ETDtriggeredCID方法应用于融合蛋白的二硫键分析(二)

2.3 数据分析方法使用 Proteome Discoverer 1.3 软件对原始谱图进行数据库搜索,具体参数如下,流程图如图 2 所示:数据库:融合蛋白对应的氨基酸序列;一级质量偏差:20 ppm;二级质量偏差:0.02 Da;三级质量偏差:0.8 Da;酶:trypsin+Chymotryspin;酶漏切位点:2; 图 2. Proteome Discoverer 1.3 软件对 ETD-triggered CID 原始数据进行二硫键定位分析的流程示意图 3. 结果与讨论3.1 以肽段 P1:SKQEGCRL-肽段P2:CRPGF为例:a. 色谱质谱提取流图如下所示: 由上图可以看出,该肽段对应的一级母离子在 13.96 min 洗脱出来,相应的质量偏差在 5.4 ppm。b. ETD 二级碎裂匹配图 由上图可以看到,二硫键连接的两条肽段在经过 ETD 碎裂后......阅读全文

ETDtriggered-CID-方法应用于融合蛋白的二硫键分析(二)

2.3 数据分析方法使用 Proteome Discoverer 1.3 软件对原始谱图进行数据库搜索,具体参数如下,流程图如图 2 所示:数据库:融合蛋白对应的氨基酸序列;一级质量偏差:20 ppm;二级质量偏差:0.02 Da;三级质量偏差:0.8 Da;酶:trypsin+Chymotrysp

ETDtriggered-CID-方法应用于融合蛋白的二硫键分析(一)

1. 前言融合蛋白 Enbrel (Etanercept) 是由人的肿瘤坏死因子(TNF,Tumornecrosis factor)膜外受体部分和人的免疫球蛋白(IgG1)的 Fc 部分融合而成,是一种人源 TNF-α 受体抗体融合蛋白,是肿瘤坏死因子(TNF-α)的拮抗剂,它通过抑制 TN

ETDtriggered-CID-方法应用于融合蛋白的二硫键分析(三)

由上图可以看到,ETD 碎裂产生的肽段 P1 和 P2 在后续的三级 CID 碎裂中,产生大量的 b、y 碎片离子,可以有效的确定肽段 P1 和 P2 的组成,并且结合 ETD 的信息,从而确定肽段 P1 和 P2 之间通过二硫键被连接在一起。 3.2 以肽段 P1:CSPGQHAK -肽段 P2:

要测定蛋白质的二硫键位置,需用什么方法

对角线电泳是一种经典的二硫键定位分析方法.这种技术包括:(1)胃蛋白酶酶切未经还原的蛋白质;(2)在酸性pH=6.5的条件下进行第一向电泳,酶解产物肽段将按其大小及电荷的不同而分离;(3)将滤纸暴露在过甲酸(CHOOOH)蒸气中,使二硫键氧化断裂,并进一步氧 化成磺酸基,被氧化的半胱氨酸称为磺基 丙

融合蛋白的制备方法

基于重复结构的融合蛋白大多为短肽,不具有复杂的空间结构,因此只需简单的多肽合成过程即可获得目标蛋白。由单个氨基酸合成多肽主要通过两个氨基酸之间脱水形成肽键来实现,主要包括以下基本步骤::首先对两性离子结构的氨基酸进行相应的氨基或羧基保护,其次将羧基活化为活性中间体,待耦合过程结束后,对肽链上氨基酸的

融合蛋白的制备方法

基于重复结构的融合蛋白大多为短肽,不具有复杂的空间结构,因此只需简单的多肽合成过程即可获得目标蛋白。由单个氨基酸合成多肽主要通过两个氨基酸之间脱水形成肽键来实现,主要包括以下基本步骤::首先对两性离子结构的氨基酸进行相应的氨基或羧基保护,其次将羧基活化为活性中间体,待耦合过程结束后,对肽链上氨基酸的

融合蛋白的方法改进

  自从20世纪70年代中期融合标签技术出现以来,亲和标签已成为一种重组蛋白纯化十分有效的工具,具有结合特异性高、纯化条件温和、纯化步骤简便、适用性广泛等显著优势。通常,亲和标签定义为对特定的生物或化学配基具有高度亲和力的一段氨基酸序列,可以分成很多类,其中一个常用的小分子短肽标签是FLAG标签。 

构建融合蛋白的基本方法

构建融合蛋白的基本方法是将具有特定功能的天然或人工编码的多肽序列模块化,并使用基因编码的DNA序列模板合成,随后将第1个蛋白的终止密码子删除,再接上带有终止密码子的第2个蛋白基因,以实现两个基因的共同表达。通过控制每一个功能肽模块在整体蛋白材料中的确切位置和密度,人们便能够根据实际需要改变融合蛋白的

