Antpedia LOGO WIKI资讯

我国科学家开发高质量基因组组装软件

11月25日,中国科学院遗传与发育生物学研究所梁承志研究组开发的高质量基因组组装软件HERA在《自然-通讯》在线发表(Nature Communications,DOI:10.1038/s41467-019-13355-3)。论文题目为Assembly of chromosome-scale contigs by efficiently resolving repetitive sequences with long reads。 高质量基因组序列对于研究一个物种基因组的结构、功能、进化、基因定位和克隆等都至关重要。目前单分子测序技术的发展,已使得构建高质量基因组草图越来越容易。然而,这些草图序列仍然存在着由于组装序列碎片化而导致的多种错误,比如不完整的基因序列、排列到染色体上之后的片段遗漏、排列顺序错误和方向错误等。这些错误对于利用这些基因组所做的很多研究会造成不便或误导。 中国科学院遗传与发育生物学研究所梁承志组多年......阅读全文

新软件按需组装无缝基因组序列

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494014.shtm 科技日报北京2月16日电 (记者张梦然)美国国立卫生研究院研究人员发布了一种创新的软件工具,用于组装来自各种物种的真正完整(即无缝)的基因组序列。这种名为Verkko的软件在芬兰

大大加速基因组分析的新软件

  最近,新加坡科技研究局(A*STAR)基因组研究所(GIS)和生物信息学研究所(BII)的科学家带领的一个国际研究小组,开发出了一种可以加快基因组分析的软件——SIFT 4G(SIFT for Genomes)。这项研究结果发表在《Nature Protocols》杂志。  基因组测序可帮助我们

我国科学家开发高质量基因组组装软件

  11月25日,中国科学院遗传与发育生物学研究所梁承志研究组开发的高质量基因组组装软件HERA在《自然-通讯》在线发表(Nature Communications,DOI:10.1038/s41467-019-13355-3)。论文题目为Assembly of chromosome-scale c

细胞器基因组组装软件开发研究获进展

  真核生物细胞器基因组包括线粒体和质体(包括叶绿体、白色体等)的全部DNA分子,是细胞质遗传的主要载体。在动植物和真菌的单个细胞内,有多个(甚至成千上万个)细胞器基因组单元的拷贝,使得利用低覆盖度的全基因组测序数据组装得到完整的细胞器基因组成为可能。随着DNA高通量测序技术的发展,测序成本下降,低

中国科学家开发出高质量基因组组装软件

  高质量基因组序列对于研究一个物种基因组的结构、功能、进化、基因定位和克隆等都至关重要。目前单分子测序技术的发展,已使得构建高质量基因组草图越来越容易。然而,这些草图序列仍然存在着由于组装序列碎片化而导致的多种错误,比如不完整的基因序列、排列到染色体上之后的片段遗漏、排列顺序错误和方向错误等。这些

美国科学家开发出快速精准肿瘤基因组分析软件

  美国 Mayo Clinic的研究人员设计了一款可识别肿瘤基因改变的软件——BIMA V3(Binary Indexing Mapping Algorithm,version 3),比其他常用基因测序程序速度快20倍,准确度高25%。   成对测序技术是一种复杂的昂贵的技术,可用

酒精测试仪软件的你软件概述

  酒精测试仪是一款手机上的生活类软件,根据用户所输入的饮酒信息,及时测试车主血液酒精浓度,进而提示所处的“醉酒驾驶”、“饮酒驾驶”、“安全驾驶”状态,并提醒不同状态下距离安全驾驶所需的时间。

我国学者研究的高质量基因组组装软件在Nature子刊发表!

  中国科学院遗传与发育生物学研究所梁承志研究组开发的高质量基因组组装软件HERA在《自然-通讯》在线发表(Nature Communications,DOI:10.1038/s41467-019-13355-3)。论文题目为Assembly of chromosome-scale contigs

熔点测定软件

提升实验台性能熔点测定软件具有什么功能? 如今,分析仪器不仅会提供准确的结果: 还应确保数据安全性并优化工作流程。 使用LabX实验室软件符合FDA 21 CFR Part 11等法规要求。 轻松管理用户、方法、结果和调整。 平滑无缝地执行复杂的工作流程。 提供多种曲线和视频,报告可以个性化

熔点测定软件

提升实验台性能熔点测定软件具有什么功能? 如今,分析仪器不仅会提供准确的结果: 还应确保数据安全性并优化工作流程。 使用LabX实验室软件符合FDA 21 CFR Part 11等法规要求。 轻松管理用户、方法、结果和调整。 平滑无缝地执行复杂的工作流程。 提供多种曲线和视频,报告可以个性化