如何预测和鉴定miRNA的靶基因
免疫沉淀当然，确定miRNA与mRNA之间的互作，我们还有更直接的方法，那就是从实验上寻找物理相互作用。我们可以利用RNA诱导沉默复合物（RISC）中的Argonaut（AGO）蛋白的抗体进行免疫共沉淀（co-IP）。目前更先进的方法是通过紫外线照射以交联复合物，然后开展深度测序以鉴定发现的RNA，这种方法被称为紫外交联免疫沉淀结合高通量测序（HITS-CLIP），或CLIP-seq。利用这种方法来寻找miRNA的靶基因，能够明显降低miRNA结合位点的假阳性预测率，并且缩小miRNA结合位点的空间范围，可在全基因组范围内鉴定AGO蛋白与不同RNA上的结合。现在有多家公司提供CLIP-seq服务，如锐博生物。 Clontech公司（Takara旗下）也推出了一种新工具，能协助鉴定细胞中的miRNA靶点。这一工具名为MirTrap系统。它利用RISC蛋白的显性失活突变体，允许miRNA与其目标结合，但限制进一步的加工。此亚基整合到......阅读全文
miRNA－mimics－miRNA－inhibitor
miRNA mimics 是模拟生物体 内源的miRNAs，运用化学合成的方法合成，能增强内源性miRNA的功能。miRNA inhibitor 是化学修饰的专门针对细胞中特异的靶miRNA的抑制剂。近年来人工合成的miRNA（artificial miRNA，amiRNA）已经成功应用于沉默预期靶
miRNA海绵—长效抑制miRNA
随着研究的深入，已知miRNA的数量与日俱增，目前Sanger miRBase数据库中收录的人miRNA已达721条。不过，大部分miRNA的功能仍是未知数。在基因功能研究中，最有效的方法是阻止特定基因的功能，然后了解其后果。miRNA同样如此。然而，相比之下，miRNA的功能研究要困难得多。为什么
miRNA海绵—长效抑制miRNA
miRNA海绵随着研究的深入，已知miRNA的数量与日俱增，目前Sanger miRBase数据库中收录的人miRNA已达721条。不过，大部分miRNA的功能仍是未知数。在基因功能研究中，最有效的方法是阻止特定基因的功能，然后了解其后果。miRNA同样如此。然而，相比之下，miRNA的功能研究要困
miRNA研究
一、miRNA研究的基本问题和研究方法二、miRNA研究的综合解决方案1. miRNA微阵列芯片服务Agilent miRNA 芯片（21.0） Affymetrix miRNA 4.0 芯片2. miRNA测序服务 miRNA-seq文库构建流程 miRNA测序数据分析流程3. miRNA R
miRNA克隆实验
在细胞中表达的 RNA 除了我们所熟悉的 mRNA 以外，还有大量不编码蛋白质的非编码 RNA（noncoding RNA，ncRNA），非编码 RNA 在细胞中起着非常重要的作用，如 rRNA 和 tRNA 维持着基因的表达，还有一部分则起着调控基因表达的作用。本实验来源「RNA 实验指导手册」主
miRNA－－克隆实验
实验方法原理 在细胞中表达的 RNA 除了我们所熟悉的 mRNA 以外，还有大量不编码蛋白质的非编码 RNA（noncoding RNA，ncRNA），非编码 RNA 在细胞中起着非常重要的作用，如 rRNA 和 tRNA 维持着基因的表达，还有一部分则起着调控基因表达的作用。实验材料 寡核
miRNA克隆实验
实验方法原理 在细胞中表达的 RNA 除了我们所熟悉的 mRNA 以外，还有大量不编码蛋白质的非编码 RNA（noncoding RNA，ncRNA），非编码 RNA 在细胞中起着非常重要的作用，如 rRNA 和 tRNA 维持着基因
Nature发布miRNA重要发现：脂肪细胞的miRNA信号
脂肪细胞并不简单，Joslin糖尿病中心的科学家发现这种细胞并不只是静静的待在我们身体中，而且能释放出激素和其它信号蛋白，影响多种组织，其中一种竟然是miRNA。利用脂肪细胞研发基因治疗方法，也许能用于治疗肝脏或其它器官的代谢疾病，还有癌症等。 这一研究成果公布在2月15日的Nature杂志上
mirna－pcr电泳多久
