Science:新型单细胞基因表达检测技术

发表在最新一期《科学》(Science)杂志上的一篇研究论文,证实了一种新型的大规模平行测序技术可借助于新一代测序(NGS)在单细胞水平上检测基因表达。 论文作者、来自Cellular Research, Inc公司的Christina Fan博士、Glenn Fu博士以及Stephen Fodor博士,描述了这一技术并报告了几项针对人类造血系统细胞的基因表达研究结果。 Fan等在研究论文中指出,单细胞分析对于了解非均质系统越来越重要。达不到这一分辨率,来自少数细胞的巨大表达变化看起来就会与来自大量细胞的微小表达变化相差无几。 在这篇文章中,科学家们描绘了“一种技术上简单的基因表达细胞计量方法”,利用细胞和分子特异性条形码可在成千上万或甚至数十万细胞中一次研究大量的基因。将单个细胞以及负载引物的磁珠放入微孔中;当细胞裂解之时,mRNAs会与磁珠上的条形码引物杂交。这些磁珠可通过磁力回收并转移到试管中进行逆转录和扩增,然......阅读全文

【中国科学报】神经胶质母细胞瘤基因研究获进展

  中科院生物物理所刘光慧实验室与北京大学汤富酬实验室及中科院动物研究所曲静实验室合作,首次揭示了人神经干细胞中的基因突变是形成神经胶质母细胞瘤(GBM)的源驱动力,为实现针对携带特定基因突变的神经胶质母细胞瘤的精准治疗提供了新型研究平台和药物评价体系。相关成果12月3日发表于《自然—通讯》。  G

研究发现调控细胞分裂素合成的水稻增产重要基因

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/505661.shtm7月27日,《自然—遗传学》杂志在线发表了华中农业大学教授邢永忠课题组(水稻产量生物学实验室)的研究论文。该研究挖掘到一个水稻的重要增产基因GY3,该基因通过调控细胞分裂素的合成,可显

抗衰老治疗研究获突破:再生基因移植恢复干细胞活力

科技日报北京8月6日电(记者张梦然)据日本东京大学官网最新报道,该大学药学研究生院团队发现,将能再生身体的简单生物体基因转移到普通果蝇体内,转移后的基因抑制了果蝇与年龄相关的肠道问题。这表明具有高再生能力的动物基因,或会恢复干细胞功能并延长另一种生物的寿命。研究团队用蓝色染料追踪果蝇的肠道健康状况,

研究发现细胞衰老可能与基因表达错误率上升有关

美国研究人员最新发现,细胞内部基因表达的错误率越来越高,无法正常合成蛋白质,可能是细胞停止分裂、陷入衰老状态的原因。 这项成果由美国国家老龄问题研究所等机构的人员取得,有望为研发抗衰老药物提供新靶点,相关论文发表在新一期英国《自然·老化》杂志上。 在基因表达的过程中,脱氧核糖核酸(DNA)序

抗衰老治疗研究获突破:再生基因移植恢复干细胞活力

据日本东京大学官网最新报道,该大学药学研究生院团队发现,将能再生身体的简单生物体基因转移到普通果蝇体内,转移后的基因抑制了果蝇与年龄相关的肠道问题。这表明具有高再生能力的动物基因,或会恢复干细胞功能并延长另一种生物的寿命。研究团队用蓝色染料追踪果蝇的肠道健康状况,因衰老而受损的果蝇肠道会渗出蓝色染料

瑞典一项最新研究发现致癌基因会“硬化”细胞

  瑞典一项最新研究证实,致癌基因会增强癌细胞的硬度和扩散能力。这为肿瘤诊断和治疗提供了更有效的依据。   瑞典卡罗琳医学院24日发布的新闻公报说,其研究人员同瑞典皇家工学院的科研人员合作,通过先进的显微技术发现,致癌基因能改变细胞内的波形蛋白纤维组织骨架的形状,诱导细胞硬度增加,同时使细胞向周边

研究揭示细胞衰老过程中基因表达模式及变化规律

  细胞衰老是一种细胞生长停滞状态,与生物体衰老密切相关。研究表明,衰老细胞的异常堆积,会通过分泌细胞衰老相关分泌表型(SASP)导致机体慢性炎症,引发各种衰老相关疾病,如癌症、阿尔兹海默症等。因此,探究细胞衰老过程中调控机制,或可为生物体衰老和相关疾病提供新的干预视角。  细胞衰老过程是一个由多种

细胞器基因组组装软件开发研究获进展

  真核生物细胞器基因组包括线粒体和质体(包括叶绿体、白色体等)的全部DNA分子,是细胞质遗传的主要载体。在动植物和真菌的单个细胞内,有多个(甚至成千上万个)细胞器基因组单元的拷贝,使得利用低覆盖度的全基因组测序数据组装得到完整的细胞器基因组成为可能。随着DNA高通量测序技术的发展,测序成本下降,低

