DNA骨架硫修饰研究又获新成果
上海交通大学、武汉大学与美国麻省理工学院共同合作，以王连荣为第一作者、陈实和彼得·帝丹为共同通讯作者联合完成的论文《DNA磷硫酰化修饰在细菌基因组中广泛分布且量化存在》日前在美国《国家科学院院刊》上发表，这是DNA骨架上硫修饰研究领域又一个新的重大进展，也是邓子新团队与彼得·帝丹合作报道了DNA骨架上硫修饰化学本质后持续合作的新成果。 该论文集高敏检测与精细量化于一体，从飞摩尔水平（10-12摩尔）对16种不同序列的磷硫酰化DNA双核苷酸及其在染色体上的修饰频率进行同步鉴定，实现了硫修饰DNA快速、高效、高通量、可定量的化学检测。在此基础上，从栖息于多样化生态环境的多种代表性微生物中发现了新型硫修饰DNA上前所未见的修饰方式包括d（GPST）、d(CPSA)、d（TPSA）、d（APSA）和d（CPSC），阐明了DNA硫修饰在从土壤微生物到海洋微生物，从植物致病菌到人类病原菌，从好氧菌到厌氧菌，甚至在最小......阅读全文
上海交大破译DNA磷硫酰化修饰基因组分布图谱
近日，上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室在DNA磷硫酰化修饰方面取得突破，《Nature Communications》在线发表了由德林教授研究小组的最新进展《Genomic mapping of phosphorothioates reveals partial modif
由德林等破译DNA磷硫酰化修饰基因组分布图谱
记者日前从上海交通大学获悉，该校微生物代谢国家重点实验室由德林研究小组在DNA磷硫酰化修饰方面取得突破。相关成果在线发表于《自然—通讯》杂志。 DNA是生命的遗传物质，由碳、氢、氧、氮、磷五种元素组成。中科院院士邓子新领衔的团队在前期工作中发现了DNA上存在一种全新的修饰——磷硫酰化
揭示了磷硫酰化修饰在全基因组水平上的异质性
DNA是重要的遗传物质，储存着所有蛋白质和RNA的全部遗传信息。DNA上的任何一个微小的变化都有可能改变生命的遗传信息，影响生命活动，如经典的DNA甲基化修饰在生物界具有保护遗传稳定，调控DNA复制、转录以及翻译过程等重要功能。DNA磷硫酰化修饰是由邓子新发现的，DNA骨架上硫原子取代磷原子上
高效的微波辅助氮硫酰基化和硫酯交换制备硫酯化修饰..
通过高效的微波辅助氮-硫酰基化和硫酯交换制备硫酯化修饰的糖肽Efficient Microwave-Assisted Tandem N- to S-Acyl Transfer and Thioester Exchange for the Preparation of a Glycosylat
DNA骨架硫修饰研究又获新成果
上海交通大学、武汉大学与美国麻省理工学院共同合作，以王连荣为第一作者、陈实和彼得·帝丹为共同通讯作者联合完成的论文《DNA磷硫酰化修饰在细菌基因组中广泛分布且量化存在》日前在美国《国家科学院院刊》上发表，这是DNA骨架上硫修饰研究领域又一个新的重大进展，也是邓子新团队与彼得·帝丹合
上海交大研究组揭示细菌DNA新型限制修饰机制
细菌DNA新型限制修饰机制 近日，上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室在DNA磷硫酰化修饰研究方面取得新进展，由德林教授研究小组与美国麻省理工学院Peter C. Dedon教授课题组合作，以博士生曹博为第一作者，在微生物领域顶级期刊《Molecular Mi
研究发现全新DNA单链磷硫酰化修饰系统
DNA单链磷硫酰化修饰-感应修饰限制系统的工作机理 近日，武汉大学药学院教授王连荣课题组在《自然·微生物学》在线发表了细菌DNA磷硫酰化领域的最新研究成果，首次揭示了一套全新的磷硫酰化限制-修饰系统——DNA单链磷硫酰化修饰Ssp系统，并解析了感应基因组修饰抗噬菌体系统的分子机制。 细菌磷硫酰化
邓子新团队DNA骨架硫修饰研究获新突破
近日，上海交通大学邓子新院士团队对DNA骨架硫修饰生物学意义的研究又获得两项突破。 聚焦核酸研究的著名国际学术刊物《核酸研究》(Nucleic Acids Research)以特写文章(Featured article)发表了由该团队由德林副教授主持，博士生徐铁刚和姚芬为共同第一作者的
邓子新团队发现DNA第六元素硫
