遗传学家:通过互联网进行在线DNA测试

遗传学家和电脑程序员组成的联盟(自称为世界基因组学与卫生联盟)正在开发一种可以在互联网范围内交换DNA信息的协议。研究人员希望他们的工作在医学领域能够起到重要作用,如同Tim Berners-Lee在1989年发明的HTTP协议在互联网中发挥的作用一样。 该组织第一批示范项目中的其中一个项目是简单的搜索引擎。利用这种引擎,可以梳理出存放在包括谷歌的服务器群和英国莱斯特大学等九个位置的成千上万封人类基因组DNA信件。根据该组织(包括人类基因组项目的核心成员在内)的介绍,搜索引擎是DNA网络的开关,最终是将数以百万计的基因联系到一起。 正在开发的技术被称为应用程序接口(API),可以实现不同基因数据库之间的交流。汇集信息可以加快取得发现的步伐,这些发现涉及的方面是通过将疑似存在基因突变的儿童与已确诊存在基因突变的其他人进行配对,确定何种基因能够并帮助医生诊断出罕见的先天缺陷, 在两年前于纽约召开的一次会议上,因为担心基因组......阅读全文

首个近完整黄瓜基因组及多组学综合数据库发布

  近日,中国农业科学院蔬菜花卉研究所葫芦科蔬菜遗传育种创新团队在黄瓜基因组学方面取得重要进展,首次完成接近完整的黄瓜参考基因组组装和基因注释,搭建了第一个黄瓜多组学综合数据库。相关研究成果发表在《分子植物》(Molecular Plant)上。  黄瓜是葫芦科的重要经济蔬菜作物。黄瓜基因组中有近3

贝瑞和康建成全球最大妇科肿瘤基因组数据库

  基因组大数据的重大意义开始凸显,贝瑞和康与阿里云合作开展的“神州基因组数据云”项目取得的阶段性成果,便已经收效显著。  9月23日,在第十九届全国临床肿瘤学大会暨CSCO学术年会上,北京贝瑞和康生物技术股份有限公司(以下简称“贝瑞和康”)公布了在生物信息分析领域和大数据建设方面做出的重要成果。 

默克投资750万加元加入结构基因组学联盟

  默克公司近日宣布将投资750万加元(约600万美元)加入结构基因组学联盟(SGC)。  默克公司在声明中表示,投资所支持的研究项目是为开发分子探针以研究基因调控的表观遗传机制,探针的应用也将加深对多个疾病领域的生物学理解,尤其是在癌症和炎症性疾病方面。  默克和SGC表示,支

国际癌症基因组联盟在中国发起四个新项目

  2012年12月5日,国际癌症基因组联盟(ICGC)宣布在中国发起四个新项目,主要对结直肠癌、食道癌、肝癌和鼻咽癌的驱动基因进行检测,为实现个体化医疗奠定基础。中国是ICGC的创始成员之一,在2008年时曾经发起了胃癌基因组项目。   ICGC带领全球科学家对各种常见和罕见的癌症进行基因组图谱

基于同源基因簇的水稻泛基因组综合数据库建成

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498300.shtm近日,华中农业大学作物遗传改良全国重点实验室、湖北洪山实验室教授张建伟课题组联合国内外高校与科研机构在《自然—通讯》与《分子植物》连续发表两篇研究论文。这两项工作以代表亚洲稻群体结构的

天津大学:新冠病毒基因组注释数据库向全球开放

  疫情就是命令!30日从天津大学获悉,该校生物信息中心新型冠状病毒基因组注释数据库上线,并纳入中国国家基因组科学数据中心向全球开放服务。新型冠状病毒基因组注释数据库 ZCURVE_CoV Database 网站截图  面对疫情加快蔓延的严重形势,科技界正在争分夺秒与病毒抗争,开展病毒防治相关药物的

北京基因组所开发完成DNA甲基化重编程数据库

  DNA甲基化是一个重要的表观遗传标记,在胚胎早期发育过程中起到至关重要的作用,不同物种所采用的机制亦各不相同。因而,整合多个物种的海量甲基化数据并提供在线的数据浏览、获取及其功能分析,可帮助更多研究人员深入探析不同物种在早期发育时期的DNA甲基化差异,并揭示其DNA甲基化重编程过程与机制。   

