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ncRNAUICLM通过ceRNA机制调控结直肠癌的肝转移

中山大学附属肿瘤医院院长、主任医师徐瑞华教授长期从事消化道肿瘤个体化治疗领域及抗癌药物研究,在消化道肿瘤的转移与转归、化疗药物耐受及其机制和优化临床治疗方面具有国际领先的创新性成果。近期,该课题组应用Arraystar lncRNA芯片在肝转移的结直肠癌组织中分析了lncRNAs的表达情况。课题组筛选到与结直肠癌肝转移显著相关的lncRNA UICLM,并阐明了lncRNA UICLM在结直肠癌肝转移中的功能和调控机制。该研究成果于2017年发表在国际著名学术期刊Theranostics(IF = 8.766)上。(芯片实验由康成生物提供技术服务)研究背景 结直肠癌(CRC)是世界上第二大常见和第三大引起死亡的恶性肿瘤疾病。尽管近年来CRC的治疗已取得了巨大的进展,但是效果还不尽人意。CRC晚期会发生肿瘤转移,其中最常见的是肝转移。肝转移患者预后非常差,生存率很低。长链非编码RNAs(lncRNAs)是一类长度大于200nt的转......阅读全文

SCI文章解析lncRNA UICLM通过ceRNA机制调控结直肠癌的肝转移

   中山大学附属肿瘤医院院长、主任医师徐瑞华教授长期从事消化道肿瘤个体化治疗领域及抗癌药物研究,在消化道肿瘤的转移与转归、化疗药物耐受及其机制和优化临床治疗方面具有国际领先的创新性成果。近期,该课题组应用Arraystar lncRNA芯片在肝转移的结直肠癌组织中分析了lncRNAs的表达情况。课

江南大学Nature子刊解析促癌lncRNA

  最近的初步研究报道了长非编码RNA——UCA1在结直肠癌中的促癌作用。然而,UCA1在结直肠癌中的功能和分子机制,仍然不明确。4月5日,Nature子刊《Scientific Reports》在线刊登了江南大学附属医院、苏州大学第二附属医院和复旦大学上海医学院的一项最新研究成果,题为“LncRN

基金委与NIH生物医学合作项目初审结果发布

  经公开征集,2016年度国家自然科学基金委员会(NSFC)与美国国立卫生研究院(NIH)生物医学合作研究项目共接收项目申请183项,根据双方项目指南的要求和相关规定,予以受理以下158个项目申请。#科学部编号项目名称申请人单位名称18161101162吲哚胺-2,3-双加氧酶IDO在HIV-1感

LncRNA:从“转录噪声”到科研高地的逆袭

  2002年日本学者Okazaki在对小鼠cDNA文库进行测序时,第一次发现并鉴定了一类较长的转录产物,并将其命名为长链非编码RNA,也就是我们所知的LncRNA。然而在这种非编码RNA被发现后的很长时间里,由于它不参与蛋白质的编码,当时认为不具有生物学功能,科学家们都普遍认为lncRNA仅仅是基

Nat Rev Genetics | 环状RNA的合成与功能

  环状RNA(circular RNA,circRNA)是一种新兴的内源性非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA),是继microRNA (miRNA)以及long noncoding RNA (IncRNA)后非编码RNA家族中极具研究潜力的新成员。越来越多的研究表明,环状RNA具

锐博生物:环状RNA研究的方法及功能作用介绍

  锐博生物:环状RNA—隐秘的未知RNA平行宇宙   环状RNA,被喻是隐秘的未知RNA平行宇宙。最近,复旦大学的郑秋鹏博士(2016交流会嘉宾之一)以第一作者身份在Nature Communications上发布了他们关于circHIPK3的最新研究成果。现在就和小编一起来学习circRNA的

一文速览丨2019年曹雪涛团队在Science,PNAS发表成果盘点

  2019年,曹雪涛团队在Science,Nature Immunology,PNAS 等杂志上发表了13篇重要研究成果,在免疫学领域取得重大进展,iNature系统盘点一下曹雪涛团队的研究成果:  【1】干扰素-γ(IFN-γ)对于细胞内细菌固有的免疫反应至关重要。 非编码RNA和RNA结合蛋白

新发现抗生素先导物可通过核糖开关抑制细菌生长

  在筛选一种可阻断细菌生物合成通路的化合物时,研究人员发现了一种抗生素先导物,它以调控RNA结构中的分子交换位点为靶标,使病原体停止生长。  1940-1960年是发现抗生素的黄金时代,而Selman Waksman的研究则宣告了这一时代的到来。这位生物化学家兼微生物学家创造了“antibioti

