《自然—结构与分子生物学》:发现RNA调控基因新标靶
美国和加拿大科学家近日研究发现,RNA可以与DNA上称为启动子区(promoter region,位于实际基因前的一小段DNA片段)的非基因区相互作用。在基因被开启前,启动子必须先被激活。相关论文7月6日在线发表于《自然—结构与分子生物学》(Nature Structural and Molecular Biology)上。 图片说明:David Corey博士和Bethany Janowski博士在讨论。(图片来源:UT Southwestern Medical Center) 在之前的研究中,美国德州大学西南医学中心的David Corey和Bethany Janowski发现,小链RNA能够激活癌细胞中的某些基因。研究人员用人造RNA证实,它们可以通过扰乱环绕DNA的调节蛋白混合体来调控基因的表达。不过其中的具体机制一直没有弄清。 在最新的研究中,研究人员发现了RNA一个意想不到的标靶。RNA瞄准的并不是......阅读全文
核糖体RNA的结构
测定rRNA的空间排列方式的方法主要有电镜法和交联法。其功能部位通过几种方法确定在70S核糖体图中显示了rRNA分子的结合部位和方向。在电镜下,16SrRNA的排列呈V型,一个臂比一个臂稍厚和长。23S的大小和形状可与50S"皇冠"式样很好匹配。有结论认为,rRNA形成了核糖体亚基的骨架,蛋白质
转移信使RNA的结构特点
中文名称转移-信使RNA英文名称transfer-messenger RNA;tmRNA定 义一类兼有接受(携带)氨基酸和编码氨基酸的双功能RNA分子。其主要功能是在特定情况下可提前终止蛋白质的生物合成,以免产生不良产物。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
核小RNA的基本结构
细胞内有核小RNA(small nuclearRNA,snRNA)。它是真核生物转录后加工过程中RNA剪接体(spliceosome)的主要成分,参与mRNA前体的加工过程。其长度在哺乳动物中约为100-215个核苷酸,共分为7类,由于含U丰富,故编号为U1~U7。snRNA只存在于细胞核中,其中U
RNA聚合酶的结构
为什么细菌的RNA聚合酶需要这么大和复杂的分子结构呢?而某些噬菌体特有的RNA聚合酶则要小得多,仅由一条多肽链组成。这证明RNA合成所需的机构可以远比宿主的酶小。这种情况说明,噬菌体内的转录仅需一条"最小"的机构。然而这种酶只能识别噬菌体本身所有的少数几个启动子;它们不能识别其他启动子。例如噬菌
核小RNA的基本结构
细胞内有核小RNA(small nuclearRNA,snRNA)。它是真核生物转录后加工过程中RNA剪接体(spliceosome)的主要成分,参与mRNA前体的加工过程。其长度在哺乳动物中约为100-215个核苷酸,共分为7类,由于含U丰富,故编号为U1~U7。snRNA只存在于细胞核中,其中U
单链RNA的结构特点
中文名称单链RNA英文名称single-stranded RNA;ssRNA定 义只含有一条链的RNA分子。生物体中绝大部分RNA是单链RNA,形成二级结构时,是既有单链、又有双链结构域的RNA分子;只有某些RNA病毒是由两条链互补而成的双链RNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与
核糖体RNA的结构
测定rRNA的空间排列方式的方法主要有电镜法和交联法。其功能部位通过几种方法确定在70S核糖体图1中显示了rRNA分子的结合部位和方向。在电镜下,16SrRNA的排列呈V型,一个臂比一个臂稍厚和长。23S的大小和形状可与50S"皇冠"式样很好匹配。有结论认为,rRNA形成了核糖体亚基的骨架,蛋白质与
基因的概念
基因(gene)的概念随着遗传学、分子生物学、生物化学等领域的发展而不断完善。从遗传学的角度看,基因是生物的遗传物质,是遗传的基本单位——突变单位、重组单位和功能单位;从分子生物学的角度看,基因是负载特定遗传信息的DNA分子片段,在一定条件下能够表达这种遗传信息,变成特定的生理功能。有的生物基
