大化所蛋白质和RNA复合物相互作用合作研究取得新进展
中科院大连化学物理研究所海洋生物产品工程组薛松研究员在其2008年非编码RNA如何帮助蛋白质寻找特异底物分子研究工作(Nature Structural & Molecular Biology)基础上,再次与合作者利用结构生物学手段,揭示了另一类非编码RNA及其相关蛋白质和RNA的复合物的三维晶体结构及其相互作用。科学家们对该复合体的组装和功能研究已经持续了十多年,这一结果被认为是在认识该复合物的组合方式和其修饰RNA甲基化机理方面迈出了一大步:可以看到在原子水平上向导RNA、底物RNA以及相关的三个蛋白质的相互作用。 RNA分子不仅仅作为编码蛋白质的模板,许多不编码蛋白质的RNA在生命活动也有重要的功能。C/D RNA就是一类广泛存在于古细菌和真核生物中的非编码RNA,他们因为含有共同的保守序列模块C和D而得名。C/D RNA主要功能是指导RNA底物,如rRNA、snRNA和tRNA发生特定......阅读全文
基因组所发表长非编码RNA分类问题综述文章
近日,中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室的“百人计划”研究员章张及其团队,与沙特阿卜杜拉国王科技大学(King Abdullah University of Science and Technology)开展科研合作,对长非编码RNA的分类问题进行了系统综述,相关论文在RN
中科院Nature子刊发表非编码RNA研究重要发现
来自中科院动物研究所生物膜与膜生物功能国家重点实验室的研究人员在新研究中证实,CARL lncRNA通过破坏miR-539依赖性的PHB2下调,抑制了心肌细胞中缺氧诱导的线粒体分裂和凋亡。 领导这一研究的是中科院动物研究所细胞增殖与信号调控研究组组长李培峰(Pei-Feng Li)
研究发现空气污染诱发肺癌关键长链非编码RNA
中科院动物所周光飚研究组通过深入研究,发现了空气污染诱发肺癌的关键长链非编码RNA。相关成果日前发表于肿瘤学杂志Oncotarge。 据了解,肺癌已成为全球发病率最高、致死人数最多的癌症,其中90%的肺癌由吸烟、空气污染等环境因素引起。然而,空气污染诱发肺癌的分子机制目前尚不清楚。 此前研究
“非编码RNA调控作用”重大研究计划2015项目指南
国家自然科学基金委员会现发布重大研究计划“基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制”2015年度项目指南,请申请人及依托单位按项目指南中所述的要求和注意事项申报。 附件:“基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制”重大研究计划2015年度项目指南 国家自然科学基金委员会
长链非编码RNA对脑生长起重要作用
“长非编码RNA通常被描述为‘基因组的暗物质’。在这里,我们系统地研究了它们对大脑发育、长期记忆储存、衰老和痴呆导致的记忆力下降的分子机制,”Puthanveettil说。 RNA是细胞的主要调节因子,是读取、转录和调节DNA表达以及构建蛋白质的小型核苷酸链,虽然科学家们已经掌握了脑细胞之间如
dna甲基化与rna甲基化的区别
DNA甲基化和组蛋白修饰的相同点:都有包含甲基化修饰;不同点:修饰对象不同,一个是对DNA修饰,一个是对蛋白:组蛋白修饰。而RNA干扰是对RNA的降解,与前两者差异较大。
分卓中心发现长非编码RNA对细胞核仁和RNA转录的调控机制
7月30日,《科学》(Science)以Research Article形式发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)研究员陈玲玲研究组和研究员刘珈泉研究组的合作研究成果——lncRNA SLERT controls phase separation of FC/DF
中山大学RNA团队开发PolⅢ转录的非编码RNA功能网络信息库
中山大学生命科学学院RNA组学团队杨建华教授等开发了Pol3Base数据和信息库,系统鉴定RNA聚合酶III(PolⅢ)转录的非编码RNA(P3RNA),全面解析P3RNA的互作组、表达、进化、表观转录组、疾病变异及调控网络。 Pol3Base 网站整合了由不同转录因子调控的数千个 RNA 聚
