上海交大研究组揭示细菌DNA新型限制修饰机制
细菌DNA新型限制修饰机制 近日，上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室在DNA磷硫酰化修饰研究方面取得新进展，由德林教授研究小组与美国麻省理工学院Peter C. Dedon教授课题组合作，以博士生曹博为第一作者，在微生物领域顶级期刊《Molecular Microbiology》发表了题为“Pathological phenotypes and in vivo DNA cleavage by unrestrained activity of a phosphorothioate-based restriction system in Salmonella”的研究论文。 DNA磷硫酰化修饰是由硫原子取代了DNA磷酸骨架上非桥联氧原子，进而形成具有序列特异性和空间构象专一性的DNA大分子结构。这是表观遗传学领域近年发现的一种新型生理修饰现象，它突破了现有的DNA骨架由碳、氢、氧、氮、磷五种......阅读全文
DNA修饰的概念
中文名称DNA修饰英文名称DNA modification定 义DNA合成后，通过一系列化学加工使其结构发生某些改变。如DNA的甲基化等。应用学科遗传学（一级学科），分子遗传学（二级学科）
上海交大研究组揭示细菌DNA新型限制修饰机制
细菌DNA新型限制修饰机制 近日，上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室在DNA磷硫酰化修饰研究方面取得新进展，由德林教授研究小组与美国麻省理工学院Peter C. Dedon教授课题组合作，以博士生曹博为第一作者，在微生物领域顶级期刊《Molecular Mi
细胞化学词汇DNA修饰
中文名称：DNA修饰英文名称：DNA modification定 义：DNA合成后，通过一系列化学加工使其结构发生某些改变。如DNA的甲基化等。应用学科：遗传学（一级学科），分子遗传学（二级学科）
多组学挖掘进食DNA硫修饰细菌对线虫寿命的影响
近日，Nature系列刊物Communications biology在线发表了上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室赵一雷教授研究团队的文章“Phosphorothioate-DNA bacterial diet reduces the ROS levels in C. ele
通过模拟细菌DNA实现穿越其限制修饰屏障的新方法
细菌是存在于自然环境中的一个重要生物类群，参与自然环境碳、氮和硫等元素的循环，另外，细菌在人类的健康与疾病、工业微生物发酵及农业生物病虫害防治等领域也占有重要地位。遗传操作是研究细菌生理功能、致病机理及构建基因工程菌株的先决条件。迄今为止，仅有少数实验室的模式菌株实现了遗传转化，而对
DNA修饰QKI基因信号通路介绍
该基因编码的蛋白质是一种RNA结合蛋白，可调节mRNA的前剪接，从细胞核输出mRNA，蛋白质翻译和mRNA稳定性。 编码的蛋白质参与髓鞘化和少突胶质细胞分化，并且可能在精神分裂症中起作用。 已经为该基因发现了编码不同同工型的多个转录物变体。
细菌DNA＝未来光盘？
英国《自然》杂志11日发表了一项生物技术重要成果：科学家利用CRISPR手段，成功将图片和视频短片编码进了细菌的DNA中，通过测序DNA再重新提取出来后仍相当准确。其证明了活细胞作为一种可靠媒介，存储一定数量的数据完全有可能。 CRISPR被称为“生物科学领域的游戏规则改变者”。最近的一些研
细菌DNA提取方案
细菌DNA提取方案：革兰氏阴性菌，如E.coli，一般有三种可以选择的方法。一、水煮模板法——主要用于PCR反应1、接种单菌落于LB或脑心平板，连续画线，37摄氏度培养18－24小时。2、刮取1～2接种环菌苔加入150微升三蒸水中，混匀，100摄氏度煮沸10分钟。3、12000转/分钟 离心10分钟
细菌DNA提取方案
