科学家通过多种方法探究长链非编码RNA
直到今天，针对lncRNA的简洁且合理的分类系统仍遥不可及。长链非编码RNA的概念模型 2013年，一群研究人员决定更加深入地挖掘一种名为H1的人类胚胎干细胞系，并且获得了一些惊喜。H1是最著名的干细胞系之一，但该团队还是成功发现了2000多个此前未被阐明的RNA片段。更重要的是，其中有146个为人类胚胎干细胞所独有，从而为研究多能性——变成体内任何细胞类型的能力——提供了诱人线索。 然而，这些转录并未受到关注，因为它们含有往往会被序列分析器过滤掉的重复性编码片段。 这是一个巨大的盲点。其他实验室曾发现了富含重复性编码并且在人类干细胞中非常重要的RNA存在的初步证据。在主要来自美国加州斯坦福大学的研究人员分析结果时，他们意识到，自己正好找到了此类RNA。团队成员Vittorio Sebastiano介绍说，在一份包含146个RNA序列的清单中，最丰富的3个——被命名为HPAT2、HPAT3和HPAT5——似乎对于建......阅读全文
调控免疫的lncRNA
当过度活化或脱靶时，免疫系统中正常对抗感染的一些细胞会转而攻击个体自身的组织。这一过程会推动作为自身免疫性疾病组成部分的炎症。现在，来自纽约大学Langone医学中心的一项新研究揭示出了抑制这些机制的一种新方法，有可能会影响未来的药物设计。相关论文 发布在12月16日的《自然》（Natur
PNAS惊人发现：基因转录成双对
DNA转录是指根据DNA模板生成信使RNA用于蛋白质合成的过程。现在Whitehead研究所的科学家发现，编码蛋白的DNA在开始转录时会同时启动一个逆向转录程序，生成相应的长非编码RNA（lncRNA）。而且，在干细胞分化为其他类型细胞的过程中，成对mRNA 和lncRNA的转录是相协调的。这一
清华大学首席科学家Cell－Stem－Cell发布lncRNA重要发现
来自清华大学、中科院动物研究所的研究人员揭示，在多能细胞中Divergent lncRNAs调控了基因表达和谱系分化。这一重要的研究发现发布在3月17日的《细胞干细胞》（Cell Stem Cell）杂志上。 清华大学973项目首席科学家沈晓骅(Xiaohua Shen)是这篇论文的通讯作者。
lncRNA研究策略与技术
研究背景：长链非编码RNA(long noncoding RNA，lncRNA)是一类不编码蛋白的RNA分子，长度在200 bp以上，起初被认为是RNA聚合酶II转录的副产物，不具有生物学功能；近期的研究表明lncRNA具有保守的二级结构，可以与蛋白、DNA和RNA相互作用，参与多种生物学过程的调控
lncRNA功能机制研究（二）
实验路线（1）LINC00346调控胃癌发展的上游机制结果：转录因子KLF5和MYC可与LINC00346启动子结合，并增强其表达a. 转录因子MYC、KLF5和 LINC00346的Oncoprint分析；b. 在含有或未含有胃癌KLF5/ MYC / LINC00346 SCNAs的转录因子
lncRNA功能机制研究（一）
文章导读LncRNA是长度大于200nt的长链非编码RNA，在调控不同的分子过程中发挥着重要作用。其主要功能不仅可以与功能蛋白结合，并在转录或转录后水平调控基因表达，而且lncRNA也可以作为诱饵，吸附miRNA，调节miRNA调控的靶基因表达。但是，目前关于lncRNA在胃癌中的表达谱和生物学功能
长链非编码RNA:－从科研到临床（二）
脂类代谢和脂肪生成最新的研究表明，lncRNA控制肝脏中的脂类代谢，调控脂肪生成，从而维持机体的脂质稳态[9]。APOA1编码蛋白是高密度脂蛋白的重要组分。其反义转录本APOA1-AS可以在体内和体外抑制APOA1的表达。LncRNA NEAT1在脂肪生成过程中调节PPARγ2的可变剪接，它还介
胚胎干细胞
胚胎干细胞当受精卵分裂发育成囊胚时，内层细胞团（Inner Cell Mass）的细胞即为胚胎干细胞。胚胎干细胞具有 全能性，可以自我更新并具有分化为体内所有组织的能力。早在1970年Martin Evans已从小鼠中分离出胚胎干细胞并在体外进行培养。而人的胚胎干细胞的体外培养才获得成功。 进
lncRNA甲基化如何研究？
lncRNA分子通过海绵机制结合microRNA发挥生物学功能，这个ceRNA机制已经让大家心生厌倦了。可大牛就是大牛，引入甲基化就能轻松的变废为宝，竟然能让lncRNA的ceRNA思路变得瞬间高大上发表10分以上的文章，你一定和小编我一样很好奇他是怎么做到的。RNA甲基化，作为最新的国自然热点受到
