NatureGenetics揭示eccDNA功能—驱动神经母细胞瘤基因组重排
在刚刚过去不到一个月的时间，染色体外环状DNA（eccDNA）重大科研成果相继刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量级期刊，这无疑将eccDNA推向21世纪20年代科学研究的风口浪尖，吸引无数科学工作者的眼球。前期报道表明eccDNA能导致原癌基因扩增，极大地促进肿瘤内的异质性，是肿瘤进化的动力。那么除此外，eccDNA是否还有其他生物学功能呢？相信各位老师跟小编一样迫切想要了解eccDNA研究的新方向，而云序生物一直关注eccDNA的研究动态，今天带来的文章刚好揭示了eccDNA新功能--驱动神经母细胞瘤基因组重排，为现代癌症基因组学提供了令人兴奋的新方向。下面请跟着编者一起走进eccDNA的新世界，了解这个神奇的分子在癌症治疗方面划时代的功能。 2019年12月16日，eccDNA驱动致癌基因重构一文发表在Nature Genetics（IF=25.455）期刊上，该文章结合eccDNA......阅读全文
Nature－Genetics－揭示eccDNA功能—驱动神经母细胞瘤基因组重排
在刚刚过去不到一个月的时间，染色体外环状DNA（eccDNA）重大科研成果相继刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量级期刊，这无疑将eccDNA推向21世纪20年代科学研究的风口浪尖，吸引无数科学工作者的眼球。前期报道表明eccDNA能导致原癌基因扩增，极大地促进肿瘤
Nature－Genetics揭示eccDNA新功能—驱动神经母细胞瘤基因组重..
1. 神经母细胞瘤eccDNA整体统计研究人员联合eccDNA-seq和RNA-seq（云序生物提供此服务）技术，与开创性的生物信息学算法相结合，首次在神经母细胞瘤（一种主要发生在儿童的致命肿瘤）中进行详细的环状DNA序列分析。本研究中分析了93名儿童的神经母细胞瘤组织样本，结果显示，每个组织样本平
揭示eccDNA新功能—驱动神经母细胞瘤基因组重排
在刚刚过去不到一个月的时间，染色体外环状DNA（eccDNA）重大科研成果相继刊登上Nature、Cell、Nature Genetics等重量级期刊，这无疑将eccDNA推向21世纪20年代科学研究的风口浪尖，吸引无数科学工作者的眼球。前期报道表明eccDNA能导致原癌基因扩增，极大地促进肿瘤
eccDNA新型生物标志物的多种应用
文章导读 新年伊始，eccDNA（染色体外环状DNA）的相关研究成果不断。2019年11月同期Nature、Cell报道了环状DNA通过高度开放染色质、复杂的拓朴异构特征增强表达的颠覆性发现，2019年12月Nature Genetics也刚刚揭示了eccDNA能够驱动神经母细胞瘤基因重排
国自然研究热点——eccDNA的前世今生（三）
小编在这儿也给大家整理了eccDNA表达谱的研究思路，如下图。 （2）生物标志物eccDNA优于线性DNA的生物稳定性以及独特的分子结构特征，为迅速发展的无创活检道路增添了新的方向，如果有较多的临床样本，它非常适合做生物标志物的研究。下面这篇文章是eccDNA在液体活检方面探索的先驱文章，小编带大家
研究发现染色体外环状DNA驱动神经母细胞瘤癌基因重构
近日，纪念斯隆?凯特林癌症中心等科研机构的研究人员在Nature Genetics上发表了题为“Extrachromosomal circular DNA drives oncogenic genome remodeling in neuroblastoma”的文章，发现染色体外环状DNA驱动神
国自然研究热点—eccDNA的前世今生
2019年11月，顶尖国际学术期刊《Nature》和《Cell》相继发表了关于染色体外环状DNA(extrachromosomal circular DNA，eccDNA)的重要研究，彻底颠覆了人们对癌基因的传统认知，同时也迅速引爆了整个生物医学界，一时之间，将人们的目光都吸引到这个科研界的新宠
再登Nature－GeneticsecDNA与致ai基因扩增及多种ai症不良...1
