解决荧光定量PCR引物探针问题
荧光实时定量 PCR 技术 (real-time quantitative PCR，qPCR) 几乎是现代分子生物学技术中最重要、应用最广泛的核酸定量检测技术。成功的定量 PCR 实验离不开精准的实验设计和操作流程。 实时荧光定量 PCR 分析的部分实施需要经过优化以确保所有反应参数均设置精确，从而获得准确的结果。常见荧光定量 PCR 困难包括引物、探针、反应抑制和软件分析等几个方面，本篇主要为大家分享引物和PCR探针方面的经验。 引物二聚体 引物二聚体的形成是最常见的问题之一。引物对之间的部分序列存在同源性时，可形成引物二聚体。如果在 PCR 反应过程中引物退火形成二聚体，则 Taq DNA 聚合酶可延伸二聚体，形成长于原始引物的产物，它可导致循环过程中更易出现退火错误。 Q：引物二聚体会引发什么问题？ &nbs......阅读全文
解决荧光定量PCR引物探针问题
荧光实时定量 PCR 技术 (real-time quantitative PCR，qPCR) 几乎是现代分子生物学技术中最重要、应用最广泛的核酸定量检测技术。成功的定量 PCR 实验离不开精准的实验设计和操作流程。 实时荧光定量 PCR 分析的部分实施需要经过优化以确保所有反应参数均设置精确
荧光定量PCR引物探针的设计总体原则
1. 先选择好探针，然后设计引物使其尽可能的靠近探针。 2. 所选序列应该高度特异，尽量选择具有最小二级结构的扩增片段——这是因为二级结构会影响反应效率，而且还会阻碍酶的扩增。建议先进行二级结构检测，如果不能避免二级结构，那么就要相应提高退火温度。 3. 扩增长度应不超过400bp，理想
荧光实时定量PCR引物设计
靶的选择和试验设计1.针对目的基因序列选择合适的扩增片断查看以下三个网站是否有合适的已经证实的QRT-PCR的扩增引物,探针以及反应条件.RTPrimerDB (http://medgen.ugent.be/rtprimerdb), 相对物种较多PrimerBank (http://pga.mgh.
荧光实时定量PCR引物设计
靶的选择和试验设计 1.针对目的基因序列选择合适的扩增片断 查看以下三个网站是否有合适的已经证实的QRT-PCR的扩增引物,探针以及反应条件. RTPrimerDB (http://medgen.ugent.be/rtprimerdb), 相对物种较多 PrimerBa
荧光实时定量PCR引物设计
靶的选择和试验设计 1.针对目的基因序列选择合适的扩增片断 查看以下三个网站是否有合适的已经证实的QRT-PCR的扩增引物,探针以及反应条件. RTPrimerDB (http://medgen.ugent.be/rtprimerdb), 相对物种较多 PrimerB
普通pcr引物设计和荧光定量pcr引物设计的区别
一、方法不同1、普通pcr引物设计：引物的优劣直接关系到PCR的特异性与成功与否。2、荧光定量pcr引物设计：通过荧光染料或荧光标记的特异性探针，标记跟踪PCR产物进行实时监测反应，利用与之相适应的软件对产物进行分析，计算待测样品模板的初始浓度二、原理不同1、普通pcr引物设计：为了找到一对合适的核
双重荧光定量PCR探针荧光基团该怎么选择
有干扰的话，在仪器上面就可以看出来，比如说，FAM和VIC，FAM有信号，单独看VIC也肯定有信号，只是低点而已
探针法荧光定量pcr－荧光值要达到多少
定量PCR有绝对定量跟相对定量，绝对定量就是先用已知浓度的质粒浓度梯度(1.00E+07、1.00E+06、1.00E+05、1.00E+04、1.00E+03)制作标准曲线，然后通过做Real-timePCR的CT值计算出其表达量;相对定量是比较管家基因(GAPDH)与目的基因的CT值，得出各标本
实时荧光定量－PCR－所用荧光探针及功能介绍
应用于实时定量 PCR 检测体系中的荧光探针主要有两种:一种是 TaqMan 探针,一种是分子信标探针。Tyagi 和 Krammer(1996)首次建立了分子信标探针,在同一寡核苷酸探针的5'端标记荧光素、3'端标记淬灭剂(DABCYL)分子信标探针能形成发夹结构,探针的噜扑环(L
