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变性梯度凝胶电泳(DGGE)

简 介 这个方法是应用最早也是最常用的突变筛查方法之一,在过去的十年中经历了很大的改进,并被诊断室所广泛使用,最近有篇关于该问题的综述(Fodde>和 Losekoot 1994 年)。原 理 如果 DNA 双链分子全长不断增加温度或用化学变性剂处理,两条链就会开始分开(解链)。首先解链的区域由解链温度较低的碱基组成。 G.C 碱基对比 A.T 碱基对结合得要牢固,因此 G. C 含量高的区域具有较高的解链温度。同时影响解链温度的因素还有相邻碱基间的吸引力(称作“堆积”)。解链温度低的区域,通常位于端部称作低温解链区( lower melting domain )。如果端部分开,那么双螺旋就由未解链部分束在一起,这一区域便称作高温解链( high melting domain ) ( 图 1) 。如果温度或变性剂浓度继续升高,两条链就会完全分开。变性梯度凝胶电泳法依据首要的一点是: DNA 双链......阅读全文

PCR-DGGE实验原理和操作步骤

【实验目的】 1.了解PCR-DGGE技术的原理。 2.了解并熟悉PCR-DGGE技术的步骤。 【实验原理】 变性梯度凝胶电泳(DGGE)是一种根据DNA片段的熔解性质而使之分离的凝胶系统。核酸的双螺旋结构在一定条件下可以解链,称之为变性。核酸50%发生变性时的温度称为熔解温度(Tm

变性梯度凝胶电泳

变性梯度凝胶电泳(DGGE)             实验方法原理 1. 变性梯度凝胶电泳(DGGE)是一种根据DNA

变性梯度凝胶电泳

变性梯度凝胶电泳(DGGE)是一种根据DNA片段的熔解性质而使之分离的凝胶系统。(1)将凝胶设置在双重变性条件下,可以检测DNA分子中的任何一种单碱基的替代、移码突变以及少于10个碱基的缺失突变,被广泛应用于基因突变检测及相关研究。(2) 用于癌症和遗传病的筛查及诊断,而且,在癌症(残存性病灶、突变

知识分享:变性梯度凝胶电泳

  实验原理   DNA 双链分子在全长不断增加温度或用化学变性剂条件处理下,两条链就会开始分开(即解链)。首先解链的区域由解链温度较低的碱基组成。GC碱基对比AT碱基对结合得要牢固,因此GC含量高的区域具有较高的解链温度。同时影响解链温度的因素还有相邻碱基间的吸引力。解链温度低的区域,通常位于端

特异性位点的DNA甲基化的检测方法

相关专题1 甲基化敏感性限制性内切酶 (methylation-sensitive restriction Endonuclease,MS-RE)-PCR/Southern法这种方法利用甲基化敏感性限制性内切酶 对甲基化区的不切割的特性,将DNA消化为不同大小的片段后再进行分析。常使用的甲基化敏感的

常用的分子生物学基本技术

核酸分子杂交技术由于核酸分子杂交的高度特异性及检测方法的灵敏性,它已成为分子生物学中最常用的基本技术,被广泛应用于基因克隆的筛选,酶切图谱的制作,基因序列的定量和定性分析及基因突变的检测等。其基本原理是具有一定同源性的原条核酸单链在一定的条件下(适宜的温室度及离子强度等)可按碱基互补原成双链。杂交的

PCR技术在突变基因检测中的应用

基因突变(gene mutation)是遗传病和肿瘤发生的根本原因,检测与遗传病及恶 性肿瘤发生有关的突变基因(mutant gene)是分子生物学,医学遗传学及肿瘤学研究 的热点,它对阐明遗传病和肿瘤发生的分子生物学基础及其诊断和早期诊断具有重要 \意义,分子生物学技术的发展,尤其是PCR技术的出

PCR技术应用三:突变基因检测

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常用的分子生物学基本技术(二)

PCR-SSCP法 PCR-SSCP法是在非这性聚丙烯酰胺凝胶上,短的单链DNA和RNA分子依其大街基序列不同而形成不同构象,一个碱基的改变将影响其构象而导致其在凝胶上的移动速度改变。其基本原理为单链DNA在中性条件下会形成二级结构,这种二级结构依赖于其碱基组成,即使一个碱基的不同,也会形成不同的二

基因多态性的检测方法概述

多态性(polymorphism)是指处于随机婚配的群体中,同一基因位点可存在2种以上的基因型。在人群中,个体间基因的核苷酸序列存在着差异性称为基因(DNA)的多态性(gene polymorphism)。这种多态性可以分为两类,即DNA位点多态性(site polymorphism)和长度多态性

DGGE技术在微生物生态学中的应用

  在自然界中存在大量丰富的微生物资源,但目前被人们所培养利用的仅仅占1%~10%,还有大量的微生物没有被人们所了解和利用。随着基因组学在生物技术领域的不断发展,微生物基因组学的研究凭借基因组研究(TIGR)所利用鸟枪法成功地对流感嗜血菌(Haem ophilus influenzae)的全基因组序

基因多态性的检测方法

多态性(polymorphism)是指处于随机婚配的群体中,同一基因位点可存在2种以上的基因型。在人群中,个体间基因的核苷酸序列存在着差异性称为基因(DNA)的多态性(gene polymorphism)。这种多态性可以分为两类,即DNA位点多态性(site polymorphism)和长度多态性

CBS变性梯度凝胶电泳实验

【实验目的】掌握变性梯度凝胶电泳检测新的突变,以及测定高度多态基因的基因型的技术方法。【实验原理】在现代遗传学中DNA 序列突变的分析占有十分重要的地位。由于在较大DNA 序列中检测一个细微的突变非常困难,因而现在人们建立了几种方法来解决这一难题。变性梯度凝胶电泳(DGGE)能把

