董梦秋、贺思敏NatureMethods发表重要成果

蛋白交联是一种特殊的翻译后修饰,在所有生命中起到了基础性的作用,包括建立细胞外基质、调控蛋白在细胞内外的功能或半衰期等。内源蛋白质交联有很多种形式,从相当普遍的二硫键或异肽键,到胶原和弹力蛋白中的特殊连接。 二硫键是许多分泌蛋白必不可少的部分,比如激素、生长因子和细胞表面受体。但分析二硫键一直是个难题。为了精确鉴定通过二硫键相连的多肽,北京师范大学、北京生命科学研究所、中科院计算技术研究所等单位的研究人员开发了一个高通量的质谱方法pLink-SS。这一成果发表在二月九日的Nature Methods杂志上,文章的通讯作者是董梦秋(Meng-Qiu Dong)研究员和贺思敏(Si-Min He)研究员。 研究人员以质谱(MS)为基础建立了一个在单个或复杂蛋白质样本中获得二硫键图谱的新方法,包括自动化数据分析和错误发现率(FDR)控制。 现在的医药产业亟需一种新工具来分析单克隆抗体中的天然二硫键。研究人员用自己的方法对一个......阅读全文

ETDtriggered-CID-方法应用于融合蛋白的二硫键分析(二)

2.3 数据分析方法使用 Proteome Discoverer 1.3 软件对原始谱图进行数据库搜索,具体参数如下,流程图如图 2 所示:数据库:融合蛋白对应的氨基酸序列;一级质量偏差:20 ppm;二级质量偏差:0.02 Da;三级质量偏差:0.8 Da;酶:trypsin+Chymotrysp

ETDtriggered-CID-方法应用于融合蛋白的二硫键分析(一)

1. 前言融合蛋白 Enbrel (Etanercept) 是由人的肿瘤坏死因子(TNF,Tumornecrosis factor)膜外受体部分和人的免疫球蛋白(IgG1)的 Fc 部分融合而成,是一种人源 TNF-α 受体抗体融合蛋白,是肿瘤坏死因子(TNF-α)的拮抗剂,它通过抑制 TN

ETDtriggered-CID-方法应用于融合蛋白的二硫键分析(三)

由上图可以看到,ETD 碎裂产生的肽段 P1 和 P2 在后续的三级 CID 碎裂中,产生大量的 b、y 碎片离子,可以有效的确定肽段 P1 和 P2 的组成,并且结合 ETD 的信息,从而确定肽段 P1 和 P2 之间通过二硫键被连接在一起。 3.2 以肽段 P1:CSPGQHAK -肽段 P2:

细胞化学基础​二硫键简介

二硫键(disulfide bond) 是连接不同肽链或同一肽链中,两个不同半胱氨酸残基的巯基的化学键。二硫键是比较稳定的共价键,在蛋白质分子中,起着稳定肽链空间结构的作用。二硫键数目越多,蛋白质分子对抗外界因素影响的稳定性就愈大。

二硫键的基本信息

在化学中,二硫键指结构为R-S-S-R '的官能团。二硫键通常由两个硫醇基团耦合而成。在生物学中,两个半胱氨酸残基中硫醇基团间形成的二硫键是蛋白质二级结构和三级结构的重要组成部分。此键在蛋白质分子的立体结构形成上起着一定的重要作用。两个半胱氨酸分子的氧化可逆反应,形成二硫键。

二硫键的基本信息

在化学中,二硫键指结构为R-S-S-R '的官能团。二硫键通常由两个硫醇基团耦合而成。在生物学中,两个半胱氨酸残基中硫醇基团间形成的二硫键是蛋白质二级结构和三级结构的重要组成部分。此键在蛋白质分子的立体结构形成上起着一定的重要作用。

二硫键的基本性质

二硫键结合能力较强,典型的二硫键键离解能为60 kcal/mol (251 kJ/mol)。由于二硫键比C-C键和C-H键弱40%左右,在许多分子中二硫键往往是”弱键”。此外,S-S键反映了二价硫的极化特性,容易被极性试剂(包括亲电试剂和亲核试剂,特别是亲核试剂)切断  。二硫键的长度约为2.05

二硫键的形成是什么

二硫键的形成是:二硫键通常由两个硫醇基团耦合而成,在生物学中,两个半胱氨酸残基中硫醇基团间形成的二硫键是蛋白质二级结构和三级结构的重要组成部分,此键在蛋白质分子的立体结构形成上起着一定的重要作用。二硫键的长度约为2.05 A,比C-C键长约0.5 A,绕S-S轴旋转的势垒较低。二硫化物对接近90°的

