我国获得国际首个染色体级别的橡胶树GT1参考基因组图谱

记者16日从中国科学院昆明植物研究所获悉,由该所及云南省热带作物科学研究所、华南农业大学基因组学与生物信息学研究中心组成的联合研究团队,历经6年,利用单分子实时测序(SMRT)和Hi-C技术,在国际上首次获得了达到染色体级别的高质量巴西橡胶树优良品种GT1的参考基因组序列,并揭示大戟植物基因组的染色体进化、胶乳生物合成与橡胶树的驯化。 橡胶树是大戟科植物,原产南美洲巴西的亚马逊河流域,历史记载其驯化始于1896年,然后向马来西亚、印度尼西亚和泰国等国家传播。在植物界大约2500种产胶植物中,橡胶树产生的以聚异戊二烯为主要功能成分的天然胶乳,约占全球天然橡胶的98%以上。中国的橡胶种植面积达114万公顷,居亚洲第三位(仅次于印度尼西亚和马来西亚),但天然橡胶年产量不足年消费量的20%,远低于国际公认的安全保障线(30%)。从二十一世纪初起,云南的橡胶树种植总面积、总产量和单位面积产量均居中国首位。 科研人员介绍,巴西橡胶树......阅读全文

中国获首个染色体级别橡胶树参考基因组图谱-利于育种

  从中国科学院昆明植物研究所获悉,由该所及云南省热带作物科学研究所、华南农业大学基因组学与生物信息学研究中心组成的联合研究团队,历经6年,利用单分子实时测序(SMRT)和Hi-C技术,在国际上首次获得了达到染色体级别的高质量巴西橡胶树优良品种GT1的参考基因组序列,并揭示大戟植物基因组的染色体进

历时6年-获首个染色体级别的橡胶树参考基因组图谱

  记者16日从中国科学院昆明植物研究所获悉,由该所及云南省热带作物科学研究所、华南农业大学基因组学与生物信息学研究中心组成的联合研究团队,历经6年,利用单分子实时测序(SMRT)和Hi-C技术,在国际上首次获得了达到染色体级别的高质量巴西橡胶树优良品种GT1的参考基因组序列,并揭示大戟植物基因组的

科学家获取染色体级别的高质量橡胶树参考基因组图谱。

   橡胶树(Hevea brasiliensis (Willd. ex A. Juss.) Muell. Arg. )是大戟科(Euphorbiaceae)植物。在植物界大约2,500种产胶植物中(如杜仲Eucommia ulmoides Oliver和橡胶草 Taraxacum kok-sagh

我国获得国际首个染色体级别的橡胶树GT1参考基因组图谱

  记者16日从中国科学院昆明植物研究所获悉,由该所及云南省热带作物科学研究所、华南农业大学基因组学与生物信息学研究中心组成的联合研究团队,历经6年,利用单分子实时测序(SMRT)和Hi-C技术,在国际上首次获得了达到染色体级别的高质量巴西橡胶树优良品种GT1的参考基因组序列,并揭示大戟植物基因组的

小叶茶染色体级别基因组图谱联合研究成果首次完成

  近日,生物学预印本服务器(www.biorxiv.org)在线发表了中美科学家联合研究团队的最新成果,该团队采用单分子实时测序(SMRT)和 Hi-C技术,在20多个代表性小叶茶品种中选用杂合度较低的小叶茶良种“碧云”,将组装获得的约2.85Gb 的基因组序列挂载到了15 条假染色体上,在国际上

我国科学家发现黄花蒿首个染色体级别基因组图谱

  疟疾至今仍威胁着人类的健康。黄花蒿是全球普遍使用的抗疟疾药物——青蒿素的主要天然资源,保障全球优质廉价的青蒿素原料供应对于全球疟疾防控有重要价值。但黄花蒿基因组杂合度和重复度很高,致使高质量的黄花蒿基因组组装成为该领域难题。  在重大新药创制科技重大专项、国家重点研发计划“中医药现代化研究”重点

染色体级别橡胶基因组研究揭秘乳胶生物合成

   橡胶树是大戟科植物。在植物界大约2500种产胶植物中,橡胶树产生的以聚异戊二烯为主要功能成分的天然胶乳约占全球天然橡胶的98% 以上。图片来源于网络  比起可能造成巨大环境污染的人工合成橡胶产业,天然橡胶因其良好的弹性、伸展性、耐老化等综合理化性能而具有不可替代性,是任何国家必须具备的重要战略

染色体级别的银杏参考基因组公开

银杏果实 曹福亮供图  作为裸子植物银杏纲唯一的孑遗物种,银杏不仅具有特殊的科学研究价值,而且具有重要的应用价值。  近日,南京林业大学联合中国农业科学院农业基因组研究所在《自然—植物》在线发表了染色体级别的银杏参考基因组,是目前已发表的组装质量最高的裸子植物参考基因组。  论文共同通讯作者、中国工