再登Nature Genetics-ecDNA与致ai基因扩增及多种ai症不良预后相关文章导读研究发现，许多扩增的原ai基因，并不只是位于染色体，而且还能变成游离的染色体外DNA（ecDNA），并出现大量拷贝，而且相当高比例的ecDNA是以环状DNA分子的形式存在，即eccDNA（染色体外环状DNA
国自然研究热点—eccDNA的前世今生
1. eccDNA为什么火？它到底是何方神圣？ 2019年11月，顶尖国际学术期刊《Nature》和《Cell》相继发表了关于染色体外环状DNA(extrachromosomal circular DNA，eccDNA)的重要研究，彻底颠覆了人们对癌基因的传统认知，同时也迅速引爆了整个生
eccDNA新型生物标志物的多种应用
新年伊始，eccDNA（染色体外环状DNA）的相关研究成果不断。2019年11月同期Nature、Cell报道了环状DNA通过高度开放染色质、复杂的拓朴异构特征增强表达的颠覆性发现，2019年12月Nature Genetics也刚刚揭示了eccDNA能够驱动神经母细胞瘤基因重排的全新功能。这一
eccDNA新型生物标志物的多种应用
新年伊始，eccDNA（染色体外环状DNA）的相关研究成果不断。2019年11月同期Nature、Cell报道了环状DNA通过高度开放染色质、复杂的拓朴异构特征增强表达的颠覆性发现，2019年12月Nature Genetics也刚刚揭示了eccDNA能够驱动神经母细胞瘤基因重排的全新功能。这一
癌基因的关键——染色体外环状DNA（eccDNA）
实验方法：环状DNA-seq, RNA-seq（云序生物提供以上服务）1. ecDNA是环状结构为了了解ecDNA的结构，作者通过环状DNA-seq（云序生物提供以上服务）方法研究了三种人类癌细胞系和来自于TCGA的临床肿瘤样品。通过这种方法检测到了GBM39细胞中的圆形扩增子游离于染色体之外，并且
Nature－Communications：发现神经母细胞瘤癌基因
神经母细胞瘤占儿童癌症死亡总数的15%。高危神经母细胞瘤患者的生存率为50%。 澳大利亚儿童癌症研究所的研究人员首次发现，一种名为JMJD6的基因在最具侵袭性的癌症中扮演着重要角色。这项研究于近日发表于Nature Communications。这一发现为治疗神经母细胞瘤开辟了一条新途径。图片
Nature子刊：基因组测序揭示脑瘤驱动基因
通过大规模基因组测序，来自Dana-Farber癌症研究所和Broad研究所的科学家们揭示了两个DNA突变，其似乎驱动了15%的脑膜瘤。这一研究发现有可能促成针对这类肿瘤的第一个有效药物治疗。 脑膜瘤是一种形成于脑膜及脑膜间隙，生长缓慢的肿瘤，通常为良性。但当脑膜瘤长到极大时，可导致癫痫发
再登Nature－GeneticsecDNA与致ai基因扩增及多种ai症不良...2
3.与线性DNA相比，ecDNA扩增导致的ai基因转录水平更高环状ecDNA扩增的转录结果发现，在所有扩增子类别中观察到DNA CN和ai基因表达水平高度明显相关(图3a)。然而，DNA CN归一化后，环状扩增子上的ai基因表达明显高于非环状扩增子。转录活性中不依赖于CN的增加现象可能部分是因为
神经母细胞瘤的简介
不同神经母细胞瘤患者预后差别很大，也即神经母细胞 瘤间存在广泛的肿瘤异质性。根据高危因素的不同，神经母细胞瘤可以分为低危组、中危组和高危组。对于低危组神经母细胞瘤患者（最常见于婴幼儿），靠单纯的观察或者是手术治疗往往可以取得很好的效果；但是高危组神经母细胞瘤患者，即使综合各种强化的治疗方案，预
什么是神经母细胞瘤
神经母细胞瘤是一种儿童常见的实质性肿瘤。主要起源于肾上腺，但也可起源于肾上腺外的交感神经的其他部分，包括腹膜后或胸部。 约%的神经母细胞瘤患者在岁以下某些患者有家族倾向性大约%的肿瘤起源于腹部%~%起源于胸部其余%起源于不同的部位例如颈部骨盆等原发于中枢神经系统的神经母细胞瘤极少见许多神经母细胞瘤
嗅觉神经母细胞瘤治疗
由于嗅觉神经母细胞瘤这种疾病的罕见性，观察性研究通常只有有限的患者数量。此外，疾病的自然病史需要长时间观察才能充分评估治疗效果。目前，关于嗅神经母细胞瘤的遗传和分子改变的信息不足以指导治疗决策。原发肿瘤手术治疗、放射治疗（RT）或化疗都已用于治疗原发性嗅神经母细胞瘤。观察性研究通常表明，与手术或单独
NatureGenetics揭示儿童癌症致病基因
