德科学家义举:序列上网免费下载

西伯利亚的丹尼索瓦洞。 德国研究人员于2月7日在马普学会进化人类学研究所网站上贴出了一个灭绝人类基因组的首个高分辨率版本。他们的目标就是让同行能够免费下载最完整的序列数据。 1年前,研究人员公布了至少3万年前生活在西伯利亚丹尼索瓦洞中的一名史前女孩的首张基因组草图。 今年1月,马普学会的古基因学家Svante Paabo在瑞典参加一次会议时注意到,其他实验室的研究人员还在关注这个1年前发布的序列数据,而与他的同事在实验室用更灵敏的新方法对序列的古DNA进行分析后得出的结果相比,前者远不是那么完整。Paabo说:“在得知我们已经拥有了相同基因组的更佳版本,并且他们要再过几个月才能够使用时,我感到很难受。” 因此,Paabo及其同事决定允许他们的同行下载该序列数据的高分辨率版本——尽管他们正在准备发表一篇有关该基因组研究的论文。利用从史前女孩的手指骨中提取的不足10毫克的DNA,研究小组......阅读全文

基因组序列草图的概念

中文名称基因组序列草图英文名称draft genome sequence定  义已测定序列占到90%以上、测序精度在1%的基因组序列图。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)

解析现代月季基因组序列

科学家研究现代月季基因。图片来源:monticelloshop.org 近日,法国农业科学研究院、里昂大学、法国国家科学研究中心的研究人员解密了现代月季的基因组序列。现代月季拥有独特的颜色与香味,广受称赞,这项研究帮助人们从分子角度了解这背后的基因和代谢流程。4月30日,相关论文在线刊登于《自然

首次测定玉米蛇基因组序列

  在现有的5000种哺乳动物中,有超过100种已经进行了基因组测序,但是,只有9种爬行动物(在10000个物种当中)的基因组对科学界来说是可用的。最近,瑞士日内瓦大学(UNIGE)的一个研究小组,构建了一个大的数据库,其中就包括一种爬行动物——玉米蛇的新基因组测序,这种蛇越来越多地被用来了解爬行动

概述酿酒酵母的基因组序列

  1996年6月,在国际互联网的公共数据库中公布了酿酒酵母的完整基因组顺序,它被称为遗传学上的里程碑。因为首先,这是人们第一次获得真核生物基因组的完整核苷酸序列;其次,这是人们第一次获得一种易于操作的实验生物系统的完整基因组。 [10]  在酿酒酵母测序计划开始之前,人们通过传统的遗传学方法已确定

前导序列

中文名前导序列外文名leader sequence前导序列是结构基因中编码区之前的一段序列,这部分序列能被转录,但不被翻译,在mRNA是从5′端起至结构基因第一编码子开始点(通常 AUG)为止,在蛋白质合成过程中不被翻译。

胡萝卜基因组序列草图成功绘出

  来自美国的一个研究小组称,他们完成了对30余种胡萝卜样品的测序,绘制出了胡萝卜基因组序列草图。这很可能是迄今最完整的蔬菜基因组序列草图。研究人员称,这一研究阐明了胡萝卜的起源和演化过程,对改善胡萝卜和其他农作物的营养价值提供了可能。相关论文在线发表在《自然·遗传学》杂志网站上。   胡萝卜和生菜

新软件按需组装无缝基因组序列

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494014.shtm 科技日报北京2月16日电 (记者张梦然)美国国立卫生研究院研究人员发布了一种创新的软件工具,用于组装来自各种物种的真正完整(即无缝)的基因组序列。这种名为Verkko的软件在芬兰

-震惊!Genbank参考基因组序列多处错误!