荧光定量PCR引物的设计原则与方法
实时荧光定量PCR是一种在DNA扩增反应中，以荧光化学物质测每次聚合酶链式反应（PCR）循环后产物总量的方法。通过内参或者外参法对待测样品中的特定DNA序列进行定量分析的方法。 实时荧光定量PCR是实验室最常用的实验。研究基因在mRNA表达水平,以及验证基因敲除后下游靶基因变化情况等等。对于新
荧光定量pcr常见问题的原因与解决方案
1.扩增产物大小不合适：实时荧光定量PCR扩增片段的长度通常在80-150 bp之间，如果调整反应的时间有可能扩增500bp的片段。 2.PCR反应过程中退火及延伸的时间过短或过长：应根据扩增片段的大小予与调整。 3.MgCl,浓度不合适：按0. 5mm的间距调整MgCI2的浓度。
PCR仪关于引物的问题及解决办法？
1. 应该选择哪种纯化方法? 取决于实验目的和引物的长度 2. 为什么我订购了50nmol,但是收到却只有40nmol? 50nmol是起始量 3. 怎样制备100μM的储液? 体积(μl)=质检报告上的nmol数目×10 4. 怎样设计引物? *一般长度20-30bp； *至少
详细解析实时荧光定量PCR探针法技术原理
目前主流的实时荧光定量PCR （Quantitative Real-time PCR）方法分为染料法和探针法，染料法以SYBR Green法为代表，SYBR Green染料游离时荧光微弱，但但一旦与双链DNA结合后，荧光大大增强，反应管中的荧光强度与反应管中双链DNA的数量成正比例关系，因此荧光定量
新型冠状病毒荧光PCR引物探针设计之我见（一）
新型冠状病毒疫情爆发以后，早期诊断成为控制疫情的关键，而荧光PCR技术成为首选的初筛检测手段。目前核酸检测率只有30-40%，使得检测试剂盒的灵敏度备受关注。本期推荐林镜中博士从引物探针设计的角度对试剂盒灵敏度的分析，以飨读者。一、前言新型冠状病毒疫情爆发以后，早期诊断成为控制疫情的关键，而荧光PC
新型冠状病毒荧光PCR引物探针设计之我见（二）
1、引物探针的位置引物探针的设计原则中，最重要的是要避免假阴性（漏检），同时保证特异性（避免假阳性），所以要选择组内（需要检出的序列）保守（即尽量避开突变或采用简并序列）、组间（对照序列）特异的区域。此外，为了获得最佳的扩增效果，还应尽量满足表1中的基本要求。用SARS和蝙蝠CoV的N基因序列作为对
新型冠状病毒荧光PCR引物探针设计之我见（三）
4、二聚体设计时通常将二聚体（自身二聚体或配对二聚体）控制在dG>-5.0kc/m, 最好dG>-3.6 kc/m。从图8显示的三套引物探针的自身二聚体可见，第二套的探针具有一个非常稳定的自身二聚体（dG=-13.1kc/m），第二套的上游引物N2F有一个稳定的自身二聚体（dG=-9.3k
关于荧光定量PCR的CT值问题
如果有标准曲线，按照标准曲线计算。一般都是相对量。则用delta delta CT方法来计算。举例如下：对照组基因A的CT值为20， 内参（比如βactin)CT值15。实验组基因A CT值18，内参CT值14。首先算加样量：delta CT=15-14=1。2的1次方是2。也就是说实验组的加样量是
实时定量PCR探针概述
实时定量PCR (qPCR)的优势•实时检测PCR反应过程•精确计算出每个循环的PCR产物量•扩增和检测同时进行•消除后续PCR的干扰在实时定量PCR反应中，杂交探针与插入染料如SYBR Green相比是更好的选择。荧光标记探针可以提高实时定量PCR结果的效率、灵敏度和特异性。而且定量PCR可以在一
定量PCR仪引物长度设定
① 引物长度 一般引物长度为18~30碱基。总的说来，决定引物退火温度（Tm值）最重要的因素就是引物的长度。有以下公式可以用于粗略计算引物的退火温度。 在引物长度小于20bp时：[4(G+C)+2(A+T)]-5℃ 在引物长度大于20bp时：62.3℃+0.41℃(%G-C)-
定量PCR仪引物长度设定
① 引物长度 一般引物长度为18~30碱基。总的说来，决定引物退火温度（Tm值）最重要的因素就是引物的长度。有以下公式可以用于粗略计算引物的退火温度。 在引物长度小于20bp时：[4(G+C)+2(A+T)]-5℃ 在引物长度大于20bp时：62.3℃+0.41℃(%G-C)-
