. aat7171)。作者从20位实体瘤患者(包括乳腺癌、结肠癌、前列腺癌、胰腺癌等)提取了115个样品、包括76个未经治疗的转移肿瘤样品。结果发现肿瘤患者的转移肿瘤

生物学研究中不可忽视的偏向性

  基因组学研究一直都存在着不同水平的偏向性(bias)。种族偏向性自不必说,美国“我们所有人(All of Us)”大规模研究计划的目标之一就是对过去代表性不足的群体进行抽样,比如非裔美国人。  同时,历史偏向性也一直存在。某些基因与疾病有着很强的相关性,但好像就是不入科学家的法眼,始终躺在角落里

中日韩人种基因拷贝数变异图谱出炉

  据韩联社4月5日报道,韩国首尔大学基因医学研究所徐廷瑄教授领导的研究小组宣称,他们通过对30名中国人、韩国人和日本人的基因组研究,成功绘制出中日韩人种超高清基因拷贝数变异图谱,并根据该图谱发现,亚洲人独有的基因拷贝数变异共有3500多个。   所谓基因拷贝数变异(Copy Number Vri

单一基因不仅和糖尿病有关,突变体还会诱发癌症!

  最近,来自牛津大学和萨里大学的研究人员通过研究发现,单一基因的突变或许就能对人类机体的面部特征产生较大的影响,近年来科学家们进行了大量研究都发现单一基因在人类多种疾病的发生上扮演着关键角色,本文中,小编对相关研究进行了整理,分享给大家!  【1】Science:单一基因或可驱动前列腺分化  do

作物基因组学研究进展

  摘要:农作物基因组学研究的发展,对于有效利用现代分子生物学手段进行物种的遗传改良发挥了重要作用。随着测序技术的发展,已经实现对重要农作物,如水稻、小麦、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因组的测序或重测序,在此基础上完成对控制重要农艺性状基因的克隆和鉴定。本文综述了2017年度主要农作物基因组

基因组学研究成果让斑马鱼研究“快马加鞭”

基因组学研究成果让斑马鱼研究快马加鞭(Genomics: Zebrafish earns its stripes)作者:谢训卫人类发育,生理功能及疾病发生的过程涉及到成千上万的基因和其变异体,但是大部分的基因和其变异体的功能依然是未知的。过去的20年里,斑马鱼逐渐成为研究人类基因功能的重要模式动物。

基因组学突破性成果:斑马鱼序列解析

  人类发育,生理功能及疾病发生的过程涉及到成千上万的基因和其变异体,但是大部分的基因和其变异体的功能依然是未知的。过去的20年里,斑马鱼逐渐成为研究人类基因功能的重要模式动物。在《自然》杂志网站发表的两篇文章里1,2,报道了斑马鱼参考基因组序列和完成超过10,000个蛋白编码基因的断裂性突变体的鉴

5基因影响乳腺癌患病风险

这一成果将有助于科研人员加深理解乳腺癌最初病因  有研究曾发现,与乳腺癌有关的基因BRCA1发生变异会显著提高女性患乳腺癌的风险。由美国梅奥诊所领导的一个国际科研小组在新一期英国学术刊物《自然—遗传学》上报告说,当BRCA1基因发生变异使女性患乳腺癌的风险提高时,另外5个基因的变异会对这一风险产生影

全基因组与外显子组测序在临床诊断中的应用

  全基因组或外显子组测序的临床应用,称为临床基因组和外显子测序( Clinical genome and exome sequencing,CGES)。由于该技术检测范围广,可以同时检测2000多个基因的变异,对于临床罕见病、疑难疾病、复杂疾病,特别是孟德尔遗传病的诊断是一种强大而有效的方法。  

遗传病家系的高通量测序:您需要了解的一些事

  高通量测序技术的出现与普及,为遗传病的研究带来了前所未有的机会。它提高了遗传病致病基因克隆和鉴定的效率,使人类对自身基因功能的认识大大加速。本文对遗传病家系的高通量测序分析提出一些注意事项,希望有助于相关的研究。   前言   我国是一个多民族的人口大国,也是遗传病家系资源比较丰富的

遗传病家系的高通量测序

摘要 高通量测序技术的出现与普及,为遗传病的研究带来了前所未有的机会。它提高了遗传病致病基因克隆和鉴定的效率,使人类对自身基因功能的认识大大加速。本文对遗传病家系的高通量测序分析提出一些注意事项,希望有助于相关的研究。 前言 我国是一个多民族的人口大国,也是遗传病家系资源比较丰富的国家之一。遗传病家

PLoS Genet:天然基因差异如何影响心脏健康

  心血管疾病的最大风险是吸烟和不良的饮食习惯。然而,不同的人更容易受到心脏病的影响,这是基于他们基因的微小差异,即变异。虽然已经有许多研究将变异与心血管特征联系起来,但目前还不清楚这些变异是否具有功能后果,比如基因或蛋白质表达的改变。在托马斯杰斐逊大学(Thomas Jefferson Unive

