NatMethods：改变蛋白质研究的强大工具
近期，《Nature Methods》发布了一种称为Aquaria的强大工具，利用这一工具，生命科学家们可以利用公开可用的网络资源，精简了深入了解3D蛋白结构的过程。延伸阅读：中科大院士JBC解析重要蛋白复合体结构。 Aquaria项目是由澳大利亚加文医学研究所和CSIRO的Seán O'Donoghue博士与慕尼黑工业大学的Andrea Schafferhans博士共同指导完成。该项目始于2009年，包括一个国际团队，大约有十几名程序员和生物信息专家。 Aquaria是建立在蛋白质数据库（Protein Data Bank）的基础之上，其中包含超过100,000个蛋白质结构。 O'Donoghue说：“蛋白质数据库是一个很好的资源，含有生命分子过程的丰富细节，但是我们都知道，很少有生物学家能够充分的利用它。所以我们构建了Aquaria，使这一有价值的信息更容易用以探索发现。” “我们所做的事情是，把很多额外有用的信......阅读全文
简述黏蛋白的蛋白质结构
成熟黏蛋白是由两个不同的区域： 氨基和羧基末端区域被轻度糖基化，且富含半胱氨酸。半胱氨酸残基参与建立二硫内和黏蛋白单体之间的联系。 的10〜80残基序列的多个串联重复序列，其中多达一半的形成的大的中央区域的氨基酸是丝氨酸或苏氨酸。这个区域被与数百饱和O-连接的寡糖。N-连接寡糖中也发现对粘蛋
蛋白质结构是如何传递的
弗莱堡大学的研究人员正在将这种问题转移到蛋白质分析中，蛋白质是细胞的分子机制。由物理化学研究所的Thorsten Hugel教授，物理研究所的Steffen Wolf博士和Gerhard Stock教授领导的一组研究人员正在研究引起蛋白质结构变化的信号如何从一个网站到另一个。他们还试图确定这些机制发
关于κBGT蛋白质结构的介绍
κ-BGT是1983年从台湾产银环蛇毒素中首次分离、分子量6500，等电点为9.1的一种神经毒素，由于k-BGT能选择性地阻断α3β2亚型，被认为是少数能作为神经元烟碱乙酰胆碱受体（nAChRs）分型的特异性工具之一。κ-BGT的蛋白质一级结构由A、B两条链构成，每条链由66个氨基酸残基组成，含
蛋白质组结构和功能特点
蛋白质组(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出，指由一个基因组(Genome)，或一个细胞、组织表达的所有蛋白质(protein). 蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别，它随着组织、甚至环境状态的不同而改变。在转录时，一个基因可以多种mRNA形式剪接，一个蛋白质组不是一个基
蛋白质序列分析和结构预测
【实验目的】 1、掌握蛋白质序列检索的操作方法； 2、熟悉蛋白质基本性质分析； 3、熟悉基于序列同源性分析的蛋白质功能预测，了解基于motif、结构位点、结构功能域数据库的蛋白质功能预测； 4、了解蛋白质结构预测。【实验内容】 1、使用Entrez或SRS信息查询系统检索人脂联素（ad
AI能“构想”新蛋白质结构
科技日报北京12月2日电 （实习记者张佳欣）半个世纪以来，科学家一直在寻找解决“蛋白质折叠问题”的方法。这是生物学领域的一项重大挑战，难倒了几代科学家。但现在，人工智能（AI）解决了这一问题。据《自然》杂志1日发表的论文，包括美国华盛顿大学、伦斯勒理工学院和哈佛大学的研究人员在内的研究小组描述了一种
关于蛋白质结构的组成介绍
一、化学组成： （1）单纯蛋白质：仅含有AAs； （2）结合蛋白质：由AAs和其他非蛋白质化合物所组成； （3）衍生蛋白质：用化学或酶学方法得到的化合物。 二、分子组成： 基本单位：氨基酸 有不同的AAs通过肽键相互连接而成； 蛋白质→眎→胨→多肽→二肽→多肽→氨基酸。 三、元素组
蛋白质结构预测(protein－structure－prediction)
一种生物体的基因组规定了所有构成该生物体的蛋白质，基因规定了组成蛋白质的氨基酸序列。虽然蛋白质由氨基酸的线性序列组成，但是，它们只有折叠成特定的空间构象才能具有相应的活性和相应的生物学功能。了解蛋白质的空间结构不仅有利于认识蛋白质的功能，也有利于认识蛋白质是如何执行其功能的。确定蛋白质的结构对于生物
噬菌体的蛋白质结构介绍