二硫键的形成是什么

二硫键的形成是:二硫键通常由两个硫醇基团耦合而成,在生物学中,两个半胱氨酸残基中硫醇基团间形成的二硫键是蛋白质二级结构和三级结构的重要组成部分,此键在蛋白质分子的立体结构形成上起着一定的重要作用。二硫键的长度约为2.05 A,比C-C键长约0.5 A,绕S-S轴旋转的势垒较低。二硫化物对接近90°的

二硫键的还原反应介绍

二硫键最重要的一个特性就是它在还原剂作用下的裂解。使二硫键裂解的还原剂较多。在生物化学中,常用的还原剂有硫醇如β-巯基乙醇(β-mercaptoethanol,β-ME)或二硫苏糖醇(DTT)。通常要使用过量硫醇试剂保证二硫键的完全裂解。其它还原剂还有三羟甲基氨基甲烷磷化氢液[ tris(2-car

二硫键的基本信息

二硫键(disulfide bond) 是连接不同肽链或同一肽链中,两个不同半胱氨酸残基的巯基的化学键。二硫键是比较稳定的共价键,在蛋白质分子中,起着稳定肽链空间结构的作用。二硫键数目越多,蛋白质分子对抗外界因素影响的稳定性就愈大。

什么是二硫键的定位

二硫键定位分析蛋白理论分子量为M1,有n各半胱氨酸:1 直接测定蛋白的分子量,得到Mw-2x,然后用DTT将全部二硫键打开得到M1x即为该蛋白含有的二硫键的个数2 将蛋白利用4-VP处理得到分子量MW+105y,y即为该蛋白含有的游离半胱氨酸个数,x+y=n3 将该蛋白利用合适的酶进行酶切(tryp

二硫键的结构和作用

氢原子与电负性大的原子X以共价键结合,若与电负性大、半径小的原子Y(O F N等)接近,在X与Y之间以氢为媒介,生成X-H…Y形式的一种特殊的分子间或分子内相互作用,称为氢键。[X与Y可以是同一种类分子,如水分子之间的氢键;也可以是不同种类分子,如一水合氨分子(NH3·H2O)之间的氢键]。

二硫键的基本性质

二硫键结合能力较强,典型的二硫键键离解能为60 kcal/mol (251 kJ/mol)。由于二硫键比C-C键和C-H键弱40%左右,在许多分子中二硫键往往是”弱键”。此外,S-S键反映了二价硫的极化特性,容易被极性试剂(包括亲电试剂和亲核试剂,特别是亲核试剂)切断。二硫键的长度约为2.05 A,

二硫键的相关氧化反应

二硫键最重要的一个特性就是它在还原剂作用下的裂解。使二硫键裂解的还原剂较多。在生物化学中,常用的还原剂有硫醇如β-巯基乙醇(β-mercaptoethanol,β-ME)或二硫苏糖醇(DTT)。通常要使用过量硫醇试剂保证二硫键的完全裂解。其它还原剂还有三羟甲基氨基甲烷磷化氢液[ tris(2-car

二硫键的结构功能特点

二硫键(disulfide bond) 是连接不同肽链或同一肽链中,两个不同半胱氨酸残基的巯基的化学键。二硫键是比较稳定的共价键,在蛋白质分子中,起着稳定肽链空间结构的作用。二硫键数目越多,蛋白质分子对抗外界因素影响的稳定性就愈大。

《科学》文章复活蛋白

来自北卡罗莱纳州大学化学系,俄勒冈州大学生态与进化生物学中心的研究人员“复活”了4亿5千万年前的一个蛋白:脊椎动物糖皮质激素和盐皮质激素受体(glucocorticoid (GR) and mineralocorticoid (MR) receptors),寻找引起这类受体进化的变化,这一研究成果公

研究揭示天然产物vinigrol靶向蛋白质二硫键异构酶的抗炎机制

  天然产物(−)-vinigrol具有广泛的生物活性,如抗高血压、抑制血小板凝集等。vinigrol可很好地拮抗肿瘤坏死因子α(Tumor Necrosis Factor α,TNF-α)信号。鉴于TNF-α及其受体TNFR1介导的信号转导途径在自身免疫性疾病发病机制中的核心作用,开发新型有效和选

二硫键被氧化后变成什么

  二硫键又称S-S键。是2个-SH基被氧化而形成的—S—S—形式的硫原子间的键。在生物化学的领域中,通常系指在肽和蛋白质分子中的半胱氨酸残基中的键。  二硫键被氧化后的产物要以氧化物的氧化能力而定。如果是强氧化剂,硫会变成最高价正六价。

