Nature发布大规模癌症蛋白质基因组学研究重要成果
基于来自癌症基因组图谱(TCGA)计划的数据，一个多机构科学家小组完成了首个大规模的乳腺癌“蛋白质基因组学”（ proteogenomic）研究，将一些DNA突变与蛋白质信号联系到一起，并帮助确定了一些驱动癌症的基因。 这项研究旨在通过蛋白质和它们的修饰来更好地认识癌症。发表在5月25日《自然》（Nature）杂志上的研究论文，证实了相比于单独采用任一种分析方法，整合基因组和蛋白质组数据来生成更完整的癌症生物学图像的能力。 论文的资深作者、Baylor医学Lester 和Sue Smith乳腺中心主任及教授Matthew Ellis博士说：“我们还没有充分认识复杂的癌症基因组是如何转化为导致复发和死亡的驱动生物学的。这些研究结果表明整合蛋白质基因组学有一天可能会被证明是一种强大的临床工具，使得我们能够横跨癌症基因组学与临床效应之间巨大的知识鸿沟。” 索取博奥生物蛋白质组学与核酸平台详细技术资料请填写联系方式 这项研究......阅读全文
PNAS：特殊蛋白质可控制机体“基因组卫士”
近日，发表在国际杂志PNAS上的一篇研究报告中，来自蒙特利尔临床研究学院的科学家通过研究鉴别出了免疫反应已知机制的一种新的作用亮点，研究人员发现了一种新型特殊蛋白，其可以控制“基因组卫士”—p53肿瘤抑制蛋白的活性。 文章中，研究者对T细胞和B细胞的发育也进行了深入研究，这两种细胞均是保
蛋白质组学之逆袭，深度注释基因组
申请课题缺创新点？撰写论文没思路？急着毕业时间紧？别怕，对于吉凯，一切都是套路！更有甚者，对于宇宙终极难题：“屌丝如何逆袭白富美？”老司机黄博也有一套经典案例分享给大家。 从前，在生物学研究领域，有一个白富美叫基因组学（Genomics），她有一项强大的技能：DNA测序，凭借这项技能，她完
蛋白质、基因组与人类疾病有了关联图
据《科学》杂志近日发表的一项最新研究，研究人员将人体血液中的数千种蛋白质数据与遗传数据相结合，绘出了蛋白质、基因组与人类疾病的网络关系图，显示了影响这些蛋白质的遗传差异如何将多种多样的相关疾病联系在一起。通过创建基因组蛋白质组图，科学家们发现了不同人类疾病之间的数百种新联系。 蛋白质故障会导
蛋白质、基因组与人类疾病有了关联图
据《科学》杂志近日发表的一项最新研究，研究人员将人体血液中的数千种蛋白质数据与遗传数据相结合，绘出了蛋白质、基因组与人类疾病的网络关系图，显示了影响这些蛋白质的遗传差异如何将多种多样的相关疾病联系在一起。 通过创建基因组蛋白质组图，科学家们发现了不同人类疾病之间的数百种新联系。 蛋白质故障会
Nat－Rev－Cancer综述：肿瘤蛋白质基因组学
导 读 肿瘤蛋白质基因组学（Cancer proteogenomics）是将基于质谱（MS）的蛋白质丰度和翻译后修饰（PTM）信息与临床前肿瘤模型和肿瘤样本的基因组、表观基因组和转录组数据相结合的组学技术。基因组学和表观基因组学为解释可能发生的生物过程提供了基础知识，蛋白质组学是对已经发
《基因组蛋白质组与生物信息学报》：蛋白质组学技术面临
《基因组蛋白质组与生物信息学报》：蛋白质组学技术面临挑战 2003年4月人类基因组图谱基本绘制完成，但对基因的调节与功能问题仍未能解读。由于基因的功能主要是通过其编码的蛋白质来实现，蛋白质才是生命活动真正的执行者，所以越来越多的科学家致力于蛋白质的研究，试图找出人类疾病的致病机理，最终解决人类
蛋白质组学之逆袭：深度注释基因组（三）
人类尚未充分认识复杂的癌症基因组是如何转化为导致复发和死亡的驱动生物学的，将蛋白质组学与基因组学结合在一起能够让我们获得对癌症的新认识，同时提供一种有价值的资源以便科学界能够用来提出关于这些疾病的新假设，以及治疗它的手段。蛋白质基因组学终有一天会被证明是一种强大的临床工具，使得人类能够横跨癌症基因组
蛋白质组学不能被基因组和转录组取代
基因和蛋白并不存在严格的线性关系ORF并不预示一定存在相应的功能性基因mRNA水平并非与蛋白质的表达水平对应翻译后修饰及同工蛋白质（isforms)等现象在基因水平无从表现
蛋白质组学之逆袭：深度注释基因组（一）
申请课题缺创新点？撰写论文没思路？急着毕业时间紧？别怕，对于吉凯，一切都是套路！更有甚者，对于宇宙终极难题：“屌丝如何逆袭白富美？”老司机黄博也有一套经典案例分享给大家。从前，在生物学研究领域，有一个白富美叫基因组学（Genomics），她有一项强大的技能：DNA测序，凭借这项技能，她完成了对多种物
蛋白质组学之逆袭：深度注释基因组（二）
针对一些乳腺癌亚型和携带常见突变如PIK3CA和TP53突变的肿瘤，分析结果揭示出了一些新的蛋白质标记物和信号通路。另外将一些基因中的拷贝数改变与蛋白质水平联系一起，从而鉴别出了10个新的候选调控因子。其中两个候选基因SKP1和 CETN3可能与癌基因EGFR有关联。EGFR是一种特别具有侵
日科学家发现可抑制基因组损伤的蛋白质
日本科学家发表于最新一期《自然》杂志网络版的论文说，他们经动物实验发现，人类以及许多动物体内都有的Zuc蛋白质在抑制转位子造成的基因组损伤过程中发挥着重要作用，这项研究成果将有助于解开不孕症发病的机制。 日本科学技术振兴机构和东京大学15日联合发表新闻公报介绍了上述成果。公报说，动物基因组
逐次修正基因组法：有效提高非模式生物蛋白质组鉴定...
