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3.与线性DNA相比，ecDNA扩增导致的ai基因转录水平更高环状ecDNA扩增的转录结果发现，在所有扩增子类别中观察到DNA CN和ai基因表达水平高度明显相关(图3a)。然而，DNA CN归一化后，环状扩增子上的ai基因表达明显高于非环状扩增子。转录活性中不依赖于CN的增加现象可能部分是因为增强子劫持机制和ecDNA上染色质可及性提高。为了比较环状扩增和非环状区域之间控制基因表达的表观遗传机制，采用36个样本(ATAC-seq)图谱分析了转座酶可达染色质的重叠分析。经DNA CN水平校正后，环状和BFB扩增子的染色质明显比重排列和线性扩增子更容易接近(图3b)，因此，增加的染色质可及性在ecDNAai基因的失调中扮演了一个重要的角色。与非环状扩增相比，环状扩增的转录子融合频率增加了5倍(图3c)。我们观察到围绕环状扩增子结构的DNA CN，RNA表达和染色质可及性的聚集(图3d)。图 3 不同类型扩增子的基因......阅读全文
再登Nature Genetics-ecDNA与致ai基因扩增及多种ai症不良预后相关文章导读研究发现，许多扩增的原ai基因，并不只是位于染色体，而且还能变成游离的染色体外DNA（ecDNA），并出现大量拷贝，而且相当高比例的ecDNA是以环状DNA分子的形式存在，即eccDNA（染色体外环状DNA
在刚刚过去不到一个月的时间，染色体外环状DNA（eccDNA）重大科研成果相继刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量级期刊，这无疑将eccDNA推向21世纪20年代科学研究的风口浪尖，吸引无数科学工作者的眼球。前期报道表明eccDNA能导致原癌基因扩增，极大地促进肿瘤
在刚刚过去不到一个月的时间，染色体外环状DNA（eccDNA）重大科研成果相继刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量级期刊，这无疑将eccDNA推向21世纪20年代科学研究的风口浪尖，吸引无数科学工作者的眼球。前期报道表明eccDNA能导致原癌基因扩增，极大地促进肿瘤
近期，Nature与Cell相继发表文章讨论染色体外环状DNA（eccDNA），这位超级明星在各家媒体、宣传号上纷纷闪亮登场。一时间eccDNA走在了生物医学研究舞台的最中央，云序生物已经带您领略过eccDNA在这两篇重量级文章中的迷人风采（点击链接：颠覆性发现：癌基因竟不在染色体上---环状D
近期，Nature与Cell相继发表文章讨论染色体外环状DNA（eccDNA），这位超级明星在各家媒体、宣传号上纷纷闪亮登场。一时间eccDNA走在了生物医学研究舞台的最中央，云序生物已经带您领略过eccDNA在这两篇重量级文章中的迷人风采（点击链接：颠覆性发现：癌基因竟不在染色体上---环状D
登革热是目前世界上传播流行最为广泛的病毒性传染病之一。登革病毒由蚊虫携带并且传播给人。目前，全世界范围内已有100多个国家及地区出现登革热的感染流行。据世界卫生组织（WHO）估计，全世界大约由25亿人生活在受登革热感染威胁的区域，每年有3.9亿人被登革病毒感染或重复感染，有50-100万人入院治
上一期为大家介绍了过去一年里CRISPR技术在动物造模及单碱基技术方面取得的重大突破。本期继续为大家从功能基因组筛选、细胞谱系示踪及疾病诊断方面谈谈CRISPR-Cas系统的技术运用。 一、大规模基因功能的筛选 尽管测序和基因组编辑技术取得了重大进展，但是解析复杂的基
二、DNA标记与细胞谱系示踪发育生物学的重点包括构成器官或生物体的细胞类型的多样性以及这些细胞的发育谱系历史。这些方面通常作为一个方向被单独研究，但最近的四篇新论文报道了一种将单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术与基于CRISPR的谱系示踪技术相结合来同时解剖转录组细胞表型和谱系历史的方法。近
