再登NatureGeneticsecDNA与致ai基因扩增及多种ai症不良...2

3.与线性DNA相比,ecDNA扩增导致的ai基因转录水平更高环状ecDNA扩增的转录结果发现,在所有扩增子类别中观察到DNA CN和ai基因表达水平高度明显相关(图3a)。然而,DNA CN归一化后,环状扩增子上的ai基因表达明显高于非环状扩增子。转录活性中不依赖于CN的增加现象可能部分是因为增强子劫持机制和ecDNA上染色质可及性提高。为了比较环状扩增和非环状区域之间控制基因表达的表观遗传机制,采用36个样本(ATAC-seq)图谱分析了转座酶可达染色质的重叠分析。经DNA CN水平校正后,环状和BFB扩增子的染色质明显比重排列和线性扩增子更容易接近(图3b),因此,增加的染色质可及性在ecDNAai基因的失调中扮演了一个重要的角色。与非环状扩增相比,环状扩增的转录子融合频率增加了5倍(图3c)。我们观察到围绕环状扩增子结构的DNA CN,RNA表达和染色质可及性的聚集(图3d)。图 3 不同类型扩增子的基因......阅读全文

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3.与线性DNA相比,ecDNA扩增导致的ai基因转录水平更高环状ecDNA扩增的转录结果发现,在所有扩增子类别中观察到DNA CN和ai基因表达水平高度明显相关(图3a)。然而,DNA CN归一化后,环状扩增子上的ai基因表达明显高于非环状扩增子。转录活性中不依赖于CN的增加现象可能部分是因为

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再登Nature Genetics-ecDNA与致ai基因扩增及多种ai症不良预后相关文章导读研究发现,许多扩增的原ai基因,并不只是位于染色体,而且还能变成游离的染色体外DNA(ecDNA),并出现大量拷贝,而且相当高比例的ecDNA是以环状DNA分子的形式存在,即eccDNA(染色体外环状DNA

《Nature》:癌基因“地震扩增”,驱动多种癌症!

  染色体外DNA(ecDNA)是一类特殊的从正常基因组上脱落下来的游离于染色体外的环状DNA。早在1964年,人们就在神经母细胞瘤细胞中观察到了ecDNA的存在 ,但由于技术受限,人们对于ecDNA在肿瘤发生发展中发挥的具体作用未能有更进一步认识。  2017年Paul Mischel团队在《自然

国内首个十万卡AI算力集群“登峰”来了

  7月10日,光合组织2026智能计算应用大会期间,中科曙光宣布我国首个全国产十万卡AI超级算力集群——登峰(曙光8000)正式落成,并同步接入国家超算互联网。这标志着AI基础设施建设开始从万卡级迈向十万卡级部署阶段。  “登峰”——曙光8000超集群。光合组织 供图  据介绍,曙光8000(登峰

AI助力自闭症诊断

医生通常通过临床观察和评估来确诊自闭症。为了剖析这一主观且难以描述的临床决策过程,研究人员借助大型语言模型(LLM),整合分析出最具诊断意义的自闭症相关行为和表现。相关成果3月27日发表于《细胞》杂志。研究显示,重复行为、特殊兴趣和感知相关行为,与自闭症诊断关联最密切。这些发现可能通过减少对社会因素

科研新突破登Nature子刊,泛生子再掀癌症基因的“面纱”

  泛生子致力于从癌症基因开始寻根溯源,揭示肿瘤产生的根源及其赖以发展的关键机制,通过临床转化为癌症患者带来希望。   近日,由美国杜克大学讲席教授、泛生子联合创始人兼首席科学家阎海教授领衔的泛生子团队,联同杜克大学及约翰霍普金斯大学研究人员完成的最新成果,在线发表于国际权威学术期刊《Nature

PCR基因扩增2

(4)引物的熔点温度(Tm值)要适当。Tm值与引物的碱基组成和长度有关;PCR引物的GC/AT应与要扩增的模板DNA相当或略高些。一般熔点温度以大于55℃为宜。(5)引物的3,末端必须与模板严格互补,而5,末端的要求可灵活些。(6)目前在引物选择中已广泛应用计算机软件,从EMBL或Genebank中

谷歌研究登《自然》:AI几何能力接近奥数金牌

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516327.shtm

施一公等登Science封面:AI与冷冻电镜揭示「原子级」NPC结构

6月10日,《Science》杂志以封面专题形式发表了 5 篇论文,其中 3 篇论文共同揭开了人类核孔复合体的近原子分辨率冷冻电镜结构,另外两项研究通过非洲爪蟾呈现了脊椎动物核孔复合体的单颗粒冷冻电镜图像。这篇封面文章将多项研究成果拼接在一起,形成的人类 NPC 图像接近原子级。这一研究成果建立在多