逐次修正基因组法：有效提高非模式生物蛋白质组鉴定的新策略随着高通量测序技术的不断崛起，全基因组测序也逐步普及。越来越多的物种基因组予以公布。目前，主要有两种获得研究物种参考基因组的策略：de novo 基因组拼接和基于mapping算法的基因组序列修正，mapping是指将所有测序读段通过序列比对定
Nature发布大规模癌症蛋白质基因组学研究重要成果
基于来自癌症基因组图谱(TCGA)计划的数据，一个多机构科学家小组完成了首个大规模的乳腺癌“蛋白质基因组学”（ proteogenomic）研究，将一些DNA突变与蛋白质信号联系到一起，并帮助确定了一些驱动癌症的基因。 这项研究旨在通过蛋白质和它们的修饰来更好地认识癌症。发表在5月25日《自然
基因组所开发出编码蛋白质DNA序列并行比对工具ParaAT
中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室“百人计划”章张研究员，带领其团队成功开发出“编码蛋白质DNA序列并行比对工具—ParaAT（Parallel Alignment and back-Translation）”。该研究成果发表在Biochemical and Biop
对人结肠癌组织开展了基因组和蛋白质组分析
贝勒医学院的研究人员近日对人结肠癌组织开展了基因组和蛋白质组分析，并将结果发表在《Cell》杂志上。这种全面的研究策略有助于深入了解结肠癌，并有望推动早期诊断和新型疗法的开发。Bing Zhang博士 在贝勒医学院分子和人类遗传学教授Bing Zhang的领导下，研究团队生成了基因组和蛋白质组
基因组学与蛋白质组学两大巨头建立合作
AB Sciex和Illumina公司近日联手推出OneOmics™ 计划，其目的是在云计算环境中结合新一代蛋白质组学（NGP）和新一代测序（NGS）的工具。作为此计划的一部分，Illumina的应用商店BaseSpace将托管AB Sciex的SWATH™ 蛋白质组学云工具，这使得BaseSp
《基因组蛋白质组与生物信息学报》影响因子显著提高
在日前举行的第四届中国英文版科技期刊研讨会上，中国科学技术信息研究所发布了《2007年版中国英文版科技期刊引证报告》。根据这一报告提供的数据，中科院北京基因组研究所主办的《基因组蛋白质组与生物信息学报》（Genomics, Proteomics & Bioinformatics，简称GPB）的
人类结肠癌蛋白质基因组学分析揭示出新的治疗策略
在一项新的研究中，来自美国国家癌症研究所、贝勒医学院、太平洋西北国家实验室、华盛顿大学、范德堡大学和得克萨斯大学卫生科学中心等研究机构的研究人员通过对来自患者的结肠癌组织产生的全部基因和蛋白的分析，对这种肿瘤有了更全面的认识，并指出新的癌症生物学机制和可能的新治疗策略。这项研究强烈支持对肿瘤组织
基因组学做不了的事－蛋白质组学更精准打击癌症
近日，国际人类蛋白质组组织公布了2020年度权威奖励获奖名单，中国科学院院士、军事科学院军事医学研究院研究员贺福初荣获蛋白质组学杰出成就奖。 贺福初院士率先提出人类蛋白质组计划的科学目标与技术路线，倡导并领衔了人类第一个关于组织、器官的蛋白质组计划，揭示了人体首个器官（肝脏）蛋白质组。2014年
修正基因组法有效提高非模式生物蛋白质组鉴定的新策略
随着高通量测序技术的不断崛起，全基因组测序也逐步普及。越来越多的物种基因组予以公布。目前，主要有两种获得研究物种参考基因组的策略：de novo 基因组拼接和基于mapping算法的基因组序列修正，mapping是指将所有测序读段通过序列比对定位到参考基因组上。De novo 基因组拼接是利用短
组学期刊三巨头：《基因组、蛋白质组与生物信息学报》