上一期为大家介绍了过去一年里CRISPR技术在动物造模及单碱基技术方面取得的重大突破。本期继续为大家从功能基因组筛选、细胞谱系示踪及疾病诊断方面谈谈CRISPR-Cas系统的技术运用。 一、大规模基因功能的筛选 尽管测序和基因组编辑技术取得了重大进展，但是解析复杂的基因型-表型关系仍
本期为大家带来的是肿瘤免疫疗法领域的最新研究进展，希望读者朋友们能够喜欢。 1. JCI：为何癌症靶向免疫药物有时会失效？ DOI: 10.1172/JCI128644 近日，来自俄亥俄州立大学综合癌症中心的研究人员做出了一项突破性研究成果，该发现有助于科学家理解为什么某些肿瘤微环境中缺乏
不知不觉，再过天2016年就离我们远去了，迎接我们的将是崭新的2017年，那么即将过去的12月里Nature杂志又有哪些亮点研究值得学习呢？小编对此进行了整理，与各位一起学习。 【1】Nature：首次揭示RNA剪接与衰老存在因果关联 doi：10.1038/nature20789 衰老是
2019年7月28日是第九个“世界肝炎日”，今年世界肝炎日的主题为“积极预防主动检测 规范治疗 全面遏制肝炎危害”，本文中，小编整理了近年来科学家们在肝炎研究领域取得的重要研究成果，与大家一起学习！ 【1】PLoS Biol：中国科学家设计出能抑制甲型肝炎病毒的新药物 doi：10.1371
今年是遗传学家、生物统计学家李景均先生著作的英文版《群体遗传学导论》一书出版70周年。该书是中国现代史上迄今为止极少数在中国出版但在西方某个科技领域产生重大影响的专业书。绝大多数新中国成立后出生的人可能都不知道李景均是谁。在美留学的大陆学生，除非所学专业和人类遗传学有关，恐怕大多数也不知道李景均是谁
登革热是目前世界上传播流行最为广泛的病毒性传染病之一。登革病毒由蚊虫携带并且传播给人。目前，全世界范围内已有100多个国家及地区出现登革热的感染流行。据世界卫生组织（WHO）估计，全世界大约由25亿人生活在受登革热感染威胁的区域，每年有3.9亿人被登革病毒感染或重复感染，有50-100万人入院治
如何将潜在的大流行及时扼杀在萌芽阶段？对于这个问题，科学家们大开“科学脑洞”，贡献出以下几样“法宝”： 广谱冠状病毒疫苗 实验室培养类器官 绘制病毒分布图 2020年，新冠疫情让全世界的人们感受到了致病病毒带来的恐怖危险。全球科学家争分夺秒，与病毒赛跑，希望早日终结疫情。与此同时，还有一
茶作为中国的传统国饮，自炎帝时期就有“神农尝百草，日遇七十二毒，得荼而解之”的说法，其中的荼就是我们现在所讲的茶，唐朝的陆羽著有《茶经》，可谓源远流长。如今茶与可可、咖啡并称为当今世界的三大无酒精饮料，每天坚持喝茶会给我们的身体带来一些非常奇妙的变化，当然包括改善机体的健康。 茶叶中富含微量营
CRISPR基因编辑会导致数以百计意想不到的突变？5月30日，《自然-方法》刊登的一篇通信文章显示，来自美国哥伦比亚大学等研究机构的科学家确认通过CRISPR基因编辑技术成功修复了导致两只小鼠失明的基因后，经全基因组测序发现小鼠体内有超过1500个单核苷酸发生突变，并有百个以上的位点发生发生了大片段
来源：Pixbay编者按：CRISPR基因编辑会导致数以百计意想不到的突变？5月30日，《自然-方法》刊登的一篇通信文章显示，来自美国哥伦比亚大学等研究机构的科学家确认通过CRISPR基因编辑技术成功修复了导致两只小鼠失明的基因后，经全基因组测序发现小鼠体内有超过1500个单核苷酸发生突变，并有百个
在自然界中，蚊子是多种烈性病毒的主要携带者和传播者。这些蚊媒病毒感染人体后可以引起多种烈性的临床症状，诸如脑炎、脑膜炎、出血热等，重度感染可以导致非常高的死亡率。蚊媒病毒在宿主和蚊虫之间传播循环（图1）。在这个过程中，蚊子可以通过叮咬吸血从病人的血液中获取病毒，病毒进入到蚊子体内，感染蚊子中肠的