清华类脑计算模型登Nature子刊,受大脑启发的人工树突网络,实现高能效AI

  5 月 30 日,清华大学类脑计算研究中心施路平团队,研发出全球首款类脑互补视觉芯片「天眸芯」,研究成果登上 Nature 封面。  近日,该团队推出一种新的神经形态计算架构,即类脑神经计算模型 「Dendristor」。  「Dendristor」旨在复制突触的组织(即神经元之间的连接)和树突

AI打通基因与药物筛选体系-精准预测细胞响应

中南大学计算机学院教授李敏团队联合腾讯生命科学实验室研究员姚建华团队,提出统一的细胞扰动建模框架UniPert-G2CP,从分子表征到表型建模两个层面连接遗传与化学扰动筛选,为虚拟细胞构建提供新的计算方法。研究成果近日在线发表于《细胞》(Cell),中南大学为论文第一完成单位。近年来,随着大规模生物

AI教育风潮席卷中国高校-学生用AI学AI

  “What does this machine do(这台机器是干什么的)?”4日下午,西南交通大学孟加拉国留学生Zahidul Alam拍下身前吊弦疲劳试验仪器的照片。收到他的语音提问后,手机中的24小时在线“AI学伴”瞬间给出如论文般详细的英文回答。  这是西南交大首门人工智能通识课的第一课

2位华人一作重磅研究登Nature

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495092.shtm 当今世界,治疗艾滋病面临最大的挑战是什么?答案是治愈。 虽然人类在治疗艾滋病方面已经取得了惊人的进展,能够通过特定药物延长患者的生命,但找到根治艾滋病病毒(HIV)的方法仍是

生成式AI可训练机器人执行多种任务

铲子,刀子,锤子,扳手3个不同的数据集:模拟(上)、机器人远程操作(中)和人类演示(下)让机器人能学习使用不同的工具。图片来源:麻省理工学院科技日报北京6月23日电 (记者张梦然)据美国麻省理工学院官网近日报道,该机构研究人员为了训练更先进的多用途机器人,开发出一种技术:使用一种称为扩散模型的生成式

生成式AI进军基因编辑领域

OpenCRISPR-1的物理结构,这是一种由Profluent的AI技术创建的基因编辑器。图片来源:singularityhub.com制图、写歌、作诗、编程、生成视频……生成式人工智能(AI)技术与各行业的结合不断为人们带来惊喜,在各领域掀起革新浪潮。现在,AI的应用场景再次拓展:美国AI蛋白质

AI发现冠心病罕见变异基因

科技日报讯 (记者张佳欣)美国西奈山伊坎医学院研究人员使用一种先进的人工智能(AI)工具,在17个基因中识别出罕见的编码变异,揭示了冠状动脉疾病(CAD,也称冠心病)的分子基础。近日发表在《自然·遗传学》上的相关研究,揭示了影响心脏病的遗传因素,或为心血管疾病的定向治疗和个性化治疗开辟新途径。研究人

AI发现冠心病罕见变异基因

  美国西奈山伊坎医学院研究人员使用一种先进的人工智能(AI)工具,在17个基因中识别出罕见的编码变异,揭示了冠状动脉疾病(CAD,也称冠心病)的分子基础。近日发表在《自然·遗传学》上的相关研究,揭示了影响心脏病的遗传因素,或为心血管疾病的定向治疗和个性化治疗开辟新途径。  研究人员使用一种计算机生

用AI识别AI:西湖大学研究可检测AI生成文本

虚假新闻、恶意产品评论、剽窃……ChatGPT、 GPT-4等AI大语言模型的应用带来便利,但其误用也带来一系列问题。西湖大学工学院张岳教授的“文本智能实验室”日前发布的一项研究提出一种高准确率、高速、低成本、通用的新文本检测方法——Fast-DetectGPT,无需训练即可识别各种AI大语言模型生

IBM再开源3个癌症AI项目-推动癌症研究

  癌症是全球第二大死亡原因, 2018年估计有1,810万新病例以及960万人死于癌症。学术界和工业界也不断致力于寻找更有效的抗癌药物。IBM位于苏黎世的研究团队正在构建一些人工智能机器学习的方法,加速人们对复杂疾病的主要驱动因素、分子机制以及肿瘤组成的差异等几方面的理解。  为了推动新疗法的研究

