北京生命科学研究院方赵庆课题组发布新的基因预测方法
当缺乏密切相关的参考基因组时，大多数的基因预测方法检测的是来自转录组组件的编码序列。这些方法的应用有限，因为高的转录本片段和广泛的组装错误，可能会导致多余的或错误的编码序列预测。11月17日在国际学术期刊《Genome Biology》发表的一项研究中，来自中科院北京生命科学研究院的研究人员，提出了一种方法——inGAP-CDG，可以利用基于密码子的de Bruijn图表，构建来自未组装转录组的完整长度的和非冗余的编码序列，从而简化了组装过程。这项研究的通讯作者是中科院北京生命科学研究院的赵庆方研究员。 对于有参考基因组的物种来说，通常是用基于同源性的方法来预测功能基因，这可能通过将靶序列对准到近缘种的原始基因，来识别基因。然而，参考数据库只代表一小部分现有的物种，从而限制了这些方法的使用。因此，依赖于已知参考基因组的基因预测方法，限制了我们对于新物种的功能性理解。当缺乏相关的参考基因组时，利用组装基因组序列的从头预测方法......阅读全文
基因可预测人类死亡时间？
[导读]美国科学家发现了一种特别的基因，甚至能预测一个人最可能在一天中的什么时候死亡。 美国科学家声称发现了一种特别的基因，不仅能够确定你能否成为一个早起的人，而且能够将你可能去世的时间预测到上午还是下午。这种特别基因控制着人体生理节律，或许是当人接近死亡的时候，身体会还原到一种更加自然的
基因预测未来靠谱吗?
“花1000美元，就能知道自己体内的所有秘密，并预见未来。”——这甚至成为了人们心目中一种理想的生活方式。可目前，由于风险评估的依据不足，准确性很差，对于疾病干预的指导性不大，因此，基因预测还不值得一提。 个体化基因组学医学一直被看做是未来医疗技术的一大热点，除了疾病诊断和治疗，
elife：基因检测可用于预测寿命
最近科学家表示，通过观察DNA，他们可以预测一个人是否能够比平均寿命更长或更短。该团队分析了影响寿命的遗传变异的综合影响，并进一步进行评分。 他们认为，排名前10％的人可能比那些得分最低的人寿命长5年。研究结果还揭示了疾病的新见解以及与衰老有关的生物学机制。 （图片来源：CC0 P
基因检测或可预测生育能力
受就业压力等影响，现代人的婚育年龄正在不断推后，然而女性生育能力会随着年龄增长逐渐降低。面对这种矛盾，美国科学家找到了初步解决方案。今后，女性或可通过脱氧核糖核酸(DNA)检测判断生育能力，从而决定何时育子。 两难境遇 研究显示，一名新生女婴的卵巢内约有100万至2
基因可预测人类死亡时间？揭基因与死亡关系
美国科学家发现了一种特别的基因，甚至能预测一个人最可能在一天中的什么时候死亡。 美国科学家声称发现了一种特别的基因，不仅能够确定你能否成为一个早起的人，而且能够将你可能去世的时间预测到上午还是下午。这种特别基因控制着人体生理节律，或许是当人接近死亡的时候，身体会还原到一种更加自然的生理节律。
基因组测序竟能准确预测长相！
克莱格·文特尔（Craig Venter）博士是一名不折不扣的“科学狂人”。几十年前，他创立的Celera Genomics曾以一家公司之力，加快了“人类基因组计划”的发展。他本人也于2000年和美国NIH负责人弗朗西斯·柯林斯（ Francis Collins）博士一道，共同宣布了人类基因组草
Cell：基因分析预测疾病发生风险
根据斯坦福大学医学院的一项新研究，一种能够提炼出大量遗传数据和患者健康记录的新方法可以预测一个人患有常见且致命的心血管疾病的风险。这种通过机器学习的方法迄今为止只被用于预测这腹主动脉瘤的患病风险。 基因组测序已经在癌症或罕见病的风险预测中被大量使用。但仍有一个悬而未决的问题：这种方法预测疾病风
基因检测来预测未来疾病风险分析
如果你进行了检测就能够知道你或者你的家人更容易患哪些疾病了，那么你是否愿意进行这样的检测呢？如今基因检测技术的快速发展引发了很多争论，比如健康人群是否应该接受基因检测呢？关于基因检测？首先我们需要理解我们所讨论的基因检测的差异性，目前关于基因检测有三项重要应用，我们通常比较容易混淆。第一项应用就是诊
基因“时钟”或能预测脊椎动物寿命
近日，一个澳大利亚研究团队报告了一种采用基因标记准确估算不同脊椎动物物种寿命的模型。这个“寿命时钟”筛选了CpG（核苷酸对）位点的42个特定基因，以预测某脊椎动物物种成员可能拥有多长的寿命。CpG位点是DNA上的短片段，其密度与寿命相关。相关论文刊登于《科学报告》。 一个物种的最大寿命难以定义
如何预测和鉴定miRNA的靶基因
免疫沉淀当然，确定miRNA与mRNA之间的互作，我们还有更直接的方法，那就是从实验上寻找物理相互作用。我们可以利用RNA诱导沉默复合物（RISC）中的Argonaut（AGO）蛋白的抗体进行免疫共沉淀（co-IP）。目前更先进的方法是通过紫外线照射以交联复合物，然后开展深度测序以鉴定发现的RNA，