董梦秋、贺思敏NatureMethods发表重要成果

蛋白交联是一种特殊的翻译后修饰,在所有生命中起到了基础性的作用,包括建立细胞外基质、调控蛋白在细胞内外的功能或半衰期等。内源蛋白质交联有很多种形式,从相当普遍的二硫键或异肽键,到胶原和弹力蛋白中的特殊连接。 二硫键是许多分泌蛋白必不可少的部分,比如激素、生长因子和细胞表面受体。但分析二硫键一直是个难题。为了精确鉴定通过二硫键相连的多肽,北京师范大学、北京生命科学研究所、中科院计算技术研究所等单位的研究人员开发了一个高通量的质谱方法pLink-SS。这一成果发表在二月九日的Nature Methods杂志上,文章的通讯作者是董梦秋(Meng-Qiu Dong)研究员和贺思敏(Si-Min He)研究员。 研究人员以质谱(MS)为基础建立了一个在单个或复杂蛋白质样本中获得二硫键图谱的新方法,包括自动化数据分析和错误发现率(FDR)控制。 现在的医药产业亟需一种新工具来分析单克隆抗体中的天然二硫键。研究人员用自己的方法对一个......阅读全文

细胞化学基础​二硫键的结构性质

二硫键结合能力较强,典型的二硫键键离解能为60 kcal/mol (251 kJ/mol)。由于二硫键比C-C键和C-H键弱40%左右,在许多分子中二硫键往往是”弱键”。此外,S-S键反映了二价硫的极化特性,容易被极性试剂(包括亲电试剂和亲核试剂,特别是亲核试剂)切断 。二硫键的长度约为2.05 A

巯基乙醇为什么能破坏二硫键

巯基乙醇的还原性很强,能够将二硫键还原为硫醇(用R-S-S-R‘表示某含二硫键化合物):2HS-CH2CH2OH + RSSR’ → RSH + R‘SH + HO-CH2CH2-S-S-CH2CH2-OH称之为破坏了二硫键。蛋白质的一级结构:蛋白质分子中氨基酸的排列顺序。主要化学键:肽键,有些蛋白

二硫键的还原反应的基本内容

  二硫键最重要的一个特性就是它在还原剂作用下的裂解。使二硫键裂解的还原剂较多。在生物化学中,常用的还原剂有硫醇如β-硫基乙醇(β-mercaptoethanol,β-ME)或二硫苏糖醇(DTT)。通常要使用过量硫醇试剂保证二硫键的完全裂解。其它还原剂还有三羟甲基氨基甲烷磷化氢液[ tris(2-c

二硫键在哪个细胞器中形成

二硫键的形成使得肽链具备有空间结构 而课本写到 在核糖体中合成的肽链要进入内质网 进行 折叠 盘旋 所以 二硫键是在内质网中形成的!

植物蛋白质氧化折叠研究中进展

  二硫键的形成对于真核生物的分泌蛋白和质膜蛋白在内质网中的折叠十分重要。在动物和酵母中,内质网氧化还原蛋白oxidoreductin-1 (Ero1) 是二硫键的主要供体,将二硫键通过蛋白质二硫键异构酶(PDI)传递给底物蛋白。前期,中国科学院遗传与发育生物学研究所农业资源研究中心研究员吕东平研究

二硫键是什么?是肽键吗?怎么脱水的

二硫键(S-S) 是连接不同肽链或同一肽链的不同部分的化学键。二硫键不是肽键。脱水方式:两个二硫键—SH中的H与一个O结合形成一分子水,二硫键变为-S-S-。二硫键由含硫氨基酸形成,半胱氨酸被氧化成胱氨酸时即形成二硫键,二硫键是比较稳定的共价键,在蛋白质分子中,起着稳定肽链空间结构的作用。二硫键数目

小麦粉面团质量形成分子机制被揭示

近日,中国农业科学院农产品加工研究所联合国内外科研团队,系统揭示了小麦基因型、灌溉条件、储存方式及制粉工艺影响面团流变特性及产品质量的微观和介观机制。该研究首次明确蛋白质分子间二硫键与氢键的比率是关键调控指标,为优质专用小麦品种选育和面制品精准加工提供了新的理论依据。相关研究成果已发表在国际食品领域

《科学》:科学家利用光控制蛋白质活性

可用来关闭细胞中致病蛋白的活性 美国科学家近日发现了一种新方法,能够利用光控制催化生化反应的某种蛋白活性。研究人员称,这是首次成功利用光来控制一种蛋白的活性,将来可能具有多种应用,比如用来关闭细胞中致病蛋白的活性等。相关论文发表在10月17日的《科学》(Science)杂志上。 美国德州大学西南

