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cDNA宏阵列方法分离拟南芥的臭氧应答基因实验

实验步骤 ##一、 cDNA 宏阵列的样品制备培养基: I : 2 (V7 V ) Gamborg B5 培 养 基(GibcoBRL, Rockville, MD), I : 1000(V /V ) Hyponex肥 料(Hyponex 10 : 5 : 10; Hyponex Japan, Osaka, Japan), 1 % 鹿糖 ; pH调 至 5. 7。##二、 cDNA宏阵列探针制备(见注释 1〜4)1.4 mol/L 硫 氢 酸 胍(guanidium thiocyanate) 溶 液 : 4 mol/L 硫氧酸胍, 0 •1mol/LTris-HCl, p H 7. 5, l0mmol/L E D TA , 0 . 5 % 十二焼基肌氨酸钠, 0.1%β-疏 基 乙 醇2.酸 -氯 仿(Phenol-chloroform): 50%......阅读全文

植物生物学研究数据库

实验概要植物生物学研究数据库实验步骤http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home 英国 Top 植物种的snoRNA基因数据库。 综合 http://bioinformatics.psb.ugent.be/webt

cDNA宏阵列方法分离拟南芥的臭氧应答基因实验(二)

11.用 mRNA 纯 化 试 剂 盒(Amersham Biosciences, Piscataway, NJ) 将 Poly.(A )+ RNA从总R N A 中分离出来(见注释5)。####(2) c D N A 文 库 的 构 建1.取1. 5 〜7. 5 μg poly (A )<

cDNA宏阵列方法分离拟南芥的臭氧应答基因实验(二)

注意事项1.所有的试剂必须用电阻高于 17. 6 的双蒸水配制。2.提取 RNA 所用的玻璃器具必须于 180°C 烘烤至少 8 h 以灭活 RNase。除缓冲液外的所有溶液都要用 0 •1 % DEPC水 配 制(见注释 3)。 RNase 的污染主要来源于实验人员的手,所以进行 RN A 实验时

植物蛋白芯片的构建和抗原抗体相互作用的研究实验

实验材料:异丙基-β-D-硫代半乳糖苷试剂、试剂盒:PP 缓冲液                                  

植物蛋白芯片的构建和抗原抗体相互作用的研究实验

实验材料异丙基-β-D-硫代半乳糖苷试剂、试剂盒PP 缓冲液变性裂解缓冲液仪器、耗材微量滴定板实验步骤3.1 高通量蛋白的表达和纯化我们用在 PQE30 表达载体里构建的,可表达带 N 端 RGS-His6 标记的大肠杆菌 cDNA 表达克隆来生产重组植物蛋白。由于超出本章节的范围,我们不

植物蛋白芯片的构建和抗原抗体相互作用的研究实验

实验材料 异丙基-β-D-硫代半乳糖苷试剂、试剂盒 PP 缓冲液变性裂解缓冲液仪器、耗材 微量滴定板实验步骤 3.1 高通量蛋白的表达和纯化我们用在 PQE30 表达载体里构建的,可表达带 N 端 RGS-His6 标记的大肠杆菌 cDNA 表达克隆来生产重组植物蛋白。由于超出本章节的范围,

顶级实验室《Nature》发布表观基因组学图谱

  基因组中表观遗传变化是能遗传的,近期来自Salk生物学研究所等处的一组研究人员完成了一项野生植物表观基因组学全范围内的研究分析,从中发现了这种修饰与遗传信息相互作用的共同模式。这一成果公布在3月7日Nature杂志在线版上。   文章通讯作者是Salk研究所的著名教授Joseph R. E

酵母双杂是什么?

   酵母双杂交技术,它是通过利用转录激活因子GAL4的特性而建立的。GAL4由两个结构域组成,一个为N端的DNA结合域(DNAbinding domain,DBD),另一个是C端的转录激活域(active domain,AD),二者可以从核酸一级结构上分开而独立表达出有功能的结构域;当二者在物理空

什么是酵母双杂?

