解析肿瘤HiC多组学研究策略

Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-Seq、ChIP-Seq、ATAC-Seq等数据进行联合分析,从基因调控网络和表观遗传网络来阐述生物体性状形成的相关机制。今天,小编以一篇经典文献带您了解Hi-C技术在疾病发生机制中的应用。 题目:Chromatin interaction analysis reveals changes in small chromosome and telomere clustering between epithelial and breast cancer cells期刊:Genome Biology影响因子:11.908研究目的......阅读全文

解析肿瘤HiC多组学研究策略

Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-S

解析肿瘤HiC多组学研究策略,IF≥10+文章不是梦!

   Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-Se

中药多组学研究取得重大突破

  中药材基因资源是国家战略资源,其挖掘、保护和利用是中药资源可持续发展的首要关键。近期,中国中医科学院中药研究所团队基于多组学技术成功揭示了紫苏、黄连、大青叶等药用植物的基因遗传背景,相关研究成果以三篇研究论文形式连续发表在国际著名权威学术期刊《自然通讯》上,引起了国际学术界对我国中药应用基础性研

中药多组学研究取得重大突破

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植物多组学比较和进化研究平台发布

近日,西北农林科技大学生命科学学院马闯教授团队发布了植物多组学数据跨物种比较和进化研究的在线分析平台,相关成果发表在Molecular Biology and Evolution上。进化是植物性状遗传多样性和适应生存环境的基础,而基因变异是物种进化的源动力。随着后基因组时代高通量技术的发展和应用,在

多组学研究助力玉米种质资源创新利用

  近日,中国农业大学农学院、国家玉米改良中心王向峰教授在《科学通报》(英文版)(Science Bulletin)上发表了方法学研究论文。   农作物种质资源精准鉴定与基因挖掘是从源头上实现种业创新、保障粮食安全的根本路径,是生物育种重点攻关的关键技术之一。全基因组关联分析(GWAS)是通过推断

多组学研究助力玉米种质资源创新利用

近日,中国农业大学农学院、国家玉米改良中心王向峰教授在《科学通报》(英文版)(Science Bulletin)上发表了方法学研究论文。 农作物种质资源精准鉴定与基因挖掘是从源头上实现种业创新、保障粮食安全的根本路径,是生物育种重点攻关的关键技术之一。全基因组关联

研究人员建立衰老生物学多组学数据库

  随着人口老龄化程度加剧,实现健康老龄化是亟待解决的社会问题和科学问题。近年来,随着衰老相关研究成果的不断增多和高通量测序技术的日益发展,衰老相关多组学数据层出叠见。然而,目前尚缺乏综合性的整合衰老生物学多组学数据的数据资源库。  中国科学院动物研究所刘光慧研究组、曲静研究组,与北京基因组研究所(

三维基因组(HiC)技术解析

  Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-Seq

三维基因组(HiC)技术解析

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三维基因组(HiC)技术解析

Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-S

布鲁克质谱:拓展多组学研究边界-推动临床转化

  --布鲁克中国区经理何磊先生专访  分析测试百科网讯,自2017年推出timsTOF以来,布鲁克每年都在为科学家们带来创新的产品,今年六月就推出了第二代timsTOF Pro 2和单细胞蛋白质组研究平台timsTOF SCP。布鲁克质谱中国区业务快速增长,不仅来源于创新的产品,也同中国团队的努力

带你解析肿瘤预后模型研究套路

    研究背景  头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)是全球人类第六大最常见的恶性肿瘤,超过50%的HNSCC确诊患者处于晚期。免疫系统的失衡在以免疫抑制性疾病为特征的HNSCC的发展中起着至关重要的作用。因此,应进一步探索肿瘤免疫微环境(TIME)的调节机制,以确定可精确预测预后及优化免疫疗法的有效生

研究团队部合作建立衰老生物学多组学数据库

  随全球人口老龄化程度加剧,实现健康老龄化是目前亟待解决的社会问题和科学问题.近年来,随衰老相关研究成果不断增多及高通量测序技术日益发展,衰老相关多组学数据逐渐增多.然而目前,尚缺乏一个综合性的、整合衰老生物学多组学数据的数据资源库.  中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)研究员鲍一明研

蛋白质组组学研究的基本策略

蛋白质组 蛋白质组(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出,指由一个基因组(genOME),或一个细胞、组织表达的所有蛋白质(PROTein). 蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别,它随着组织、甚至环境状态的不同而改变. 在转录时,一个基因可以多种mRNA形式剪接,并且,同一

如何选择技术方法来进行单细胞多组学研究

现阶段,科学家们已经开始以单细胞分辨率组合多层信息。这些“多组学”技术可以更仔细地观察细胞之间的可变性,更清楚地识别特定细胞及其功能。分析基因组DNA揭示了单细胞基因组,甲基化组织或染色质,而分析RNA和蛋白质则能分别产生转录组和蛋白质组数据。如何做出选择有了这么多种的检测方法可供选择,研究人员还需

著名癌研究学者PNAS解析肿瘤转移

  来自美国哈佛大学医学院和麻省总医院的研究人员发现联合使用3种靶向抗癌药物,能推迟HER2阳性乳腺癌脑转移,这不仅有助于临床上开发针对HER2阳性乳腺癌的新型治疗方法,也对于进一步解析乳腺癌脑转移作用机制具有重要意义。相关研究成果公布在《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志上。   领导这一研究