构建融合蛋白的基本方法

构建融合蛋白的基本方法是将具有特定功能的天然或人工编码的多肽序列模块化,并使用基因编码的DNA序列模板合成,随后将第1个蛋白的终止密码子删除,再接上带有终止密码子的第2个蛋白基因,以实现两个基因的共同表达。通过控制每一个功能肽模块在整体蛋白材料中的确切位置和密度,人们便能够根据实际需要改变融合蛋白的

融合蛋白的制备方法介绍

基于重复结构的融合蛋白大多为短肽,不具有复杂的空间结构,因此只需简单的多肽合成过程即可获得目标蛋白。由单个氨基酸合成多肽主要通过两个氨基酸之间脱水形成肽键来实现,主要包括以下基本步骤:首先对两性离子结构的氨基酸进行相应的氨基或羧基保护,其次将羧基活化为活性中间体,待耦合过程结束后,对肽链上氨基酸的保

融合蛋白的制备方法介绍

  基于重复结构的融合蛋白大多为短肽,不具有复杂的空间结构,因此只需简单的多肽合成过程即可获得目标蛋白。由单个氨基酸合成多肽主要通过两个氨基酸之间脱水形成肽键来实现,主要包括以下基本步骤::首先对两性离子结构的氨基酸进行相应的氨基或羧基保护,其次将羧基活化为活性中间体,待耦合过程结束后,对肽链上氨基

融合蛋白的设计方法介绍

融合蛋白的设计大致分为基于重复结构、基于生长因子以及基于细胞粘附分子3类。第1类融合蛋白中最典型的是来源于弹性蛋白( Elastin-Like Polymers,ELPs) 及丝素蛋白( Silk-Like Polymers,SLPs) 的融合蛋白。ELPs 是一种由数个重复的氨基酸序列组成的细胞外

构建融合蛋白的基本方法

构建融合蛋白的基本方法是将具有特定功能的天然或人工编码的多肽序列模块化,并使用基因编码的DNA序列模板合成,随后将第1个蛋白的终止密码子删除,再接上带有终止密码子的第2个蛋白基因,以实现两个基因的共同表达。通过控制每一个功能肽模块在整体蛋白材料中的确切位置和密度,人们便能够根据实际需要改变融合蛋白的

构建融合蛋白的基本方法

构建融合蛋白的基本方法是将具有特定功能的天然或人工编码的多肽序列模块化,并使用基因编码的DNA序列模板合成,随后将第1个蛋白的终止密码子删除,再接上带有终止密码子的第2个蛋白基因,以实现两个基因的共同表达。通过控制每一个功能肽模块在整体蛋白材料中的确切位置和密度,人们便能够根据实际需要改变融合蛋白的

GST融合蛋白纯化方法

Abstract: Many people have vented out frustration over insoluble GST-fused proteins. This is a protocol for enzymatically active soluble GST-fused pro

二硫键的定义

二硫键(disulfide bond) 是连接不同肽链或同一肽链中,两个不同半胱氨酸残基的巯基的化学键。二硫键是比较稳定的共价键,在蛋白质分子中,起着稳定肽链空间结构的作用。二硫键数目越多,蛋白质分子对抗外界因素影响的稳定性就愈大。

二硫键的作用

二硫键(disulfide bond) 是连接不同肽链或同一肽链中,两个不同半胱氨酸残基之巯基的化学键。二硫键是比较稳定的共价键,在蛋白质分子中,起着稳定肽链空间结构的作用。二硫键数目越多,蛋白质分子对抗外界因素影响的稳定性就愈大。性质二硫键结合能力较强,典型的二硫键键离解能为60 kcal/mol

二硫键的性质

二硫键结合能力较强,典型的二硫键键离解能为60 kcal/mol (251 kJ/mol)。由于二硫键比C-C键和C-H键弱40%左右,在许多分子中二硫键往往是”弱键”。此外,S-S键反映了二价硫的极化特性,容易被极性试剂(包括亲电试剂和亲核试剂,特别是亲核试剂)切断 。二硫键的长度约为2.05 A

二硫键的作用

二硫键(disulfide bond) 是连接不同肽链或同一肽链中,两个不同半胱氨酸残基之巯基的化学键。二硫键是比较稳定的共价键,在蛋白质分子中,起着稳定肽链空间结构的作用。二硫键数目越多,蛋白质分子对抗外界因素影响的稳定性就愈大。性质二硫键结合能力较强,典型的二硫键键离解能为60 kcal/mol

二硫键作用

二硫键二硫键(S-S) 是连接不同肽链或同一肽链的不同部分的化学键。它由含硫氨基酸形成,半胱氨酸被氧化成胱氨酸时即形成二硫键,二硫键是比较稳定的共价键,在蛋白质分子中,起着稳定肽链空间结构的作用。二硫键数目越多,蛋白质分子对抗外界因素影响的稳定性就愈大。二硫键disulfide bond反应:2SH