   酵母双杂交技术,它是通过利用转录激活因子GAL4的特性而建立的。GAL4由两个结构域组成,一个为N端的DNA结合域(DNAbinding domain,DBD),另一个是C端的转录激活域(active domain,AD),二者可以从核酸一级结构上分开而独立表达出有功能的结构域;当二者在物理空

通过cDNA宏阵列和基因表达谱检测环境毒物毒理效应实验

本章主要介绍如何通过制备和使用 cDNA 宏阵列来检测环境毒物对基因表达的影响,同时具体介绍实验所用到的材料与方法。由于一些非传统模式的物种研究购买不到商业化的芯片,应用本章讲述的方法,研究人员可以自行设计和使用适合自己实验目的的芯片。我们有意略去了实验中统计分析方面的内容,因为统计分析的方法仍有待

通 过 cDNA宏阵列和基因表达谱检测 环境毒物的毒理效应

实验步骤 一.材料 1.扩增和制备克隆 (1)甘 油 保 存 的E.coli, 质 粒 含 有 目 标 cDNA 插入片段。 (2)Tag 聚合酶和缓冲液(New Englang Biolabs cat. no. M0267

浙大周雪平、清华戚益军教授Cell子刊发表植物学新成果

2016年12月10日,国际学术权威刊物Cell出版集团旗下子刊《Molecular Plant》在线发表了浙江大学和清华大学合作的一项最新研究成果,题为“Turnip yellow mosaic virus P69 interacts with and suppresses GLK transcr

非损伤微测技术助力重金属转运体促植物Cd积累研究

NISC文献编号:C2017-029植物天然抗性巨噬细胞蛋白(Nramp)家族在重金属胁迫中起着重要的作用。然而,现有研究几乎没有发现Nramps在重金属富集植物 东南景天中的功能特征。2017年,中国林科院亚热带林业研究所卓仁英研究员课题组在Scientific Reports上发表了题目为“Se

基因芯片技术及其研究现状和应用前景

  生物芯片技术是随着"人类基因组计划"(human genome project, HGP)的进展而发展起来的,它是90年代中期以来影响最深远的重大科技进展之一,它融微电子学、生物学、物理学、化学、计算机科学为一体的高度交叉的新技术,具有重大的基础研究价值,又具有

基因芯片的制备、应用与前景

 摘要:基因芯片技术是90年代中期以来快速发展起来的分子生物学高新技术,是各学科交叉综合的崭新科学。其原理是采用光导原位合成或显微印刷等方法,将大量DNA探针片段有序地固化予支持物的表面,然后与已标记的生物样品中DNA分子杂交,再对杂交信号进行检测分析,就可得出该样品的遗传信息。基因芯片技术目前国内

生物芯片入门(五):应用

基因芯片技术及其研究现状和应用前景生物芯片技术是随着“人类基因组计划”(human genome project,HGP)的进展而发展起来的,它是90年代中期以来影响最深远的重大科技进展之一,它融微电子学、生物学、物理学、化学、计算机科学为一体的高度交叉的新技术,具有重大的基础研究价值,又具

基因芯片技术及其研究现状和应用前景

  摘要:基因芯片技术是90年代中期以来快速发展起来的分子生物学高新技术,是各学科交叉综合的崭新科学。其原理是采用光导原位合成或显微印刷等方法,将大量DNA探针片段有序地固化予支持物的表面,然后与已标记的生物样品中DNA分子杂交,再对杂交信号进行检测分析,就可得出该样品的遗传信息。基因芯片技术目前国

生物芯片入门(一):生物芯片及应用简介

生物芯片(biochip)是指采用光导原位合成或微量点样等方法,将大量生物大分子比如核酸片段、多肽分子甚至组织切片、细胞等等生物样品有序地固化于支持物(如玻片、硅片、聚丙烯酰胺凝胶、尼龙膜等载体)的表面,组成密集二维分子排列,然后与已标记的待测生物样品中靶分子杂交,通过特定的仪器比如激光共聚焦扫描或

遗传发育所谢旗研究员到版纳植物园进行学术交流

  1月18日,中国科学院遗传与发育生物学研究所谢旗研究员到版纳植物园进行学术交流,并作了题为A mobile C2-domain protein confers salt tolerance in plant 的报告。   谢旗研究员介绍了以小盐芥为材料开展的相关研究工作。从小盐芥

OsAGAP在拟南芥中的功能分析

实验概要本实验对水稻小G蛋白ArfGTPase激活蛋白OsA GAP在拟南芥中的功能进行了分析,首先构建了OsAGAP在拟南芥中的正义表达载体,利用农杆菌介导的真空抽滤法转化拟南芥,筛选拟南芥阳性苗,然后用组织PCR和 Southern杂交做了检测。实验材料1. 所用拟南芥((Arabidopsis