根据贝勒医学院圣路易斯华盛顿大学医学院和不列颠哥伦比亚大学的研究人员的研究，大型基因组分析将某些DNA突变与雌激素受体阳性乳腺癌复发的高风险联系起来，而其他突变与更好的结果相关联。 这些知识可以帮助预测哪些患者最有可能患上癌症，并且可以帮助指导治疗决策。它还为新发现的高危突变患者开辟了更积极的
根据贝勒医学院圣路易斯华盛顿大学医学院和不列颠哥伦比亚大学的研究人员的研究，大型基因组分析将某些DNA突变与雌激素受体阳性乳腺癌复发的高风险联系起来，而其他突变与更好的结果相关联。 这些知识可以帮助预测哪些患者最有可能患上癌症，并且可以帮助指导治疗决策。它还为新发现的高危突变患者开辟了更积极的
环状RNA作为研究持续火热的明星分子，不同于对其丰富的表达谱研究，环状RNA功能机制研究还仅仅处在起步阶段。环状RNA研究多为miRNA海绵机制，部分circRNA可竞争性结合miRNA，解除miRNA对靶基因的抑制作用，上调靶基因的表达。其实，环状RNA可以通过结合不同种类的功能蛋白，分别在转
马上就要过年了，吃货的春天又将来临，想必大家都已经准备好了上好的食材，时刻准备着磨刀嚯嚯向猪羊。或与家人团圆欢聚，或与朋友把酒言欢，或畅谈发小一吐不快，或智斗姑姨险避相亲，但是都逃不开一个字儿：吃！那么问题就来了：怎么海吃海喝才能不长肉呢？我们来看看达尔文怎么说：物竞天择，适者生存！这是什么意思
RNA甲基化领域是当前最耀眼的国际科研明星，也是国自然申请的大热点；究其原因，是因为最近一两年，RNA甲基化的功能与分子机制方面取得了巨大的进展。RNA甲基化已被证实在癌症发生发展，病毒感染，神经发育，干细胞分化等过程中发挥着关键作用。今天，我们承接上一期的癌症篇，为您带来病毒领域的RNA甲基化研究
RNA甲基化领域是当前最耀眼的国际科研明星，也是国自然申请的大热点；究其原因，是因为最近一两年，RNA甲基化的功能与分子机制方面取得了巨大的进展。RNA甲基化已被证实在癌症发生发展，病毒感染，神经发育，干细胞分化等过程中发挥着关键作用。今天，我们承接上一期的癌症篇，为您带来病毒领域的RNA甲基化
【1】Nat Commun：广谱性流感病毒抗体疫苗新进展 doi：10.1038/s41467-018-05482-0 根据最近来自宾夕法尼亚大学医学院的研究者们做出的研究成果，一类广谱的流感病毒疫苗有望保护人们免受世界上大多数流感病毒的感染。 这一疫苗前体的相关研究发表在最近一期的《Na
摘要： 封面故事：细菌为什么会与人共存? 为什么哺乳动物身上会有大量共生细菌生存?这些细菌又是怎样到它们身上去的?微生物学家正在开 始了解这些问题。但是，将有益细菌与有害细菌区分开来的是什么仍然不大清楚。2005年，研究表明，小肠菌Bacteroides fragilis对哺乳动物免疫系统有深远
看点预告 ● 浙大继续“开挂”，拿下今年第9篇CNS ● 昆明理工研究成果登上Nature，同一团队10月刚完成Science首秀 ● 寻找马约拉纳零能模再下一城，中科院丁洪、高鸿钧团队发Science 本周，中国学者在Cell、Nature和Science上共发文6篇。 其中，浙大
在国家自然科学基金项目(项目批准号：81301412，81422028，81571975) 等资助下，清华大学医学院程功研究员团队首次发现了登革病毒非结构蛋白NS1在病毒“宿主-蚊”传播循环过程中的重要作用，阐明了NS1蛋白促进病毒感染蚊虫的分子机制，回答了“登革病毒如何从宿主传播到蚊虫”这一重
肺癌是全球最常见的恶性肿瘤，死亡率居恶性肿瘤之首，如今肺癌已经成为中国主要疾病负担之一，其发病率和死亡率均高居癌症首位。据统计，2015年我国新增肺癌患者约为73万例，每年约有61万人死于肺癌。此外，与其它癌症相比，肺癌的5年生存率极低，严重危害人民健康，预计到2025年，我国每年肺癌新发病例将