细菌DNA提取方案:革兰氏阴性菌,如E.coli,一般有三种可以选择的方法. 一、水煮模板法——主要用于PCR反应1、接种单菌落于LB或脑心平板,连续画线,37摄氏度培养18－24小时.2、刮取1～2接种环菌苔加入150微升三蒸水中,混匀,100摄氏度煮沸10分钟.3、12000转/分钟离心10分钟
与DNA白修饰相关因子介绍QKI
该基因编码的蛋白质是一种RNA结合蛋白，可调节mRNA的前剪接，从细胞核输出mRNA，蛋白质翻译和mRNA稳定性。 编码的蛋白质参与髓鞘化和少突胶质细胞分化，并且可能在精神分裂症中起作用。 已经为该基因发现了编码不同同工型的多个转录物变体。 [由RefSeq提供，2014年7月]The protei
检测癌症相关DNA修饰新测序方法
牛津Ludwig癌症研究所助理成员Chunxiao Song和Benjamin Schuster-Boeckler领导的这项研究表明，他们开发的新方法，TET辅助吡啶硼烷测序（TET-assisted pyridine borane sequencing，TAPS）是一种比亚硫酸氢盐测序（bis
DNA甲基化——表现遗传学中DNA的修饰
DNA甲基化是哺乳动物DNA最常见的复制后调节方式之一，是正常发育、分化所必需的，具有重要的生物学意义。在DNA甲基转移酶 (DNAmethyltransferase，DNMT)的作用下，以S—腺苷甲硫氨酸(SAM)为甲基供体，可以将甲基基团转移到基因组DNA胞嘧啶第 5位碳原子(C5)
细菌的限制修饰系统包含哪些基因？
细菌的限制修饰系统包含三个连锁基因：（1）hsd R：编码限制性核酸内切酶（2）hsd M：编码限制性甲基化酶（3）hsd S：编码限制性酶和甲基化酶的协同表达
DNA修饰SMARCD1基因信号通路介绍
该基因编码的蛋白质是SWI / SNF蛋白质家族的成员，其成员具有解旋酶和ATPase活性，被认为可以通过改变那些基因周围的染色质结构来调节某些基因的转录。 编码的蛋白质是大型ATP依赖的染色质重塑复合体SNF / SWI的一部分，并且与酵母Swp73蛋白具有序列相似性。 已经发现该基因的两个编码不
DNA修饰ERCC2基因信号通路介绍
核苷酸切除修复途径是修复DNA损伤的机制。该基因编码的蛋白参与转录偶联核苷酸切除修复，是基础转录因子btf2/tfiih复合物的一个不可分割的成员。该基因产物具有ATP依赖性DNA解旋酶活性，属于解旋酶的RAD3/XPD亚家族。这种基因的缺陷可导致三种不同的疾病，即癌症易发综合征着色性干皮病互补组D
DNA修饰MEN1基因信号通路介绍
这个基因编码脑膜，一种与多发性内分泌肿瘤1型综合征相关的假定的肿瘤抑制因子。体外研究表明，脑膜定位于细胞核，具有两种功能性核定位信号，并通过JUND抑制转录激活，但这种蛋白的功能尚不清楚。在Northern blots上检测到两条信息，但未对较大的信息进行描述。选择性剪接导致多个转录变体。
PNAS：DNA修饰可控制个体恐惧感
研究称 DNA 修饰可控制个体恐惧感 来自昆士兰大学昆士兰脑研究所的神经学家或许发现了控制个体产生恐惧感的方法 对许多人来说，类似乘坐飞机或看到蜘蛛在地板上爬过这样的经历，并不只是简单地导致心跳加速和手心出汗，而是已经成为严重的恐惧症，能带来沉重的焦虑。近日，一个国际研究团队的论文指出，他们或许
DNA修饰MED12基因信号通路介绍
转录的启动部分受称为预启动复合物的大型蛋白质装配的控制。 这种预启动复合体的一个组成部分是一个称为Mediator的1.2 MDa蛋白聚集体。 该介体组分与包含该基因编码的蛋白质，介体复合物亚基12（MED12）以及MED13，CDK8激酶和细胞周期蛋白C的CDK8亚复合体结合。 和重新激发率。 M
DNA修饰EWSR1基因信号通路介绍
该基因编码一种多功能蛋白，参与多种细胞过程，包括基因表达、细胞信号传导、RNA加工和转运。该蛋白包括一个N末端转录激活域和一个C末端RNA结合域。该基因与编码转录因子的各种基因之间的染色体易位导致参与肿瘤发生的嵌合蛋白的产生。这些嵌合蛋白通常由该蛋白的N末端转录激活域与转录因子蛋白的C末端DNA结合
美绘出DNA一修饰因子基因图谱