找到对抗艾滋病新方法，新成果将发表于《自然—化学生物学》 DNA是生命的物质基础，科学界以往认为，它是由五种元素——碳、氢、氧、氮、磷构成的四种核苷酸序列。如今，上海交大科研人员发现了DNA的第六元素——硫，硫的“自我修饰”改变了遗传特性。通过“基因药物”干扰病菌DNA的“硫修饰”，有望对抗癌症和
上海药物所研发新型硫鎓修饰糖肽抗生素
目前全世界每年有70万人死于耐药细菌的感染。万古霉素耐药的金黄色葡萄球菌（VISA，VRSA）和肠球菌（VRE）被世界卫生组织（WHO）列入亟需新型抗生素的12种重要耐药菌之中。 中国科学院上海药物研究所黄蔚、蓝乐夫和宫丽崑研究团队针对耐药菌感染的重大临床需求，积极研发新型糖肽抗生素，在前期研
上海有机化学所硫肽类抗生素生物合成研究取得进展
经过近6年的不懈努力，中国科学院上海有机化学研究所刘文课题组的专家通过最为典型的硫链丝菌素及其类似物盐屋霉素A的比较研究，发现硫肽类抗生素起源于一条核糖体编码的前体肽，经过包括环化脱水/脱氢形成噻唑/咪唑环、脱水形成脱水氨基酸以及【4 + 2】环合反应等后修饰步骤构建了这一家族化合物所共有的特征
多组学挖掘进食DNA硫修饰细菌对线虫寿命的影响
近日，Nature系列刊物Communications biology在线发表了上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室赵一雷教授研究团队的文章“Phosphorothioate-DNA bacterial diet reduces the ROS levels in C. ele
上海植物逆境中心建立植物基因组精确定点修饰技术
中科院上海植物逆境生物学研究中心朱健康课题组近日通过模仿和改造微生物中的一种抵御外源侵染的防护机制，成功开发出一种能对植物基因组进行精确定点修饰的技术，从而使高效植物分子改良性状成为可能。这一适用于植物的CRISPR/Cas技术就像一把剪刀可以对基因组任意感兴趣的位置进行编辑，它的成功开发将革命
化学修饰微生物絮凝剂的研究进展
化学修饰微生物絮凝剂的研究取得了显著进展。研究人员通过多种化学修饰方法改善了微生物絮凝剂的性能。例如，利用酯化、醚化等反应引入特定官能团，增强了微生物絮凝剂的电荷密度和疏水性，从而提高了其对不同类型污染物的絮凝能力。在修饰试剂的选择上，不断有新型、高效且环境友好的试剂被应用。这些试剂不仅能有效地实现
迄今最久微生物基因组草图出炉
英国《自然》杂志日前在线发表的一项演化学研究报告，近乎完整地构建出了一种口腔细菌的基因组，这个有48000年历史的微生物的基因组，是迄今为止历史最悠久的微生物基因组草图，研究同时揭示了尼安德特人的饮食结构。 尼安德特人的DNA序列和现代人类的DNA序列非常相似。他们是现代欧洲人祖先的近亲，从1
研究揭示硫化氢介导的蛋白硫巯化修饰调节免疫稳态机制
硫化氢（H2S）是机体第三类气体信号分子，对机体骨稳态和免疫稳态具有重要作用。细胞凋亡过程中，可释放一类特殊的细胞外囊泡，称为凋亡囊泡。凋亡囊泡具有良好的免疫调节和促再生作用，而凋亡缺陷会导致严重的自身免疫性疾病、衰老和肿瘤等。目前，对于细胞凋亡和硫化氢气体之间的内在相互联系尚未见报道。12月1
研究揭示硫化氢介导的蛋白硫巯化修饰调节免疫稳态机制
硫化氢（H2S）是机体第三类气体信号分子，对机体骨稳态和免疫稳态具有重要作用。细胞凋亡过程中，可释放一类特殊的细胞外囊泡，称为凋亡囊泡。凋亡囊泡具有良好的免疫调节和促再生作用，而凋亡缺陷会导致严重的自身免疫性疾病、衰老和肿瘤等。目前，对于细胞凋亡和硫化氢气体之间的内在相互联系尚未见报道。12月1
伊成器教授Nature子刊：人基因组脱氧尿嘧啶修饰图谱
来自北大-清华生命联合中心的研究人员发表了题为“Genome-wide mapping reveals that deoxyuridine is enriched in the human centromeric DNA”的研究论文，解析了人类基因组上脱氧尿嘧啶的图谱，发现该修饰在染色体的着丝
如何确定微生物絮凝剂化学修饰的最佳条件？
要确定微生物絮凝剂化学修饰的最佳条件，可以采取以下步骤：选择修饰方法和试剂：根据微生物絮凝剂的化学结构和预期的修饰效果，选择合适的化学修饰方法和试剂。设计实验方案：确定要研究的因素，如试剂浓度、反应温度、反应时间、pH 值等。为每个因素设定合理的水平范围。进行单因素实验：依次改变一个因素，保持其他因
