生科院发布首个全球人群基因组多样性和祖源信息数据库
11月3日，中国科学院上海生命科学研究院（人口健康领域）计算生物学研究所徐书华课题组的研究成果，以PGG.Population: a database for understanding genomic diversity and genetic ancestry of human populations为题，在线发表在《核酸研究》上。该研究分析了涵盖全球范围107个国家的356个人类族群的基因组多样性和祖源信息，并发布了开放获取的专门数据库——PGG.Population（群体基因组学·族群）。PGG.Population是迄今唯一在基因组水平专门解析人类族群遗传关系和祖源信息的公开数据库，也是目前收集族群数量最大的群体基因组数据库，为研究人员、临床医生及学生和公众理解不同人群的遗传背景提供查询和分析平台。 人类族群多样性的形成是迁移、隔离、分化、再接触和交流的复杂演化过程。同时，长期对特定环境的适应或能影响特定的性状以......阅读全文
Nature：用单细胞基因组探索多样性
宏基因组研究极大地提高了我们对于细菌以及古细菌多样性的理解。然而，环境宏基因组数据往往不容许个别物种的基因组组装，因此，大多数完整的基因组序列来自于培养的微生物。如今，两个新的大规模研究利用单细胞基因组，直接从未培养的环境样本中恢复了细菌和古细菌基因组。 Rinke等人利用荧光活化性细胞分
Cell：全基因组测序揭示人类遗传多样性
遗传的历史就书写在现代非洲人的DNA中，但还需要一些调查工作来对其进行注释。在即将出现在8月3号《细胞》(Cell)杂志封面上的一篇报道中，宾夕法尼亚大学的遗传学家们和他们的同事对分属三个不同狩猎者(hunter-gatherer)群体的15个非洲人的完全测序基因组进行了分析，并破解了一些必定涉
基因组多样性和祖源信息数据库
11月3日，中国科学院上海生命科学研究院（人口健康领域）计算生物学研究所徐书华课题组的研究成果，以PGG.Population: a database for understanding genomic diversity and genetic ancestry of human popul
多样性增加281％，人类肠道菌群基因组图谱公布！
近两年来，以免疫检查点为药物靶点的免疫检查点抑制剂治疗癌症受到越来越多科研工作者的青睐。但是临床研究结果表明，许多癌症患者因接受免疫药物治疗而出现不同程度的免疫相关不良反应，最终出现不得不提前终止治疗的情况。 而寄居在人体内的肠道菌群可以影响免疫检查点抑制剂治疗癌症，能够极大地改善患者对该疗法
质体基因组多样性演化，提供土壤碳动态新视角
近日，中科院植物研究所研究员杨元合团队以青藏高原高寒草原生态系统为研究对象，依托野外长期氮添加控制实验平台，结合18O-DNA标记、高通量测序等技术揭示了氮添加影响土壤微生物CUE的新机制。相关研究成果发表于《全球变化生物学》。工业革命以来，化石燃料燃烧和农业化肥使用等人类活动导致大气氮沉降增加。持
我国专家首绘蝎子基因组图谱－揭开多样性面纱
由武汉大学领衔，与上海生物信息技术研究中心合作，近日完成了对马氏正钳蝎(Mesobuthus martensii)的基因组测序，预测了32016个蛋白质编码基因，在国际上第一个揭示了蝎子(scorpion)这一种独特的节肢动物适应模式。 专家表示，马氏正钳蝎基因组的解析揭开了蝎毒素多样
蝴蝶基因组大小进化进展－发现表型多样性进化遗传基础
蝴蝶因其丰富的形态多样性，自达尔文时代就作为研究物种适应性进化的重要类群之一，近几年更被认为是研究形态遗传、进化和发育的理想模型，已成为发育生物学、进化生物学、种群遗传学、保护生物学和生态学等研究领域的重要模式生物之一。 中国科学院昆明动物研究所科研团队在2015年完成所有蝴蝶模式种金凤蝶及其
大豆基因组重测序表明:野生大豆遗传多样性更高
“中原有菽，庶民采之。”五千年前，华夏始祖将野生大豆驯化，变成今天的“五谷”之一。而今，一项被称为“大豆回家”的基因组研究计划在其故乡中国取得突破。 11月15日，由香港中文大学、华大基因研究院、农业部基因组重点实验室、中国农业科学院等单位合作完成的《31个大豆基因组重测序揭示遗传多样性和
Illumina与PacBio测序数据帮助质体基因组多样性演化机制