核移植胚胎干细胞的印迹基因甲基化研究

核移植来源的胚胎干细胞(NTES  cells)在以干细胞为基础的细胞治疗中扮演着非常重要的角色,得到全能性良好且表观遗传修饰正常的核移植胚胎干细胞是解决治疗性克隆安全问题的重要前提。DNA甲基化修饰在基因表达和印迹基因的表达中起非常重要的作用,两步法克隆可能存在的不完全重编程问题很可能存在于印

Nature:研究发现调控心脏细胞再生的特异基因Meis1

  日前,德克萨斯大学西南医学中心的研究人员发现了一个心脏损伤后调控其再生能力的特异基因。过去,人们并不知道这一称作Meis1的基因能够在心脏中发挥功能。新研究发现对于预防心力衰竭具有重要的意义。相关论文在线发表在《自然》(Nature)杂志上。   研究人员表示,婴儿出生后不久,就在心肌细胞停止

研究发现影响血液干细胞中特殊基因表达的关键元件

  基因转录通常会被启动子和调节元件(比如增强子和沉默子)之间的染色质环来进行调节,不同的转录因子(TFs,transcription factors)能够与这些调节元件结合,并以一种细胞类型特异性的方式来调节启动子-增强子环。尽管其在控制基因表达方面发挥着重要作用,但转录因子如何促进启动子-增强子

研究发现增强棉花体细胞胚胎发生的基因可变剪切

近日,中国农业科学院棉花研究所棉花优质育种团队研究发现GhLSM1B基因的一个可变剪切可以加速棉花愈伤组织增殖,并改变体细胞胚胎发生过程中的细胞形态,为提高棉花遗传转化效率提供了新思路。相关研究成果发表在《植物生物技术杂志》(Plant Biotechnology Journal)上。体细胞胚胎发生

华大基因中心正研究智商基因

  中国有基因中心进行天才基因比对研究,希望解开人类智力密码。相关研究容易引起道德争议,被利用来针对某个族群。亦有学者担心,人类有朝一日会藉研究成果,透过胚胎筛选技术製造天才婴儿。   深圳华大基因中心进行的基因智力专桉,是将从世界各地收集到的2000组聪明人的基因样本,和普通人的基因样本做比对,

基因编辑细胞疗法

  17日,Sangamo Therapeutics公司宣布,欧洲药品管理局(EMA)孤儿药委员会(COMP)公布了详细资料,支持授予其在研体外基因编辑细胞疗法BIVV003孤儿药资格,治疗镰刀型细胞贫血病(SCD)。

细胞凋亡研究

前言:细胞凋亡是细胞程序性死亡中最具特征性的一种。它在生物发展,体内平衡,甚至在不同的疾病,例如:癌症,的发病机制都扮演着重要的角色。在过去的几十年里,科学家们对细胞凋亡进行了广泛的研究。细胞凋亡的过程中,细胞会有不同的形态变化。同时,细胞膜(plasma membrane),线粒体(mitocho

挑战传统假设,研究揭示细胞有非基因组信息系统

美国莫菲特癌症中心科学家一项新研究提出,细胞拥有一个此前未知的、独立于基因组的信息处理系统,使它们能够对环境变化迅速作出反应。相关论文发表于最近的《交叉科学》(iScience)杂志。图片来源:《交叉科学》杂志几十年来,科学家们一直将DNA视为细胞信息的唯一来源。这个DNA蓝图指导细胞构建蛋白质并控

系列研究阐明多能干细胞基因组稳态维持新机理

  多能干细胞(Pluripotent stem cells, PSCs)因其在体外具有无限增殖和分化为不同类型细胞的潜能,在再生医学领域中具有广泛应用前景,也成为目前临床上最具潜能的成药细胞。PSCs制备过程中的标准化、规模化及细胞质量稳定性是其走向临床应用的先决条件.但人PSCs在体外扩增培养过

生化与细胞所肿瘤的靶向基因病毒治疗研究获新成果

  3月17日,基因治疗领域国际专业期刊《基因治疗》(Gene Therapy)在线发表了中科院上海生命科学研究院生化与细胞所刘新垣院士研究组关于“肿瘤的靶向基因-病毒治疗”(Cancer Targeting Gene-Viro-Therapy, CTGVT)策略的最新研究成果。  

基因组所等研究揭示细胞胞质分裂新机制

  5月14日,中国科学院北京基因组研究所疾病基因组与个体化医疗实验室“百人计划”研究员杨运桂研究组,与奥斯陆大学Arne Klungland教授合作完成的“ALKBH4依赖的肌动蛋白去甲基化调控胞质分裂机制研究”取得重要进展,相关学术论文在Nature子刊《自然·通讯》(Nature Co