蛋白质结构显示肿瘤抑制基因开合
据美国物理学家组织网报道,美国加州大学圣克鲁兹分校癌症研究人员最近观察到细胞内生化反应分子机制,解释了肿瘤抑制基因是如何控制细胞生长分裂周期的,有助于开发癌症治疗新途径。研究发布在8月《自然结构与分子生物学》上。 目前已知,眼癌肿瘤抑制基因蛋白质就像一扇门,其打开还是关闭控
《自然—方法学》:蛋白质结构分析新技术创测定速度纪录
过去需几年时间完成的工作现在仅用几天即可完成 据美国物理学家组织网7月20日报道,隶属于美国能源部的劳伦斯伯克利国家实验室的科学家开发出一种利用小角度X射线散射技术测定蛋白质结构的新方法,大大提高了蛋白质结构研究分析的效率,使过去需要几年时间完成的工作仅需要几天即可完成,这将极大地促进结构
艾滋病病毒生命周期研究有新发现
德国亥姆霍兹RNA感染研究所(HIRI)和德国罗伯特·科赫研究所(RKI)的科学家们现已开发出一种新技术,可用于分析和影响艾滋病病毒(HIV)生命周期的关键阶段。研究结果提供了对人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)生命周期后期阶段的见解,并为RNA二聚化和包装机制之间的联系提供了新解释。相关论文2
结构基因的结构
人类结构基因4个区域:①编码区,包括外显子与内含子;②前导区,位于编码区上游,相当于RNA5’末端非编码区(非翻译区);③尾部区,位于RNA3’编码区下游,相当于末端非编码区(非翻译区);④调控区,包括启动子和增强子等。基因编码区的两侧也称为侧翼顺序(图3-1)。 1.外显子和内含子 大多
病毒基础知识(3)
(四)分子病毒学的研究时期 自从1953年DNA双螺旋结构理论建立以来,由于分子生物学的迅速发展,新技术和新方法的应用,使得病毒学的研究步入了分子病毒学的发展时期。50年代至60年代是分子生物学的奠基时代,而病毒特别是噬菌体和植物病毒为此做出了巨大的贡献,因此分子病毒学也正是分子生物学的发展过程中
上海巴斯德所发现IFITMs在巨细胞病毒感染过程中的作用
近期,国际学术期刊Journal of Virology 在线发表了中国科学院上海巴斯德研究所疱疹病毒分子生物学研究组和分子免疫学研究组的合作研究论文Human Cytomegalovirus Exploits Interferon-Induced Transmembrane Proteins
施一公团队破解结构生物学最大难题之一
施一公 北京时间8月21日凌晨,著名的《科学》杂志在线发表了清华大学生命科学学院施一公教授研究组的两篇具有里程碑意义的论文,宣布得到了高分辨率的剪接体三维结构和剪接体对前体信使RNA执行剪接的基本工作机理,从而将分子生物学的“中心法则”在分子机理的研究上大幅度向前推进。 “这项研究成果的意义很可
寨卡病毒基因组RNA结构与感染性的关系
2018年11月21日,清华大学生命科学学院张强锋课题组、药学院谭旭课题组在《细胞宿主与微生物》(Cell Host & Mircobe)期刊在线发表题为《寨卡病毒基因组RNA结构的综合分析揭示了病毒感染性的关键决定因素》(Integrative Analysis of
Nature新文章阐析异病同源
来自约翰霍普金斯大学的研究人员称,他们发现了近期揭露的一种遗传突变有可能引起两种棘手的神经系统疾病的一条途径。受累基因有可能是促进了有毒RNA累积而非生成很多的蛋白质,问题的根源似乎在于突变位点生成的缺陷遗传物质混乱。 领导这一研究小组的是约翰霍普金斯大学医学院生物化学、分子生物学和神经科
当ChatGPT遇上CRISPR
在探索CRISPR基因编辑系统的过程中,研究人员从温泉、泥炭沼泽、粪便甚至酸奶中搜寻各种微生物。现在,由于生成式人工智能的进步,他们可能只需按一下按钮就能设计出这些系统。 据《自然》报道,日前,研究人员公布了他们使用一种名为蛋白质语言模型的生成式人工智能工具,设计CRISPR基因编辑蛋白质的细
中科大最新Nature子刊发现lncRNA新功能