近日，中科院植物研究所研究员张宪春、副研究员向巧萍等揭示了自养维管植物中目前已知最特异的质体基因组。相关研究成果发表于《植物学报》。近年来质体基因组研究揭示了复杂多样的结构和序列变异，对教科书上经典的四分体结构提出了挑战。质体基因组多样性演化的机制常被笼统地诉诸于DNA修复系统可能存在缺陷。科研人员
2012国际热带生物多样性及基因组学研讨会开幕
6月4日，“2012国际热带生物多样性及基因组学专题研讨会”（Workshop on Tropical Biodiversity and Genomics at Xishuangbanna Tropical Botanical Garden）在中国科学院西双版纳热带植物园举行。会议
上海生科院发布基因组多样性和祖源信息数据库
该研究分析了涵盖全球范围107个国家的356个人类族群的基因组多样性和祖源信息，并发布了开放获取的专门数据库——PGG.Population（群体基因组学·族群）。PGG.Population是迄今唯一在基因组水平专门解析人类族群遗传关系和祖源信息的公开数据库，也是目前收集族群数量最大的群体基
植物多样性能预测昆虫多样性
日前，应用宏条形码技术，中科院昆明动物研究所研究员俞维理课题组对“植物多样性精确预测昆虫多样性”的重要结论进行了验证和扩展。 昆虫具有宿主特异性，因此植物多样性应该能够预测昆虫多样性，但是已有的研究并不支持该结论；直到Basset 等人在一个热带森林里进行前所未有的全面采样，并结合复杂的统计模
生科院发布首个全球人群基因组多样性和祖源信息数据库
11月3日，中国科学院上海生命科学研究院（人口健康领域）计算生物学研究所徐书华课题组的研究成果，以PGG.Population: a database for understanding genomic diversity and genetic ancestry of human popula
水生所揭示鲤科鱼类基因组加倍促进血氧系统表型多样性
生物的生存、繁殖、以及分布或多或少都受到环境氧的影响。生物的正常有氧代谢有赖于保持氧的需求（代谢）和供应（储存和传递）的平衡关系。而实现这一平衡关系主要依靠生物体内特异的血氧传递系统。血氧系统的多样化不仅体现了物种在生理上的多样性，也从侧面反映了物种对环境的适应能力。在进化史上，基因组加倍是生物
多种养殖哺乳动物携带的病毒基因组遗传多样性被解码
复旦大学公共卫生学院教授粟硕团队与中国科学院微生物研究所研究员毕玉海等合作者，揭示了多种哺乳动物宏基因组数据中的病毒基因组组成、生态学特征与潜在跨物种传播风险，为构建“人-动物-环境”一体化、多维度新发传染病预测预警体系奠定了重要数据基础。9月4日，相关研究发表于《自然》。21世纪以来，人类多次经历
遗传多样性缺失导致少量人种被忽略－基因组学应包容性
一个来自被忽略人种的研究 几十年来，Néstor Ruiz Hernández一直在争取认可。他在墨西哥南部太平洋沿岸的一个小镇长大。在那里，他和其他许多人都是十六世纪被人贩子从非洲贩运到墨西哥的奴隶的后代。他们认为自己是Afromexican，但该组织并未被墨西哥政府正式承认为少数族裔群体。
国际热带生物多样性及基因组学专题研讨会在版纳园召开
6月27日至7月1日， 国际热带生物多样性及基因组学专题研讨会（Workshop on Tropical Biodiversity and Genomics）在中科院西双版纳热带植物园召开，来自十多个不同国家的三十余名科研人员参加了研讨会。 本次研讨会历时五天，
非洲首个大型人类基因组学研究揭示高水平遗传多样性
南非科技部资助的“南部非洲人类基因组计划（SAHGP）”，顺利完成了对24名来自不同民族语言个体的全基因组测序，证实非洲人群存在高水平的遗传多样性，研究结果发表在《自然-通讯》期刊上。 该计划是非洲首个由政府资助开展的人类基因组学研究，旨在揭示南部非洲人群的独特遗传特征，全方位发掘各类人群
人类基因组完整改组图谱绘成－深化人们对遗传多样性的理解
冰岛基因解码公司科学家完成了一项重要研究。他们绘制了一份人类基因组完整改组图谱，即详尽的人类DNA在生殖过程中混合方式的地图。这项研究深化了人们对遗传多样性的理解，是25年来科学家探索人类基因组中新生多样性产生机制，以及与健康和疾病关联研究的延续。相关成果22日发表在《自然》杂志上。 论文的作
