NatMethods：改变蛋白质研究的强大工具
近期，《Nature Methods》发布了一种称为Aquaria的强大工具，利用这一工具，生命科学家们可以利用公开可用的网络资源，精简了深入了解3D蛋白结构的过程。延伸阅读：中科大院士JBC解析重要蛋白复合体结构。 Aquaria项目是由澳大利亚加文医学研究所和CSIRO的Seán O'Donoghue博士与慕尼黑工业大学的Andrea Schafferhans博士共同指导完成。该项目始于2009年，包括一个国际团队，大约有十几名程序员和生物信息专家。 Aquaria是建立在蛋白质数据库（Protein Data Bank）的基础之上，其中包含超过100,000个蛋白质结构。 O'Donoghue说：“蛋白质数据库是一个很好的资源，含有生命分子过程的丰富细节，但是我们都知道，很少有生物学家能够充分的利用它。所以我们构建了Aquaria，使这一有价值的信息更容易用以探索发现。” “我们所做的事情是，把很多额外有用的信......阅读全文
蛋白质结构和功能的基础模型
蛋白质设计程序使用在体内环境中驱动蛋白质的分子力的计算机模型。为了使问题易于解决，蛋白质设计模型简化了这些作用力。尽管蛋白质设计程序相差很大，但它们必须解决四个主要的建模问题：设计的目标结构是什么，目标结构允许什么样的灵活性，搜索中包括哪些序列，以及将使用哪个力场来分数序列和结构。目标结构蛋白质功能
蛋白质序列分析和结构预测实验
实验步骤 1. 人脂联素蛋白质序列的检索（1）调用Internet浏览器并在其地址栏输入Entrez网址（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez）；（2）在Search后的选择栏中选择protein；（3）在输入栏输入homo sapiens adiponectin；
蛋白质二级结构的定义
成氢键，这是稳定α－螺旋的主要键。 （4）肽链中氨基酸侧链R，分布在螺旋外侧，其形状、大小及电荷影响α－螺旋的形成。酸性或碱性氨基酸集中的区域，由于同电荷相斥，不利于α－螺旋形成；较大的R（如苯丙氨酸、色氨酸、异亮氨酸）集中的区域，也妨碍α－螺旋形成；脯氨酸因其α－碳原子位于五元环上，不易扭转，加之
关于蛋白质结构的发展历史介绍
1959年佩鲁茨和肯德鲁对血红蛋白和肌血蛋白进行结构分析，解决了三维空间结构，获1962年诺贝尔化学奖。 鲍林发现了蛋白质的基本结构。克里克、沃森在X射线衍射资料的基础上，提出了DNA三维结构的模型。获1962年诺贝尔生理或医学奖。50年代后豪普特曼和卡尔勒建立了应用X射线分析的以直接法测定晶
蛋白质原转换酶的基本信息
中文名称蛋白质原转换酶英文名称proprotein convertase定 义催化蛋白质原转化为成熟的蛋白质的蛋白酶类。如蛋白质原转换酶1(编号：EC 3.4.21.93)、蛋白质原转换酶3(编号：EC 3.4.21.94)、蛋白质原转换酶(编号：EC 3.4.21.61)等，切割蛋白质原的位点多
蛋白质原转换酶的基本信息
中文名称蛋白质原转换酶英文名称proprotein convertase定 义催化蛋白质原转化为成熟的蛋白质的蛋白酶类。如蛋白质原转换酶1(编号：EC 3.4.21.93)、蛋白质原转换酶3(编号：EC 3.4.21.94)、蛋白质原转换酶(编号：EC 3.4.21.61)等，切割蛋白质原的位点多
关于蛋白质纯化的基本信息介绍
蛋白质的一级、二级、三级和四级结构决定了它的物理、化学、生物化学、物理化学和生物学性质，综述了不同蛋白质之间的性质存在差异或者改变条件是使之具有差异，利用一种同时多种性质差异，在兼顾收率和纯度的情况下，选择蛋白质提纯的方法。 蛋白质在组织或细胞中一般都是以复杂的混合物形式存在，每种类型的细胞都
关于缀合蛋白质的基本信息介绍
结合蛋白质的分子中除氨基酸组分之外，还含有非氨基酸物质，后者称为辅因子，二者以共价或非共价形式结合，往往作为一个整体从生物材料中被分离出来。单纯蛋白质是指分子组成中，除氨基酸构成的多肽蛋白成分外，没有任何非蛋白成分称为单纯蛋白质。自然界中的许多蛋白质属于此类。而结合蛋白质是单纯蛋白质和其他化合物
甘露糖结合蛋白质的基本信息
中文名称甘露糖结合蛋白质英文名称mannose-binding protein;MBP定 义特指以甘露糖为配体的动物凝集素。一些可溶性的甘露糖结合蛋白质具有专一结合甘露糖基的蛋白质，属胶原凝素家族。如人体血清中的甘露糖结合蛋白质由富含半胱氨酸的氨基端区、胶原蛋白样区及羧基端糖类识别结构域组成。另有
糖基化蛋白质的基本信息
中文名称糖基化蛋白质英文名称glycosylated protein定 义带有共价连接糖链的蛋白质。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），糖类（二级学科）
