Autoimmunity：能研究细胞表观基因组学特性的新型工具
如今研究人员都知道，表观基因组在控制DNA表达上扮演着关键角色，而且表观基因组的一系列改变与多种健康问题直接相关，比如癌症、自身免疫性障碍等多种疾病，但目前科学家们关于表观基因组并不是知道地很多，甚至也并没有工具去研究表观基因组。图片来源：CC0 Public Domain 刊登在国际杂志Autoimmunity上的研究报告中，来自北卡罗来纳州立大学的科学家们通过研究开发了一种新型工具来研究表观基因组；当人们谈论起“表观基因组”时，它们指的是蛋白质及其与蛋DNA自身或蛋白质相关的一系列化学修饰的集合，这些蛋白质和化学修饰在决定基因功能开启或关闭上扮演着关键角色。 目前研究表观基因组学的研究人员不得从成千上万个细胞中提取DNA和相关的表观遗传学物质来得到一份样本，随后他们会对样本进行生化分析来确定表观遗传学物质是否存在。本文中，研究人员学习了更多内容，比如他们通过研究鉴别出了健康细胞和疾病细胞表观基因组学的差异。 研究人......阅读全文
Autoimmunity：能研究细胞表观基因组学特性的新型工具
如今研究人员都知道，表观基因组在控制DNA表达上扮演着关键角色，而且表观基因组的一系列改变与多种健康问题直接相关，比如癌症、自身免疫性障碍等多种疾病，但目前科学家们关于表观基因组并不是知道地很多，甚至也并没有工具去研究表观基因组。图片来源：CC0 Public Domain 刊登在国际杂志Au
表观基因组学研究指南（三）
今年九月，对于基因组研究者们来说是一个具有纪念意义的月份，因为美国人类基因组研究院(NHGRI)资助的ENCODE项目在 Nature，Genome Biology，Genome Research等杂志上公布了三十多份论文，还有在Science，Cell，以及the Journal
表观基因组学研究指南（一）
今年九月，对于基因组研究者们来说是一个具有纪念意义的月份，因为美国人类基因组研究院(NHGRI)资助的ENCODE项目在Nature，Genome Biology，Genome Research等杂志上公布了三十多份论文，还有在Science，Cell，以及the Journal of Bi
新型基因组学工具ECCITEseq扩展多模态单细胞分析
单细胞RNA测序是基因组研究的重要领域之一。其能够帮助研究人员深入探索单细胞的特性，有效区分不同的细胞类型，并在单细胞水平下研究多种人类疾病的发病机制。随着对复杂人体组织甚至整个生物体的研究进展，研究人员越来越认识到需要大规模并行技术及数据集才能更加深入地揭示微妙的细胞状态。 近日，一种新型单
解决基因组学重要挑战的新工具
单细胞基因组学和宏基因组学是开创性的技术，可帮助研究人员评估环境微生物群落的结构和功能。现在应用这些技术的项目越来越多，但是，仍缺乏一种高通量过程来检查所组装的基因组序列，从而阻碍了这些技术的广泛应用。目前，去除已上传到公共数据库的微生物基因组中的污染序列，还是一个手动和耗时的过程，为了去除污染
解决基因组学重要挑战的新工具
单细胞基因组学和宏基因组学是开创性的技术，可帮助研究人员评估环境微生物群落的结构和功能。现在应用这些技术的项目越来越多，但是，仍缺乏一种高通量过程来检查所组装的基因组序列，从而阻碍了这些技术的广泛应用。目前，去除已上传到公共数据库的微生物基因组中的污染序列，还是一个手动和耗时的过程，为了去除污染
顶级实验室《Nature》发布表观基因组学图谱
基因组中表观遗传变化是能遗传的，近期来自Salk生物学研究所等处的一组研究人员完成了一项野生植物表观基因组学全范围内的研究分析，从中发现了这种修饰与遗传信息相互作用的共同模式。这一成果公布在3月7日Nature杂志在线版上。 文章通讯作者是Salk研究所的著名教授Joseph R. E
下一代转基因工具：表观遗传调控
2015年，加州大学圣地亚哥分校的生物学家Ethan Bier和Valentino Gantz提出了一项突破性技术，这种名为“活跃遗传（active genetics）”的新技术打破了父母向后代传递遗传性状的几率（超越孟德尔式遗传）。 今年2月，他们和Shannon Xu在《eLife》发表文
Nature子刊：表观遗传学研究的强大工具
