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美国最大生物银行初具规模发布初始研究成果

在近期举行的美国人类遗传协会(ASHG)年会上,研究人员整合了他们收藏的加利福尼亚州北部10万人的基因和医学数据,并发布了初始研究成果。这将帮助建成美国规模最大的“生物银行”。 《科学》杂志相关报道称,科学家的这些努力工作已经揭示了死亡数和染色体终端的有趣联系,并发现了遗传性变型和疾病特性的新关联。“这只是开始。”来自凯萨医疗机构――KP,一个大型保健组织――的“银行”管理者们指出。 生物银行计划是以收集大范围人群的医学和DNA数据,寻找疾病、生活方式、性格和基因之间的联系为目标的诸多计划之一。十多年前,冰岛DeCODE Genetics公司开创了生物银行的先河,目前,它已经拥有14万年冰岛人的相关数据。并且,英国生物银行已经登记了约50万人的数据,虽然还没有检测他们的DNA,但是,这将有望成为世界上最大的生物银行。 目前,美国几个较大的生物银行正在建设中,例如,KP的研究部门和来自加州大学旧金山分校(......阅读全文

科学家开发出集合人类血液中化合物的可视化数据库!

  日前,一项刊登在国际杂志Nucleic Acids Research上的研究报告中,来自日本东北大学的研究人员通过收集5000名志愿者的血液样本,开发出了集合血液代谢物的数据库,目前该数据库将免费提供给全世界的研究人员。  代谢产物和蛋白质能够控制机体内部多个生理学过程,同时还能阐明细胞和其周围

离开实验室的材料科学:AI正将新材料的发现提速200倍

算法和材料数据库正帮科学家预测哪些元素能合成新材料。几百年来,人们一直是通过反复试验或者靠运气和偶然发现新材料。现在,科学家们正在使用人工智能来加速这一过程。最近,西北大学的研究人员用AI来解决如何生成新的金属玻璃混合物的问题。这比起在实验室进行实验快了200倍。科学家们正在构建由数千种化合物组成的

大数据研究推翻常规认识

  近年来,科学创新日渐进入"大数据"时代,各种高通量的分析手段以及各类"组学"的发展,使得我们对生命科学的基本原理以及与人类健康有关的疾病发生机制方面有了更加深入的认识。针对最近一段时间以来科学家们利用"大数据"的手段产生的科学进展,我们

Nucleic Acid Res:大数据库助力癌症药物的开发

  近日,来自英国癌症研究所的研究人员通过研究表示,通过加入错误蛋白的3D结构,以及绘制癌症交流的图谱,就会为世界上最大的癌症药物数据库带来革命性的突破;最近更新的canSAR数据库或将为英国及全球的科学家们提供机会来设计出更加高效的癌症疗法,相关研究刊登于国际杂志Nucleic Acid Rese

遗传多样性缺失导致少量人种被忽略 基因组学应包容性

  一个来自被忽略人种的研究  几十年来,Néstor Ruiz Hernández一直在争取认可。他在墨西哥南部太平洋沿岸的一个小镇长大。在那里,他和其他许多人都是十六世纪被人贩子从非洲贩运到墨西哥的奴隶的后代。他们认为自己是Afromexican,但该组织并未被墨西哥政府正式承认为少数族裔群体。

Nat Methods:新型工具改变科学家对蛋白质的传统认知

  近日,一篇发表在国际杂志Nature Methods上的研究论文中,来自Garvan医学研究学院的研究人员表示他们如今已经可以使用公共的网络资源来简化收集3D蛋白质结构的流程,研究者表示,一种名为Aquaria的强大工具或在日后可以帮助改变他们对蛋白质的传统观点。  Aquaria是基于蛋白质数

新型工具改变科学家对蛋白质的传统认知

  近日,一篇发表在国际杂志Nature Methods上的研究论文中,来自Garvan医学研究学院的研究人员表示他们如今已经可以使用公共的网络资源来简化收集3D蛋白质结构的流程,研究者表示,一种名为Aquaria的强大工具或在日后可以帮助改变他们对蛋白质的传统观点。  Aquaria是基于蛋白质数

英国生物库数据开始对外开放

  英国生物库数据于3月30日正式面向研究人员开放。通过这一数据库,全球的科学家都可以将近50万英国人的各种健康数据用于研究,这无疑对全球医学研究起到积极的推动作用。   英国生物库项目于2006年8月正式启动,旨在收集大量的生物样本和医学数据用于医学研究。数据收集目标为40岁到65岁的英国人,数