上海师大团队破解染色体级别基因组密码

  中新网上海12月16日电 (记者 许婧)上海师范大学16日发布消息称,该校王全华研究团队在菠菜基因组研究领域又取得一项重大标志性研究成果。团队联合康奈尔大学Boyce Thompson研究所(BTI)费章君教授课题组等多家科研机构完成了新一代菠菜基因组精细图谱绘制、重要农艺性状遗传基础和菠菜驯化

龙井茶树染色体级别基因组组装成功

   龙井43    中国农科院供图 近日,《自然—通讯》在线发表了我国科学家在茶树全基因组组装和茶树起源演化研究上取得的重要突破。该项研究由中国农业科学院茶叶研究所(以下简称茶叶所)和中国农业科学院深圳农业基因组研究所(以下简称基因组所)主导并携手中国科学院昆明动物研究所(以下简称昆

染色体级别的铁线蕨基因组首次绘制

   日前,中国农业科学院深圳农业基因组研究所联合国内外8家科研院所首次绘制了染色体级别的铁线蕨基因组,揭示了蕨类植物孢子发育、真叶植物起源和种子演化、茉莉素信号通路进化等分子机制。相关研究成果发表在《自然—植物(Nature Plants)》。  真蕨植物以孢子体和配子体均具有光合自养能力为主要特

象腿蕉染色体级别基因组组装研究获进展

象腿蕉(Ensete glaucum)是芭蕉科中耐寒的蕉类植物,原产于中国云南和东南亚地区,具有观赏、饲用和药用价值。中国科学院华南植物园教授John Seymour Heslop Harrison带领的研究团队,采用单分子纳米孔、Illumina测序策略,结合染色体构像捕获技术,发表了首个象腿蕉染

象腿蕉染色体级别基因组组装研究获进展

中国科学院华南植物园海外知名学者John Seymour Heslop Harrison教授领导的研究团队,在象腿蕉染色体级别基因组组装研究方面取得新进展。相关研究发表于Gigascience。王梓维为该文第一作者,John Seymour Heslop Harrison和刘青副研究员为通讯作者,华

破解染色体级别基因组密码解析栽培菠菜的“前世今生”

  上海师范大学16日发布消息称,该校王全华研究团队在菠菜基因组研究领域又取得一项重大标志性研究成果。团队联合康奈尔大学Boyce Thompson研究所(BTI)费章君教授课题组等多家科研机构完成了新一代菠菜基因组精细图谱绘制、重要农艺性状遗传基础和菠菜驯化历史的解析。  该研究成果以“基因组解析

人类种了6000年的作物有了染色体级别基因组

  大麻又名火麻、汉麻、线麻等,籽用大麻在食品、医药、纺织、造纸等多个领域被广泛使用,是一种重要的工业原料。  9月15日,福建农林大学麻类研究室联合该校基因组与生物技术中心在《植物通讯》(Plant Communications)上发表了首个染色体级别的籽用大麻参考基因组图谱。他们在此基础上解析了

鸭嘴兽基因组图谱揭秘独特的性染色体

  鸭嘴兽可能是世界上长得最奇怪的动物。据说,当欧洲学者第一次见到这种鸭子嘴、海狸尾、水獭足的动物时,他们认为这是一场精心设计的骗局。它看上去既像爬行动物又像哺乳动物,还像鸟类。实际上,它属于稀有的单孔类动物。  鸭嘴兽不仅有一些奇特的身体特征,其新的基因组版本也强调了它一些不寻常的遗传特性。在上周

科学家绘制出橡胶树基因组草图

  日本和马来西亚研究人员合作成功绘制出橡胶树基因组草图,这将有助于培育更加高产的橡胶树,提高天然橡胶的产量。  日本理化学研究所日前发布一份公报说,该研究所和马来西亚理科大学的研究人员对东南亚广泛栽种的橡胶树品种“PRIM600”进行了基因组测序,绘制出的基因组草图包含了超过93.7%的橡胶树基因

最大动物基因组图谱——南极磷虾基因组图谱破译

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495141.shtm   ? Cell官网截图。黄海水产研究所供图   日前,由中国水产科学研究院黄海水产研究所联合青岛华大基因研究院、德国阿尔弗雷德?魏格纳研究所、澳大利亚联邦科学

橡胶树HeveaDB基因组数据库平台完成测试

本报讯 日前,中国热带农业科学院“橡胶树等主要热带作物功能基因组学研究”创新团队负责搭建的橡胶树HeveaDB基因组数据库平台(hevea.catas.cn)上线运行,并在国际橡胶研究与发展委员会(IRRDB)各成员国间开展测试工作。经过1个月的测试,数据库平台各项指标保持稳定,运行可靠,达到

