科学家构建出目前最高质量的植物基因组参考序列
随着PacBio单分子实时（SMRT）测序技术的发展，利用它已能够独立完成高质量基因组草图的组装。然而，这些草图序列中仍然存在多种错误，比如序列中会包含有很多嵌合体（即不同位置的序列连接到了一起）或是组装质量比较差的区域等，特别是重复序列区域有的没有组装出来，有的组装出来多个序列，而且这些错误通常也难以检测。另外，单纯利用SMRT测序还只能装出一个个的DNA小片段，而要连成整条染色体的序列，则需要借助于遗传图谱，或是最近发展的Hi-C技术。然而，简单利用这两个技术形成的染色体序列，仍存在很多的缺陷：（1）小的片段难以放到染色体上，导致形成的染色体序列上有大量的缺口；（2）放上的片段中包含有大量的顺序排列错误和序列的方向错误。这样形成的染色体用作参考基因组进行基因定位，容易漏掉基因或导致错误的定位。 为了利用现有的技术进行高质量的植物基因组组装，中国科学院遗传与发育生物学研究所梁承志研究组与四川农业大学教授李仕贵合作，从20......阅读全文
PacBio构建目前最高质量的植物基因组参考序列
来自中科院遗传与发育生物学研究所，四川农业大学的研究人员发表了题为“Sequencing and de novo assembly of a near complete indica rice genome”的文章，对一个籼稻基因组蜀恢498（R498）进行PacBio单分子测序，结合遗传图谱和
科学家构建出目前最高质量的植物基因组参考序列
随着PacBio单分子实时（SMRT）测序技术的发展，利用它已能够独立完成高质量基因组草图的组装。然而，这些草图序列中仍然存在多种错误，比如序列中会包含有很多嵌合体（即不同位置的序列连接到了一起）或是组装质量比较差的区域等，特别是重复序列区域有的没有组装出来，有的组装出来多个序列，而且这些错误通
Sanger采用SMRT测序技术获得 NCTC 3,000株细菌基因组图谱
英国著名的Wellcome Sanger研究所与Pacific Biosciences（PacBio）合作已完成了对英国公共卫生部国家标准菌库NCTC中 3,000多株细菌的基因组的测序工作，其中包括一些世界上最危险的细菌，如引起鼠疫、痢疾和霍乱的细菌。通过解码DNA，研究人员能够更好地了解细菌
中国获首个染色体级别橡胶树参考基因组图谱 利于育种
从中国科学院昆明植物研究所获悉，由该所及云南省热带作物科学研究所、华南农业大学基因组学与生物信息学研究中心组成的联合研究团队，历经6年，利用单分子实时测序(SMRT)和Hi-C技术，在国际上首次获得了达到染色体级别的高质量巴西橡胶树优良品种GT1的参考基因组序列，并揭示大戟植物基因组的染色体进
历时6年 获首个染色体级别的橡胶树参考基因组图谱
记者16日从中国科学院昆明植物研究所获悉，由该所及云南省热带作物科学研究所、华南农业大学基因组学与生物信息学研究中心组成的联合研究团队，历经6年，利用单分子实时测序(SMRT)和Hi-C技术，在国际上首次获得了达到染色体级别的高质量巴西橡胶树优良品种GT1的参考基因组序列，并揭示大戟植物基因组的
我国获得国际首个染色体级别的橡胶树GT1参考基因组图谱
记者16日从中国科学院昆明植物研究所获悉，由该所及云南省热带作物科学研究所、华南农业大学基因组学与生物信息学研究中心组成的联合研究团队，历经6年，利用单分子实时测序(SMRT)和Hi-C技术，在国际上首次获得了达到染色体级别的高质量巴西橡胶树优良品种GT1的参考基因组序列，并揭示大戟植物基因组的
华大基因引入亚洲首台Sequel测序仪器系统
12月24日，华大基因宣布与实时单分子测序技术（SMRT）领导者加利福尼亚太平洋生物科学公司（PacificBiosciencesofCalifornia,Inc.，以下简称PacBio）再次合作，购入亚洲第一台Sequel测序系统，并有后续购买计划，会将SMRT测序平台纳入其全球业务。今年初华
华大基因引入亚洲首台Sequel测序仪更全面的基因组研究服务
2015年12月24日，中国深圳--全球最大的基因组研发机构华大基因今天宣布与实时单分子测序技术（SMRT）领导者加利福尼亚太平洋生物科学公司（Pacific Biosciences of California, Inc.，以下简称PacBio）再次合作，购入亚洲第一台Seque
二倍体人类基因组的首次全面分析
2003年人类基因组测序的完成可谓生命科学史上的一个里程碑。然而，这个项目并非没有缺陷。最终组装好的序列，也就是人们所说的参考基因组，是由单倍体序列组成，但是人类基因组却是二倍体的。 近日，美国的一组研究人员首次对二倍体的人类基因组进行了全面分析，并将其结果发表在《Nature Methods
小叶茶染色体级别基因组图谱联合研究成果首次完成
近日，生物学预印本服务器（www.biorxiv.org）在线发表了中美科学家联合研究团队的最新成果，该团队采用单分子实时测序（SMRT）和 Hi-C技术，在20多个代表性小叶茶品种中选用杂合度较低的小叶茶良种“碧云”，将组装获得的约2.85Gb 的基因组序列挂载到了15 条假染色体上，在国际上