科学家开发出对单细胞进行大规模分析的新型工具—BigSCale

  近日,一项刊登在国际杂志Genome Research上的研究报告中,来自西班牙的研究人员通过研究提出了一种复杂的计算机框架来分析单细胞的基因表达水平,这一技术可以扩展到对数百万个独立的细胞进行分析处理,这项研究中,研究人员首次开发了一种工具来分析诸如大规模的单细胞RNA序列数据库,这或能极大地

“大数据”助力人类疾病研究

  近年来,科学家们依托“大数据”在改善人类健康、助力人类疾病研究上取得了重大进展,本文中,小编就对近期相关研究成果进行整理,分享给大家!  图片来源:CC0 Public Domain  【1】Front Immunol:大数据帮助设计更好的流感疫苗  doi:10.3389/fimmu.2019

免费网站“试水”数据二次发布

将来自上百万项生物学研究的知识编译到一个网络中——这是Daniel Himmelstein对Hetionet的诱人描述。Hetionet是将来自药物、基因和疾病的28个公共资源的数据聚合在一起的免费在线资源。不 过,对于一个以公共信息为基础构建的产品来说,获得法律许可异常艰难。 当身

前列腺肥大药物特拉唑嗪有望降低个体患帕金森疾病风险

  JAMA Neurol:  近日,一项刊登在国际杂志JAMA Neurology上的研究报告中,来自美国爱荷华大学等机构的科学家们通过进行大规模的观察性研究后发现,摄入一种治疗前列腺肥大的特殊药物或能降低个体患帕金森疾病的风险。相关研究或能提供强有力的证据,表明药物特拉唑嗪(terazosin)

Nat Commun:大数据助力科学家阐明乳腺癌扩散的分子机制

  如今科学家们能够利用大量基因组数据来及早发现患者的疾病状况,但同时这也能帮助研究人员更好地研究疾病发生的分子机制。近日,一项刊登在国际杂志Nature Communications上的研究报告中,来自密歇根州立大学的科学家们通过进行大数据分析,确定了一种更好的模型来对抗乳腺癌的扩散并能帮助测试有

《自然》发表人类遗传变异体大型数据库gnomAD

  英国《自然》杂志及其子刊27日在线发表了基因组聚集数据库(gnomAD)团队的系列研究论文,介绍了研究人员对这个大型数据库的多方面分析,其结果有助人们深入认识人类基因功能,提升对罕见和常见遗传病的理解。  基因组聚集数据库(gnomAD)是一个大规模的人类遗传变异体数据库,汇集了来自不同人群的外

生物银行:可储存百姓健康 通过芯片了解易感癌症基因

  “这个特殊银行的建设与我们普通老百姓有什么关系呢?”……今天扬州网记者获悉,昨天本报《扬州启动“生物银行”建设》一文见报后,引起关注,不少读者致电本报了解情况。为此,记者对上海分子医学工程技术研究中心主任、生物芯片上海国家工程研究中心副主任、中国医药生物技术协会生物样本库分会主任委员郜恒骏教授进

美NIH新项目欲发掘废弃药物新用途

NIH研究人员所发现的数种药物的新用途。(图片提供:NIH)  转化医学是美国国立卫生研究院(NIH)的重要研究领域之一,据新出版的《科学》杂志报道,继NIH院长弗朗西斯·柯林斯于2010年底宣布将创立一个致力于转化医学的新中心——国家促进转化科学中心后,今年6月,他提出了一个名为“

美国最大生物银行初具规模

    美国将建成最大基因生物银行  在近期举行的美国人类遗传协会(ASHG)年会上,研究人员整合了他们收藏的加利福尼亚州北部10万人的基因和医学数据,并发布了初始研究成果。这将帮助建成美国规模最大的“生物银行”。  《科学》杂志相关报道称,科学家的这些努力工作已经揭示了死亡数和染色

美国最大生物银行初具规模 发布初始研究成果

  美国将建成最大基因生物银行。图片来源:blog.dnagenotek.com本报讯(记者唐凤)在近期举行的美国人类遗传协会(ASHG)年会上,研究人员整合了他们收藏的加利福尼亚州北部10万人的基因和医学数据,并发布了初始研究成果。这将帮助建成美国规模最大的“生物银行”。  《科学

地下水里的病毒离我们多远?