橡胶树HeveaDB基因组数据库平台完成测试

  日前,中国热带农业科学院“橡胶树等主要热带作物功能基因组学研究”创新团队负责搭建的橡胶树HeveaDB基因组数据库平台(hevea。catas。cn)上线运行,并在国际橡胶研究与发展委员会(IRRDB)各成员国间开展测试工作。经过1个月的测试,数据库平台各项指标保持稳定,运行可靠,达到预期效果。

破解了香气之谜-蜡梅的染色体水平精细基因组图谱公布

  “一花香十里,更值满枝开。”凌寒怒放的蜡梅,是万花凋零的寒冬里一道亮丽的风景,其香味浓郁而独特,成为历代文人墨客挥笔高歌的对象。蜡梅为何冬季开花?其独特香味由何而来?蜡梅 华中农大供图  近日,华中农业大学刘秀群、赵凯歌研究组和金双侠研究组联合西南林业大学陈龙清研究组,在《基因组生物学》在线发表

Nature公布大麦基因组图谱

  大麦是世界上最重要的粮食作物之一,17日Nature公布了目前为止最完善的大麦基因组测序图谱。这项由美国农业部主导的大工程,在德国、日本、芬兰、澳大利亚、英国、美国和中国科学家们的共同努力下,历经六年终于取得了重大进展。大麦基因组图谱将成为人们提高大麦产量、增强大麦抗虫抗病能力、增加大麦营养价值

一国际研究小组将精度达93.7%的橡胶树基因组草图绘出

  日本理化学研究所的一个国际研究小组成功绘制出精度达93.7%的橡胶树基因组草图。    该研究小组对东南亚广泛栽种的帕拉橡胶树品种“PRIM600”进行了基因组测序。他们首先利用约100个碱基短序列信息以99%以上精度进行解读的“Illumina”方法,与7000个碱基长序列信息以85%精度

一国际研究小组将精度达93.7%的橡胶树基因组草图绘出

  日本理化学研究所的一个国际研究小组成功绘制出精度达93.7%的橡胶树基因组草图。  该研究小组对东南亚广泛栽种的帕拉橡胶树品种“PRIM600”进行了基因组测序。他们首先利用约100个碱基短序列信息以99%以上精度进行解读的“Illumina”方法,与7000个碱基长序列信息以85%精度解读的“

B染色体精细图谱和功能研究

  早在一个多世纪前发现B染色体在很多植物、动物和真菌基因组中广泛存在。B染色体对于个体的生命活动来说不是必需的,但它们仍然通过不同的机制存在于种群中。例如玉米B染色体不与任何A染色体配对,其传递不遵循孟德尔遗传定律,花粉第二次有丝分裂B染色体会发生不分离 (nondisjunction),包含B染

多线染色体的图谱的介绍

  把用杂交试验得到的果蝇多线染色体的遗传图谱与正常的带谱比较,可以看出每条带相当于一个遗传单位,并且可以鉴定出许多具有特殊遗传功能的带的位置。在特殊情况下,一条带可能同时有几个结构基因。例如,用原位杂交法曾经证明5SRNA基因的大部分拷贝位于2R的一条带(56F)上;组蛋白mRNA只能杂交到2L的

首次绘制小麦表观基因组图谱

  最近,英国利物浦大学的科学家们,对小麦中调节基因活性的遗传性分子变化,进行了首次全基因组范围的调查,这可能成为提高作物育种技术的一种新工具。相关研究结果发表在最新一期的《Genome Biology》。延伸阅读:权威期刊发布首个小麦单体型图谱。  表观遗传标记是一种化学标签,将自己附着在DNA上

首个家鸡基因组图谱绘制完成

西南大学教授徐洛浩课题组以中国特有家鸡品系胡须鸡为材料,在国际上率先绘制出首个家鸡全基因组图谱。2月13日,相关研究成果以《家鸡基因组完成图的演化分析》为题,发表在美国《国家科学院院刊》上。这是继去年人类基因组完成图公布以来,首个发表的脊椎动物基因组完成图,也是基因组完成图谱绘制技术首次在经济动物中

基因组图谱的方法和意义

中文名称基因组图谱英文名称genomic map定  义展示一种生物全基因组结构的图谱。按建立图谱的研究目的方法和精细程度,可以有不同的形式,包括以遗传学方法建立的遗传连锁图谱,按距离绘出基因位置分布的物理图谱,经测定核酸序列建立的核苷酸序列图谱,以及标记出可表达序列的转录图谱等。应用学科生物化学与

揭秘:帝王蟹的基因组图谱

  科学家成功获得高质量帝王蟹基因组图谱   帝王蟹 唐伯平供图  帝王蟹基因组染色体图谱 唐伯平供图  帝王蟹和其他泛甲壳动物的系统演化关系 唐伯平供图  近日,《分子生态资源》发表了首个歪尾类螃蟹的高质量基因组图谱,即一种重要经济蟹类蓝帝王蟹(Paralithodes platypus)的基因组