二硫键的基本功能

二硫键与蛋白质高级结构的生物活性有关,同时与蛋白质的复性也有关联。如核糖核酸酶A经巯基乙醇(还原剂)和尿素(蛋白质变性剂)处理后,发生变性作用,4对二硫键断裂,多肽链伸展开来,高级结构发生变化,失去生物活性。如果用透析法将大量还原剂和变性剂除去,在微量还原剂存在下,4对二硫键在原来的位置重新形成,伸

二硫键与钛键的关系

二硫键和肽键都是维持蛋白质结构的重要连接,其中,肽键是氨基酸之间的基本连接,维持蛋白质一级结构。它由氨基酸的氨基和羧基脱水缩合连成,化学式是以下:R-C=O |R-N-HR代表不同的氨基酸残基。二硫键在蛋白质中一般只由半胱氨酸形成,可以维持蛋白质更高级的结构,化学式是-S-S-左边和右边连着不同的两

细胞化学基础​二硫键的功能

二硫键与蛋白质高级结构的生物活性有关,同时与蛋白质的复性也有关联。如核糖核酸酶A经巯基乙醇(还原剂)和尿素(蛋白质变性剂)处理后,发生变性作用,4对二硫键断裂,多肽链伸展开来,高级结构发生变化,失去生物活性。如果用透析法将大量还原剂和变性剂除去,在微量还原剂存在下,4对二硫键在原来的位置重新形成,伸

二硫键被氧化后变成什么

  二硫键又称S-S键。是2个-SH基被氧化而形成的—S—S—形式的硫原子间的键。在生物化学的领域中,通常系指在肽和蛋白质分子中的半胱氨酸残基中的键。  二硫键被氧化后的产物要以氧化物的氧化能力而定。如果是强氧化剂,硫会变成最高价正六价。

细胞化学基础​二硫键基本信息

在化学中,二硫键指结构为R-S-S-R '的官能团。二硫键通常由两个硫醇基团耦合而成。在生物学中,两个半胱氨酸残基中硫醇基团间形成的二硫键是蛋白质二级结构和三级结构的重要组成部分。此键在蛋白质分子的立体结构形成上起着一定的重要作用。

关于二硫键的基本内容介绍

  二硫键(disulfide bond) 是连接不同肽链或同一肽链中,两个不同半胱氨酸残基的巯基的化学键。二硫键是比较稳定的共价键,在蛋白质分子中,起着稳定肽链空间结构的作用。二硫键数目越多,蛋白质分子对抗外界因素影响的稳定性就愈大。  在化学中,二硫键指结构为R-S-S-R '的官能团。

胞化学基础​二硫键的还原反应

二硫键最重要的一个特性就是它在还原剂作用下的裂解。使二硫键裂解的还原剂较多。在生物化学中,常用的还原剂有硫醇如β-硫基乙醇(β-mercaptoethanol,β-ME)或二硫苏糖醇(DTT)。通常要使用过量硫醇试剂保证二硫键的完全裂解。其它还原剂还有三羟甲基氨基甲烷磷化氢液[ tris(2-car

植物蛋白质氧化折叠过程中-AtERO1或是主要的二硫键供体

  二硫键的形成对于真核生物的分泌蛋白和质膜蛋白在内质网中的折叠至关重要。在动物和酵母中,内质网氧化还原蛋白oxidoreductin-1 (Ero1) 是二硫键的主要供体。但是,植物Ero1在蛋白质二硫键形成过程中的作用机制还不清楚。图:植物在还原条件下生长需要AtERO1基因发挥功能  中国科学

董梦秋、贺思敏Nature-Methods发表重要成果

  蛋白交联是一种特殊的翻译后修饰,在所有生命中起到了基础性的作用,包括建立细胞外基质、调控蛋白在细胞内外的功能或半衰期等。内源蛋白质交联有很多种形式,从相当普遍的二硫键或异肽键,到胶原和弹力蛋白中的特殊连接。  二硫键是许多分泌蛋白必不可少的部分,比如激素、生长因子和细胞表面受体。但分析二硫键一直

二硫键在哪个细胞器中形成

二硫键的形成使得肽链具备有空间结构 而课本写到 在核糖体中合成的肽链要进入内质网 进行 折叠 盘旋 所以 二硫键是在内质网中形成的!

二硫键的还原反应的基本内容

  二硫键最重要的一个特性就是它在还原剂作用下的裂解。使二硫键裂解的还原剂较多。在生物化学中,常用的还原剂有硫醇如β-硫基乙醇(β-mercaptoethanol,β-ME)或二硫苏糖醇(DTT)。通常要使用过量硫醇试剂保证二硫键的完全裂解。其它还原剂还有三羟甲基氨基甲烷磷化氢液[ tris(2-c