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建立在线生物预印本文库总站计划引热议

建立新生物医学和生物预印本文库的计划已经受到十余家大型科学资助机构的青睐,其中包括政府机构、大型资助结构和研究慈善机构。但它同样引发了一场争论:现有预印本文库bioRxiv.org是否应该成为这些资料自然而然的归处。 尽管目前对该计划尚无确定的资助,但非盈利机构ASAPbio在2月13日宣布了一份应用请求,以对预印文本(尚未被一家期刊接收或进行同行评议的文章)建立“中心服务”。ASAPbio与美国国立卫生研究院、欧盟研究理事会、英国医学研究理事会、美国霍华德·休斯医学研究所和英国惠康信托研究慈善资助机构一起,就提议的文本库的原则和条件达成了一份共识。例如,该文本库必须有一个科学家带领的独立监管委员会,但对提交和阅读预印文本却是自由的。 中心服务旨在成为过去几年中出现的不同预印网站的聚合总站。例如,一些生物预印本被提交到arXiv.org网站,这是到目前为止建立时间最长的对应自然科学的网站,还有一些预印文本被提交到同行评议......阅读全文

生物学预印网站BioRxiv正式启动

  一个知名的研究实验室正在开展一项大手笔的计划——创建一个提供作者原始手稿的免费网站。一些生物学家表示,实行这一举措的时机已经成熟。   11月11日,非营利机构美国冷泉港实验室(CSHL)启动了BioRxiv,旨在将 BioRxiv打造为生物学家专有的预印本文献库。作为一个收集物理学、数学

武汉病毒科研让更多人认识BioRxiv

  最近,有关武汉冠状病毒的科学研究成果陆续发布,很多小伙伴注意到,很多文章都是发布在bioRxiv上,这并不是传统意义上的期刊,也没有影响因子,大家可能会奇怪,这些研究者难道不怕别的人窃取他们的idear吗?  其实这样做反而是抢占了先机,原因还得从什么是预印本说起...  大家知道一稿多投是学术

源自国外?新冠病毒溯源深陷迷雾

  2月27日,国家卫健委高级别专家组组长钟南山在新闻通气会上表示,疫情首先出现在中国,不一定是发源在中国。  同时,最新研究表明,继蛇、穿山甲、水貂之后,龟类也可能是新冠病毒的潜在中间宿主。  有关新冠病毒溯源的新进展源源不断。然而,它从哪里来?如何到达人类?又为什么是武汉?这些问题迄今没有答案,

新冠病毒溯源深陷迷雾

  2月27日,国家卫健委高级别专家组组长钟南山在新闻通气会上表示,疫情首先出现在中国,不一定是发源在中国。  同时,最新研究表明,继蛇、穿山甲、水貂之后,龟类也可能是新冠病毒的潜在中间宿主。  有关新冠病毒溯源的新进展源源不断。然而,它从哪里来?如何到达人类?又为什么是武汉?这些问题迄今没有答案,

2020年CRISPR/Cas最新研究进展

  基因组编辑技术CRISPR/Cas9被《科学》杂志列为2013年年度十大科技进展之一,受到人们的高度重视。CRISPR是规律间隔性成簇短回文重复序列的简称,Cas是CRISPR相关蛋白的简称。CRISPR/Cas最初是在细菌体内发现的,是细菌用来识别和摧毁抗噬菌体和其他病原体入侵的防御系统。图片

原来真的可以“一稿多投” BioRxiv让人“大开眼界”

  最近,有关武汉冠状病毒的科学研究成果陆续发布,很多小伙伴注意到,很多文章都是发布在bioRxiv上,这并不是传统意义上的期刊,也没有影响因子,大家可能会奇怪,这些研究者难道不怕别的人窃取他们的idear吗?  其实这样做反而是抢占了先机,原因还得从什么是预印本说起...  大家知道一稿多投是学术

“空间定位组学”和“4D组学”建起科学研究与疾病治疗的桥梁

  分析测试百科网讯 布鲁克一直以MALDI技术闻名全球,并已在成像领域占据领导地位;自去年推出timsTOF Pro创新组学系统后,在深度覆盖和高通量蛋白质组学分析中取得了突破性的进展,并且迅速和国内院校和企业开展了一系列深度的合作。比如timsTOF系列,已和北京大学、清华大学、复旦大学、厦门大

Science年度突破发布,看看都是哪些技术上了热榜~

  1、原子水平的生命(Life at the atomic level)  冷冻电镜技术获得2017年诺贝尔化学奖,其影响自不必多说。  同时,生物探索特推出专题《冷冻电镜新晋诺奖,想进一步了解就来看这个专题》,详细介绍冷冻电镜是如何被开发出来的,其发展历程上的里程碑事件以及冷冻电镜在中国的发展,

