《自然》：美首次对老鼠基因组调控序列测序
美国科学家在7月1日出版的英国《自然》杂志上撰文表示，他们首次详细标示出了老鼠基因组功能序列中一个重要部分——调控序列的详细情况。老鼠是生物医学研究中最广泛使用的哺乳动物模型，因此，最新研究也将有助于我们进一步解读人类基因组。 加州大学圣地亚哥分校路德维格癌症研究所基因调控实验室主任任兵教授（音译）表示：“10多年前，我们就精确知道组成人类基因组的字母系统（包括碱基等），但是，这些字母如何编排成有意义的单词、段落甚至生命，我们还知之甚少。例如，我们知道，起作用的基因组中只有1%—2%的部分会为蛋白质编码，但除此之外，基因组内还有很多区域影响着基因和疾病的发育情况。很显然，这些区域会做一些事情；而且它们本身也可能发生变化或者消失。” 这些区域中最主要的是顺式调控元件，它们是存在于基因旁侧序列中能影响基因表达的序列，调控着基因的转录活动，而基因调控出错可能会导致癌症等疾病的出现。任兵和同事使用高通量测序技术，......阅读全文
美首次对老鼠基因组的调控序列测序
美国科学家在7月1日出版的英国《自然》杂志上撰文表示，他们首次详细标示出了老鼠基因组功能序列中一个重要部分――调控序列的详细情况。老鼠是生物医学研究中最广泛使用的哺乳动物模型，因此，最新研究也将有助于我们进一步解读人类基因组。 加州大学圣地亚哥分校路德维格癌症研究所基因调控实验室主任任兵教
《自然》：美首次对老鼠基因组调控序列测序
美国科学家在7月1日出版的英国《自然》杂志上撰文表示，他们首次详细标示出了老鼠基因组功能序列中一个重要部分——调控序列的详细情况。老鼠是生物医学研究中最广泛使用的哺乳动物模型，因此，最新研究也将有助于我们进一步解读人类基因组。 加州大学圣地亚哥分校路德维格癌症研究所基因调控实验
重叠基因的调控序列
①在5′端转录起始点上游约20～30个核苷酸的地方，有TATA框(TATA box)。TATA框是一个短的核苷酸序列，其碱基顺序为TATAATAAT。TATA框是启动子中的一个顺序，它是RNA聚合酶的重要的接触点，它能够使酶准确地识别转录的起始点并开始转录。当TATA框中的碱基顺序有所改变时，mRN
割裂基因的调控序列种类介绍
①在5′端转录起始点上游约20～30个核苷酸的地方，有TATA框(TATA box)。 TATA框是一个短的核苷酸序列，其碱基顺序为TATAATAAT。TATA框是启动子中的一个顺序，它是RNA聚合酶的重要的接触点，它能够使酶准确地识别转录的起始点并开始转录。当TATA框中的碱基顺序有所改变时，
测序技术及DNA序列测定结果分析
实验概要 在分子生物学研究中，DNA的序列分析是进一步研究和改造目的基因的基础。目前用于测序的技术主要有Sanger等（1977）发明的双脱氧链末端终止法和Maxam和 Gilbert（1977）发明的化学降解法。这二种方法在原理上差异很大，但都是根据核苷酸在某一固定的点开始，随机在某一个特定的
液相序列捕获系统与高通量测序
Nature Biotechnology 2009年2月封面文章:基于安捷伦寡核苷酸序列合成技术的液相序列捕获系统 – 高通量平行靶向测序的最佳解决方案来自美国麻省理工学院和哈佛大学Broad研究院的研究人员，利用安捷伦(Agilent Technologies)卓越的寡核苷酸序列合成技术，合成
关于断裂基因的调控序列种类介绍
①在5′端转录起始点上游约20～30个核苷酸的地方，有TATA框(TATA box)。TATA框是一个短的核苷酸序列，其碱基顺序为TATAATAAT。TATA框是启动子中的一个顺序，它是RNA聚合酶的重要的接触点，它能够使酶准确地识别转录的起始点并开始转录。当TATA框中的碱基顺序有所改变时，m
三代测序技术实现44倍测序序列连续性提升
2019年9月3日，PNAS（美国科学院院报）在线发表了上海交通大学王文琴副教授团队课题组题为“Plant evolution and environmental adaptation unveiled by long-read whole-genome sequencing of Spirodel
测序解析miRNA调控害虫发育机制