无尾部结构的二十面体：这种噬菌体为一个二十面体，外表由规律排列的蛋白亚单位——衣壳组成，核酸则被包裹在内部。 有尾部结构的二十面体：这种噬菌体除了一个二十面体的头部外，还有由一个中空的针状结构及外鞘组成的尾部，以及尾丝和尾针组成的基部。 线状体：这种噬菌体呈线状，没有明显的头部结构，而是由壳
蛋白质结构解析的方法简介
到目前为止，蛋白质结构解析的方法主要是两种，x射线衍射和NMR。近年来还出现了一种新的方法，叫做Electron Microscopy。其中X射线的方法产生的更早，也更加的成熟，解析的数量也更多，我们知道，第一个解析的蛋白的结构，就是用x晶体衍射的方法解析的。而NMR方法则是在90年代才成熟并发展起
关于蛋白质结构的类型介绍
许多蛋白质都可以被分为多个结构组成单元，结构域就是这样一个组成单元。结构域一般可以自稳定，且常常独立进行折叠，而不需要蛋白质其他部分的参与；很多结构域都有自己独特的生物学功能。很多结构域并不是一个基因或基因家族对应蛋白质的独特结构单元，而往往是许多类蛋白质的共同结构单元。结构域常常是以其生物学功
突变按照蛋白质结构改变分类
按照蛋白质结构改变分类移码突变任何不能被3整除的插入或缺失引起的突变称为移码突变。由于密码子的三联体性质，插入或缺失破坏了阅读框或密码子的分组，从而导致与野生型完全不同的翻译 。缺失或插入发生位置在序列中越靠前，引起的蛋白质变化越明显。相反，任何可被3整除的插入或缺失引起的突变称为框内突变。同义突
关于蛋白质结构肽键的介绍
两个氨基酸可以通过缩合反应结合在一起，并在两个氨基酸之间形成肽键。而不断地重复这一反应就可以形成一条很长的残基链（即多肽链）。这一反应是由核糖体在翻译进程中所催化的。肽键虽然是单键，但具有部分的双键性质（由C=O双键中的π电子云与N原子上的未共用电子对发生共振导致），因此C-N键（即肽键）不能旋
多酶蛋白质的基本信息
中文名称多酶蛋白质英文名称multienzyme protein定 义由多个不同亚基组成的蛋白质。每个亚基分别催化部分反应最终完成整体反应。如乙酰辅酶A羧化酶由生物素羧基载体蛋白、生物素羧化酶和羧基转移酶组成，共同完成乙酰辅酶A的羧化反应。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），酶（二级学科）
多酶蛋白质的基本信息
中文名称多酶蛋白质英文名称multienzyme protein定 义由多个不同亚基组成的蛋白质。每个亚基分别催化部分反应最终完成整体反应。如乙酰辅酶A羧化酶由生物素羧基载体蛋白、生物素羧化酶和羧基转移酶组成，共同完成乙酰辅酶A的羧化反应。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），酶（二级学科）
非蛋白质氮的基本信息
中文名称非蛋白质氮英文名称non-protein nitrogen;NPN定 义血液中除蛋白质外其他含氮化合物中的氮总量。由尿素、氨基酸、肌酸、尿酸和氨等的含氮量组成。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），新陈代谢（二级学科）
蛋白质的结构域与三级结构的分类α/β型结构
一、结构域是蛋白质三级结构的基本结构单位和功能单位 蛋白质三级结构的基本结构单位是结构域。一个蛋白质可以只包含一个结构域也可以由几个结构域组成，故结构域是能够独立折叠为稳定的三级结构的多肽链的一部分或全部。结构域也是功能单位，通常多结构域蛋白质中不同的结构域是与不同的功能相关联的。许多已知的例子表
高能键的结构和信息
一般超过5kcal/mol(1cal=4.18kJ)。通常用“～”符号表示。例如三磷酸腺苷中的焦磷酸键，酰基辅酶A中的硫酯键等。
替加环素的结构信息
替加环素（tigecycline），化学名为（(4S,4aS,5aR,12aS)-4,7-双(二甲氨基)-9-[(叔丁基氨基)乙酰胺基]-3,10,12,12a-四羟基-1,11-二氧代-1,4,4a,5,5a,6,11,12a-八氢并四苯-2-甲酰胺，分子式为C29H39N5O8，是一种静脉给药的
胆固烷醇的结构信息
中文名称胆固烷醇英文名称cholestanol定 义即：3-β-羟胆烷。与胆固醇的差别是B环上没有双键，在肠道细菌的作用下，胆固醇被还原成5，6-二氢胆固醇及其异构体β粪固醇。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），脂质（二级学科）