西奈山伊坎医学院（Icahn School of Medicine at Mount Sinai）的科学家们开发了一个新技术，可以更精确地揭示细菌群体的表观遗传学异质性。这项研究发表在六月十五日的Nature Communications杂志上，为人们提供了表观遗传学研究的新工具，有助于解决愈演
细胞自噬工具
就像我们会打扫以保持房间整洁一样，细胞也演化出了一系列“清洁”机制，来维持有序的生命活动。自噬（autophage）就是其中最重要的机制之一。自噬于上个世纪60年代被发现，但引起科学界的广泛关注，还是在1990年代日本科学家大隅良典（Yoshinori Ohsumi）做的相关研究。大隅良典也因此获得
成年干细胞的表观控制
Linheng Li及同事完成的一项新的研究工作研究的是，造血干细胞中H19“差异化甲基化区域” (H19-DMR) 的删除所产生的效应。DMR已知控制印记基因H19 和 Igf2从H19–Igf2 位点的表达，将H19 的表达限制于母方等位基因，将Igf2的表达限制于父方等位基因。作者
细胞代谢的评估工具
代谢，是生命基本的特征之一，机体从外界摄取营养物质，包括碳水化合物、脂肪、蛋白质、微量元素、水及维生素等，同时经过体内分解吸收将其中蕴藏的化学能释放出来转化为组织和细胞可以利用的能量，再通过利用这些能量来维持正常的生命活动。我们把这种代谢过程中所伴随的能量的释放、储存和利用称为能量代谢。 细胞，
简化细胞凋亡研究的工具
有许多凋亡触发器，其中包括某些细胞因子，蛋白质 - 蛋白质相互作用和化学品。一旦开始凋亡，线粒体膜电位变化，可以测量通过流式细胞仪使用BD：MitoScreen（JC-1）流式细胞仪检测试剂盒。 线粒体膜电位导致线粒体膜通透性增加，并释放出可溶性蛋白，如细胞色素C和亲半胱天冬酶的增加。 半胱天冬
细胞凋亡及检测工具
程序性细胞死亡（Programmed Cell Death, PCD）是有机体在漫长的进化过程中发展起来的细胞自杀机制，在清除无用的、多余的或癌变的细胞，维持机体内环境稳态方面发挥重要作用。程序性细胞死亡调控机制的失调与多种疾病的发生发展相关，如神经变性性疾病、自身免疫病、恶性肿瘤、衰老、病原微
AI工具精准描述细胞代谢状态
科技日报北京9月3日电 （记者张梦然）瑞士洛桑联邦理工学院领导的团队创建了一个基于AI的工具RENAISSANCE，其可结合各种类型的细胞数据，准确描述细胞代谢状态，从而帮助人们更精准地理解细胞功能。RENAISSANCE是计算生物学的一项重大进步，为健康研究和生物技术创新开辟了新途径。现代生物学生
AI工具精准描述细胞代谢状态
瑞士洛桑联邦理工学院领导的团队创建了一个基于AI的工具RENAISSANCE，其可结合各种类型的细胞数据，准确描述细胞代谢状态，从而帮助人们更精准地理解细胞功能。RENAISSANCE是计算生物学的一项重大进步，为健康研究和生物技术创新开辟了新途径。 现代生物学生成了有关各种细胞活动的大量数据
细胞修复DNA有“工具箱”
从一个细胞到另一个细胞，从这一代人到下一代人，决定人类生长的基因信息在我们体内流淌了千万年。它们每天都会遭到紫外线辐射、自由基和其他致癌物质的伤害，并不断地发生自发的变化，然而却神奇地完好无缺。 这些遗传物质之所以没有乱成一团，是因为大量的分子系统在持续不断地监测并修复着我们的DNA。托马斯
AI工具精准描述细胞代谢状态
瑞士洛桑联邦理工学院领导的团队创建了一个基于AI的工具RENAISSANCE，其可结合各种类型的细胞数据，准确描述细胞代谢状态，从而帮助人们更精准地理解细胞功能。RENAISSANCE是计算生物学的一项重大进步，为健康研究和生物技术创新开辟了新途径。现代生物学生成了有关各种细胞活动的大量数据集。这些
新工具实现贴壁细胞的单细胞分析
美国麻省理工学院的研究人员开发出一种微流体装置，一次能吸取一个细胞内的东西，而不干扰周围的细胞，这为研究人员测定单细胞的生化性质带来了一种新方法。它有助于研究不同干细胞之间的差异，或为什么同一肿瘤的不同细胞有着不同的治疗响应。 MIT电气工程与计算机科学系的Jongyoon
细胞增殖新的工具以确定细胞分裂