eLife：lncRNA调控癌症关键基因
Salk研究所的科学家们发现，一种长非编码RNA(lncRNA)是癌症发展过程中的一个关键基因开关。这项研究于四月二十九日发表在eLife杂志上，为相关癌症的治疗提供了一条新的途径。 研究人员将这种lncRNA命名为PACER(p50-associated COX-2 extragenic
lncRNA助力叶酸研究新成果
LncRNA研究发表的成果五花八门，然而借助于lncRNA芯片，挖掘其中的高通量数据，发表5分影响因子的文章，还是可行的。本研究是以叶酸处理肥胖模型为基础，让我们来看看到底怎么样就可以在《Cellular Physiology and Biochemistry》（IF=5.104）上发表。研究背
如何快速查找LncRNA序列
查找LncRNA序列的网站有很多，包括Genebank，Ensembl，RefSeq，UCSC数据库等。今天，小编就给大家讲讲如何通过LncRNA ID号查找LncRNA的序列。 一．根据LncRNA来源数据库，进入相应链接。 1. Genebank：https://www.ncb
如何快速查找LncRNA序列？
查找LncRNA序列的网站有很多，包括Genebank，Ensembl，RefSeq，UCSC数据库等。今天，小编就给大家讲讲如何通过LncRNA ID号查找LncRNA的序列。一．根据LncRNA来源数据库，进入相应链接。 Genebank：https://www.ncbi.nlm.nih.gov
lncRNA的概念及形成过程
lncRNA，即Long non-coding RNA，你可以把它理解为不表达蛋白的mRNA。它的很多特征与mRNA很类似。比如，它与mRNA一样有启动子、有polyA尾巴、有不同剪接、有动态表达水平。除了不表达蛋白这一点以外，仅从核苷酸水平上来看，可以说它与mRNA并无实质分别。所以对于设计PC
lncRNA表达与RNA的延伸
LncRNA的火热研究已经有几年的时间了，关于lncRNA总归是有说不完的话题。目前对lncRNA的基础分析都已形成了一定的模式。然后，今年来lncRNA的相关文章依然如雨后春笋。 长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是长度大于 200 个核苷酸的非编码 RN
多篇文章聚焦lncRNAs与人类健康的密切关联！
长链非编码RNA(lncRNAs)因其重要的调控功能而受到全球科学家们的广泛关注，许多研究都表明，lncRNAs与多种人类疾病有千丝万缕的关系，其或会通过调控基因的转录，或会调节蛋白的功能。本文中，小编就整理了多篇研究报告，共同解读长链非编码RNA与人类健康的密切关联，分享给大家！ 基因组扩增
第二军医大Nature子刊发表lncRNA新发现
长非编码RNA（lncRNA）是一些长度超过二百个核苷酸的RNA分子，来自于基因组的非编码区域。虽然lncRNA没有编码任何蛋白质，但它们在不同组织和发育阶段的表达依然具有特异性，这说明lncRNA具有重要的生物学意义。 在测序技术的帮助下人们已经发现了数千种lncRNA，但这些lncRNA的
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇
RNA甲基化是目前申请国自然项目热点，也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature，cell级别高分文章领域，近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码，之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究（详细见云序课堂之前往期回顾）。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RN
Nature重要发现：调控免疫的lncRNA
当过度活化或脱靶时，免疫系统中正常对抗感染的一些细胞会转而攻击个体自身的组织。这一过 程会推动作为自身免疫性疾病组成部分的炎症。现在，来自纽约大学Langone医学中心的一项新研究揭示出了抑制这些机制的一种新方法，有可能会影响未来 的药物设计。相关论文发布在12月16日的《自然》（Nature）
LncRNA芯片应用于胃癌研究
