我国科学家首次解析病毒RNA与宿主蛋白质互作网络

以流感为代表的由RNA病毒引发的疾病严重威胁人类健康,甚至影响社会经济发展。RNA作为RNA病毒的遗传物质,在致病过程中发挥着关键作用,但很少有研究报道病毒RNA与宿主蛋白间的相互作用。近期,我国科学家首次解析了多种病毒RNA与宿主蛋白质互作的关系网络,研究成果发表在《Cell Research》,标题为“Comparison of viral RNA–host protein interactomes across pathogenic RNA viruses informs rapid antiviral drug discovery for SARS-CoV-2”。 研究人员采用RNA结合蛋白综合鉴定(Comprehensive identification of RNA-binding proteins by mass spectrometry)技术,全面解析了新冠病毒(SARS-CoV-2)、寨卡病毒(ZIKV)......阅读全文

Cell-Research:研究发现病毒RNA与宿主蛋白质互作网络

  RNA病毒是一类以RNA为遗传物质的病毒。许多RNA病毒可以感染人类并引起疾病,比如冠状病毒(如新冠病毒,SARS-CoV-2)、黄病毒属(如寨卡病毒,ZIKV;登革热病毒,DENV)、丝状病毒(如埃博拉病毒,EBOV)以及流感病毒(Influenza virus)等。由RNA病毒引起的疾病,比

Cell子刊:研究发现病毒RNA与宿主蛋白质互作网络

   RNA病毒是一类以RNA为遗传物质的病毒。许多RNA病毒可以感染人类并引起疾病,比如冠状病毒(如新冠病毒,SARS-CoV-2)、黄病毒属(如寨卡病毒,ZIKV;登革热病毒,DENV)、丝状病毒(如埃博拉病毒,EBOV)以及流感病毒(Influenza virus)等。由RNA病毒引起的疾病,

我国科学家首次解析病毒RNA与宿主蛋白质互作网络

  以流感为代表的由RNA病毒引发的疾病严重威胁人类健康,甚至影响社会经济发展。RNA作为RNA病毒的遗传物质,在致病过程中发挥着关键作用,但很少有研究报道病毒RNA与宿主蛋白间的相互作用。近期,我国科学家首次解析了多种病毒RNA与宿主蛋白质互作的关系网络,研究成果发表在《Cell Research

我国科学家首次解析病毒RNA与宿主蛋白质互作网络

  以流感为代表的由RNA病毒引发的疾病严重威胁人类健康,甚至影响社会经济发展。RNA作为RNA病毒的遗传物质,在致病过程中发挥着关键作用,但很少有研究报道病毒RNA与宿主蛋白间的相互作用。近期,我国科学家首次解析了多种病毒RNA与宿主蛋白质互作的关系网络,研究成果发表在《Cell Research

我国科学家首次解析病毒RNA与宿主蛋白质互作网络

  以流感为代表的由RNA病毒引发的疾病严重威胁人类健康,甚至影响社会经济发展。RNA作为RNA病毒的遗传物质,在致病过程中发挥着关键作用,但很少有研究报道病毒RNA与宿主蛋白间的相互作用。近期,我国科学家首次解析了多种病毒RNA与宿主蛋白质互作的关系网络,研究成果发表在《Cell Research

浙大揭示新冠病毒RNA非编码区域与宿主蛋白质互作网络

  近日,浙江大学生命科学研究院冯新华、蒋超、任艾明、杨兵实验室在美国微生物协会(American Society for Microbiology)旗下的期刊mSystems杂志上合作发表了题为“High-sensitivity profiling of SARS-CoV-2 noncoding

了解病毒如何侵入宿主细胞蛋白质制造机制

传染性病毒具有多种形状和大小,并使用略有不同的攻击机制使人类和动物患病。但是所有病毒都有一个共同点:它们只能通过在另一生物体的细胞内复制来造成损害,这些生物是其宿主。 病毒如何诱骗宿主细胞复制病毒的这一广泛而基本的过程吸引了科罗拉多州立大学的一组科学家数年。生物化学与分子生物学系的Monfort教授

揭示宿主内的小RNA参与乙肝病毒表达调控

乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染可引起肝脏的急性和慢性炎症。急性感染一般表现为自限性肝炎,除爆发性肝炎外,对人体的危害较小;而慢性感染则与肝硬化(cirrhosis)和原发性肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)的发生密切相关。全球

PNAS:植物病原真菌抑制宿主小RNA跨界干扰增强毒力机制

  通过生物活性分子相互作用的生物之间的交流在自然界中很普遍,并且在各种生物过程中发挥着关键作用。小 RNA (sRNA) 可以在宿主植物和丝状病原体之间传播,以触发受体细胞中的跨界 RNA 干扰 (RNAi) 并调节植物防御和病原体毒力。然而,很少有关于真菌病原体如何对抗跨界抗真菌 RNAi 的报