 震惊!Genbank参考基因组序列多处错误!   随着基因组测序技术的飞速发展以及测序成本的快速降低,全基因组数据也在急速增加。尽管参考基因组数据是非常有价值的资源,但是由于测序过程中的外源污染或者研究者对数据组装方法的误用,使得基因组数据面临很多问题。  近日,约翰霍

白菜甘蓝油菜全基因组序列测定

   由中国科学家领衔的白菜、甘蓝和油菜全基因组测序项目取得阶段性重大成果,获得了白菜全基因组的精细图,甘蓝和油菜全基因组的框架图。   研究表明,白菜、甘蓝和油菜的基因组大小分别约为5亿、6.5亿和11亿个碱基对,白菜和甘蓝含有的基因总数目分别约4.2万和4.5万个,油菜基因覆盖度85%以上。该

马铃薯基因组序列框架图全球发布

中国科学家的创新性思路助推测序工作提前完成   9月23日,由14国科学家组成的“国际马铃薯基因组测序协作组”分别在北京、阿姆斯特丹、伦敦、纽约、利马等地同时宣布了马铃薯基因组序列框架图的完成。此次公布的马铃薯基因“蓝图”绘制工作的中国参与单位主要来自中国农业科学院蔬菜花卉所和深圳华大基因研究院。

史上最全小麦基因组序列图集问世

  据最新一期《自然》杂志报道,加拿大萨斯喀彻温大学领导的国际团队在一项对全球小麦生产具有里程碑意义的研究——10+基因组计划中,对代表全球育种计划的15个小麦品种的基因组进行了测序。这将使科学家和育种人员能够更快地识别出具有影响力的基因,从而提高小麦产量、害虫抗性和其他重要的农作物性状。 小麦

草鱼全基因组序列图谱绘制完成

  近日,记者从中国科学院水生生物研究所获悉,该所鱼类功能基因组学学科组负责的草鱼全基因组序列图谱绘制完成。该成果由水生生物研究所、中国科学院国家基因研究中心和中山大学等机构合作完成,相关研究成果于5月4日在线发表于《自然—遗传学》杂志。  据该所研究员汪亚平介绍,该研究采用鸟枪法测序策略,分别对一

四篇Science文章公布最新基因组序列

  小麦是全球最重要的粮食作物之一,提供了20%人类所需的热量。2010年英国科学家宣布他们绘制出了小麦基因组草图,但这一序列并不完整。在7月17日Science杂志上,两个研究组分别公布了Chinese Spring小麦品种的每个染色体臂的基因组序列,以及小麦染色体3B基因组序列,另外两个研究小组

牡蛎全基因组序列图谱绘制完成

牡蛎基因组部分序列及其分析牡蛎基因组计划(OGP)团队成员在深圳华大基因研究院讨论项目中国科学院海洋研究所和深圳华大基因研究院签约仪式牡蛎是产量最大的海水养殖动物  牡蛎养殖  近日,牡蛎基因组计划(Oyster Genome Project,OGP)项目组宣布,

《Genome-Research》:根据基因组序列预测MRSA毒性

  微生物毒力一直是一个复杂的多因素表型,与病原体的进化轨迹有着复杂的关联。毒性,破坏宿主细胞膜和粘附的能力,粘附到人体组织的能力,是许多细菌病原体的主要毒力因子,包括金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)。   金黄色葡萄球菌是临床上常见的毒性较强的细菌,自从上世纪40

中国新型冠状病毒的基因组序列

  《自然》杂志2月3日发表了新型冠状病毒的基因组序列(论文:A new coronavirus associated with human respiratory disease in China),病毒样本系从一名曾在最先爆发疫情的海鲜市场工作过的患者体内分离得到。基因组分析显示,该病毒与此前在

核酸序列分析

【实验目的】1、 掌握已知或未知序列接受号的核酸序列检索的基本步骤;2、 掌握使用BioEdit软件进行核酸序列的基本分析;3、 熟悉基于核酸序列比对分析的真核基因结构分析(内含子/外显子分析);4、 了解基因的电子表达谱分析。【实验原理】针对核酸序列的分析就是在核酸序列中寻找基因,找出基因的位置和

冲激序列信号与阶跃序列信号各有什么特性

单位脉冲序列只在n=0 处有一个单位值1,其余点上皆为0;单位阶跃序列只有在n>=0时,才取非零值1,当n

设计引物用cds序列和cdna序列的区别

cDNA和mRNA的序列是互补的,如果用两个引物,最后的两条DNA序列分别对应于mRNA和cDNA中的一段。由于引物方向从5‘至3’,所以两个引物对应于mRNA和cDNA中相应序列即可。