一般是根据PCR产物大小和所用电压来决定时间的吧一般溴酚蓝跑到胶的1/3处就可以了。电压大，就时间短，第一次跑，还是在边上观察着点吧，分子小，时间不长的。
MicroRNA（miRNA）的概念
MicroRNA（miRNA）：是含有茎环结构的miRNA前体，经过Dicer加工之后的一类非编码的小RNA分子（~21-23个核苷酸）。MiRNA，以及miRISCs（RNA-蛋白质复合物）在动物和植物中广泛表达。因之具有破坏目标特异性基因的转录产物或者诱导翻译抑制的功能，miRNA被认为在调控发
如何设计miRNA－mimics
miRNA mimic能模拟细胞中内源性成熟miRNA的高水平表达，以增强内源性miRNA的调控作用，是miRNA功能研究的一大利器。miRNA mimic是一种简单高效的miRNA研究工具，只需用转染试剂包裹即可转染进入细胞，无需构建载体的繁琐操作，无需病毒防护方面的担忧，用转染对照即可观察其转染
miRNA的qPCR检测
测序技术的引入促使miRNA研究领域进入快速发展阶段，然而qPCR仍是验证测序数据的重要标准。本文将为您介绍使用qPCR进行miRNA分析的基本要点，希望能帮助新人快速入门。什么是miRNA？miRNA是一类小的非编码RNA，能够与RNA诱导沉默复合物（RISC）结合，通过作用于mRNA，进而介导转
miRNA－qPCR－Detection－Primer－Set（miRNA检测试剂盒）实验说明
一、概述 1、介绍 microRNA(miRNA)是一类有大约22 个核苷酸组成的非编码小分子RNA，其广泛存在于真核生物中。miRNA 在个体发育的不同时期及不同组织中有不同的表达模式，都表明了其在发育和分化中起有重大的调控作用。迄今为此，对miRNA 的检测方法主要有Northe
miRNA－qPCR－Detection－Primer－Set（miRNA检测试剂盒）实验说明
一、概述1、介绍microRNA(miRNA)是一类有大约22 个核苷酸组成的非编码小分子RNA，其广泛存在于真核生物中。miRNA 在个体发育的不同时期及不同组织中有不同的表达模式，都表明了其在发育和分化中起有重大的调控作用。迄今为此，对miRNA 的检测方法主要有Northern B
Isolation－of－microRNA－(miRNA)
实验概要 This protocol utilizes the powerful guanidine isothiocyanate–phenol:chloroform extraction method which allows the rapid isolation of t
micro－RNA(miRNA)综述3
未来要解决的问题miRNAs在多个物种中广泛被发现，而且在进化上高度保守。这些“小玩意儿”留给我们一大堆谜团：miRNA的确切功能是什么？它的目标靶是什么？作用机制是什么？也许需要对植物或者线虫的基因组进行miRNAs突变株的筛选，在果蝇中可以用targeted- disruption缺失miR
micro－RNA(miRNA)综述1
RNA一度被认为仅仅是DNA和蛋白质之间的“过渡”，但越来越多的证据清楚的表明，RNA在生命的进程中扮演的角色远比RNA我们早前设想的更为重要。RNA干扰（RNA interference）的发现使得人们对RNA调控基因表达的功能有了全新的认识，更因为可以简化替代基因敲除而成为研究基因功能的
micro－RNA(miRNA)综述2
miRNA的作用方式最早被发现的两个miRNAs――lin-4 and let-7被认为是通过不完全互补结合到目标靶mRNA3'非编码区端，以一种未知方式诱发蛋白质翻译抑制，进而抑制蛋白质合成，阻断mRNA的翻译。多个果蝇miRNAs也被发现和他们的目标靶mRNAs的3'非编码区
miRNA研究之RNA标记
RNA标记RNA标记是将标记物（如放射性同位素、荧光素或酶）共价地连接到RNA，通过检测标记物，进而实现对RNA鉴别和检测的目的。RNA标记在分子探针领域应用广泛，在疾病诊断方面也很有前景。 理想的RNA标记方法应符合以下要求：1. 操作简单，灵敏度高2. 不影响碱基配对的特异性3. 不影响R
miRNA引物设计流程介绍