分子生物学:从基因组背后寻找疾病的根源

  通过破译横跨非洲、亚欧及美洲地区数国逾1000人的基因组图谱,科学家已成功汇编了目前最详尽的有关人类基因变异的研究目录。这是一笔巨大的资源,它将有助于医学研究人员从基因角度来追溯全人类罕见和常见疾病的根源。   200名来自圣·路易斯华盛顿大学医学院及其他研究机构的科学家共同参与了这项“千人基

“夜猫子”是基因变异导致

  如果你是个“夜猫子”,晚上睡不着早上起不来,不妨从基因中找找原因。  新一期美国《细胞》杂志发表的一项研究发现,一种名为CRY1的基因特定位点出现变异后,人体生物钟就会发生改变。通常情况下,CRY1基因变异的人要比一般人晚睡2到2.5个小时。  “夜猫子”在医学上通常被诊断为“睡眠相位后移症”。

英研究称爱吃“垃圾食品”可能是基因变异作怪

英国科学家经实验发现,某些人对“垃圾食品”不由自主的爱好可能由于其某一基因发生变异。 尽管如此,研究人员认为,只要建立起健康的生活方式,哪怕发生这种基因变异,也不一定就会成为胖子。 基因变异作怪 其实早在去年,科学家们便发现了一种被命名为FTO的基因与人体肥胖问题有关,但一直无法解释其机理。

Cell:人类阳光敏感相关基因变异的鉴定

  在11月21日的Cell杂志上发表的一项研究中,包括美国国立卫生院的研究者在内的一个研究团队鉴定了与阳光过敏、棕色头发、蓝眼睛和雀斑紧密相关的基因组变异。在对冰岛人的研究中,研究者发现了一个复杂的路径,涉及一个人类色素沉着特征相关基因的散在DNA序列或非编码区。   我们经常发现,那些祖先来自

《Nature》子刊精彩选读

神经递质如何在细胞间传递 来自美国康奈尔大学的研究人员通过在微观尺度上分享神经递质如何在细胞间传递,发现之前被认为存在于这个过程中的电流实际上并不存在。这项研究的论文发表在7月22日的《自然·细胞生物学》杂志的网络版上。文章的作者是华裔学者龚梁伟(Liang-Wei Gong)和Manfred

自然子刊综览

  《自然—气候变化》  无人驾驶出租车可显著减少美国温室气体排放  据新发表在《自然—气候变化》上的一项研究显示,在接下来的20年里,由电力驱动的无人驾驶智能出租车将显著减少美国国内由轻型汽车带来的温室气体排放。该研究估计,相比目前的传统能源驱动汽车而言,这些出租车可让私人汽车每英里的排放最高减少

Nature子刊:12万例数据确定乳腺癌风险相关的5种变异

  一项包含120000名女性的国际研究确定了影响乳腺癌风险的五个基因变异,这些突变被认为是影响乳腺癌细胞对雌激素的反应。  乳腺癌是女性中最常见的癌症之一,大约有八分之一的女性在生命的某个阶段会患有此病,且大多数病例发生在50岁以上。雌激素作为一种触发器,在大多数的乳腺癌细胞中与雌激素受体结合并引

专访中国医学科学院肿瘤医院林东昕院士

  近年来在精准医疗领域的研究和投资热度不减。尤其是针对癌症的早期诊断技术的开发如基因筛查等开始受到广泛的关注,吸引了越来越多的研究者投身其中。对于各类癌症发生的分子机制以及易感基因的研究则是这项技术的关键环节。  中国医学科学院肿瘤医院病因及癌变研究室主任林东昕院士是肿瘤病因学领域的资深

Nat Genet揭秘“胖人国”的遗传原因

  萨摩亚(Samoas)有着世界领先的的肥胖率,这是一个新的现象,受到全球快速转向高热量加工食品和久坐不动的生活方式的严重影响。  然而,近期在《Nature Genetics》发表的一项新研究表明,近一半萨摩亚人都有一个新发现的和显著的遗传变异,可导致肥胖的风险;这个变异一直未被发现,直到研究人

国际科学家研究小组成功绘制肺癌遗传变异染色体图表

据physorg网站2007年11月4日报道,一个国际科学家研究小组4日宣布,通过共同努力他们绘制了肺癌遗传变异图。肺癌是世界上导致癌症病人死亡的头号杀手。《自然》杂志在线版本于11月4日刊登了这一研究成果。研究对肺癌细胞的非正常遗传进行了全面观察,发现在人肺肿瘤中有五十多个基因组区域频率地出现或消

基因编辑进展梳理 Part II 基于CRISPR-Cas9的技术应用篇(下)

  上一期为大家介绍了过去一年里CRISPR技术在动物造模及单碱基技术方面取得的重大突破。本期继续为大家从功能基因组筛选、细胞谱系示踪及疾病诊断方面谈谈CRISPR-Cas系统的技术运用。   一、大规模基因功能的筛选   尽管测序和基因组编辑技术取得了重大进展,但是解析复杂的基因型-表型关系仍