据美国物理学家组织网7月21日报道，美国科学家已经首次绘制出了人体胚胎干细胞内一个名为5-羟甲基胞嘧啶（5hmC）的修饰因子的全基因图谱。科学家们表示，5hmC在一些被打开或激活的基因内出现的频率非常高，最新研究将有助于癌症的控制。研究论文发表在最新一期《基因组生物学》杂志上。
DNA修饰EP300基因信号通路介绍
该基因编码腺病毒E1A相关的细胞p300转录辅激活蛋白。作为组蛋白乙酰转移酶，通过染色质重塑调节转录，在细胞增殖和分化过程中起重要作用。通过与磷酸化CREB蛋白特异性结合来介导cAMP基因调控。该基因也被鉴定为HIF1A（缺氧诱导因子1α）的共激活物，因此在缺氧诱导基因如VEGF的刺激中起到作用。这
DNA修饰SMARCB1基因信号通路介绍
SMARCB1基因编码的蛋白是ATP依赖性染色质调节复合物SWI/SNF的核心亚基，参与基因的表观修饰和转录调控。SMARCB1基因突变与神经鞘瘤的发生相关，其作为抑癌基因可以诱导细胞G1停滞、抑制染色体非整倍性等，发挥肿瘤抑制的作用。
DNA骨架硫修饰研究又获新成果
上海交通大学、武汉大学与美国麻省理工学院共同合作，以王连荣为第一作者、陈实和彼得·帝丹为共同通讯作者联合完成的论文《DNA磷硫酰化修饰在细菌基因组中广泛分布且量化存在》日前在美国《国家科学院院刊》上发表，这是DNA骨架上硫修饰研究领域又一个新的重大进展，也是邓子新团队与彼得·帝丹合
DNA修饰CHD2基因信号通路介绍
CHD家族蛋白的特征是存在染色质（染色质组织修饰剂）结构域和SNF2相关解旋酶/ ATPase结构域。 CHD基因可能通过修饰染色质结构来改变基因表达，从而改变转录设备对其染色体DNA模板的访问。 已经发现该基因的编码不同同工型的剪接的转录变体。
DNA修饰ARID2基因信号通路介绍
该基因编码一个富含AT的相互作用域（ARID）的DNA结合蛋白家族成员。 ARID家族的成员在胚胎模式，细胞谱系基因调控，细胞周期控制，转录调控和染色质结构修饰中发挥作用。 该蛋白作为多溴和BRG1相关因子或PBAF（SWI / SNF-B）染色质重塑复合物的亚基，通过核受体促进配体依赖性转录激活。
DNA修饰TOP2A基因信号通路介绍
这个基因编码一种DNA拓扑异构酶，这种酶在转录过程中控制和改变DNA的拓扑状态。这种核酶参与诸如染色体凝聚、染色单体分离以及DNA转录和复制过程中发生的扭转应力的减轻等过程。它催化双链DNA的两条链的瞬间断裂和重新结合，使双链彼此穿过，从而改变DNA的拓扑结构。这种酶有两种形式，可能是基因复制事件的
JCB：“流放”DNA的表观遗传学修饰
皮肤细胞在发挥作用时启动的基因与肝细胞完全不同，而其他基因需要保持关闭。将基因“流放”到细胞核边缘，是能够一举关闭大量基因的重要途径。Johns Hopkins大学的一项新研究揭示了DNA被发配到细胞核边疆的具体机制，这一过程对于控制基因表达和决定细胞命运至关重要。相关论文发表在近期的Journ
DNA修饰TAF1基因信号通路介绍
rna聚合酶ii启动转录需要70多种多肽的活性。协调这些活动的蛋白质是基础转录因子tfiid，它与核心启动子结合以正确定位聚合酶，充当组装其余转录复合物的支架，并充当调控信号的通道。tfiid由tata结合蛋白（tbp）和一组进化上保守的蛋白质（tbp相关因子或taf）组成。tafs可能参与基础转录
DNA测序——MaxamGilbert化学修饰法
实验方法原理用化学试剂 处理具有末端放射性标记的DNA片段 ，造成碱基的特异性切割并产生一组具有不同长度的DNA链降解产物，经凝胶电泳分离和放射自显影后，可直接读出待测DNA片段的核苷酸序列。实验材料DNA试剂、试剂盒蒸馏水仪器、耗材电泳仪实验步骤一、取待测DNA片段，既可以是单链也可以是双链。 此
修改DNA诱骗细菌产蛛丝
蜘蛛纺出了工程师梦想的东西。它们的丝和钢铁一样坚固，同时具有弹性、无毒且能生物降解。但蜘蛛不容易养殖。每只仅能产生少量的丝，有时还会自相残杀。几十年来，科学家一直试图仿造这种银色的线，以用于手术缝线、运动装备和防弹背心。不过，他们合成的纤维始终有所欠缺。如今，一个团队“诱骗”细菌产生了和天然蛛丝