小菜蛾（Plutella xylostella）是全球范围内严重危害十字花科作物生长的鳞翅目害虫，据估计每年造成的损失和防治成本达到40-50亿美元。最近的转录组分析和基因组测序为了解小菜蛾适应环境胁迫的分子机制提供了一个极好的机会。尽管Etebari等1发现了在寄生胁迫下二龄幼虫中的一组miRNA
古老病毒序列，竟可调控鸟类大脑基因！
病毒与宿主在漫长的演化过程中的相互作用，会对宿主产生深远的影响。近日，我国科学家最新发现了古病毒与鸟类演化的有趣关联。研究人员发现，古老病毒曾经插入到鸟类DNA中，并伴随着雀形目鸟类的物种大爆发，从而在鸟类宿主里不断增殖。有意思的是，鸟类不仅可以高效的清除掉增殖的病毒DNA，有时还会利用残余的病毒来
DNA序列和大规模DNA测序策略的探讨（图）
人类基因组计划的核心内容之一是基因组测序。随着人类基因组图谱趋于完成，人类基因的 定位克隆、鉴定分析直至全基因组测序取得了突破性进展，测序策略的成熟、测序方法的改进、自动测序仪的广泛应用、计算机数据分析系统的扩展以及测序分析能力的提高， 大大推进了大规模DNA测序的进程。第一节 DNA测序的基本方法
“条形码”序列测序（BRBseq）廉价且高效
RNA测序是一种通过观察基因表达来分析整个基因组的技术。如今，这种全基因组表达分析是基因组研究的标准工具，因为它们依赖于高通量技术，而这些技术本身已经变得广泛可用。 尽管如此，RNA测序仍然是昂贵和费时的，因为它首先需要昂贵的准备一个完整的基因组库——由细胞RNA生成的DNA池——同时数据本身
三篇Nature－Methods：定位基因组的调控序列
科学家们利用染色质对DNase消化和Tn5转座的敏感性，对基因组的调控序列进行定位和解读。 近来越来越多的证据显示，许多遗传学差异并非直接影响基因，而是改变控制基因开/关的调控序列。近期Nature Methods杂志上发表了三篇文章，介绍了在基因组中定位调控序列的新技术，阐述了进行数
Nature：CRISPRa截然不同的非编码调控序列分析技术
来自加州大学旧金山分校的一组研究人员修改了现有的基因编辑CRISPR技术，用以来寻找增强子，他们的方法并不是编辑增强子，令其发挥作用，而是利用一种称为CRISPRa（CRISPR activation）的工具，搜寻影响T细胞免疫细胞发育的一种基因的增强子。这项研究发现将有助于解析自身免疫疾病，如
麻栗坡兜兰简单重复序列表达调控关键基序获揭示
华南农业大学教授王艇团队、福建农林大学教授刘仲健团队和中山大学教授苏应娟团队在国家自然科学基金、广东省基础与应用基础研究基金等项目的资助下，基于统计基因组学分析揭示了麻栗坡兜兰简单重复序列的表达调控关键基序。相关成果近日发表于《先进科学》（Advanced Science）。简单重复序列（SSR）在
中国农大:测序解析miRNA调控害虫发育机制
小菜蛾（Plutella xylostella）是全球范围内严重危害十字花科作物生长的鳞翅目害虫，据估计每年造成的损失和防治成本达到40-50亿美元。最近的转录组分析和基因组测序为了解小菜蛾适应环境胁迫的分子机制提供了一个极好的机会。尽管Etebari等1发现了在寄生胁迫下二龄幼
测序与芯片揭示miRNA调控海参夏眠机制
海参（Apostichopus japonicus），是生活在海边至海底8000米的海洋棘皮动物，以海底藻类和浮游生物为食。当夏季来临，上层海水由于太阳光强烈照射，温度上升。此时，海底的小生物都浮到海面，进行一年一度的大量求食和繁殖。而留在海底的海参，迫于夏季食物中断，进入夏眠，此时，其基础代谢率明
放射自显影和从测序凝胶上读取－DNA－序列实验
本实验介绍关于放射自显影和从测序凝胶上读取 DNA 序列的过程。本实验来源于分子克隆实验指南（第三版）下册，作者：〔美〕J. 萨姆布鲁克 D.W.拉塞尔。实验步骤材料缓冲液和溶液贮存液、缓冲液和试剂的配方见附录 1。将贮存液稀释到合适的浓度。凝胶固定液300 ml 甲醇2.4L 水300 ml 冰醋
放射自显影和从测序凝胶上读取－DNA－序列实验
实验步骤 材料缓冲液和溶液贮存液、缓冲液和试剂的配方见附录 1。将贮存液稀释到合适的浓度。凝胶固定液300 ml 甲醇2.4L 水300 ml 冰醋酸放射性混合物放射性墨水或化学发光标记物参见附录 9。可重复使用的放射性墨水主要是选择 Strat
首个亚洲人源基因检测序列标准物质完成研制