非洲首个大型人类基因组学研究揭示高水平遗传多样性
南非科技部资助的“南部非洲人类基因组计划（SAHGP）”，顺利完成了对24名来自不同民族语言个体的全基因组测序，证实非洲人群存在高水平的遗传多样性，研究结果发表在《自然-通讯》期刊上。 该计划是非洲首个由政府资助开展的人类基因组学研究，旨在揭示南部非洲人群的独特遗传特征，全方位发掘各类人群
如何通过计算多样性指数评估苔藓物种多样性
通过计算多样性指数来评估苔藓物种多样性，通常可以按照以下步骤进行：数据收集首先，需要通过实地调查、标本采集等方法，确定研究区域内苔藓的物种组成以及每个物种的个体数量。选择多样性指数常见的用于评估苔藓物种多样性的指数包括香农 - 威纳指数（Shannon-Wiener Index）、辛普森指数（Sim
抗体的多样性
人血清中的抗体多种多样，B淋巴细胞可产生的抗体种类在108以上，可与众多不同抗原发生特异性结合。抗体多样性的原因主要有两方面：1．外源性因素环境中抗原种类甚多，每种大分子抗原又有多种抗原表位，每种抗原表位均可选择激活体内一个B细胞克隆，产生一种特异性抗体。2．内源性因素抗体多样性的另一个原因是由基因
抗体的多样性
人血清中的抗体多种多样，B淋巴细胞可产生的抗体种类在108以上，可与众多不同抗原发生特异性结合。抗体多样性的原因主要有两方面： 1．外源性因素环境中抗原种类甚多，每种大分子抗原又有多种抗原表位，每种抗原表位均可选择激活体内一个B细胞克隆，产生一种特异性抗体。 2．内源性因素抗体多样性的另一个
物种多样性指数
物种多样性指数类别名称计算公式物种多样性指数Simpson指数D=1-∑Ni2Shannon-Wiener指数H=-∑PilogPi备注：式中，N为群落中所有物种个体总数，Pi=ni/N，ni为物种i的重要值，Ni为物种i的个体数。
国际生物多样性日：保护生物多样性全球在行动
５月２２日，是国际生物多样性日，而今年又是联合国确定的国际生物多样性年。 生物多样性与人类息息相关。如果没有生物多样性，人类难以感受到树林的绿意，还可能失去空气、食物和水。如果没有多姿多彩的其他生命形式，不仅生活会变得索然无味，而且人类可能
物种多样性与遗传多样性关系研究取得新进展
11月22日，国际权威植物学期刊New Phytologist在线刊出了中科院武汉植物园在物种多样性与遗传多样性关系研究领域的最新成果（Contrasting relationships between species diversity and genetic diversity
RFLP（扩增片段长度多样性）研究遗传多样性的介绍
基于RFLP（限制性酶切片段多样性） 和PCR技术发展起来的一种用来研究分类的技术.原理是：不同物种的DNA序列不同，那么用同种限制性内切酶酶切会得到不同的片段，这些不同的片段中，有很多长度也会有不同.通过同样两种限制性内切酶消化后，根据酶切位点序列设计互补序列并额外添加一段特异性序列，用T4连
如何利用多样性指数评估苔藓物种多样性的恢复速度？
以下是利用多样性指数评估苔藓物种多样性恢复速度的一般步骤：选择合适的多样性指数常见的用于评估物种多样性的指数包括香农 - 威纳指数（Shannon-Wiener Index）、辛普森指数（Simpson Index）、皮卢均匀度指数（Pielou's Evenness Index）等。香农
如何利用多样性指数评估苔藓物种多样性的恢复速度？
以下是利用多样性指数评估苔藓物种多样性恢复速度的一般步骤：选择合适的多样性指数常见的用于评估物种多样性的指数包括香农 - 威纳指数（Shannon-Wiener Index）、辛普森指数（Simpson Index）、皮卢均匀度指数（Pielou's Evenness Index）等。香农
Nature－Genetics－|－中国农大等单位合作通过泛基因组分析揭示苹果属（Malus）的进化与多样性
近日，Nature Genetics在线发表中国农业大学等团队合作的题为“Pan-genome analysis reveals the evolution and diversity of Malus”的研究论文，该论文首次对30个苹果属物种（涵盖二倍体与多倍体）进行高质量基因组测序与组装，构