  武汉新冠病毒阻击战还在继续,铺天盖地的是口罩,酒精的采购信息。  为什么需要这些?因为病毒的传播途径使然。  人们知道了打喷嚏出来的病毒可以跑出几米,就都带上了口罩。知道了可能通过气溶胶传播,恨不得都套上防护服。知道了可能通过眼睛粘膜传播,都抢起了护目镜。这些紧密围绕在我们身边的传播媒介值得我们

《科学家》杂志评选2018年论文撤回事件

十大论文撤回事件图片来自Pixabay, Openclipart。  《撤稿观察(Retraction Watch)》排行榜包括一些非常狡猾的角色。这个排行版的头号位置仍然(也许总是)属于Yoshitaka Fujii,共有183篇文章被撤回。  如今, 需要至少有20篇文章撤回才能刚好进入这个排行

中国举起大刀砍向“灌水”论文,一年45万篇SCI将何去何从

  日前,中国的科研机构已被告知,停止向在期刊上发表论文的科研人员支付奖金,这是一项新的国家政策的一部分,目的是减少鼓励科学家发表大量论文、而不是专注于高影响力工作的不正当激励。  在上周发布的一项命令中,中国科技部和教育部还表示,科研机构不得仅仅根据论文发表数量或论文引用量来提拔或招募科研人员。研

中国举起大刀砍向“灌水”论文,一年45万篇SCI将何去何从

  日前,中国的科研机构已被告知,停止向在期刊上发表论文的科研人员支付奖金,这是一项新的国家政策的一部分,目的是减少鼓励科学家发表大量论文、而不是专注于高影响力工作的不正当激励。  在上周发布的一项命令中,中国科技部和教育部还表示,科研机构不得仅仅根据论文发表数量或论文引用量来提拔或招募科研人员。研

新质谱成像技术+?=“谷歌地球”癌症地图

  在英国政府癌症研究重大挑战计划的资助下,英国国家物理研究院(NPL)来自化学、物理、生物等多领域的专家共同研发了一种可复制的标准方法,能够极其精准、全面地为肿瘤制图。这一开拓性项目已取得令人瞩目的进展和成果,将为人们更好地了解、诊断和治疗癌症提供新的更好的方法。世界首个癌症细胞代谢的“罗塞塔石碑

可充放热能的热电池有望研发成功

  据美国物理学家组织网10月25日报道,美国研究人员精确地揭示了二钌富瓦烯(fulvalene diruthenium)分子的工作原理。1996年被科学家发现的这种物质可按需存储和释放热能。研究人员表示,新研究有助于科学家发现和设计出比该物质更便宜的替代品,从而研发出可存储和释放热能

Nature技术:解决组学研究大问题

  METLIN是由美国Scripps研究院Gary J Patti和Gary Siuzdak开发出的新型数据库,将能用于解决代谢组学等领域研究中关于数据处理这个大问题。   在过去十年间,代谢组学 metabolomics 已成为最新“-omic(组学)”(继基因组学和蛋白质组

生物学研究中不可忽视的偏向性

  基因组学研究一直都存在着不同水平的偏向性(bias)。种族偏向性自不必说,美国“我们所有人(All of Us)”大规模研究计划的目标之一就是对过去代表性不足的群体进行抽样,比如非裔美国人。  同时,历史偏向性也一直存在。某些基因与疾病有着很强的相关性,但好像就是不入科学家的法眼,始终躺在角落里

美科学家抗议临床试验新政

   研究人类行为和大脑认知功能的科学家正在激烈抗议美国国立卫生研究院(NIH)提出的一项计划,即将涉及人类参与者的大部分研究归类为临床试验。  近日,一封发表于在线请愿网站并被寄送给NIH院长Francis Collins的公开信表示,此项政策“会为研究人员增加不必要的行政负担”,并且减缓基础研究

SARS-CoV-2最新检测技术及未来发展趋势

  目前检测新型冠状病毒感染的方法依赖于特定的基因序列,不过已有新的测定方法正在开发,满足日益增长的对快速检测的需求。  根据SARS-CoV-2基因组的快速测序和COVID-19爆发早期的数据分布,研究人员开发出来多种测定方法,基于病毒的遗传片段诊断患者。但是,随着潜在病例数量的增加以及对全球大流

我们皮肤上存在大量病毒“暗物质”

  近年来,科学家们在微生物组研究中已经取得了较大的进展。现在,宾夕法尼亚大学的研究人员又将目光转向了病毒组研究。他们发表在mBio杂志上的研究显示,健康人类皮肤上的绝大多数DNA病毒是前所未见的,属于病毒“暗物质”。  我们体内居住的细菌(微生物组)对身体健康和疾病发展起到了至关重要的影

Google Genomics:25元/年的基因云存储生意

  相较于Google研究的高大上的月球探测器项目,Google Genomics可能对人类有更重大的意义。从现在的配对数千组基因组,随着技术的发展未来能做到配对数百万对,Google Genomics计划无疑能推动下一个十年内医学的发展。但是我们的问题又来了,亚马逊、Google、IBM、微软,巨