MiRNA的命名原则可以大致归纳如下： 一个系统命名包含三部分内容，即物种，microRNA类别，序号。三者间用短线连接。物种一般用三个小写字母表示，如hsa,mmu和rno分别代表人，小鼠和大鼠。MicroRNA类别是指所命名的microRNA是pre-miRNA还是mature miR
miRNA引物设计流程介绍
MiRNA的命名原则可以大致归纳如下：一个系统命名包含三部分内容，即物种，microRNA类别，序号。三者间用短线连接。物种一般用三个小写字母表示，如hsa,mmu和rno分别代表人，小鼠和大鼠。MicroRNA类别是指所命名的microRNA是pre-miRNA还是mature miRNA。pre
小分子RNA（miRNA）简介
一、什么是小分子RNA（ MicroRNA）? MicroRNA (miRNA) 是一类长度约为20-24个核苷酸长度的具有调控功能的非编码RNA。 miRNA 主要参与基因转录后水平的调控。这些miRNA基因首先在细胞核内转录成原始miRNA转录本（primary transcrip
miRNA研究综合解决方案
一、miRNA研究的基本问题和研究方法 二、miRNA研究的综合解决方案 1. miRNA微阵列芯片服务 目前上海伯豪可以提供Agilent和Affymetrix miRNA芯片。 Agilent miRNA 芯片（21.0） Affymetrix miRN
RNA干扰相关知识MicroRNA（miRNA）
MicroRNA（miRNA）：是含有茎环结构的miRNA前体，经过Dicer加工之后的一类非编码的小RNA分子（~21-23个核苷酸）。MiRNA，以及miRISCs（RNA-蛋白质复合物）在动物和植物中广泛表达。因之具有破坏目标特异性基因的转录产物或者诱导翻译抑制的功能，miRNA被认为在调控发
Cell：miRNA，调控子的调控
MicroRNAs是多细胞生物体遗传程序的重要调控者。由于它们具有强大的作用，其自身的生成也受到严密地控制。来自德国马克思•普朗克发育生物学研究所的科学家们在新研究中获得了关键的研究发现。他们在拟南芥(阿拉伯芥,thale cress)中发现了一个调节micro RNAs生成的新元件，通过去
GEN：miRNA检测行业热度不减
MicroRNAs （miRNAs）是一种存在于真核生物的内源性非编码小RNA，具有抑制靶向mRNA转录、翻译或者剪切靶向mRNA并促使其降解的功能。它会组装进入沉默复合体（RISC），识别并与靶向mRNA互补配对，从而降解或者阻止mRNA翻译。 miRNAs负责调控多种生理过程，包括细胞周期
MicroRNA（miRNA）的结构和用途
MicroRNA（miRNA）：是含有茎环结构的miRNA前体，经过Dicer加工之后的一类非编码的小RNA分子（~21-23个核苷酸）。MiRNA，以及miRISCs（RNA-蛋白质复合物）在动物和植物中广泛表达。因之具有破坏目标特异性基因的转录产物或者诱导翻译抑制的功能，miRNA被认为在调控发
疾病检测新指标miRNA（二）
杨医师等人在另一个研究中，分析小鼠在遭受革兰氏阳性菌感染后，血液中miRNA表达谱的变化（Hsieh CH et al., 2013）。枯草杆菌（Bacillus_subtilis）、粪链球菌（Streptococcus faecalis）、金黄色葡萄球菌（Staphylococcus au
MicroRNA(miRNA)荧光定量PCR原理
一、什么是miRNA?MicroRNAs (miRNAs)是一种大小约21—23个碱基的单链小分子RNA，是由具有发夹结构的约70-90个碱基大小的单链RNA前体经过Dicer酶加工后生成，不同于siRNA（双链）但是和siRNA密切相关。据推测，这些非编码小分子RNA（miRNAs）参与调控基
疾病检测新指标miRNA（一）
microRNA（miRNA）是真核生物中广泛存在的一种由 non-coding 区域转录的小片段 RNA，长度仅有 19~25 个核苷酸。根据 miRBase 数据库，在所有物种发现的 miRNAs，至今已超过 2 万个。miRNA 透过与标的 mRNA 的特异性结合，经由 post-tr