荧光定量PCR对肠道乳酸杆菌的定量问题
我个人理解是重组质粒应该是将16s rDNA的序列重组到某质粒上，然后根据质粒的量来计算质粒的拷贝数作为标准品，这种标准品有些是有商业化的，并不是你所谓的在基因组中是否是单拷贝，我们实验室的标准品都是这么来的，没有用细菌的基因组DNA做过标准品。
定量PCR常见问题及解决方法
Q1．CT值出现过晚1.扩增效率低，反应条件不够优化。设计更好的引物或探针；改用三步法进行反应；适当降低退火温度；增加镁离子浓度等。2.PCR各种反应成分的降解或加样量的不足。3.PCR产物太长。一般采用80-150bp的产物长度。Q2．无CT值（信号）出现1.反应循环数不够。一般都要在35个循环以
荧光定量PCR
荧光定量PCR( realtime fluorescence quantitative PCR，RTFQ PCR) 是1996 年由美国Applied Biosystems 公司推出的一种新定量试验技术，它是通过荧光染料或荧光标记的特异性的探针，对PCR产物进行标记跟踪，实时在线监控反应过程，结
荧光定量PCR技术的荧光定量PCR的方法
接下来我们就来了解一下荧光定量的主要方法，我们如何选择合适的方法？荧光定量PCR所使用的荧光化学可分为两种：荧光探针和荧光染料。而荧光定量 PCR 的方法相应的可分为特异类和非特异类两类，特异性检测方法是在PCR反应中利用标记荧光染料的基因特异寡核苷酸探针来检测产物；而非特异性检测方法是在在PCR反
实时荧光定量PCR仪【实时荧光定量PCR仪】
【FT-PCR】实时荧光定量PCR仪【实时荧光定量PCR仪】_风途厂家_Kgaoletšo ya dikarolo tše bopago seswantšho tša kgole ya PCR 具体来讲扑杀无害化处理染疫动物，禁止泔水饲喂生猪，加强生猪养殖运输屠宰等各个环节的清洗和消毒，包括养
讲解7500荧光定量PCR仪常见问题
打怪升级的不败经验在于“储备”，储备技能和能量，从容应对每一个遇到的挑战。就像解决荧光定量PCR仪常规问题一样，学几招，也许在某一刻就是你需要的，先储备起来吧！Q ：7500快速定量PCR仪可以使用0.2ml PCR反应管或者96孔板吗？A：不可以，7500 快速定量PCR仪只支持0.1ml PC
荧光定量PCR检测试剂盒简述荧光探针法的应用
荧光定量PCR检测试剂盒简述荧光探针法的应用荧光定量PCR检测试剂盒的原理在于PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针，该探针为一寡核苷酸，两端分别标记一个报告荧光基团和一个淬灭荧光基团。探针完整时，报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收；刚开始时, 探针结合在DNA任意一条单链上;P
荧光定量pcr原理
荧光定量pcr原理如下：荧光定量PCR（Real-time PCR），是指在PCR扩增反应体系中加入荧光基团，通过对扩增反应中每一个循环产物荧光信号的实时检测,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。以探针法荧光定量PCR为例：PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针，该探针两
实时荧光定量PCR
Real Time PCR实时荧光定量PCR 其定量的基本原理是在 PCR 反应体系中加入非特异性的荧光染料（如： SYBR GREEN I ）或特异性的荧光探针（如： Taqman 探针），实时检测荧光量的变化，获得不同样品达到一定的荧光信号（阈值）时所需的循环次数： CT 值（ Cycle
关于荧光定量PCR
实时荧光定量PCR （Quantitative Real-time PCR）是一种在DNA扩增反应中，以荧光化学物质测每次聚合酶链式反应（PCR）循环后产物总量的方法。通过内参或者外参法对待测样品中的特定DNA序列进行定量分析的方法。 Real-timePCR是在PCR扩增过程中，通过荧光信号