干细胞研究泰斗发国内期刊论文-解析基因调控新技术

  据最新公布的SCI影响因子,中科院主办的《Cell Research》杂志从去年的8.19跃升至10.526,实现了10的突破。这份期刊主要收纳细胞生物学等领域前沿科学研究成果,近期干细胞研究领域的权威人物Rudolf Jaenisch教授带领研究组,在这一期刊上发表了关于一种新基因调控

中国留学生的生殖细胞基因改造研究引发全球关注

  世界各地的科学家们目前正对一项哈佛大学中国留学生杨璐菡的研究成果翘首以盼,因为该项研究或许标志着人类胚胎中的DNA(脱氧核糖核酸)首次将以可延续给后代的方式进行修改,这将成为人类医学史上一次划时代的进步,其地位可与上世纪疫苗的成功研发相媲美。  此项研究成果虽尚未发表,但已在科学期刊和网络上引发

生化与细胞所合作研究发现新的肺癌致病基因突变

  2月21日,Cell research在线发表了中科院上海生科院生化与细胞所季红斌研究组与复旦大学肿瘤医院合作的最新研究成果Identification of RET gene fusion by exon array analyses in "pan-negative" lung ad

Autoimmunity:能研究细胞表观基因组学特性的新型工具

  如今研究人员都知道,表观基因组在控制DNA表达上扮演着关键角色,而且表观基因组的一系列改变与多种健康问题直接相关,比如癌症、自身免疫性障碍等多种疾病,但目前科学家们关于表观基因组并不是知道地很多,甚至也并没有工具去研究表观基因组。图片来源:CC0 Public Domain  刊登在国际杂志Au

日本研究小组发现特定基因大量表达可促癌细胞转移

  日本京都大学附属医院特聘副教授原田浩领导的研究小组日前宣布,他们发现一种特定基因大量表达后会促进癌细胞转移。这一发现有望促进开发抑制癌细胞转移的药物。  此前有研究显示,编码合成“低氧诱导因子-1”的“HIF1基因”在癌细胞转移过程中发挥着重要作用。如果这种基因活跃地发挥作用,就会催生很多小血管

研究发现NUDT15基因与白细胞减少症的联系

  《自然—遗传学》报告了基因NUDT15与克罗恩氏病患者用常见免疫抑制剂进行治疗时可能伴随的白细胞减少症患病风险之间的联系。这项研究或能帮助医生鉴别出那些对此不良反应具有高风险的病人。  巯基嘌呤诱导产生的白细胞减少症是使用巯基嘌呤类药物治疗时所产生的一种副作用,巯基嘌呤类药物通常用于癌症或炎症性

单细胞研究指南:细胞分离

  多细胞生物的每个细胞都携带着相同的遗传学信息。不过,近年来蓬勃发展的单细胞研究告诉我们,每一个细胞都是独一无二的。不同类型的细胞激活特定组合的机制,即使是同类型细胞,基因表达也会出现差异。  那么,细胞之间的哪些差异有生物学意义,哪些差异来自于技术偏好呢?要获得可靠的结果又需要研究多少细胞呢?这

“基因剪刀”让皮肤细胞“变身”干细胞

  美国科学家用“基因剪刀”编辑实验鼠细胞的基因组,成功使皮肤细胞转变成干细胞,为培育诱导多能干细胞开辟了新路。  诱导多能干细胞是对成熟细胞“重编程”得到的,像胚胎干细胞一样具备分化成多种细胞的潜力,可用于修复受损的组织和器官。“基因剪刀”指CRISPR基因编辑技术,用它能像在电脑上编辑文章一样,

“基因剪刀”让皮肤细胞“变身”干细胞

  美国科学家用“基因剪刀”编辑实验鼠细胞的基因组,成功使皮肤细胞转变成干细胞,为培育诱导多能干细胞开辟了新路。诱导多能干细胞是对成熟细胞“重编程”得到的,像胚胎干细胞一样具备分化成多种细胞的潜力,可用于修复受损的组织和器官。   “基因剪刀”指CRISPR基因编辑技术,用它能像在电脑上编辑文章一

单细胞分离用于单细胞基因扩增

 单细胞分离连接不同管径大小的毛细玻璃针,可分离捕获各种非贴壁状态的单细胞和微粒等,如细菌、酵母、藻类细胞、植物花粉、原生动物单细胞、悬浮细胞、血液细胞、免疫细胞、卵细胞、各种悬液中单细胞及特殊标记的单细胞等。  单细胞分离用于各种类型的细胞分离培养、纯化、检测;获得单克隆细胞;用于单细胞基因扩增,

《细胞》:单细胞测序助力基因重组图谱

  来自斯坦福大学医学院等处的研究人员发表了题为“Genome-wide Single-Cell Analysis of Recombination Activity and De Novo Mutation Rates in Human Sperm”的文章,首次公布了来自一个成人男子91个