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染色质免疫沉淀法（Chromatin immunoprecitation,ChIP)是研究体内ＤＮＡ与蛋白质相互作用的重要工具.它可以灵敏地检测目标蛋白与特异ＤＮＡ片段的结合情况,还可以用来研究组蛋白与基因表达的关系.核小体组蛋白可以发生多种翻译后的共价修饰,如乙酰化、甲基化、磷酸化、泛素化等,这些共价修饰与真核基因的表达密切相关.根据“组蛋白密码”假说,组蛋白的各种共价修饰的组合,会以协同或拮抗的方式诱导特异的下游生物学功能因此,ChIP也为研究组蛋白修饰在基因表达中的作用,全面阐明真核基因的表达调控机制提供了强有力的研究工具。真核生物细胞状态是由内源和外源因素共同影响的，所有信号传递途径的终点都是DNA。DNA通过核蛋白复合物组成染色质，染色质是基因调控的一个重要作用位点。转录激活因子和辅助抑制因子的研究显示存在一种新的调节机制 --"组蛋白密码"，其信息存在于组蛋白的转录后修饰等过程中。该类修饰包括组蛋......阅读全文
染色质免疫沉淀法（Chromatin immunoprecitation，ChIP）是研究体内DNA与蛋白质相互作用的重要工具。它可以灵敏地检测目标蛋白与特异DNA片段的结合情况，还可以用来研究组蛋白与基因表达的关系。核小体组蛋白可以发生多种翻译后的共价修饰，如乙酰化、甲基化、磷酸化、泛素化等，这些
实验概要 The immunoprecipitation (IP) of cross-linked chromatin with antibodies specific for certain histone modifications (chromatin &nb
METHOD Analysis of precipitated chromatin fractions (from Chromatin Immunoprecipitation on Unfixed Chromatin from Cells and Tissues to Analy
INTRODUCTION After chromatin immunoprecipitation (ChIP), different PCR-based approaches can be used to determine how much DNA is p
The eukaryotic genome is packaged by histone and nonhistone proteins to form chromatin. The assembly of nucleosomesas well as compaction of nucleosoma
The chromatin packaging of the genome is dynamic, changing with the cell cycle and with transcriptional regulation. During mitosis, chromatin is conde
INTRODUCTIONAfter chromatin immunoprecipitation (ChIP), different PCR-based approaches can be used to determine how much DNA is precipitated at a locu
INTRODUCTIONAfter chromatin immunoprecipitation (ChIP), different PCR-based approaches can be used to determine how much DNA is precipitated at a locu
实验概要Native chromatin immunoprecipitation to query specific chromatin states of individual genes. 主要试剂10 x TBS 0.1 M Tris-HCl (pH 7.5) 1.5 M NaCl
Fine Mapping of Genomic Targets of Nuclear Proteins in Cultured CellsAchim Breiling and Valerio OrlandoDulbecco Telethon Institute, Institute of Genet
染色质重塑复合物利用ATP的能量移动核小体在基因组上的位置和组成成分，在控制染色质结构、调节基因转录等方面具有重大作用，主要可以分四大类：SWI/SNF、CHD、ISWI和INO80【1】。这些分子机器的运行机理，即如何利用ATP水解的能量推动核小体移动和组蛋白交换，一直是一个未解的科学问题。利
1. The preparation of native chromatin from cultured human cells1.1.Cultured cells (e.g. HL-60 or lymphoblastoids) are grown to a density of approxima
近年来，深度学习等人工智能技术在图像识别，自然语言处理等领域取得了令人瞩目的成就。人工智能技术应用于生命科学，对生物信息多个领域产生了重大的影响。深度学习算法借助于生命科学大数据的飞速发展，从海量大数据中自动高效地提取特征进行学习，极大超越了依赖人工提取特征的传统人工智能算法，在医疗图像处理、结
Dr. William H. Heidcamp, Biology Department, Gustavus Adolphus College Exercise 10.3 - Extraction of ChromatinLEVEL IIMaterials Bovine
Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象，利用高通量测序技术，结合生物信息分析方法，研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系，获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-S
One mechanism used by cytotoxic T cells to kill tumor cells and virus-infected cells is the release of perforin and granzyme proteins. Perforin protei
Packaging of DNA into chromatin allows the cell to store its genetic information efficiently and has an important role in regulating gene expression.