核仁小RNA(snoRNAs)的功能及其在癌症研究中的作用介绍

  核仁小RNA(snoRNAs)是一类中等长度的非编码小RNA,它们的长度在60-300nt不等,能与核仁核糖核蛋白结合形成snoRNPs 复合物[1]。在脊椎动物中编码核仁小RNA的基因主要存在于蛋白编码基因或非蛋白编码基因的内含子区域,并且经过进一步的转录后加工处理形成成熟的核仁小RNA[2]

PNAS:天然免疫白细胞介素12表达调控的表观机制

  中国医学科学院基础医学研究所免疫学系暨医科院免疫治疗研究中心曹雪涛院士课题组对天然免疫反应中白细胞介素12(IL-12)的选择性表达机制进行研究,发现巨噬细胞中核定位的碳酸酐酶6B(CA-VI B)促进IL-12表达的新型表观调控机制。  相关论文以“Nuclear carbonic an-hy

出人意料的新才能:非编码RNA

  在《来自基因组暗物质的lncRNA、ciRNA和miRNA》一文中我们提到:人类基因组中也存在大量被称为基因组“暗物质(dark matter)”的非编码序列,包括基因间非编码序列、内含子非编码序列等。所谓基因组“暗物质”,其实就是基因组中的非编码RNA——不包含用于制造蛋白质的版图,构成了超过

刘默芳组:LARP7介导U6修饰及在生精细胞mRNA精准剪接功能

  在较高等的真核生物中,大部分基因都含有内含子,在转录完成后需经过剪接(splicing)从mRNA前体移除内含子,以产生成熟、有翻译活性的mRNA,这个过程由剪接体(spliceosome)催化完成。经典的剪接体包括五种snRNA(small nuclear RNA),即U1、U2、U4、U5和

核仁小RNA的功能及其在癌症研究中的作用(二)

snoRNAs在癌症中的作用snoRNAs参与的癌症的分子病理学研究snoRNAs在癌症中的作用起始于一项研究:在脑膜瘤中,与正常脑组织相比snoRNAs的表达大幅下调[20]。最近研究发现,在非小细胞肺癌中多种snoRNAs呈现出不同的表达状态[21]。其它的研究证明snoRNAs U50

基因芯片技术的应用和发展趋势

随着基因芯片技术的日渐成熟, 在功能基因组、疾病基因组、系统生物学等领域中得到了广泛的应 用, 已经发表了上万篇研究论文, 每年发表的论文呈现增长的趋势. 芯片制备技术极大地推进了生物芯片的发展, 从实验室手工或机械点制芯片到工业化原位合成制备,&n

tRF&tiRNA:为什么以及如何研究它们?

  概述    转运RNA (tRNA)是一种参与解码mRNA、翻译蛋白质的接头分子。近年来的研究表明tRNA还能作为小非编码RNA (sncRNA)的主要来源之一,具有独特且多样的功能1。这些tRNA来源的ncRNA并非随机降解的产物,而是通过精确的生物发生过程产生的 (图.1) 。源自tRNA

tRF&tiRNA:为什么以及如何研究它们?

   转运RNA (tRNA)是一种参与解码mRNA、翻译蛋白质的接头分子。近年来的研究表明tRNA还能作为小非编码RNA (sncRNA)的主要来源之一,具有独特且多样的功能1。这些tRNA来源的ncRNA并非随机降解的产物,而是通过精确的生物发生过程产生的 (图.1) 。源自tRNA的ncRNA

中国科技大学Nature子刊聚焦环状RNA

  来自中国科技大学、华中师范大学等处的研究人员报告称,他们鉴别出了一类与RNA聚合酶Ⅱ相关的环状RNA(circRNAs),将之命名为外显子-内含子circRNAs(EIciRNAs)。并证实这些EIciRNAs调控了细胞核中的转录。这些研究成果在线发表在2月9日的《自然结构与分子生物学

LncRNA:从分子调控到临床应用的最新成果

  2009年,随着非编码RNA(ncRNA)研究进展的深入,一类新的ncRNA分子—lncRNA掀起科学界的热点话题,并逐渐成为分子生物学及临床医学研究的重要方向。康成生物与美国Arraystar公司合作,利用Arraystar LncRNA系列芯片平台,率先开展lncRNA表达筛查服务。Arra

LncRNA:从分子调控到临床应用的最新成果

  2009年,随着非编码RNA(ncRNA)研究进展的深入,一类新的ncRNA分子—lncRNA掀起科学界的热点话题,并逐渐成为分子生物学及临床医学研究的重要方向。康成生物与美国Arraystar公司合作,利用Arraystar LncRNA系列芯片平台,率先开展lncRNA表达筛查服务。Arra