一不小心暴露年龄?竟然是肠道菌群告诉AI的

  数十亿个细菌在我们的肠道中安家并发挥着调节作用,从我们消化食物的能力到免疫系统的运作,都离不开这些肠道菌群的帮助。但是,科学家们对这种被称为微生物组的系统可谓是知之甚少。这个系统如何随着时间的推移发生变化,“正常的”微生物组究竟长什么样,诸如此类的问题科学家们也无法全部回答上来。▲脆弱拟杆菌是人

2020 HIV研究亮点进展

  人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus, HIV),即艾滋病(AIDS,获得性免疫缺陷综合征)病毒,是造成人类免疫系统缺陷的一种病毒。1983年,HIV在美国首次发现。它是一种感染人类免疫系统细胞的慢病毒(lentivirus),属逆转录病毒的一种。HIV通过

bioRxiv:华人科学家开发出AIOD-CRISPR技术

  来自美国康涅狄格大学健康中心生物医学工程系的研究人员一直在努力开发一种新的基于CRISPR的低成本诊断平台,以便检测包括新型冠状病毒SARS-CoV-2(之前称为2019-nCoV)在内的传染病。  随着近期导致2019年冠状病毒病(COVID-19)的病原体SARS-CoV-2疫情爆发,在一项

多篇文章介绍掌上测序仪的新兴应用

  Oxford Nanopore的MinION掌上测序仪近来有点火。这边厢,公司正忙着升级仪器,发布新产品;那边厢,用户也在不断发表研究成果,从全长cDNA测序到快速的病原体测序。  上个月,康涅狄格大学健康中心的研究人员在BioRxiv预印本网站上发表了一项成果。他们利用MinION对四个果蝇基

科学家对医疗预印本服务器计划褒贬不一

  医学家可能很快就有了发布未出版论文的预印本服务器了。美国耶鲁大学和耶鲁大学医学院的研究人员正准备启动服务器MedArXiv,专门发布临床研究成果。  但近日在第八届国际同行评议和科技出版会议上,人们对耶鲁大学心脏病学家Harlan Krumholz提出的这个计划褒贬不一。医学界的许多人都不确定在

新冠肺炎疫情 开启“云端”科研模式

   美国威斯康星国家灵长类动物研究中心的戴夫·奥康纳清晨收到在伦敦的一名合作伙伴发来的论文预印本。这项研究在中国完成,两人通过企业协同云端办公软件Slack讨论了一上午。下午2点,奥康纳打开高清会议系统GoToMeeting,和多个机构的研究人员讨论改进研究计划,他们希望构建一个灵长类动物模型来研

多篇文章介绍掌上测序仪的新兴应用

  Oxford Nanopore的MinION掌上测序仪近来有点火。这边厢,公司正忙着升级仪器,发布新产品;那边厢,用户也在不断发表研究成果,从全长cDNA测序到快速的病原体测序。  上个月,康涅狄格大学健康中心的研究人员在BioRxiv预印本网站上发表了一项成果。他们利用MinION对四个果蝇基

六位科学家质疑《Nature》论文CRISPR实现人体胚胎编辑的结果

  本周,六位科学家就在生物学预印网站BioRxiv发表了一篇针对CRISPR实现人体胚胎编辑的质疑文章,包括纪念斯隆凯特琳癌症中心的Mari Jasin在内的六位科学家质疑的内容就是:胚胎采用的是健康母体DNA作为模版纠正缺陷序列,而不是由研究人员外源提供的DNA。   8月初,一组研究人员利用

timsTOF Pro和PASEF一双慧眼 探究更多组学奥秘

  离子淌度技术发展几十年,布鲁克这个致力于挑战极限的公司,2016年一出手就推出业界最高淌度分辨的timsTOF质谱,在完成硬件的挑战后,布鲁克同德国马普研究所的Matthias Mann合作PASEF技术,于去年HUPO推出了timsTOF Pro,在蛋白质组学领域刷新了“鸟枪”法鉴定的速度、灵

动则2米长的DNA,为什么不像耳机线那样容易打结?