来自中科大的消息,中国科学技术大学教授单革课题组发现并命名了一个长链非编码RNA――5S-OT,并发现在灵长类中,5S-OT RNA获取了调控多个基因可变剪切的新功能。该研究成果发表在10月3日出版的《自然-结构和分子生物学》上。论文的共同第一作者为课题组的博士生胡珊珊和硕士生王小林。从酵母到人类的
RNA介导的基因沉默实验
实验材料pGEM-T 载体 DNA 模板 试剂、试剂盒d
RNA介导的基因沉默实验
实验材料 pGEM-T 载体DNA 模板试剂、试剂盒 dNTP 混合物DNA 聚合酶(Sigma) 及配套缓冲液限制酶仪器、耗材 PCR 纯化试剂盒或柱子实验步骤 一、筛选目的基因片段的参数1. 序列( 1 ) 构建一个指定的 RNA 沉默载体首先要进行生物信息学分析。根据目的基因对应的已知 c
RNA介导的基因沉默实验
实验材料pGEM-T 载体DNA 模板试剂、试剂盒dNTP 混合物DNA 聚合酶(Sigma) 及配套缓冲液限制酶仪器、耗材PCR 纯化试剂盒或柱子实验步骤一、筛选目的基因片段的参数1. 序列( 1 ) 构建一个指定的 RNA 沉默载体首先要进行生物信息学分析。根据目的基因对应的已知 cDNA 序列
中国科大发现新型非编码RNA
最近,中国科学技术大学单革教授实验室在国际知名杂志《自然-结构和分子生物学》(Nature Structural & Molecular Biology)发表研究性论文,报导了其实验室发现的一类新型非编码RNA以及此类非编码RNA的功能和功能机理。 非编码RNA是一大类不编码蛋白质而在细胞中起
蛋白质结构在结构基因组学中的应用介绍
已经测定了酿酒酵母(Saccharomyces cereuisiae)、线虫(Caenorhabditis elegans)、果蝇(Drosophilamelanogaster)、拟南芥(Arabidopsis thaliana)等模式生物的基因组序列.。特别值得一提的是,随着人类基因310福建
当代生命科学的显著特点
当代生命科学的显著特点是:分子生物学的突破性成果,成为生命科学的生长点,使生命科学在自然科学中的位置起了革命性的变化。20世纪50年代,遗传物质DNA双螺旋结构的发现,开创了从分子水平研究生命活动的新纪元。此后,遗传信息由DNA通过RNA传向蛋白质这一“中心法则”的确立以及遗传密码的破译,为基因工程
人工智能设计的基因编辑工具来了
在不断探索以前未知的CRISPR基因编辑系统的过程中,研究人员从温泉、泥炭沼泽、粪便甚至酸奶中搜寻各种微生物。现在,由于生成式人工智能的进步,他们可能只需按一下按钮就可以设计出这些系统。据《自然》报道,日前,研究人员公布了他们如何使用一种名为蛋白质语言模型的生成式人工智能工具设计CRISPR基因编辑
Nature:跨越鸿沟的RNA结构信号
科罗拉多大学的研究人员在Nature杂志上发表文章指出,一个以RNA结构为基础的信号,能够跨越不同生命类型数十亿年的进化趋异。这一发现改变了人们对生命(细菌和真核生物)起始蛋白质合成的基础认识。 长期以来,科学家们一直认为细菌和真核生物中的翻译起始信号是相互排斥的,这篇文章的通讯作者Jeffr
Nature:跨越鸿沟的RNA结构信号
科罗拉多大学的研究人员在Nature杂志上发表文章指出,一个以RNA结构为基础的信号,能够跨越不同生命类型数十亿年的进化趋异。这一发现改变了人们对生命(细菌和真核生物)起始蛋白质合成的基础认识。 长期以来,科学家们一直认为细菌和真核生物中的翻译起始信号是相互排斥的,这篇文章
关于转运RNA的结构的概述
转运RNA分子由一条长70~90个核苷酸并折叠成三叶草形的短链组成的。上图中有两种不同的分子,苯丙氨酸tRNA(4tna)和天冬氨酸tRNA(2tra)。tRNA链的两个末端在图上方指出的L形结构的末端互相接近。氨基酸在箭头示意的位置被连接。在这条链的中央形成了L形臂,如图下方所示,露出了形成反
核糖体RNA的结构介绍
测定rRNA的空间排列方式的方法主要有电镜法和交联法。其功能部位通过几种方法确定在70S核糖体图1中显示了rRNA分子的结合部位和方向。在电镜下,16SrRNA的排列呈V型,一个臂比一个臂稍厚和长。23S的大小和形状可与50S"皇冠"式样很好匹配。有结论认为,rRNA形成了核糖体亚基的骨架,蛋白质与