《自然》:美首次对老鼠基因组调控序列测序

  美国科学家在7月1日出版的英国《自然》杂志上撰文表示,他们首次详细标示出了老鼠基因组功能序列中一个重要部分——调控序列的详细情况。老鼠是生物医学研究中最广泛使用的哺乳动物模型,因此,最新研究也将有助于我们进一步解读人类基因组。  加州大学圣地亚哥分校路德维格癌症研究所基因调控实验

科学家破译“纯种马”基因组序列

马有90多种遗传疾病与人类的遗传疾病相似       一个国际科研小组11月5日报告说,他们破译了“纯种马”的基因组序列。这项研究成果将刊登在6日出版的新一期《科学》杂志上。       报告中所指的“纯种马”最早是300多年前英国培育的一种名贵赛马品种,后被一些欧美和亚洲国家引进,主要用于赛马和马

首次测定南极抗冻鱼基因组序列

  近,包括美国东北大学H. William Detrich教授在内的一个国际研究小组,首次测定了南极抗冻鱼(Antarctic notothenioid fish)的基因组序列。他说,这一突破性成果,将阐明动物对寒冷水域独特的进化适应性,将有助于揭示鱼类如何应对海水温度上升,由于气候变化,预计接下

三篇Nature-Methods:定位基因组的调控序列

  科学家们利用染色质对DNase消化和Tn5转座的敏感性,对基因组的调控序列进行定位和解读。   近来越来越多的证据显示,许多遗传学差异并非直接影响基因,而是改变控制基因开/关的调控序列。近期Nature Methods杂志上发表了三篇文章,介绍了在基因组中定位调控序列的新技术,阐述了进行数

我国完成朱鹮全基因组序列图谱绘制

       4月15日,深圳华大基因研究院与西安交通大学联合在西安公布了濒危野生动物朱鹮的全基因组序列图谱,这是继鸡基因组、珍珠鸟基因组、火鸡基因组之后,我国完成 的第四个鸟类基因组测序项目和全基因组序列图谱。朱鹮这种被称为“东方宝石”的珍稀鸟类目前世界仅存千余只,这一研究成果将对于挽救和保护朱

科学家完成辣椒全基因组序列测定

  由我国科技人员主导完成的“栽培种和野生种辣椒的全基因组测序揭示辣椒属的驯化与特异性”研究论文,今年3月在国际著名期刊《美国国家科学院院刊》(PNAS)刊发。该论文的正式发表,标志着辣椒基因组序列成功解码,我国辣椒基础性研究取得重大进展,进入分子育种阶段。   美国农艺学会主席、新墨西哥州立大学

首个完整人类基因组序列公布

  由美国国家人类基因组研究所、加利福尼亚大学圣克鲁斯分校、华盛顿大学等机构研究人员领衔的国际科研团队3月31日公布了首个完整、无间隙的人类基因组序列。与这项重大成果相关的6篇论文当天发表在美国《科学》杂志上。美国国家人类基因组研究所在一份公报中表示,人类基因组含有约30亿个DNA(脱氧核

美首次对老鼠基因组的调控序列测序

  美国科学家在7月1日出版的英国《自然》杂志上撰文表示,他们首次详细标示出了老鼠基因组功能序列中一个重要部分――调控序列的详细情况。老鼠是生物医学研究中最广泛使用的哺乳动物模型,因此,最新研究也将有助于我们进一步解读人类基因组。   加州大学圣地亚哥分校路德维格癌症研究所基因调控实验室主任任兵教

DNA微序列技术

·         Protocols for Making Drosophila Arrays (Stanford U.)Detailed protocol for making arrays including PCR Amplification of cDNAs for Printing, 

AluI序列的定义

人基因组约有50万~70万份拷贝,AluI序列长282个核苷酸,由两个同源但略有差别的亚基组成。

DNA-序列分析技术

试剂、试剂盒 琼脂糖TE 水饱和酚无水乙醇70%乙醇TEMED测序酶溴化乙锭仪器、耗材 电泳仪离心管离心机冰浴箱恒温板DNA 测序仪