新发现:SARSCoV2-RNA与宿主细胞的相互作用

  一个由牛津大学、格拉斯哥大学和海德堡大学的研究人员领导的国际多学科研究小组发现了SARS-CoV-2 RNA与宿主细胞的相互作用,其中许多是感染的基础。这些发现为开发具有广泛抗病毒潜力的COVID-19新的治疗策略铺平了道路。  SARS-CoV-2的遗传信息编码在RNA分子而不是DNA中。这种

TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质

TRIzol试剂适用于从细胞和组织中快速分离RNA。TRIzol试剂有多组分分离作用,与其他方法如硫氰酸胍/酚法、酚/SDS法、盐酸胍法、硫氰酸胍法等相比,最大特点是可同时分离一个样品的RNA\DNA\蛋白质.TRIzol使样品匀浆化,细胞裂解,溶解细胞内含物,同时因含有RNase抑制剂可保持RNA

TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质

TRIzol试剂适用于从细胞和组织中快速分离RNA。TRIzol试剂有多组分分离作用,与其他方法如硫氰酸胍/酚法、酚/SDS法、盐酸胍法、硫氰酸胍法等相比,最大特点是可同时分离一个样品的RNA\DNA\蛋白质.TRIzol使样品匀浆化,细胞裂解,溶解细胞内含物,同时因含有RNase抑制剂可保持RNA

Ella-Simple-ELisa检测技术在宿主细胞蛋白质残留的应用

宿主细胞蛋白质(HCP)残留,是重组治疗性蛋白质、重组疫苗及重组抗体药物工艺过程中产生的宿主细胞蛋白质及其修饰体。HCP残留是工艺稳定性监测的重要评价指标,是重组疫苗及重组抗体类药物的重要质控指标,ELISA法是各国药典推荐方法。美国FDA推荐值:1-100ppm(ppm:百万分之一),中国药典重组

RNA病毒聚合酶具有一个与宿主适应相关的特征区域

  RNA病毒编码的依赖RNA的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,简称RdRP)是一类独特的核酸聚合酶,在病毒基因组复制和转录过程中发挥核心作用,是抗病毒药物研究的热点靶标。病毒的RdRP由于可与其他功能域融合或与其他病毒蛋白共折叠,其整体结构多样性较高,但其催

科学研究!新冠病毒RNA是否能够整合进宿主基因组?

  新型冠状病毒SARS-CoV-2是造成COVID-19在全球范围肆虐的病因。该病毒为一种单股正链RNA病毒,具有高传染性特性,能够感染人体各代谢系统的多种组织器官,并引发严重的临床症状,深入研究新冠病毒基因组RNA的特性十分必要。  2021年8月2日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中

新型冠状病毒RNA不具备整合进宿主基因组的能力

       SARS-CoV-2是一种具有高度传播性的单股正链RNA病毒,是COVID-19严重流行的病因。SARS-CoV-2具备高传染性特性,并通过侵犯多器官系统而引起严重临床症状。本研究聚焦新冠病毒RNA基因组是否整合到受其感染的宿主细胞基因组的可能性。       2021年8月2日,中国

《Nature》RNA调节蛋白质合成的隐藏信号

  RNA以A、U、C和G等基本核苷酸在细胞的蛋白质加工厂中指挥蛋白质生产。为了制造蛋白质,机器的一端先锁定在RNA上,然后扫描整条RNA,直到AUG字符串后停止扫描,AUG是将遗传密码翻译成蛋白质的开始信号。  在巡查第一个AUG位点时,蛋白质制造机器经常会遇到一个与AUG不同的字符串(如AUA)

TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质3

DNA污染:A. 样品匀浆时加的试剂量太少。B.样品中含有有机溶剂(如乙醇,DMSO等),强缓冲液或碱性溶液。蛋白聚糖和多糖污染:沉淀RNA的过程中作以下改进可去除这些污染,步骤7中,每使用1ml TRIzol在水相中加0.25ml异丙醇和0.25ml高盐溶液(0.8M柠檬酸钠和1.2MNaCl)混

RNA-蛋白质的相互作用2

叶绿体mRNA3’末端的体外加工l      RNA加工反应1.在1.5ml微量离心管中加入下列反应液:缓冲液IVT(20×)                            0.5μl叶绿体蛋白提取物(20μg)                      Lμl缓冲液E           