蛋白质中的二硫键是如何形成的

又称S-S键。是2个SH基被氧化而形成的—S—S—形式的硫原子间的键。在生物化学的领域中,通常系指在肽和蛋白质分子中的半胱氨酸残基中的键。此键在蛋白质分子的立体结构形成上起着一定的重要作用。为了确定蛋白质的一级结构,首先必须将二硫键打开,使成为线状多肽链。为此,需要在2-巯-乙醇、二硫苏糖类、巯基乙

硫氧还蛋白二硫键还原酶的基本信息

中文名称硫氧还蛋白-二硫键还原酶英文名称thioredoxin-disulfide reductase定  义编号:EC 1.8.1.9。催化使硫氧还蛋白-S2还原成硫氧还蛋白-(SH)2,同时使NADPH氧化成NADP+的一种含黄素腺嘌呤二核苷酸的黄素蛋白。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科)

蛋白质二硫键异构酶的基本信息

分泌蛋白需要通过在分子内或分子间形成二硫键,从而形成其天然构象。蛋白二硫键异构酶,可以催化这些二硫键的形成和异构化。PDI一方面可以通过二硫键异构酶活性促进蛋白内或蛋白间形成正确的二硫键,另一方面也可以催化某些蛋白的二硫键的水解。在肽链分部快速折叠成蛋白质过程中,抑制半胱氨酸之间形成错误位置的二硫键

蛋白质二硫键异构酶的基本信息

protein disulfide isomerase, PDI。分泌蛋白需要通过在分子内或分子间形成二硫键,从而形成其天然构象。蛋白二硫键异构酶,可以催化这些二硫键的形成和异构化。PDI一方面可以通过二硫键异构酶活性促进蛋白内或蛋白间形成正确的二硫键,另一方面也可以催化某些蛋白的二硫键的水解。在肽

构建融合蛋白的基本方法介绍

构建融合蛋白的基本方法是将具有特定功能的天然或人工编码的多肽序列模块化,并使用基因编码的DNA序列模板合成,随后将第1个蛋白的终止密码子删除,再接上带有终止密码子的第2个蛋白基因,以实现两个基因的共同表达。通过控制每一个功能肽模块在整体蛋白材料中的确切位置和密度,人们便能够根据实际需要改变融合蛋白的

简述二硫键的功能

  二硫键与蛋白质高级结构的生物活性有关,同时与蛋白质的复性也有关联。如核糖核酸酶A经巯基乙醇(还原剂)和尿素(蛋白质变性剂)处理后,发生变性作用,4对二硫键断裂,多肽链伸展开来,高级结构发生变化,失去生物活性。如果用透析法将大量还原剂和变性剂除去,在微量还原剂存在下,4对二硫键在原来的位置重新形成

二硫键的功能特点

二硫键与蛋白质高级结构的生物活性有关,同时与蛋白质的复性也有关联。如核糖核酸酶A经巯基乙醇(还原剂)和尿素(蛋白质变性剂)处理后,发生变性作用,4对二硫键断裂,多肽链伸展开来,高级结构发生变化,失去生物活性。如果用透析法将大量还原剂和变性剂除去,在微量还原剂存在下,4对二硫键在原来的位置重新形成,伸

二硫键的功能介绍

二硫键与蛋白质高级结构的生物活性有关,同时与蛋白质的复性也有关联。如核糖核酸酶A经巯基乙醇(还原剂)和尿素(蛋白质变性剂)处理后,发生变性作用,4对二硫键断裂,多肽链伸展开来,高级结构发生变化,失去生物活性。如果用透析法将大量还原剂和变性剂除去,在微量还原剂存在下,4对二硫键在原来的位置重新形成,伸

二硫键的基本特性

二硫键最重要的一个特性就是它在还原剂作用下的裂解。使二硫键裂解的还原剂较多。在生物化学中,常用的还原剂有硫醇如β-巯基乙醇(β-mercaptoethanol,β-ME)或二硫苏糖醇(DTT)。通常要使用过量硫醇试剂保证二硫键的完全裂解。其它还原剂还有三羟甲基氨基甲烷磷化氢液[ tris(2-car

二硫键怎样形成的

二硫键存在于有机化合物中,是在取代反应中生成的。含碳元素的化合物叫做有机化合物(碳的氧化物、碳酸、碳酸盐除外)。有机化合物包括烃和烃的衍生物。最简单的烃是甲烷,它是最简单的有机化合物。当烃分子中的氢原子,被其它原子或原子团(称为官能团)所取代时,生成的化合物就叫烃的衍生物。能取代烃分子里的氢原子的原