近年来GPB的中国风封面 冯丽妃摄 从编委到现任执行副主编，美国费城儿童医院和宾夕法尼亚大学教授邢毅与《基因组蛋白质组与生物信息学报》（Genomics, Proteomics & Bioinformatics，以下简称GPB）期刊结缘已近10年。前些年，该刊编辑部不时找他约稿子，以解“缺米之炊”
“十二五”基因组和蛋白质组技术发展战略研究启动
6月9日至10日，科技部中国生物技术发展中心在深圳组织召开了“基因组和蛋白质组技术发展战略研讨会”，标志着该领域的“十二五”发展战略规划研究正式启动。国内从事基因组学和蛋白质组学研究的院士、专家、学者共40多人参加了会议。科技部基础司张先恩司长应邀出席会议，生物中心马宏建副主任、深圳市委常委、常
十二五基因组和蛋白质组技术发展战略研究启动
6月9日至10日，科技部中国生物技术发展中心在深圳组织召开了“基因组和蛋白质组技术发展战略研讨会”，标志着该领域的“十二五”发展战略规划研究正式启动。国内从事基因组学和蛋白质组学研究的院士、专家、学者共40多人参加了会议。科技部基础司张先恩司长应邀出席会议，生物中心马宏建副主任、深圳市委常委、常
Cell：人类结肠癌蛋白质基因组学分析揭示新的治疗策略
近日，美国贝勒医学院及太平洋西北国家实验室的科学家们利用基因组蛋白组学相结合的分析技术首次对人类结肠癌的蛋白基因组进行了详尽的分析，全面剖析了结直肠癌相关生物标志物、药物靶点和肿瘤抗原，并在Cell杂志上发表题为“Proteogenomic Analysis of Human Colon Can
中国本土期刊《基因组蛋白质组与生物信息学报》被SCIE收录
由中国科学院主管、中国科学院北京基因组研究所和中国遗传学会主办的英文期刊Genomics, Proteomics & Bioinformatics（简称GPB，中文名《基因组蛋白质组与生物信息学报》，ISSN 1672-0229，CN 11-4926/Q）于2017年8月被科睿唯安旗下的Scie
自然：二倍体蚕豆基因组解开全球蛋白质作物的变异之谜
丹麦奥胡斯大学Stig Uggerhøj Andersen等研究人员的最新发现表明，巨大的二倍体蚕豆基因组解开全球蛋白质作物的变异之谜。2023年3月8日，《自然》杂志在线发表了这项成果。研究人员介绍，在目前肉类丰富的饮食中增加当地生产的植物蛋白的比例，可以大大减少温室气体排放和生物多样性的损失。然
谁在先？“鸡基因组”和“鸡蛋基因组”
是先有鸡还是先有鸡蛋？这个问题相当恼人，恐怕很难说清楚。现在，研究人员回答了与这个问题一样恼人的问题：是人类基因组中的成千上万的长重复DNA片段中，那个是第一个产生的？那些被复制了？ 这个答案发表在10月7日的《自然·遗传学》杂志上。该研究给出了人类基因组中DNA重复片段复制的第一个进化证据，这种
巨大的二倍体蚕豆基因组解开全球蛋白质作物的变异之谜
丹麦奥胡斯大学Stig Uggerhøj Andersen等研究人员的最新发现表明，巨大的二倍体蚕豆基因组解开全球蛋白质作物的变异之谜。2023年3月8日，《自然》杂志在线发表了这项成果。研究人员报告了一个高质量的染色体尺度的蚕豆基因组组装，并表明它已经通过扩增和消除逆转录基因和卫星重复的速度之间的
基因组测序
如果楼主指的是人类基因组计划，那时用的方法叫做双脱氧终止法，也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成过程中，DNA聚合酶能够使用ddNTP(双脱氧核苷酸）来作为原料，但它的反应会在加入ddNTP的时候终止。具体实验是通过PCR来完成的，但与普通PCR不同，它只需要一个引物而不是一对。在4个相同的
叶绿体基因组
叶绿体是地球上绿色植物把光能转化为化学能的重要细胞器，叶绿体中进行的光合作用是严格地受到遗传控制的。早在20世纪初，人们就已知叶绿体的某些性状是呈非孟德尔式遗传的，但直到60年代才发现了叶绿体DNA(chloroplast DNA，ctDNA)。叶绿体基因组是一个裸露的环状双链DNA分子，其大小在1