代谢组学——肿瘤研究的利器

  细胞内许多生命活动是发生在代谢物层面的,代谢物更多地反映了细胞所处的环境,比如细胞现在是不是健康?药物是否起效?环境污染物是不是正在伤害细胞?等等。由此,20世纪90年代,衍生出了一门新学科:代谢组学。它回答了基因组学和蛋白质组学不能回答的问题:细胞到底发生了什么?  1、肿瘤与代谢组学  肿瘤

骨组织学研究解密水龙兽生存策略

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454791.shtm 新疆水龙兽的骨组织显微结构 近日,中国地质大学(武汉)副教授韩凤禄与中国科学院古脊椎动物与古人类研究所研究员刘俊、副研究员赵祺合作完成了对新疆地区水龙兽骨组织学的初步研

蛋白质组学研究的策略和范围

蛋白质组学一经出现,就有两种研究策略。一种可称为“竭泽法”,即采用高通量的蛋白质组研究技术分析生物体内尽可能多乃至接近所有的蛋白质,这种观点从大规模、系统性的角度来看待蛋白质组学,也更符合蛋白质组学的本质。但是,由于蛋白质表达随空间和时间不断变化,要分析生物体内所有的蛋白质是一个难以实现的目标。另一

ACS-Central-Sci:研究开发肿瘤靶向治疗新策略

  在杀死肿瘤细胞的同时保留正常细胞是癌症化疗的核心挑战。现在,研究人员已经制造出一种水凝胶,当注射到小鼠肿瘤附近时,可以招募药物来缩小肿瘤,副作用也更少。他们将研究结果发表在ACS Central Science。图片来源:ACS Central Science  科学家们试图通过将抗体附着在癌细

仅需10万个细胞!“升级版”HiC技术,大大降低建库门槛

  作为遗传物质的载体,染色体在细胞中并不是随机分布的。近年来,越来越多的研究开始关注染色体的空间结构。大量证据表明,染色体构象与基因表达、DNA复制、DNA损伤修复以及基因组的稳定性密切相关。  Hi-C是近年发展起来的三维基因组学研究利器,由高通量测序技术(High-throughput seq

高通量解析骨质疏松非编码易感变异被揭示

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/517668.shtm西安交通大学生命科学与技术学院杨铁林教授团队开发了一个增强子调控网络打分方法,鉴定了33个显著富集的转录因子,并发现这些转录因子显著富集到转录激活和骨代谢相关分子通路。近日该研究成果发

多组分着色策略,实现高性能光响应变色材料

  功能(智能)材料在满足人类需求的电子产品中扮演着重要角色,其中的光致变色材料因其广阔的应用前景备受青睐(例如:其在医疗和其他领域的传感检测、在电子显示、在满足人们信息交流和日用产品需求等方面的潜在应用)。现有的光驱动变色体系中,主要分为传统的紫外光驱动和新兴的可见光驱动两大类。相比于紫外光驱动材

精准医疗大会—聚焦大队列、大数据、多组学技术研究突破

  导读:2018年12月1-2日,北京朗丽兹西山花园酒店,P4 China 第三届国际精准医疗大会将隆重召开!有美中院士领衔的主旨论坛+队列与多组学转化研究论坛+肿瘤精准诊断与用药研究论坛+精准医疗产业技术开发论坛四大细分论坛分别围绕科研转化、应用探索及技术开发进行深入分享与探讨。  届时Illu

暨南大学研究团队为肿瘤患者带来全新治疗策略

  11月25日,暨南大学尹芝南教授团队重大科研成果转让签约仪式在广州举行。会上,暨南大学与广东暨德康民生物科技有限责任公司,就尹芝南团队的科研成果“同种异体Vγ9Vδ2-T细胞免疫疗法”签署成果转让协议。基于对科研成果转化的政策扶持,暨南大学将该项非ZL技术成果转让给广东暨德康民生物科技有限责任公

暨南大学研究团队为肿瘤患者带来全新治疗策略

    签约现场。暨南大学 供图  11月25日,暨南大学尹芝南教授团队重大科研成果转让签约仪式在广州举行。会上,暨南大学与广东暨德康民生物科技有限责任公司,就尹芝南团队的科研成果“同种异体Vγ9Vδ2-T细胞免疫疗法”签署成果转让协议。基于对科研成果转化的政策扶持,暨南大学将该项非ZL技术成果转让

布鲁克发布全新空间单细胞代谢组学研究策略

  摘要  * 创新的无偏原位空间单细胞代谢组学(SSCM)能够以单细胞分辨率实现高通量代谢组织样本表征;  * 基于 timsTOF fleX MALDI 的全新 5 μm microGRID 技术可在大视场内提供几乎无伪影的小分子图像;  * 创新的 4D-代谢组学可通过 CCS-Predict

Bruker投资PreOmics扩展蛋白质组学研究策略

PreOmics宣布完成B轮融资,以加快蛋白质组学工具和耗材的研发和商业化PreOmics提供独特的技术、先进的自动化解决方案和高性能耗材,用于生物制药和临床研究的无偏深层蛋白质组学中活检、组织、细胞系和血浆样品的均化、富集和样品制备    德国慕尼黑——2022年1月18日——PreOmics G