来自约翰霍普金斯大学Kimmel癌症中心和费城儿童医院(CHOP)的科学家们在对74个儿童神经母细胞瘤进行全基因组测序后，发现ARID1A和ARID1B两个基因发生改变的患儿相比无此基因改变的患儿生存期缩短了四分之三。这一发现有可能最终导致早期确认患有侵袭性神经母细胞瘤的儿童，他们或许需要接受其
《Nature－Genetics》：癌症的基因组结构研究
癌症的基因组结构研究发表《Nature Genetics》 B细胞通过一系列精心控制的染色体重排和“良好”突变产生抗体，这些突变使细胞能够产生大量不同的抗体。“尽管变化对产生大量多样的抗体至关重要，但仍有可能发生‘坏’突变并导致B细胞源性癌症，”研究负责人、哥伦比亚大学内科医师和外科医生学院微
Nature－Genetics：多种技术解析草莓基因组
近日，美国密歇根州立大学和加州大学戴维斯分校的研究人员组装出近乎完整的栽培草莓基因组，并揭示了这种复杂的异源多倍体的起源和进化过程。 一转眼又到了草莓上市的季节。这种小巧可爱的果实有着酸甜可口的味道，可搭配出各种各样的美妙滋味。不过，对于草莓的基因组，你又了解多少？ 世界各地广泛种植的凤梨草
Nature－Genetics：揭示肠癌早期转移最新证据
根据传统的癌症分期方法，癌症可以笼统地被分为早期、中期和晚期。这个分类方法不仅很好地概括了癌症的特点，还通俗易懂地向大众传递了癌症的严重程度。然而近日发表于Nature Genetics的研究对上述分类提出质疑。 来自美国斯坦福大学医学院的医学和遗传学助理教授Christina Curtis联
国自然研究热点——eccDNA的前世今生（二）
(3) 形成特征早期的研究发现eccDNA是基因扩增的产物，是基因组不稳定性的一种表现形式。肿瘤基因扩增往往以两种方式，一种是在染色体上进行基因的扩增，另一种则是形成eccDNA。目前关于肿瘤中eccDNA的形成机制还没有定论。早期的研究认为短重复序列是介导eccDNA形成的因素，主要通过基因重组机
神经母细胞瘤的临床症状
神经母细胞瘤的初发症状不典型，因此在早期诊断有 所困难。比较常见的症状包括疲乏，食欲减退，发烧以及关节疼痛。肿瘤所导致的症状取决于肿瘤所处的器官以及是否发生转移。 腹腔的神经母细胞瘤一般表现为腹部膨隆以及便秘；胸腔神经母细胞瘤一般表现为呼吸困难；脊髓神经母细胞瘤一般表现为躯干与肢体力量减退，
关于神经母细胞瘤的诊断
最终的诊断依赖于术后的病理，但同时也要综合考虑患者的临床表现以及其他的辅助检查结果。 生化检查 将近90%的神经母细胞瘤患者，其血液或尿液里儿茶酚胺及其代谢产物（多巴胺，高香草酸、香草扁桃酸）的浓度较正常人群有显著升高。 影像检查 另外一个检测神经母细胞瘤的手段是间位腆代苄胍（meta-
神经母细胞瘤的生化检查
将近90%的神经母细胞瘤患者，其血液或尿液里儿茶酚胺及其代谢产物（多巴胺，高香草酸、香草扁桃酸）的浓度较正常人群有显著升高。
神经母细胞瘤的影像检查
另外一个检测神经母细胞瘤的手段是间位腆代苄胍（meta-iodobenzylguanidine，mIBG）扫描。该检查的分子机理为，间位腆代苄胍是去甲肾上腺素的功能类似物（analog），并可被交感神经元所摄取。当间位腆代苄胍与放射性物质如碘-131或者是碘-123耦联后，即可作为放射性药物而用
Nature－Genetics公布又一大规模癌症基因组分析结果
超过20个研究机构的63位研究人员公布了一项包括30,000多人血液样本的大规模研究成果，通过这项分析，研究人员确定了13种胶质瘤新遗传危险因素，这揭示了增加胶质瘤易感性的个体DNA的特殊差异，同时也首次为临床医师提供了一种能区分成胶质细胞瘤和非胶质母细胞瘤等胶质瘤类型的新方法。 这一研究成果
Nature－Genetics：全基因组测序的诊断价值
根据《Nature Genetics》上发表的一项新成果，全基因组测序有望用于临床上的遗传病诊断。这项研究评估了影响全基因组测序在临床诊断中取得成功的因素。 这个国际研究小组由英国的研究人员领导，对156个病例或家庭开展了临床基因组测序。这些病例有着遗传疾病的特征，但无法通过之前的筛查
Nature－Genetics：全基因组测序的诊断价值
根据《Nature Genetics》上发表的一项新成果，全基因组测序有望用于临床上的遗传病诊断。这项研究评估了影响全基因组测序在临床诊断中取得成功的因素。 这个国际研究小组由英国的研究人员领导，对156个病例或家庭开展了临床基因组测序。这些病例有着遗传疾病的特征，但无法通过之前的筛查检测来解