同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平(下)
又到了一周云序生物课堂开讲时间!你,准备好了吗? 上一期文章当中,云序通过引用这样一张表格给大家传递了一个重要信息:表中的METLL3、METTL14、NSun2、FTO、ALKBH5、YTHDF2均是RNA甲基化重要的酶,而且这些酶在不同疾病当中意义有所不同,例如METTL3在AML、B
快速检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平(下)
又到了一周云序生物课堂开讲时间!你,准备好了吗? 上一期文章当中,云序通过引用这样一张表格给大家传递了一个重要信息:表中的METLL3、METTL14、NSun2、FTO、ALKBH5、YTHDF2均是RNA甲基化重要的酶,而且这些酶在不同疾病当中意义有所不同,例如METTL3在AML、B
解析检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶RNA甲基化水平(上)
云序生物解析如何做到快速同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶&RNA甲基化水平(上) RNA甲基化作为云序生物的主打科研产品,已经帮助多个研究团队展开了RNA甲基化研究。作为国内RNA甲基化研究的领跑者,云序生物是国内RNA甲基化10分文章发表的成熟服务商,首发推出了非编码RNA甲基化测
基因沉寂的作用
这个“原则”就是目前尚没有真正完全清楚的“组蛋白密码”(Histone Code)。能够与甲基化组蛋白结合的蛋白质有sir1/2/3/4,这是一组被称为"Silencing Informative Repressor"的蛋白,其中,Sir2就是上文中的“去乙酰化”酶,而Sir1/3/4则负责与甲基化
基因沉寂的作用
这个“原则”就是目前尚没有真正完全清楚的“组蛋白密码”(Histone Code)。能够与甲基化组蛋白结合的蛋白质有sir1/2/3/4,这是一组被称为"Silencing Informative Repressor"的蛋白,其中,Sir2就是上文中的“去乙酰化”酶,而Sir1/3/4则负责与甲基化
关于基因沉寂的作用介绍
这个“原则”就是目前尚没有真正完全清楚的“组蛋白密码”(Histone Code)。能够与甲基化组蛋白结合的蛋白质有sir1/2/3/4,这是一组被称为"Silencing Informative Repressor"的蛋白,其中,Sir2就是上文中的“去乙酰化”酶,而Sir1/3/4则负责与甲
基因沉寂的作用
这个“原则”就是目前尚没有真正完全清楚的“组蛋白密码”(Histone Code)。能够与甲基化组蛋白结合的蛋白质有sir1/2/3/4,这是一组被称为"Silencing Informative Repressor"的蛋白,其中,Sir2就是上文中的“去乙酰化”酶,而Sir1/3/4则负责与甲基化
中科院、复旦Nature子刊解析RNA甲基化
在分子生物学的中心法则中,遗传信息从DNA、RNA流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰,这些修饰可以调控基因的表达,并由此决定细胞的状态,影响细胞的分化和发育。近年来人们发现,mRNA和其他RNA上也存在类似的调控机制。 N6-methyladenosine(m6A)是真
RNA甲基化研究深度剖析
一、听说最近 RNA甲基化很火,它是何方神圣? 1、高分文章频现 说起近来的科研热点,RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一,亮点文章频出,着实让人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月发表的文章影响因子为10分以上的,就有高达 17 篇。
RNA甲基化促进草莓成熟
果实中富含的营养成分是人类膳食结构的重要组成部分,对人体健康不可或缺。果实品质在成熟过程中逐渐形成,受到精确调控。解析果实成熟调控机制,将为果实品质改良和新品种选育提供理论基础。根据成熟机制的不同,果实可分为两种类型:呼吸跃变型(如番茄、苹果、香蕉)和非呼吸跃变型(如草莓、葡萄、柑橘)。植物激素
从心脏病到癌症——长非编码RNA到底发挥了什么作用?