研究背景 在全世界分范围内，每年因肝癌死亡的病例超过50万人，是主要的致死恶性肿瘤之一。在过去的十年中，随着影像学的进步以及健康体检的普及，越来越多的肝癌病人在患病早期被发现。但由于肝脏捐赠者的短缺，外科肝脏切除术仍然是治疗早期肝癌病人的最主要方法。目前对于术后患者缺乏准确
国际知名学者综述：LncRNA分类
美国St. Laurent Institute的Philipp Kapranov教授，是基因组学与系统生物学领域具有重要国际影响的专家，长期从事系统生物学和基因组功能方面的研究，其发现人类基因组能够产生大量的有功能作用的非编码RNA，在概念层次上重新定义了“基因”，这一发现被Science选为最
Cell重要发现：调控免疫的lncRNA
由麻省大学医学院Katherine A. Fitzgerald领导的研究小组证实，一种长链非编码RNA lincRNA-EPS发挥转录刹车作用限制了炎症。这一重要的研究发现发布在6月16日的《细胞》（Cell）杂志上。 细胞类型特异性的调控回路以复杂、动态和短暂调节的方式控制着基因表达。了解这
LncRNA芯片应用于胃癌研究
上海交通大学附属仁济医院房静远教授主要从事消化系统肿瘤发生的分子机制、早期诊断和分子治疗等相关研究。近期，该课题组应用美国Arraystar公司的lncRNA芯片分析了胃癌组织的lncRNAs表达情况，筛选到可预测胃癌发生的分子标志物GClnc1，并且阐明了GClnc1在胃癌的发生和发展中是如何发挥
Sci－Rep：PRC2与lncRNA相互作用的序列特异性新发现
国际学术期刊《科学报告》（Scientific Reports）近期在线发表了中国科学院－马普学会计算生物学伙伴研究所邵振研究组关于PRC2与长非编码RNA（lncRNA）之间相互作用的序列特异性研究成果。 由多梳（PcG）家族蛋白组成的表观调控复合物PRC2是控制动物组织发育的重要因子，但在
PRC2与lncRNA相互作用的序列特异性研究获进展
国际学术期刊《科学报告》（Scientific Reports）近期在线发表了中国科学院－马普学会计算生物学伙伴研究所邵振研究组关于PRC2与长非编码RNA（lncRNA）之间相互作用的序列特异性研究成果，题为The PRC2-binding long non-coding RNAs in hu
南京大学、第二军医大Nature揭示支持肿瘤起始细胞的lncRNA
肾肿瘤起始细胞（T-IC）推动了肾细胞癌（RCC）的发生、发展和药物抵抗。南京大学和第二军医大学的研究人员在Nature Communications杂志上发表文章，揭示了肾肿瘤起始细胞的一个增殖机制。文章通讯作者是第二军医大学的王林辉（Linhui Wang） 和南京大学医学院的张征宇（Zheng
云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究汇总—非编码RNA篇
RNA甲基化是目前申请国自然项目热点，也是唯一能在短短3个月内发数十篇nature，cell级别高分文章领域，近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究热潮。因mRNA参与蛋白编码，之前多数文章针对mRNA甲基化进行研究（详细见云序课堂之前往期回顾）。然而许多研究表明发生m6A甲基化的非编码RN
我国首个胚胎干细胞产品标准《人胚胎干细胞》标准发布
2月26日，《人胚胎干细胞》团体标准新闻发布会在北京举行。该标准是我国首个针对胚胎干细胞的产品标准，由中国细胞生物学学会干细胞生物学分会组织制订。记者从此次发布会上获悉，该标准综合考虑了科研、临床、产业、行业等因素，系统规定了胚胎干细胞的基本质量属性、质量控制的技术准则，以及产品使用和流通的相
北大汤富酬等人揭示人类胚胎发育机制
基因表达图 近日，北京大学研究团队采用先进的单细胞 RNA-Seq 转录组测序技术绘制出了完整的人类植入前胚胎和胚胎干细胞的转录组图谱，这一重要的研究成果发表在9月的《自然结构与分子生物学》(Nature Structural & Molecular Biology)杂志上。 由
科学家通过多种方法探究长链非编码RNA
直到今天，针对lncRNA的简洁且合理的分类系统仍遥不可及。长链非编码RNA的概念模型 2013年，一群研究人员决定更加深入地挖掘一种名为H1的人类胚胎干细胞系，并且获得了一些惊喜。H1是最著名的干细胞系之一，但该团队还是成功发现了2000多个此前未被阐明的RNA片段。更重要的是，其中有1