  一个简单的过程似乎能解释庞大的基因组是如何保持有序的,但人们无法就这一过程由何驱动达成一致。  Leonid Mirny在办公椅上转了一圈,抓起自己笔记本电脑的电源线。他用手指绕出了一个甜甜圈大小的环,兴奋地坐立难安:“这就是马达蛋白不断挤压成环的动态过程!”Mirny说。他是美国麻省理工学院的

新冠病毒在肾脏和膀胱中转了这么“一圈”

  中南大学湘雅医院钟永联合南京新格元生物科技有限公司范珏团队在预印本网站(bioRxiv)上发表了一篇文章,题为“Single-cell Analysis of ACE2 Expression in Human Kidneys andBladders Reveals a Potential Rou

科学家们如何进行多种疾病的研究

  本文中,小编整理了多篇研究成果,共同解读科学家们如何利用特殊模型来助力多种疾病的研究,分享给大家!  图片来源:es.wikipedia.org  【1】bioRxiv:特殊模型有望帮助预测新型冠状病毒的潜在药物靶点  doi:10.1101/2020.02.26.961938  近日,一篇发表

2019年8月HIV研究亮点进展

  人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus, HIV),即艾滋病(AIDS,获得性免疫缺陷综合征)病毒,是造成人类免疫系统缺陷的一种病毒。1983年,HIV在美国首次发现。它是一种感染人类免疫系统细胞的慢病毒(lentivirus),属逆转录病毒的一种。HIV通过

新冠抗体消失谜团:T细胞成整体免疫反应主力

  全世界对新冠疫情的最大期望,现在都放在了开发出有效的疫苗上。  主流的观点认为:只要有了疫苗,就能激发人体产生出特异的、针对新冠病毒的抗体,也就能防止人体被病毒感染。  它的核心在于:人体内必须要有足够的抗体,才能抵御病毒。  可是,真的是这样吗?  最近一项发表在顶级期刊《自然医学》上来自我们

bioRxiv:科学家发现新型冠状病毒母婴传播的证据!

  近日,一篇刊登在预印版平台bioRxiv上题为“The ACE2 expression of maternal-fetal interface and fetal organs indicates potential risk of vertical transmission of SARS-C

华大在新冠病毒基因组变异监测及研究方法上取得突破

  随着新型冠状病毒肺炎(COVID-19)肆虐全球,世界卫生组织(WHO)已经正式宣布其为全球流行病(Pandemic)。WHO最新新冠疫情状态报告显示,截至北京时间2020年3月26日10点,新冠肺炎疫情已蔓延至全球198个国家和地区,确诊患者超过46万例,且仍呈现迅速增长态势。  病毒在传播过

张永振、石正丽团队分别发表文章报道武汉新型冠状病毒

  2020年2月3日,上海公共卫生临床中心、复旦大学公共卫生学院张永振教授团队和中科院武汉病毒研究所石正丽教授团队分别在Nature上发表文章A new coronavirus associated with human respiratory disease in China和A pneumon

纳米孔直接RNA和cDNA长读长测序概述

  RNA测序已经在生物学和医学的各个领域取得了前所未有的发展。在包括癌症在内的诸多疾病中,转录异构体的表达和用途是健康组织和患病组织之间变异的重要来源。鉴定差异剪接的异构体和融合转录本,可以为疾病的诊断和治疗提供信息。RNA测序还有助于揭示从单细胞到整个组织的转录组动力学。同时,cDNA测序也极大

猫能感染新冠、狗不易感,是否传人不明确

  4月1日,《自然》网站以“新冠病毒能感染猫,但不易感染狗”为题,报道了中国农科院哈尔滨兽医研究所(以下简称哈兽医)陈化兰和步志高团队的一项最新研究。  该团队调查了雪貂和与人类密切接触的动物对SARS-CoV-2的易感性。结果表明,新冠病毒在狗、猪、鸡和鸭子中的复制能力很差,但在雪貂和猫身上能有

阐述新冠病毒感染机制,推进抗病毒药物研发

最近的预印本杂志bioRxiv发表了德国波恩大学,夏里特大学,德国马克斯·普朗克精神病研究所等单位联合研究成果,阐述了SARS-CoV-2病毒可以抑制自噬。亚精胺,MK-2206,氯硝柳胺等作用于自噬的小分子化合物,可以作为抗病毒潜在治疗药物。Analysis of SARS-CoV-2-contr

科学家质疑美国首批基因编辑人类胚胎

  8月初,一个美国团队宣布,利用CRISPR技术成功修复了人类早期胚胎中一种与遗传性心脏病相关的基因突变。这是美国国内首次进行人类胚胎基因编辑。该消息在生物界引起一番热议。   由于精确的基因编辑技术可用于修复人类胚胎中的致病基因突变,将其与体外受精等技术结合使用,或能防止有遗传性疾病相关基因变

从1966年保存的淋巴结样本中提取出HIV-1基因组

  在一项新的研究中,来自美国、比利时和刚果民主共和国的研究人员从一种已在石蜡中保存了50多年的淋巴结组织中提取出近乎完整的HIV-1基因组。这种样本是迄今为止发现的最早的HIV-1基因组,比此前最古老的样本早了十年。相关研究结果近期发表在预印本服务器bioRxiv上,论文标题为“A near-fu