6月，中国计量科学研究院和深圳华大基因研究院共同发布首个亚洲人源(炎黄一号)DNA序列标准物质(BW-5201)和大肠杆菌O157基因组DNA序列标准物质(BW-5202)。这是全球首次发布亚洲人源DNA和微生物基因组DNA序列标准物质，为基因检测产业评估测序和数据分析的准确性提供了参考标准。
放射自显影和从测序凝胶上读取－DNA－序列实验
实验步骤 材料缓冲液和溶液贮存液、缓冲液和试剂的配方见附录 1。将贮存液稀释到合适的浓度。凝胶固定液300 ml 甲醇2.4L 水300 ml 冰醋酸放射性混合物放射性墨水或化学发光标记物参见附录 9。可重复使用的放射性墨水主要是选择 Stratagene 的冷光标记物（Glosos)。标记物能被多
重磅|华大智造首度公开旗下测序仪文库构建核心序列
2018年9月8日，在华大基因集团19周年庆前夕，华大智造首次向业内公开华大智造测序仪文库构建核心序列，致敬华大基因集团。华大智造成立于2016年，一直致力于研发和生产基因测序设备。如行业内小伙伴们所知，华大智造已拥有四款高通量测序仪——BGISEQ-500、BGISEQ-50、MGISEQ-2
Science：新测序法挖掘新的核糖调控元件
最近，以色列魏茨曼科学研究所分子遗传学系的副教授Rotem Sorek带领的一个研究小组，开发出一种新的测序技术，为细菌核糖调控打开了大门。相关研究结果发表在《Science》杂志。 当涉及到调节基因时，细菌与真核生物有很大的不同。在细菌中，称为核糖开关（riboswitches）的功能性调控
安捷伦：用于RNA测序的文库制备与靶向序列捕获解决方案
简化的RNA和DNA测序解决方案，用于精简临床NGS 2020年9月1日，北京——安捷伦科技公司（纽约证交所：A）今日宣布推出SureSelect XT HS2 RNA试剂盒。该解决方案采用模块化设计，为RNA 和 DNA样品提供了一种简单的平行分析方法，从而确保客户能够简化并整合其工作流程，而无
科学家阐明摄食全过程的序列性神经调控机制
自然环境变幻莫测。自然界中的动物即使在摄食过程中也需要时刻关注环境中的各种线索，一方面有助于及时发现危险，另一方面利于获取更多资源。长期以来，由于缺乏细致分析动物多种自发行为的手段，科学家主要利用摄食量这一指标来评价动物的摄食行为。当前的研究将摄食行为简化为三个阶段——饥饿-寻找食物、摄入食物、饱食
我国学者在合成生物基因调控序列智能设计领域取得进展
图1 跨物种基因调控序列的逆向设计图2 基于TFBU的增强子模块化建模与智能设计 在国家自然科学基金项目（批准号：62250007、62225307）等资助下，清华大学自动化系汪小我教授团队在合成生物基因调控序列智能设计取得进展，系列研究成果连续发表两篇论文：（1）以“系统表示与优化实现细菌跨物种
中海大：测序与芯片揭示miRNA调控海参夏眠机制
海参（Apostichopus japonicus），是生活在海边至海底8000米的海洋棘皮动物，以海底藻类和浮游生物为食。当夏季来临，上层海水由于太阳光强烈照射，温度上升。此时，海底的小生物都浮到海面，进行一年一度的大量求食和繁殖。而留在海底的海参，迫于夏季食物中断，进入夏眠，此时，其基础代谢
西北农林科技大学PLOSGenetics发表红枣基因组序列测序结果
高品质的干枣基因组序列，以及从其近缘种树木的基因序列，能够阐明这种人类已经种植超过7000年的古老果树的驯化历史。近期，西北农林科技大学与美国康奈尔大学Boyce Thompson植物研究（BTI）以及北京林业大学的研究人员合作，对中国干枣进行了基因组测序，相关结果发表在12月22日的《PLOS G
揭示重复序列对三维基因组区隔化的调控作用
Cell Research | 沈晓骅/孙育杰课题组合作揭示重复序列对三维基因组区隔化的调控作用 哺乳动物基因组DNA全长近2 m，经过多层有序组织与折叠后分布于直径5-10 μm的细胞核中。染色质高级结构对基因表达，细胞分化和胚胎发育起着至关重要的作用。其中，基因组A/B区隔化（A/B c
全转录组测序技术揭示circRNA新的调控机制（二）
3. 环状RNA的差异表达与前列腺癌的进展有关研究者对144个前列腺癌进行了聚类分析，与线性RNA相比，环状RNA最强模式与它们在每个样本中的总体丰度相一致。另外，极端circRNA分布的患者的预后明显较circRNA分布稳定的患者差，同时极端circRNA index组也与更高的转移发生率