蛋白质组氨酸激酶的基本信息
中文名称蛋白质组氨酸激酶英文名称protein histidine kinase定 义蛋白质-组氨酸-近-激酶(protein-histidine-pros-kinase，编号EC 2.7.3.11)和蛋白质-组氨酸-远-激酶(protein-histidine-tele-kinase，编号EC
雄激素结合蛋白质的基本信息
前列腺组织中含有丰富的雄激素和与之结合的蛋白，这些结合蛋白能够吸纳、浓聚性激素，因此将它们统称为性激素结合蛋白(sex hormone_binding globulin，SHBG)。
关于色素蛋白质的基本信息介绍
色素蛋白质是复合蛋白质的一种，是以色素为辅基的复合蛋白质的总称。它是由单纯蛋白质和色素结合而成的，主要与呼吸作用有关。血液中的血红蛋白就属于此类蛋白质。因辅基分子团种类的不同各自显有特异的色调及生物体内氧载体或氧化还原反应、光化学反应的触酶等的生理机能。
蛋白质组氨酸激酶的基本信息
中文名称蛋白质组氨酸激酶英文名称protein histidine kinase定 义蛋白质-组氨酸-近-激酶(protein-histidine-pros-kinase，编号EC 2.7.3.11)和蛋白质-组氨酸-远-激酶(protein-histidine-tele-kinase，编号EC
胆固烯酮的结构信息
中文名称胆固烯酮英文名称cholestenone定 义一种脱氢胆固烷酮。与胆固烷酮的区别是在A环的C-4和C-5之间有一个双键。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），脂质（二级学科）
信息素分子结构的定义
中文名称信息素分子结构英文名称molecular structure of pheromone定 义信息素分子中各原子之间的连接与排列方式。应用学科生态学（一级学科），化学生态学（二级学科）
信息素的结构和功能特点
信息素，也称做外激素，指的是由一个个体分泌到体外，被同物种的其他个体通过嗅觉器官（如副嗅球、犁鼻器）察觉，使后者表现出某种行为，情绪，心理或生理机制改变的物质。它具有通讯功能。几乎所有的动物都证明有信息素的存在。1959年发表雌蚕蛾会分泌性信息素，是科学界首次证明了性信息素是存在的。信息素一词源于希
磷酸肌醇的结构信息
一类磷酸肌醇的总称，它包括1-磷酸肌醇[inositol-1-phosphate，Ins 1-P]、1,4-二磷酸肌醇[inositol-1,4-bisphosphate，Ins 1-(1,4)P2]和1,4,5-三磷酸肌醇(inositol-1,4,5-triphosphosate，IP3)等。它
新型人造DNA结构信息密度加倍
脱氧核糖核酸（DNA）中存储着遗传代码。它由4种核苷酸组成，以4个不同字母表示。美国研究人员最新合成一种由8个字母组成的新型DNA结构。其信息存储密度加倍，未来有望应用于合成生物等领域。 DNA是存储及传递遗传信息的复杂分子，是地球生物的遗传物质基础，由4种核苷酸组成，即腺嘌呤、胸腺嘧啶、胞嘧
中性粒细胞的信息和结构
中性粒细胞（Neutrophil 或 Neutrocyte）亦称嗜中性粒细胞或嗜中性多核球（Neutrophilic Granulocyte），是血液白细胞的一种，也是哺乳动物血液中最主要的一种白细胞。中性粒细胞在非特异性免疫系统中有着非常重要的作用。中性粒细胞用苏木精-伊红染色时，中性粒细胞的染色
βαβ结构域的基本信息
中文名称β-α-β结构域英文名称β-α-β motif;betaalpha-beta motif定 义蛋白质超二级结构之一，由β折叠-α螺旋-β折叠所构成的功能结构域。应用学科细胞生物学（一级学科），细胞化学（二级学科）
概述复制子的结构信息
很多实验都证明：复制是从DNA分子上的特定部位开始的，这一部位叫做复制起始点(origin of replication)常用ori或o表示。细胞中的DNA复制一经开始就会连续复制下去，直至完成细胞中全部基因组DNA的复制。DNA复制从起始点开始直到终点为止，每个这样的DNA单位称为复制子或复制
肌醇的结构信息和来源
肌醇，又名环己六醇，广泛分布在动物和植物体内，是动物、微生物的生长因子。最早从心肌和肝脏中分离得到。肌醇在自然界存在有多个顺、反异构体，天然存在的异构体为顺-1,2,3,5-反-4,6-环己六醇。
胆固烷醇的结构信息
中文名称胆固烷醇英文名称cholestanol定 义即：3-β-羟胆烷。与胆固醇的差别是B环上没有双键，在肠道细菌的作用下，胆固醇被还原成5，6-二氢胆固醇及其异构体β粪固醇。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），脂质（二级学科）