“AI+”时代-|-AI“解码”免疫系统

  人体免疫系统包含了很多有关身体健康的信息,其中的关键部分就包含在血液中。医学界提出了一个大胆设想:通过创建一个万能的血液测试,采集免疫系统与病原体之间的反应信息,绘制“免疫图谱”,从而解码免疫系统中的信息,及时在疾病恶化前筛查确诊。那么,什么样的平台能提供足够的计算力,不断通过机器学习和精准模型

ChatGPT的拷问:何为AI伦理、AI治理

前不久,AI聊天机器人程序ChatGPT席卷全球,完成了AI第一次大规模的自传播。作为人工智能领域的现象级应用,ChatGPT可能引发的信任、责任、伦理、法律等问题也很快引发各界关注与担忧。近年来,不少关于人工智能(AI),并和人类生产、生活关系紧密的议题被广泛讨论,诸如“如何应对AI可能对社会产生

ChatGPT的拷问:何为AI伦理、AI治理

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494707.shtm   前不久,AI聊天机器人程序ChatGPT席卷全球,完成了AI第一次大规模的自传播。作为人工智能领域的现象级应用,ChatGPT可能引发的信任、责任、伦理、法律等问题也很快引发各

拜登签署行政命令,发布白宫首个生成式AI监管规定

·行政命令要求美国多个政府机构制定标准,对人工智能产品进行测试,寻求“水印”等内容验证的最佳方法,拟定网络安全计划,吸引技术人才,以保护隐私,促进公平和公民权利,维护消费者和劳动者的利益,促进创新和竞争,提升美国的领导地位等。·白宫将向十多个政府机构发布内容广泛的指令,还将任命一个白宫人工智能委员会

211高校,再登《Science》!

近日,傅正义院士团队平航副研究员在材料过程仿生制备新技术研究方面取得创新性进展,成果以“Mineralization Generates Megapascal Contractile Stresses in Collagen Fibrils”为题,发表在国际顶级期刊《Science》(科学)上。武汉

春日里与“AI”相约摘草莓

春来伊始,万象“耕”新。当春耕遇上“AI”,小小的草莓园里,藏着怎样的“新质生产力”?近日,南京农业大学工学院教授汪小旵团队成功研发了一款草莓选择性采收机器人。在丰收的草莓园中,你可以和这台最先进的机器人一起踏上一场充满乐趣和科技感的草莓采摘之旅。汪小旵介绍,由于草莓采摘繁重而精细,需要大量人力,生

中国团队成果登Nature,颠覆“长寿基因”认知

  8月22日,《Nature》期刊在线发表了这一篇题为“SIRT6 deficiency results in developmental retardation in cynomolgus monkeys”的文章。来自中国科学院生物物理研究所的刘光慧、动物研究所的胡宝洋和李伟课题组合作以食蟹猴为

AI深入基因治疗!博腾生物与百图生科联合推出-AI-驱动-AAV-解决方案

  自 2023 年 11 月 ,博腾生物(Porton Advanced)宣布与百图生科(BioMap)建立战略合作伙伴关系,双方致力于运用前沿的生命科学大模型技术,助力腺相关病毒(AAV)相关算法开发。经过半年的紧密协作,博腾生物与百图生科于 2024 年 7 月迎来重大里程碑,并成功推出 AI

纳米技术的重大飞跃,这种神奇材料再登Nature

  2004年,英国曼彻斯特大学的两位科学家安德烈·盖姆(Andre Geim)和康斯坦丁·诺沃消洛夫(Konstantin Novoselov)发现他们能用一种非常简单的方法得到越来越薄的石墨薄片。他们从高定向热解石墨中剥离出石墨片,然后将薄片的两面粘在一种特殊的胶带上,撕开胶带,就能把石墨片一分

复旦的新衣再登Nature!可穿戴技术领域新里程

  今天,一件来自中国的衣服登上了Nature。  没看出有什么特别?别眨眼,下一秒神奇的事情就发生了(注意那个手机)。    没错,这件衣服正在给手机无!线!充!电!  不是把充电宝缝进了衣服里,而是这件可以正常折叠、水洗的衣服,本身就是一块电池!  这项最新研究来自复旦大学彭慧胜教授团队,也是该

先发Nature-immunology-再登Molc-Cell-NIBS邵峰团队取得系列进展

  死亡受体信号传导对细胞死亡,炎症和免疫稳态至关重要。死亡受体信号通过跨膜死亡受体的肿瘤坏死因子受体(TNFR)家族的死亡域(DD)与下游衔接子(包括TNFR1相关死亡域蛋白(TRADD),受体相互作用的丝氨酸/)之间的同型或异型相互作用来介导。在被同源配体激活后,死亡受体包括FAS,TNF相关凋