细胞增殖，可能会发生许多刺激如细胞因子的曝光或多种其他进程。BD有一个新的产品，以帮助研究人员研究细胞增殖。空?紫扩散染料450，用于检测细胞的增殖与紫色激光，这有利于使用较大的面板。这使得更多的数据从有限样本使用多色流式细胞仪测定。 VPD450是一个非荧光酯化染料。酯基使染料进入细胞。一旦染
表观遗传学分子生物学软件——DNA甲基化分析工具
第一类：基于引物设计功能的软件。此类软件主要是针对重亚硫酸盐序列进行甲基化特异性PCR（methylation-specific PCR, MS-PCR or MSP）和重亚硫酸盐测序（bisulfite sequencing, BS）引物的设计。由于重亚酸盐修饰的特殊性，使常规的分子生物学
华裔女学者Science解析干细胞表观遗传
来自约翰霍普金斯大学（Johns Hopkins University）的研究人员针对干细胞表观遗传性质，发现了干细胞在不对称分裂过程中的表观遗传学方式，认为这是其维持干性的一种重要机制，相关成果公布在Science杂志上。文章的通讯作者是约翰霍普金斯大学华裔女科学家陈昕（Xin Chen），她在中
Nature发布单细胞基因组学新技术
胚胎是如何形成我们肺脏、肌肉、神经和其他组织中的细胞的?一种新的方法可以解码使得胚胎万能细胞能够增殖并转变为机体许多特化细胞类型的遗传指令。 一开始是一团相同的细胞，随着增殖不断地改变形状和功能，最终变为我们肺脏、肌肉、神经和机体所有其他特化组织中的细胞。胚胎拥有这种创造奇迹的能力。
单细胞表观组学：单细胞ChIPseq解码细胞命运决定机制
在国家重点研发计划“干细胞及转化”重点专项（批准号：2017YFA0103402）等资助下，北京大学分子医学研究所、北大-清华生命科学联合中心何爱彬课题组近期突破单细胞表观遗传研究的瓶颈，开发了两种具有普适性、操作简单、风格迥异的单细胞ChIP-seq技术，可适应于不同课题研究需要，解析发育与疾
只需100个细胞的表观基因组分析
近年来，表观遗传学已经成为了干细胞分化、炎症、癌症等多个领域的研究热点，但它在临床上的潜力还未得到充分挖掘。表观基因组分析可以帮助医生根据患者的自身状态调整治疗方案，最终实现个性化医疗。问题在于，表观基因组分析需要的细胞量很大。举例来说，检测全基因组的蛋白-DNA互作和染色质修饰大约需要一千万细
干细胞多能性与表观遗传调控的综述
7月23日，Nature Review Molecular Cell Biology杂志在线发表了中国科学院生物物理研究所刘光慧研究员同美国索尔科生物学研究所(The Salk institute for Biological Studies)研究人员合作的关于干细胞多能性与表观遗传调控
－Nat－Met：新型单细胞技术助力表观遗传研究
跨学科组织的专家们首次为临床医生实现“无艾滋病时代”的目标设计了最新的改进方案，方案融合了尖端的生物医学技术以及基础的行为干预方法。该研究发表在《美国医学协会杂志》上。 这项方案是由国际抗病毒组织IAS-USA召集的专家志愿者小组提出的，为临床医生实施新型HIV预防方法提供了指导方针。专家们对
中南大学医学表观基因组学实验室获批湖南省重点实验室
中南大学医学表观基因组学实验室正式获批湖南省重点实验室 根据湖南省科技厅《关于同意组建2010年度省级重点实验室的通知》(湘科计字【2010】116号)精神，中南大学医学表观基因组学实验室正式获得立项批准组建省级重点实验室，建设期为2年，此次湖南省有6个实验室获得批准。 医学
庄小威院士：新成像方法测量染色质的表观遗传修饰
空间组学方法的最新发展使得单细胞转录组分析和三维基因组组织具有较高的空间分辨率。空间分辨单细胞表观基因组学方法将扩展空间组学工具的知识库，加速对细胞和组织功能的空间调节的理解。 2022年10月21日，哈佛大学庄小威团队在Cell 在线发表题为“Spatially resolved epige
分子细胞卓越中心开发出活细胞DNA成像新工具
7月4日，《自然-方法》（Nature Methods）在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心陈玲玲研究组关于CRISPR-dCas12a应用于DNA活细胞标记的研究成果（CRISPR array-mediated imaging of non-repetitive and multipl