微生物絮凝剂化学修饰的常用方法有哪些？
微生物絮凝剂化学修饰的常用方法包括：羧甲基化：在碱性条件下，将微生物絮凝剂中的羟基与氯乙酸或其钠盐反应，引入羧甲基，从而增加其水溶性和负电荷密度。磷酸化：使微生物絮凝剂与磷酸化试剂反应，引入磷酸基团，增强其电荷特性和与金属离子的络合能力。胺化：通过与胺类化合物反应，将氨基引入微生物絮凝剂分子中，改变
美发明可识别固氮细菌的选择剂
据《每日科学》网站8月25日报道，美国科学家发明了一种识别固氮细菌的方法，无需经过基因组测序或者遗传修饰，这将有利于更好地产生清洁能源氢气。 固氮细菌是以空气中的氮气为养料，形成自身蛋白质的微生物，它们生活在土壤以及某些植物的根部，把空气中的氮转化成化学养分来供植物生长。固氮细菌是氢的重要微生物来
宏基因组如何指导微生物分离培养
近日，中国农业科学院北京畜牧兽医研究所奶产品质量与风险评估科技创新团队受邀撰写综述文章，阐述了宏基因组指导未培养微生物分离培养的机遇与挑战，系统总结了基于宏基因组分离培养未培养微生物的方法。相关综述文章发表在《微生物》（Microbiome）。 随着宏基因组测序技
单分子测序改善微生物基因组组装
美国国家生物防卫分析和反制中心的研究人员近日在《Genome Biology》上发表文章，介绍了SMRT技术在微生物基因组组装上的应用。他们认为，单分子测序数据能降低测序费用，并带来更多完整的基因组，改善微生物基因组数据库的质量。 随着测序费用的不断下降，测序项目的数量也在不断上升。G
宏基因组如何指导微生物分离培养
近日，中国农业科学院北京畜牧兽医研究所奶产品质量与风险评估科技创新团队受邀撰写综述文章，阐述了宏基因组指导未培养微生物分离培养的机遇与挑战，系统总结了基于宏基因组分离培养未培养微生物的方法。相关综述文章发表在《微生物》（Microbiome）。 随着宏基因组测序技
北京基因组所揭示共转录m6A修饰建立机制及功能
4月2日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）任捷团队和杨运桂团队，在《分子细胞》（Molecular Cell）上在线发表了题为DDX21 mediates co-transcriptional RNA m6A modification to promote transcription
化学修饰微生物絮凝剂的具体方法有哪些？
化学修饰微生物絮凝剂的具体方法包括以下几种：酰化反应：通过将微生物絮凝剂中的羟基、氨基等官能团与酰化试剂反应，引入酰基，从而改变其化学性质和物理性质。醚化反应：使微生物絮凝剂中的羟基与醚化试剂反应，形成醚键，以调整其性能。酯化反应：利用微生物絮凝剂中的羧基或羟基与醇类进行酯化反应，增加其疏水性或改变
微生物絮凝剂化学修饰方法的选择依据是什么？
选择微生物絮凝剂化学修饰方法的依据主要包括以下几个方面：微生物絮凝剂的化学结构和官能团：了解微生物絮凝剂的主要化学组成和存在的官能团，根据这些特点选择能够与之反应并实现预期修饰效果的方法。期望达到的性能改进目标：如果希望增强絮凝剂的水溶性，可能会选择引入亲水基团的修饰方法；若要提高对特定离子或污染物
上海交大赵一雷教授Sci－Rep解析DNA磷硫酰化修饰新机制
上海交通大学生命科学技术学院、微生物代谢国家重点实验室等处的研究人员发表了题为“Mechanistic investigation on ROS resistance of phosphorothioated DNA”的文章，通过体内/体外实验和理论计算相结合的方法，揭示了磷硫酰化修饰DNA抵抗
北京基因组所合作揭示RNA－m6A修饰调控抗肿瘤免疫机制
免疫治疗是对抗肿瘤的前沿阵地，其治疗成功的关键是引发针对肿瘤抗原的自发性T细胞反应。许多病人的免疫系统无法有效识别肿瘤抗原，难以引发持续性的T细胞应答并清除肿瘤。研究免疫系统识别肿瘤抗原的分子机制有望发现新型药物靶点，提高免疫治疗效果。 中国科学院北京基因组研究所韩大力团队与清华大学徐萌团队、
华大基因完成肠道微生物基因组关联分析
从物种、功能及生态群落上展示肠道微生物与结直肠腺瘤及结直肠癌的关联特征，这是深圳华大基因研究院、奥地利因斯布鲁克医科大学、奥本多夫医院、丹麦哥本哈根大学、华南理工大学等多家单位最新的联合取得的科研进展。3月11日，国际学术期刊《自然通讯》杂志发表了这项研究成果。该研究对结直肠腺瘤、结直肠癌的早期