Genome Research丨lncRNA在精子发生过程中的关键作用

  Genome Research丨lncRNA在精子发生过程中发挥重要作用   一直被很多科学家认为是真核生物基因组进化中“垃圾”信息的非编码RNA(ncRNA),既不编码蛋白质,又缺乏生物学功能的遗传学证据,近几年得到了“平反”,越来越多的研究表明ncRNA 在剂量补偿效应(Dosage co

ncRNA在精子发生过程中的关键作用研究

Genome Research丨lncRNA在精子发生过程中发挥重要作用一直被很多科学家认为是真核生物基因组进化中“垃圾”信息的非编码RNA(ncRNA),既不编码蛋白质,又缺乏生物学功能的遗传学证据,近几年得到了“平反”,越来越多的研究表明ncRNA 在剂量补偿效应(Dosage comp

曹雪涛团队再发Nature——揭示新型非编码RNA调控网络

  先天性免疫反应可保护宿主免受病原体感染,并向病原体施加进化压力,以减弱这些反应并确保其存活和复制的策略。这些不断变化的压力导致了跨宿主-病原体相互作用的先天性免疫稳态的复杂机制,但尚未得到全面了解。尤其是,更好地了解控制宿主与病原体相互作用并促进入侵病原体清除或逃逸的调节剂,可以确定传染病和慢性

Nature子刊:非编码RNA癌症药物基因组图谱新突破

  近日,匹兹堡大学药物遗传研究中心的杨达和张敏课题组借力于一种名为弹性网络回归(Elastic Net regression)的机器学习模型,从1,001个肿瘤细胞系的高通量长非编码RNA表达谱(long noncoding RNAs, lncRNAs)与265种抗癌药物敏感性数据中,挖掘出了27

Cell:小分子RNA的大作用

  所有有性繁殖多细胞生物体都依赖于卵子来支持早期的生命。加州大学圣地亚哥医学院及Ludwig癌症研究所的研究人员利用微小线虫作为模型,更好地了解了卵子仅借助于已存在的物质实现胚胎发育的机制。发表在3月24日《细胞》(Cell)杂志上的这项研究,揭示出了小分子RNA(Small RNAs)和辅助蛋白

Pacbio单分子实时测序技术于药用植物基因组研究应用

  药源短缺成为限制临床治疗和新药研发的最大瓶颈,因此,开发新的药物来源途径是迫切需要解决的问题。利用现代生物技术和次生代谢工程手段是未来生产药物最有潜力的发展方向。我国药用植物有1 万多种,大多数药用植物遗传背景不清楚,基因组信息缺乏,遗传信息和功能基因的研究亦极为薄弱。例如人参属(Panax)

水生所非编码RNA分子机制研究取得进展

  非编码RNA(non-coding RNA, ncRNA)是指不能编码产生蛋白质的RNA分子,种类众多。具有调控作用的非编码RNA包括微小RNA(miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)以及环状RNA(circRNA)等。越来越多的研究表明,非编码RNA具有重要且复杂的生物学功能

非编码RNA(ncRNA)在前列腺癌发生发展中的作用机制

  人类基因组计划的研究结果显示, 仅有2.5万~3万个蛋白质编码基因, 占总基因组序列不到3%, 其余基因组序列转录产生的RNA都是非编码RNA(non-coding RNA, ncRNA). ncRNA与恶性肿瘤发生发展关系密切. 近年来, 关于ncRNA中的长链非编码RN(lncRNA)以及环

四川农大BMC发表lncRNA新成果

  在过去的几年里,长非编码RNAs(lncRNAs)已经得以广泛研究。有研究已在小鼠、大鼠和人类中鉴定了大量的lncRNAs,其中一些已被证明在肌肉发育和生成过程中起着重要的作用。然而,对于覆盖家畜骨骼肌所有发育阶段的lncRNAs的特性,报道还较少。  8月22日,四川农业大学动物科技学院的研究

Nature杂志3月必看的亮点研究,你都看了么?

  一转眼3月即将结束,那么3月Nature有什么亮点研究呢?下面小编为大家盘点了本月Nature杂志的亮点文章,以飨读者。  【1】Nature:重磅!发现CD4 T细胞HIV病毒库的标志物---CD32a  doi:10.1038/nature21710.  在一项新的研究中,法国研究人员发现一

南京医科大学最新文章:癌细胞中的RNA表达模式

  系统生物学认为, 生命体是一个复杂的动态变化网络, 对于生命的研究需要从整体出发, 研究生命网络中的这些复杂的相互作用和调控关系, 而不是仅孤立地研究各个网络中的节点。近期针对非编码RNA,来自南京医科大学的研究人员进行了深入探索,旨在构建全基因组水平编码-非编码 RNA调控网络, 探讨 ncR