浙江科学家成功克隆竹子部分成花基因

浙江林学院研究人员经过10多年研究,日前成功克隆到竹子的部分成花基因,在探究竹子开花奥秘的道路上迈出了重要一步。 竹子开花问题是竹子研究领域的世界性难题。竹子的开花周期可长达60年至120年,且难以预测,使得竹子的分类和杂交育种工作难以有效开展。另一方面,竹子一开花就意味着死亡,弄清竹子开花机理可

单细胞分离和鉴定系统在清华大学投入使用

  2014年2月,由美国FLUDIGM公司生产的C1™ 单细胞全自动制备系统和BioMark™ HD基因分析系统正式在清华大学基因组与合成生物学平台启用。   C1™ 单细胞全自动制备系统基于Fluidigm创新的微流体技术,能够让研究者们快速可靠地分离单个细胞并进行基因组分析。前所未有

利用植物蛋白质芯片研究蛋白磷酸化实验

实验材料异丙基 β-D-硫代半乳糖苷试剂、试剂盒非变性裂解液非变性洗涤液非变性洗脱液苯甲基磺酰氟仪器、耗材超声匀浆器聚丙烯柱实验步骤3.1 非变性条件下重组激酶的纯化用于磷酸化筛选的激酶必须是可溶和有活性的,且无其他激酶参杂的纯化激酶。因此,我们可以从 cDNA 表达文库中,大量生产和纯化组氨酸标记

利用植物蛋白质芯片研究蛋白磷酸化实验

实验材料 异丙基 β-D-硫代半乳糖苷试剂、试剂盒 非变性裂解液非变性洗涤液非变性洗脱液苯甲基磺酰氟仪器、耗材 超声匀浆器聚丙烯柱实验步骤 3.1 非变性条件下重组激酶的纯化用于磷酸化筛选的激酶必须是可溶和有活性的,且无其他激酶参杂的纯化激酶。因此,我们可以从 cDNA

利用植物蛋白质芯片研究蛋白磷酸化实验

实验材料:异丙基 β-D-硫代半乳糖苷        试剂、试剂盒:非变性裂解液                          

TLP基因的表达模式分析

实验概要本实验对水稻、拟南芥及杨树的TLP基因表达模式进行了分析,为进一步研明植物中TLP基因的功能奠定基础。实验步骤1. 水稻TLP基因的RT-PCR分析   1) 植物材料选取水稻的根、茎、叶、花和种子的新鲜组织用于RNA的提取。水稻材料采集后,用液氮速冻,以保证RNA不被降

RT-PCR实验方法

RT-PCR定义:是指对组织或细胞的总RNA进行抽提,把RNA反转录为cDNA,然后设计目的基因引物进行PCR,琼脂糖电泳并数码拍照,分析电泳条带灰度值,判断目的基因mRNA转录水平的相对量的变化。 RT-PCR流程简介 一、抽提RNA: 1、防止RNA酶污染 180℃的高温下

cDNA宏阵列方法分离拟南芥的臭氧应答基因实验(一)

除 cDNA 微阵列外,基于尼龙膜支持物的 cDNA 宏阵列方法是又一被广泛应用的大规模基因表达数据的收集方法。从新基因的发现到基因表达谱的分析, cDNA 宏阵列被应用于分子生物学研究领域的各个方面。尽 管 cDNA 宏阵列的点阵密度低于微阵列,但由于应用灵敏度较高的同位素标记的 cDNA 探针,

一种无酚/无氯仿组织研磨从热带木本植物中提...(一)

一种无酚/无氯仿组织研磨从热带木本植物中提取核酸的方法概述:木本热带植物中含有大量复杂的有机化合物,这些有机化合物会抑制提取RNA或DNA所需的化学程序,从而不利于后续研究及应用,如RNA测序和基因表达分析。为了克服这个问题,研究人员必须使用CTAB / PVP缓冲液的提取方案,而不能使用市售的

DNA微阵列技术介绍及其应用

DNA微阵列技术(microarray)指在固体表面(玻璃片或尼龙膜)上固定成千上万DNA克隆片段,人工合成的寡核苷酸片段,用荧光或其他标记的mRNA,cDNA或基因组DNA探针进行杂交,从而同时快速检测多个基因表达状况或发现新基因,快速检测DNA序列突变,绘制SNP遗传连锁图,进行DNA序列分析等