RNA-蛋白质的相互作用1

叶绿体RNA的体外加工与紫外交联分析RNARNA的合成l      DNA模板的线性化1.根据供应商的指导用合适的限制酶酶解含有DNA模板(如亚克隆在转录载体如pBluescript®(Stratagene)上的菠菜叶绿体psbA基因)的质粒(Schuster and Gruissem1991)。2

TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质2

5. 2-8℃10000×g离心15分钟。样品分为三层:底层为黄色有机相,上层为无色水相和一个中间层。RNA主要在水相中,水相体积约为所用TRIzol试剂的60℅。6. 把水相转移到新管中,如要分离DNA和蛋白质可保留有机相,进一步操作见后。用异丙醇沉淀水相中的RNA。每使用1mlTRIzol加入0

TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质4

注意事项:1. DNA在中间层和有机相中时可在2~8℃保存过夜。2.DNA沉淀在75%乙醇中2~8℃可保存几个月。3.DNA在8mM NaOH溶液中4℃可放置过夜,如长期保存需用HEPES调节pH至7~8并且加EDTA至1mM,可置于4℃或-20℃长期保存。常见问题分析:得率低:A.样品匀浆和裂解的

TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质(一)

TRIzol试剂适用于从细胞和组织中快速分离RNA。TRIzol试剂有多组分分离作用,与其他方法如硫氰酸胍/酚法、酚/SDS法、盐酸胍法、硫氰酸胍法等相比,最大特点是可同时分离一个样品的RNA\DNA\蛋白质.TRIzol使样品匀浆化,细胞裂解,溶解细胞内含物,同时因含有RNase抑制剂可保持RNA

TRIzol法同时提取RNA、DNA、蛋白质(二)

DNA的分离准备试剂:乙醇0.1M柠檬酸钠(含10%乙醇)、 75%乙醇、8mM NaOH操作步骤:1. 样品加氯仿分层后,移去上层水相,用乙醇沉淀中间层和有机相中的DNA。每使用1mlTRIzol加0.3ml无水乙醇混匀,室温放置3分钟,2~8℃不超过2000×g离心5分钟。2. 移去上清,(如需

什么是宿主?

宿主(host),也称为寄主,是指为寄生生物包括寄生虫、病毒等提供生存环境的生物。寄生生物通过寄居在宿主的体内或体表,从而获得营养,寄生生物往往损害宿主,使生病甚至死亡。宿主不只是被动地接受病原体的损害,而且主动产生抵制、中和外来侵袭的能力。如果宿主的抵抗力较强,病原体就难以侵入或侵入后迅速被排除或

什么是宿主?

宿主(host),也称为寄主,是指为寄生生物包括寄生虫、病毒等提供生存环境的生物。寄生生物通过寄居在宿主的体内或体表,从而获得营养,寄生生物往往损害宿主,使生病甚至死亡。宿主不只是被动地接受病原体的损害,而且主动产生抵制、中和外来侵袭的能力。如果宿主的抵抗力较强,病原体就难以侵入或侵入后迅速被排除或

宿主的类别

最终宿主最终宿主是指寄生生物的成虫或者有性生殖阶段所寄生的物种。这类宿主通常为寄生物提供长期稳定的寄生环境,包括营养和生物上的保护。中间宿主中间宿主是指寄生生物的幼虫、童虫或无性生殖阶段用以寄生的物种。这类宿主也可为寄生物提供营养和保护,不过寄生物不能在中间宿主体内成长为成虫,寄生物透过中间宿主为媒

武汉病毒所揭示宿主细胞未折叠蛋白质反应重要作用

  3月6日,国际学术期刊Journal of Virology(《病毒学杂志》)在线发表了中国科学院武汉病毒研究所/病毒学国家重点实验室研究员胡志红、肖庚富团队合作研究的最新成果,论文题为Quantitative proteomic analysis reveals unfolded protei

病毒-ADP-核糖转移酶将RNA与宿主蛋白偶联在一起

  在此之前,人们一直认为 RNA 和蛋白只是在细胞过程中发生短暂的相互作用。在一项新的研究中,来自德国马克斯-普朗克陆地微生物研究所的研究人员发现,事实并非如此:细菌病毒---也称为噬菌体---在发育周期中会将特定的 RNA 与宿主蛋白“粘合”在一起。这种称为RNAylation的化学修饰可能为噬

Cell-Research-肠道菌群调控宿主RNA甲基化和基因表达新机制

  肠道菌群微生物组学是近年来研究热点,肠道菌群在维持宿主生理平衡和健康中发挥着重要作用,在人和动物疾病治疗方面具有极大的应用前景。研究表明,肠道菌群及其代谢产物可调节宿主基因表达。随着研究的深入, 肠道菌群和宿主之间的相互作用机理也越来越多被发现,特别是通过表观遗传影响宿主的基因表达。如最新研究发