The packaging of eukaryotic DNA into nucleosomes inhibits the access of factors to DNA and results in the repression of transcription, replication and
染色质结构通过促进或抑制该结构的转录可以控制基因组的功能和细胞身份认定。这些染色质结构中存在特定的组蛋白翻译后修饰（posttranslational modifications，PTMs），它们与特定转录状态相关，并可促进抑制性染色体结构的形成，影响基因的表达【1】。 为了在细胞分裂时依然保
美国霍华德休斯医学研究所Zhe Liu、加州大学伯克利分校Robert Tjian等研究人员合作，开发了用于可及性基因组超分辨成像的新型显微镜。 这一研究成果于2020年3月16日在线发表在《自然—方法学》上。 为了在纳米尺度上对可及性基因组进行原位成像，研究人员开发了转座酶可及性染色质光激
染色体构象捕获3C（chromosome conformation capture【1】）和Hi-C（high-throughput chromosomeconformation capture【2,3】）测序技术已经逐渐成熟，成为研究远距离基因调控机制的重要方法。越来越多的学者提出分析Hi-C
Apoptotic cell death can be triggered by many different cellular stimuli, resulting in activation of apoptotic signaling pathways including caspases (
染色质的3D结构会随着细胞的生活周期而变化，对我们人体的健康和疾病发生产生重要的影响。近年来随着新技术的发展，科学家们发现染色质折叠让一些DNA片段彼此靠近并发生互作，他们将这样的区域称为拓扑相关结构域TAD。大脑中TAD结构与神经精神疾病的患病风险息息相关，但这一研究领域仍存在许多未解之谜。来自西
染色质（Chromatin）最早是1879年Flemming提出的用以描述核中染色后强烈着色的物质。现在认为染色质是细胞间期细胞核内能被碱性染料染色的物质。染色质的基本化学成分为脱氧核糖核酸核蛋白，它是由DNA、组蛋白、非组蛋白和少量RNA组成的复合物。染色质是真核生物基因组DNA存在的主要形式。因
Chromosomal DNA Prep : cultured cells/tissue samples (Mike A Dyer)This protocol was developed for cultured cells but should be appropriate for di
日本九州大学和东京理工学院的科学家们研发了一种使用非常少量的细胞，范围从100到1000的细胞，来分析DNA-蛋白质相互作用的新技术。他们的方法可以捕获前所未有的细胞内表观遗传组信息，该技术奖促进生物标记的发现并为精准医学开辟新道路。 这项被称为染色质整合标记测序（Chromatin Inte
7月21日，发表在Science上的一项研究中，科学家们发表了关于染色体追踪的一项重要成果。哈佛大学庄小威教授以及哈佛医学院Chao-ting Wu 教授是本文的共同通讯作者。 染色质的空间组织从很大程度上影响着基因组的功能。最近，科学家们通过染色体-构象-捕捉揭示了间期染色体大量的结构信息，
11月17日Cell杂志SnapShot专栏介绍了表观遗传研究的检测方法，这四种方法包括：亚硫酸氢钠测序法（bisulfite sequencing）、染色质免疫沉淀测序技术（chromatin immunoprecipiation sequencing）、开放染色质测定（determinati
在真核生物细胞内，DNA缠绕着组蛋白八聚体形成染色质的基本组成单位，核小体。染色质在包装、保护遗传物质方面发挥着关键作用。 染色质形成同时对细胞内的一些生理过程，如DNA复制、转录、修复等产生了巨大的障碍。为此SWI/SNF家族染色质重塑复合物通过利用ATP水解的能量调控染色质的结构，广泛参与
Andrea J. Gossett and Jason D. Lieb1Department of Biology, University of North Carolina at Chapel Hill, Chapel Hill, NC 27599, USA1Correspon