《科学》：深度测序带来人类转录组“空前”全貌
德国科学家最近利用下一代测序技术和分析方法，得到了对于人类转录组（transcriptome）的崭新认识。相关论文7月3日在线发表于《科学》杂志。 到目前为止，人类转录组的功能复杂性尚未完全阐明。在最新研究中，通过对源自人类两大细胞系——胚肾和B细胞系的转录子（本）进行“鸟枪法测序”（shotgun sequencing，一种随机且高通量的序列测定方法），德国马普分子遗传学研究所和Genomatix测序软件公司的科学家揭示出人类转录组前所未有的复杂性和可变性。 他们发现，50%的转录子对应于特定的基因组域，其中有80%吻合已知的外显子（exon）。多聚腺苷酸化的转录组（polyadenylated transcriptome）的66%对应于已知基因，其余的34%则对应在未标注的基因组域中。很明显，还有大量的新基因候选活跃在被研究的细胞系中。而根据已知的转录子，研究人员发现，RNA测序可以比微阵列多探测到25%......阅读全文
科学家将分类和测序人体所有细胞
计算生物学家Aviv Regev 喜欢挑战一些看似不可能完成的任务。2011年，她与分子遗传学家Joshua Levin合作，测试了RNA测序的几种方法。科学家希望找到这几种技术的极限，以查看哪种方法表现最佳。最终，Levin指出，一些技术的灵敏度非常高，能检测含量低于单细胞中含有的RNA量的样
科学家成功实现活细胞转录组测序
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/8/484542.shtm 活细胞测序记录细胞的变化示意图 来源：Duygu Koldere Vilain 在我们呱呱坠地之前，受精卵是如何发育成复杂个体的？为何正常的细胞会慢慢变成癌细胞？ 细胞
Science：单细胞分析？并行测序技术可以
近日，一项发表于国际杂志Science上的研究论文中，来自美国的研究者描述了一种新型的大规模并行技术，通过利用新一代测序技术来在单细胞水平上实现对基因表达的监测；研究者表示，单细胞分析对于理解人类造血系统的必要性及重要性不断凸显，如果没有这种分析的话，来自少许细胞的大量表达改变就和来自许多细胞的
科学家进行大规模古代DNA测序分析
通过分析101个古代欧亚人的基因组，遗传学家们揭示了青铜时代欧洲和亚洲的大规模人口迁徙和变化，是如何塑造当今欧洲和亚洲的人口结构的。11日发表在英国《自然》期刊上的这项遗传学研究，是迄今为止对古代DNA样本分析的最大项目，加深了科学家对现今人们的身体特征以及语言传播的理解。 青铜时代在考古学
NIH鼓励科学家在单细胞测序领域创新
8月19日，美国国立卫生研究院（NIH）的Common Fund 基金会向单细胞测序领域发出挑战，Common Fund 称，愿意提供2项50万美元的奖金奖励那些在单细胞测序领域中有所突破的科学家或科研团队。 通过该技术，NIH称，希望能够了解细胞在发育过程中的各个阶段的变化以及行为，NIH要
2014年测序、克隆、细胞分析等技术展望
新一代测序 新一代测序(NGS)技术一路走来，逐渐褪下其神秘面纱，进入越来越多的实验室。随着时间的推移，NGS系统从“高端大气上档次”的大型平台演化成满足个性化需求的台式测序仪。MiSeq、Ion Torrent和454 GS Junior这些仪器的上市，也推动了测序平台的普及。同
Cell：科学家利用单细胞测序描绘骨髓间质完整细胞类群
哈佛大学的研究人员在Cell上发表了题为“A Cellular Taxonomy of the Bone Marrow Stroma in Homeostasis and Leukemia”的文章。研究者们从单细胞角度系统地对骨髓间质细胞进行了详细的分类学研究，揭示了急性髓系白血病对间质细胞群体
最新测序技术能用单个细胞分析基因组
美国物理学家组织网9月18日报道，最近，来自美国加利福尼亚大学圣地亚哥分校、克雷格·文特尔研究院和Illumina公司的科学家对现代基因测序算法进行了改良，只需从一个细菌细胞中提取的DNA（脱氧核糖核酸）就可组装成接近完整的基因组，准确率达到90%，而传统的测序方法至少需要10亿个
浅谈单细胞RNA测序的技术与分析难点
如今，单细胞生物学是一个热门话题。而在这一领域中，最前沿的则是单细胞RNA测序（scRNA-seq）。传统“批量的”RNA测序方法（RNA-seq）可以一次处理成千上万个细胞，并得到变异的平均水平。但是没有两个细胞是完全相同的，而scRNA-seq则可以揭示出每个细胞独特的微妙变化，甚至可以揭示全新
单细胞测序数据的分析有什么意义
单细胞测序可以分析一个细胞里面的基因组序列这个主要适用于受精卵的试管婴儿