上海药物所揭示氧化感应因子AbfR的作用机制

  蛋白质翻译后修饰是生物体实现功能多样性调控的重要途径。活性氧(ROS, reactive oxygen species)参与的信号转导通路主要通过蛋白质活性半胱氨酸的氧化还原化学来实现抗性基因表达的转录调控。中国科学院上海药物研究所杨财广课题组日前揭示了表皮葡萄球菌转录因子AbfR感应ROS氧化

辅酶A二硫键还原酶的基本信息

中文名称辅酶A-二硫键还原酶英文名称CoA-disulfide reductase定  义编号:EC 1.8.1.14。以NADH为氢的供体,催化一分子氧化型辅酶A还原成二分子还原型辅酶A及其逆反应的酶。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),酶(二级学科)

辅酶A二硫键还原酶的基本信息

中文名称辅酶A-二硫键还原酶英文名称CoA-disulfide reductase定  义编号:EC 1.8.1.14。以NADH为氢的供体,催化一分子氧化型辅酶A还原成二分子还原型辅酶A及其逆反应的酶。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),酶(二级学科)

关于含有一个二硫键的多肽的介绍

  这是一类数量很少的抗菌肽,第1个被发现的这类多肽是bactenecin,来源于牛中性粒细胞。其12个氨基酸中含有4个精氨酸,在其第2位和第11位氨基酸残基间形成二硫键。bactenecin对大肠杆菌和金黄色葡萄球菌都有活性。这类多肽中还包括一些来源于蛙类皮肤的多肽抗生素,一般在C端有一个由7个氨

二硫键是共价键还是非共价键

是两个硫原子之间形成的共价键,一般指多肽链中的两个半胱氨酸残基侧链的硫原子之间形成的共价键。二硫键(disulfide bond)是连接不同肽链或同一肽链中,两个不同半胱氨酸残基的巯基的化学键。二硫键是比较稳定的共价键,在蛋白质分子中,起着稳定肽链空间结构的作用。二硫键数目越多,蛋白质分子对抗外界因

中国(广州)分析测试论坛报告集锦(一)

华南师范大学 贾丽教授   来自华南师范大学激光生命科学研究所&激光生命科学教育部重点实验室的贾丽教授带来报告“在线富集毛细管电泳技术及应用”。   首先,贾教授介绍了毛细管电泳仪的基本组成、特点、分离模式和局限性等等。   接着,贾教授以水溶性维生素的富集、核酸的富集和激素类物质的富集为

走近大科学工程:国家蛋白质科学中心

  图为蛋白质科学研究(上海)设施核磁共振分析系统  生活中的乌云总是不期而至。一位正值花季的美国女孩,突然被告知患上了一种非常难治的癌症。基因检测结果显示,她所患癌症的亚型发生率极低。  在患同一大类癌症的人群中,只有2%的人所患亚型和她一样。幸运的是,针对这一亚型恰好有一种特效药。经过不到3个月

植物油菜素内酯信号转导研究取得进展

  油菜素内酯是一种控制植物生长和发育的植物激素,受体激酶BRI1是位于细胞表面的油菜素内酯受体。二硫键的形成对于跨膜蛋白的结构和功能至关重要,但人们对于BRI1蛋白中二硫键以及半胱氨酸位点的生物学功能缺乏系统研究。  中国科学院遗传与发育生物学研究所农业资源研究中心吕东平研究组与清华大学生命科学学

蛋白质和多肽反相HPLC分析和纯化指南(五)

二硫键测定蛋白质依靠正确的二硫键键合维持其三级结构和生物活性。如果二硫键被还原或交换,则蛋白质会失去天然三级结构和生物活性。HPLC保留值取决于蛋白质“疏水脚”的大小(图41),它会受到三级结构的影响。二硫键的改变通常会使“疏水脚”增大,从而使蛋白质在反相HPLC中的保留值增大。图42中,天然白细胞

科学家发现癌症转移关键蛋白

  英国伦敦国王学院研究人员最近在《细胞生物学杂志》上发表研究文章称,他们首次发现一种癌细胞转移所需的关键蛋白,以这种蛋白为靶点,或将成为预防继发性癌症(癌症转移)的有效方法。   这一蛋白被研究人员命名为Cdc42蛋白,存在于癌细胞内部。研究人员发现,这种蛋白能够帮助癌细胞依附于血管壁上,从而使