直到近几年才发现人类基因的70%是非编码RNA,非编码RNA不能翻译为蛋白质,但仍在人体中发挥重要作用。Stefanie Dimmeler是首批发现一个microRNA亚群在血管再生中发挥重要作用的研究人员之一,她最近获得了欧洲研究委员会(ERC)的ERC高级研究员资助,这使她能够对另一群非编码
中国科大长非编码RNA调控细胞周期研究取得成果
12月4日,中国科学技术大学教授吴缅研究组的研究成果,在线发表在eLife上。LAST调控CCND1 mRNA稳定性的示意图 细胞生长依赖于精确的细胞周期调控,一旦该体系中的某一环节出现问题,就有可能导致肿瘤的发生。细胞一旦通过G1/S检查点,只能进行分裂,G1/S期的转换点是细胞周期进程中的
中国科大长非编码RNA调控细胞周期研究取得成果
12月4日,中国科学技术大学教授吴缅研究组的研究成果,以LAST, a c-Myc-inducible long noncoding RNA, cooperates with CNBP to promote CCND1 mRNA stability in human cells为题,在线发表在e
上海生科院总结多种基因内部来源的非编码RNA生成机制
10月1日,中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所研究员杨力受邀在WIREs RNA 发表了题为Splicing noncoding RNAs from the inside out 的综述论文,系统总结了多种来自于前体RNA内部序列的非编码RNA分子及其产生机制和潜在功能作用。 真核基
第二军医大学Hepatology解析癌症与非编码RNA
来自第二军医大学的研究人员发现,一种癌胚胎非编码RNA通过稳定NOP2促进了肝癌细胞增殖以及获得干细胞样特性。这项研究已被在国际著名肝脏疾病杂志Hepatology(最新影响因子12.003)接受并在线发布。 第二军医大学的孙树汉(Shu-Han Sun)教授、李文(Wen Li)副教授以及李
华人学者Cancer-Cell:首张人类癌症非编码RNA综合图谱
随着对重要但知之甚少的基因组部分——“DNA暗物质”的认识日渐增加,从根本上改变了科学家们研究疾病的方式。人类基因组中包含有大约2万个蛋白质编码基因(占总数的不到2%),而70%的基因组被转录为非编码RNA。但当前仍尚未系统地调查过这些称作为长链非编码RNAs (lncRNAs)的片段以及它们发
李培峰教授Cell、Nature子刊非编码RNA研究重要发现
青岛大学转化医学研究院院长李培峰(Pei-Feng Li)教授曾在国际上首先提出“抗氧化酶自身被氧化”的新理论,是国际上少数几个最早将细胞凋亡引入心血管研究的科学家之一。近日李培峰教授领导的研究小组连接在非编码RNA研究领域取得重要研究发现,相关论文发表在《分子细胞》(Molecular Cel
非编码RNA结合肌细胞增强因子2D调控肌肉发育
近日,农科院特产研究所李光玉研究员带领的研究团队发现了一个新的在肌肉发育过程中发挥重要功能的长非编码RNA,该非编码RNA-Irm通过直接结合肌细胞增强因子2D来调节肌源性基因的转录,进而调节肌生成。该研究结果为动物肌肉生长发育研究提供了新的调节因子和表观调控机制,对深入解析肌肉生长发育的分子调
中国科大长非编码RNA调控细胞周期研究取得新成果
12月4日,中国科学技术大学教授吴缅研究组的研究成果,以LAST, a c-Myc-inducible long noncoding RNA, cooperates with CNBP to promote CCND1 mRNA stability in human cells为题,在线发表在e
微生物所揭示CMV非编码卫星RNA的起源和发生
烟草植物感染黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)以后,随着连续继代和病毒感染,一个长链非编码RNA(long non-coding RNA)神奇地出现并被称为CMV卫星RNA(satellite RNA,satRNA)。satRNA因能够利用CMV编码的复制酶进行复
Nature子刊:非编码RNA癌症药物基因组图谱新突破
近日,匹兹堡大学药物遗传研究中心的杨达和张敏课题组借力于一种名为弹性网络回归(Elastic Net regression)的机器学习模型,从1,001个肿瘤细胞系的高通量长非编码RNA表达谱(long noncoding RNAs, lncRNAs)与265种抗癌药物敏感性数据中,挖掘出了27
科学家通过多种方法探究长链非编码RNA
直到今天,针对lncRNA的简洁且合理的分类系统仍遥不可及。长链非编码RNA的概念模型 2013年,一群研究人员决定更加深入地挖掘一种名为H1的人类胚胎干细胞系,并且获得了一些惊喜。H1是最著名的干细胞系之一,但该团队还是成功发现了2000多个此前未被阐明的RNA片段。更重要的是,其中有1