科学家得到详细的恶性胶质细胞瘤细胞基因组数据库

  科学家启动了肿瘤基因组图谱计划(The Cancer Genome Atlas,TCGA),打算分析所有组织的肿瘤细胞的基因组。脑组织肿瘤是科学家的第一个目标,因为其挑战性大回报也最大。   TCGA收集了多形性成胶质细胞瘤(glioblastoma multiforme,GBM)的组

北京基因组所合作开发完成长非编码RNA数据库

  长非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是近年来国际研究的新热点,与人类癌症、神经系统等疾病发生密切相关,在疾病诊疗方面表现出了潜在的重大应用价值。虽然长非编码RNA表达量相对较低,但由于其在转录、基因组印记、翻译、可变剪切、转录后表达调控、蛋白运输与定位等过程的

上海生科院发布基因组多样性和祖源信息数据库

   该研究分析了涵盖全球范围107个国家的356个人类族群的基因组多样性和祖源信息,并发布了开放获取的专门数据库——PGG.Population(群体基因组学·族群)。PGG.Population是迄今唯一在基因组水平专门解析人类族群遗传关系和祖源信息的公开数据库,也是目前收集族群数量最大的群体基

研究人员发布全基因组单核苷酸变异数据库

  10月22日,国际学术期刊Genome Biology 以PGG.SNV: understanding the evolutionary and medical implications of human single nucleotide variations in diverse popul

首个近完整黄瓜参考基因组及多组学综合数据库发布

近日,中国农业科学院蔬菜花卉研究所葫芦科蔬菜遗传育种创新团队在黄瓜基因组学方面取得重要进展,首次完成接近完整的黄瓜参考基因组组装和基因注释,搭建了第一个黄瓜多组学综合数据库。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》(IF5 year = 21.4)上。黄瓜(Cucumis s

生科院发布首个全球人群基因组多样性和祖源信息数据库

  11月3日,中国科学院上海生命科学研究院(人口健康领域)计算生物学研究所徐书华课题组的研究成果,以PGG.Population: a database for understanding genomic diversity and genetic ancestry of human popula

我国建成全球第四个综合基因组权威数据库

  近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队题为“The BIG Data Center: from deposition to integration to translation”(北京基因组研究所生命与健康大数据中心:从存储到整合、再到转化)的研究论文被国际学术期刊《核酸研究》

全球共享的基因组数据库办不下去了,怎么办?

  1资金困境  作为世界上最具权威性的人类疾病相关的基因目录第五十个生日时,它面临着令人不安的变化。在接下来的几年里,美国国家人类基因组研究所(NHGRI)预计退出作为基因组数据库的始祖——称为在线人类孟德尔遗传(OMIM)唯一的资助者。谁将继承标签尚未明确。当美国国家卫生研究院(NIH)评估其数

研究构建绵羊和山羊肠道高质量微生物基因组数据库

近日,西北农林科技大学羊遗传改良与生物育种团队携手国内外多家科研机构,在绵羊和山羊肠道微生物基因组数据库构建及肠道粘蛋白和多糖代谢功能菌种挖掘方面取得进展,研究成果发表在Microbiome上。研究团队在全国范围内的32个羊场收集了来自21个绵羊和山羊品种共计320个肠道样本,分别构建了包含1.6亿

中外科学家成功绘制并公开达尔文雀基因组图谱

  “万种脊椎动物基因组计划”(G10K)联盟和深圳华大基因研究院于8月16日联合宣布勇地雀(Geospizafortis)基因组图谱绘制完成。勇地雀是最早由达尔文记载的生活在加拉帕戈斯群岛上的13种达尔文雀之一。据悉,勇地雀是G10K 联盟最早计划进行测序的100种脊椎动物之一。   勇地雀

群众基因数据:揭示疾病病因

  本月月初,来自40个国家的研究人员和提倡者成立了一个全球联盟来开启安全共享的基因组和临床数据库,目的是为了在这个时代结束时可以使人类能够利用遗传数据。   英国政府,凯萨医疗机构及美国共同努力收集和整理了大量的遗传数据。但是随着全球的联盟,有一天临床医生可以广泛使用遗传数据,全世界的研究者可以

基因组与健康全球联盟与INCF共同打造全球神经科学数据社区

 基因组与健康全球联盟(GA4GH)和国际神经信息学协调中心(INCF)周五宣布,它们已合作建立了被称为神经科学社区的项目,旨在连接全球神经科学和基因组数据。作为近年来由GA4GH创建的几个“兴趣社区”之一,新的神经科学项目旨在支持制定并使用患者数据的最佳实践和改进标准。新成立的GA4GH和INCF