CBS变性梯度凝胶电泳DGGE 实验

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DGGE、CGGE和TGGE比较

  DGGE、CGGE和TGGE三种方法是基于相同的原理而设计的突变检测方法,它仍均是根据DNA的解链特性而设计。对于同一定序列组成或的DNA片段来说,它具有恒定的解链温度(Tm),但若其序列发生改变时,Tm值亦发生改变,在含有变性因素(变性剂,高温)的凝胶半进行电泳,当其比链解开形成分叉时,电泳迁

凝胶电泳仪产品应用

凝胶电泳被广泛用于分子生物学、遗传学和生物化学:1.大的DNA或者RNA分子通常利用琼脂糖凝胶电泳(agarose gel electrophoresis)分离,也可以使用聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)。2.蛋白质的凝胶电泳通常在加入十二烷基硫酸钠的聚丙烯酰胺凝胶中进行(SDS-PAGE),或者非变

凝胶电泳的基本原理及应用

  凝胶电泳的基本原理及应用凝胶电泳的原理比较简单。当一种分子被放置在电场当中时,它们就会以一定的速度移向适当的电极,这种电泳分子在电场作用下的迁移速度,叫做电泳的迁移率。它同电场的强度和电泳分子本身所携带的净电荷数成正比。也就是说,电场强度越大、电泳分子所携带的净电荷数量越多,

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试管婴儿植入前遗传学诊断单细胞PCR的方法(2)

7.等位基因特异性扩增 在设计引物时,根据已知突变位点的特征,在引物3’端或中间设计一错配碱基,使之仅能与突变型或野生型基因互补,而只扩增相对应的突变型或野生型基因。主要用于点突变导致的遗传病的检测。其优点是只需一步PCR,而无需电泳和标记,摆脱了分子生物学方法中必经电泳的现象。在相互竞争的突变

毛细管电泳法检测肺癌p53基因第七外显子的突变

作者:刘勇1,2 王荣*1,2 高 岚2 贾正平1 辛晓婷1,2 谢 华1 马 骏1   作者单位:1(兰州军区兰州总医院临床药理基地,兰州 730050) 2(兰州大学生命科学学院,兰州 730000) 【摘要】  p53基因点突变在肺癌的发生过程

DGGE,CGGE及TGGE 比较

DGGE,CGGE及TGGE三种方法是基于相同的原理而设计的突变检测方法,它仍均是根据DNA的解链特性而设计.对于同一定序列组成或的DNA片段来说,它具有恒定的解链温度(Tm),但若其序列发生改变时,Tm值亦发生改变,在含有变性因素(变性剂, 高温)的凝胶半进行电泳,当其比链解开形成分叉时,电泳迁移

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凝胶电泳技术的应用和基本原理

  凝胶电泳的原理比较简单。当一种分子被放置在电场当中时,它们就会以一定的速度移向适当的电极,这种电泳分子在电场作用下的迁移速度,叫做电泳的迁移率。它同电场的强度和电泳分子本身所携带的净电荷数成正比。也就是说,电场强度越大、电泳分子所携带的净电荷数量越多,其迁移的速度也就越快,反之则较慢。由于在电泳

DGGE,CGGE及TGGE 比较

DGGE,CGGE及TGGE三种方法是基于相同的原理而设计的突变检测方法,它仍均是根据DNA的解链特性而设计.对于同一定序列组成或的DNA片段来说,它具有恒定的解链温度(Tm),但若其序列发生改变时,Tm值亦发生改变,在含有变性因素(变性剂, 高温)的凝胶半进行电泳,当其比链解开形成分叉时,电泳迁移

常用的分子生物学基本技术(三)

DNA序列分析(DNA sequencing) 应用各种突变检测技术检测到的基因突变,最后都需用序列分析才能确定突变类型及突变位置,其效率可以达到100%。现在的测序方法已与经典的方法有了很大的不同,其基本原理虽仍是双脱氧终止法,但自动化程度大为提高,操作更简便,测序时间也大大缩短。随着PCR技术与

SNP检测方法、前景和问题

SNP 是指基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA 序列多态性,在群体中的发生频率不小于1 %。包括单个碱基的转换、颠换、插入和缺失等。所谓转换是指同型碱基之间的转换,如嘌呤与嘌呤( G2A) 、嘧啶与嘧啶( T2C) 间的替换;所谓颠换是指发生在嘌呤与嘧啶(A2T、A2C、C2G、G

动物细胞基因组DNA SNP的生物芯片检测-1

实验原理:1、SNP的概念及意义单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种。占所有已知多态性的90%以上。SNP在群体中的发生频率不小于1%。SNP在

重要转基因作物对农田生态系统的影响实验材料与方法

   1)土壤理化性质及微生物数量测定    土壤微生物(细菌、真菌和放线菌)数量测定采用稀释平板法;土壤酶活性指标测定参照关松荫(1986)《土壤酶及其研究方法》的方法进行。土壤脲酶活性的测定采用苯酚钠比色法;土壤磷酸酶活性的测定采用磷酸苯二钠比色

C.B.S变性梯度凝胶电泳DGGE 应用原理及注意事项

原理:变性梯度凝胶电泳(Denaturing Gradient Gel Electrophresis,DGGE)是一种实用价值较高研究DNA突变的分析方法。本质是一类电泳(电泳定义:带电颗粒在电场作用下,向着与其电性相反的电极移动,称为电泳(electrophoresis, EP)。利用

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