科学家解开淀粉样蛋白结构

  淀粉样蛋白(amyloids)是一类非常容易聚集在一起形成纤维状结构的蛋白质片段,最著名的例子就是在阿兹海默病患者脑部发现的β-淀粉样蛋白斑块。许多淀粉样蛋白都会与锌或其它金属离子结合,但是,这些金属离子的功能却不为人所知。更重要的是,不是所有的淀粉样蛋白都会引起疾病,许多淀粉样蛋白具有重要的生

关于蛋白表达科学研究的介绍

  rBPI56或其功能性氨基端片段通常在真核细胞中表达,将有助于获得具有生物学活性抗G菌重组蛋白。但因该种表达方式存在成本高、表达量低等问题而影响其实际应用。用原核细胞表达BPI23-Fcγ1重组蛋白 [1] 。  Profinity eXact融合标签表达系统:利用bio-rad rofinit

科学依据/蛋白质测序仪

自著名的 Edman 降解技术成功从 N 末端开始测定蛋白质序列以来,蛋白质的结构分析有了重大进展。岛津 PPSQ -21A 蛋白测序仪(Protein sequencer)能够适于多种方法制备的样品。可进行 Pmol 水平的氨基酸序列分析。 LC 分析采用恒溶剂成分洗脱方式,氨基酸的鉴定、装置维护

简述蛋白表达系统的科学研究

  rBPI56或其功能性氨基端片段通常在真核细胞中表达,将有助于获得具有生物学活性抗G菌重组蛋白。但因蛋白表达系统存在成本高、表达量低等问题而影响其实际应用。用原核细胞表达BPI23-Fcγ1重组蛋白 [1]。  Profinity eXact融合标签表达系统:利用bio-rad rofinity

科学家开发“精准”蛋白设计方法

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/7/504974.shtm美国科学家开发了一种能设计新蛋白质的深度学习方法,名为RoseTTAFold Diffusion(RFdiffusion)。该方法能生成各种功能性蛋白质,包括在天然蛋白质中从未见过的拓

细菌过表达产物(无二硫键者)新纯化实验

实验步骤操作程序第 1 天今天的目的是试验 T7 RNA 聚合酶表达的诱导条件,确定其在上清/沉淀中的分布情况,并为第二天的分离纯化步骤作出初步评估。1) 取一份 50-ml 经低密度培养过夜的大肠杆菌细胞培养物,开始工作。2) 于 A600nm 为 0.3~0.7 时,用 0.8 mmol/L I

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实验步骤 操作程序第 1 天今天的目的是试验 T7 RNA 聚合酶表达的诱导条件,确定其在上清/沉淀中的分布情况,并为第二天的分离纯化步骤作出初步评估。1) 取一份 50-ml 经低密度培养过夜的大肠杆菌细胞培养物,开始工作。2) 于 A600n

细菌过表达产物(无二硫键者)新纯化实验

实验步骤 操作程序第 1 天今天的目的是试验 T7 RNA 聚合酶表达的诱导条件,确定其在上清/沉淀中的分布情况,并为第二天的分离纯化步骤作出初步评估。1) 取一份 50-ml 经低密度培养过夜的大肠杆菌细胞培养物,开始工作。2) 于 A600nm 为 0.3~0.7 时,用 0.8 mmol/L

方案4-用Ellman-试剂测定自由巯基和二硫键实验

实验材料蛋白质样品试剂、试剂盒变性剂二硫苏糖醇Ellman 试剂碘乙酸氮气反应缓冲液4-乙烯基吡啶仪器、耗材透析系统尺寸排阻层析装置分光光度计和小试管实验步骤方法 1: 自由巯基1.加人 3 ml 反应缓冲液到样品管和对照小试管中。2.在 412nm 测定吸收值(吸收值应该调节至0,Abuffer)

《科学》子刊:首次证实,新冠病毒S蛋白竟是溶酶体蛋白

  新冠疫情爆发至今已经三年,虽然奥密克戎致病性有所减弱,但新冠病毒仍在快速变异,而变异主要集中在S蛋白。因此,破解S蛋白核心变异对新冠病毒进出细胞的影响,对新冠病毒溯源、抗体疗法、疫苗设计尤其重要。  近日,由约翰·霍普金斯大学医学院Stephen Gould教授领衔的研究团队,在著名期刊Scie

中国科学家揭示蛋白质氧化折叠在干细胞衰老中的作用

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/506109.shtm8月3日,中国科学院生物物理研究所王磊、王志珍课题组和中国科学院动物研究所刘光慧课题组合作,在国际学术期刊《欧洲分子生物学组织报告》(EMBO Reports)发表封面文章,揭示蛋白质