国产仪器示范联盟成为2012产业技术联盟试点

  日前,科技部发布了2012年度产业技术创新战略联盟试点名单,其中包括国产科学仪器设备应用示范产业技术创新战略联盟等39个联盟开展产业技术创新战略联盟试点工作,试点期2年。 关于发布2012年度产业技术创新战略联盟试点名单的通知 各省、自治区、直辖市及计划单列市科技厅(委、局),新疆

打破“数据孤岛”,推动组学资源管理自立自强

今年1月,依托中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)(以下简称基因组所)的国家基因组科学数据中心(NGDC)有10篇论文集中亮相国际生物数据库期刊《核酸研究》。对于这样一本顶级期刊来说,这种情况并不多见。一个刚6岁的数据中心何以取得这样的成绩?近日,《中国科学报》走进基因组所了解NGDC成长

期刊数据库更新

图片来源:B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影响因子多年来备受批评,认为其扭曲了学术出版。近日,美国宾夕法尼亚州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用报告(JCR)数据库的更新版本,并表示它提供了理解期刊特征和受众的背景信息。 影响因子代表期刊文章的引用次数,除以其两年间发表

期刊数据库更新

图片来源:B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影响因子多年来备受批评,认为其扭曲了学术出版。近日,美国宾夕法尼亚州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用报告(JCR)数据库的更新版本,并表示它提供了理解期刊特征和受众的背景信息。 影响因子代表期刊文章的引用次数,除以其两年间发表的文章数量,

基于八大基因组学数据库-构建迄今最完整的癌症eRNA图谱

  增强子RNA(eRNA)是一种从增强子转录的非编码RNA。目前,科学家已经在人类细胞中鉴定出数以万计的eRNA,其中许多都在RNA转录过程中发挥重要作用,以介导靶基因的激活。在人类癌症中,癌基因或致癌信号通路的激活通常引起增强子的激活和eRNA的产生。例如,ESR1的激活可以整体上增加乳腺癌中e

获“产业技术创新联盟”专项支持联盟名单

关于公示“产业技术创新战略联盟促进”科技专项拟支持联盟的通知  各有关单位:  依据《北京市关于促进产业技术创新战略联盟加快发展的意见》,经组织专家评审,提出北京市2011年度拟支持产业技术创新战略联盟名单。单位和个人对名单中联盟有异议的,请自本通知发布之日起5个工作日内以书面形式提出。提

世界骨科联盟成立

  由近70个国家和地区的骨科专家组成的世界骨科联盟(WOA)11月15日在中国北京成立,中华医学会骨科学分会主任委员王岩教授任联盟主席。WOA是以提高发展中国家骨科医疗水平为目的的国际学术团体。联盟希望通过成员携手合作,提高中国和其他发展中国家医疗水平、推动医生教育和产品开发等活动,为骨骼与肌肉创

深圳法语联盟揭牌

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498282.shtm4月10日,深圳法语联盟在深圳大学正式揭牌,法国驻华大使白玉堂(Bertrand LORTHOLARY),深圳大学校长、中国科学院院士毛军发出席活动,并共同为联盟揭牌。揭牌仪式现场 深

热带高校联盟成立

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/512294.shtm11月14日,热带高校联盟成立大会在海南省三亚市举行。   ?热带高校联盟正式成立。海南大学供图热带高校联盟由致力于热带地区高等教育和社会发展的高校,如海南大学、埃及开罗大学

宁夏草业发展联盟、西北百合产业发展联盟成立

  7月22日,由中科院农业项目办、宁夏自治区农发办、盐池县政府、隆德县政府共同发起的宁夏草业发展联盟、西北百合产业发展联盟成立大会在银川召开。   优质牧草产业是宁夏自治区党委和政府确定的13个优势特色产业之一。发展优质牧草,能够有效解决围栏封育、生态移民、改善生态环境、调整种植结构等政策的实施

谷歌投资生物基因公司惹非议

据英国《泰晤士报》报道,美国谷歌公司(Google)日前宣布向一家生物基因公司投资390万美元。经过进一步整合,谷歌的用户有望通过该搜索引擎查询自己的基因组成。 据悉,谷歌以390万美元(190万英镑)投资的23andMe生物科技公司创建于2006年,创建者之一就是安妮-沃西基,这位原保健部分析师