我国建成全球第四个综合基因组权威数据库

近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队题为“The BIG Data Center: from deposition to integration to translation”(北京基因组研究所生命与健康大数据中心:从存储到整合、再到转化)的研究论文被国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表。这是我国首次以数据中心为模式整体发布我国生命组学数据资源建设情况,标志着我国建设综合性基因组数据资源获得国际同行认可。 北京基因组研究所有关人员表示,此前,国际上被认可的生物组学数据中心主要有美国的NCBI、欧洲的EBI及日本的DDBJ,要想在国际期刊发表论文,需要先将自己的原始数据提交到这三个官方指定的数据库中。“中国的生物组学数据产量约占全球的40%,是数据产出大国,却没有能够被国际认可的数据库系统,不得不将自己宝贵的数据资源交给他人代管。” 该数据库成为国际上第四个被......阅读全文

北京基因组所数据资源建设取得进展

  近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队研究论文在线发表于《核酸研究》期刊。该研究成果的发表是国内首次以数据中心为模式,整体发布我国生命组学数据资源建设情况,标志着生命与健康大数据中心建设取得实质性重要进展,也标志着我国建设综合性基因组数据资源获得国际同行认可。  生命与健康大数

国家基因组科学数据中心公布数据资源整合挖掘体系

  近日,国家基因组科学数据中心在国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表题为Database Resources of the National Genomics Data Center in 2020 的文章,以整体形式介绍基因组数据资源整合与挖掘体系建设

北京基因组所生命组学数据资源建设获进展

  近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队题为The BIG Data Center: from deposition to integration to translation 的研究论文被国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表。该研究成

专家解读-|-深化数据资源开发利用-促进数据资源价值释放

  近期,在第八届数字中国建设峰会上,《全国数据资源调查报告(2024年)》(以下简称“报告”)正式发布。调查显示,我国数据开发利用更加活跃,创新引擎作用更加凸显。2024年,我国公共数据开放程度逐渐提升,企业加快应用大模型,高质量数据集建设进入加速期。  一、数据资源开发利用活跃度保持上升态势  

国家基因组科学数据中心发布2019新型冠状病毒资源库

  1月22日,国家基因组科学数据中心正式发布2019新型冠状病毒资源库。该库整合了世界卫生组织(WHO)、中国疾病预防控制中心(CDC)、美国国家生物技术信息中心(NCBI)、全球流感序列数据库(GISAID)等机构公开发布的冠状病毒基因组序列数据、元信息、学术文献、新闻动态、科普文章。同时,对不

两会简讯|把握数据资源

赵红卫   受访者供图 2021年国务院印发《“十四五”数字经济发展规划》,提出数字经济是继农业经济、工业经济之后的主要经济形态,是以数据资源为关键要素,以现代信息网络为主要载体,以信息通信技术融合应用、全要素数字化转型为重要推动力,促进公平与效率更加统一的新经济形态。 随着传感器技术

空间大数据+自然资源模式-助推生态资源产业发展

今年3月,国土资源部、国家测绘地理信息局等一部三局正式组建自然资源部,新一轮政府机构改革,给自然资源乃至整个地理信息产业带来了新的发展机遇。近日,WGDC 2018地理信息开发者大会“空间大数据+自然资源”峰会在国家会议中心举行。 据悉,此次会议由自然资源部大地出版传媒集团、中国国土资

-ORFeome:基因组规模的人类ORF资源

  一个国际合作组织,包括Dana-Farber癌症研究所,已经在创造人类细胞中不同蛋白质的成千上万的完整基因图谱库的工作上达到了一个里程碑。开放阅读框ORF(编码蛋白全长的基因)的集合,是科学家研究人类细胞基础机制和疾病中的过程的重要资源。  在2月25日发表在Nature Method上的文章,

中国自然资源学会资源大数据分会学术年会举办

8月16日,中国自然资源学会资源大数据分会2024年学术年会在山东省聊城市召开。本次学术年会以“资源大数据赋能高质量发展”为主题,由中国自然资源学会资源大数据分会主办,聊城大学承办。来自自然资源部信息中心、中国科学院地理与资源科学研究所、中国科学院空天信息创新研究院、中国地质大学(北京)、武汉大学等

制药公司需要更好地利用数据资源

  一项新的报告表明,制药公司需要重视数据的价值以提高生产效率。  普华永道和铁山公司在他们的2014信息风险成熟指数调查中指出,相比分析与自身价值相关的数据,制药行业是更关心数据破坏或采取法律行动的行业之一。  调查中相关的其他行业有:法律、金融服务、能源、保险和制造及工程。该

盐湖资源环境信息数据库建成

  日前,中国科学院青海盐湖研究所在科技部基础专项、中科院“百人计划”等项目的支持下,立足柴达木盆地盐湖资源优势,历时6年建成的盐湖资源与环境科学基础数据共享数据库正式通过科技部验收。这标志着目前我国数据量最大的盐湖资源与环境科学基础数据共享系统正式建成,并对基于科学数据的盐湖资源合理利用、长远决策

缺乏数据使用指导原则,基因组数据共享遇阻

   基因组数据共享将生物医学研究推向快车道,但向公共领域发布的现有数据指南一方面承认免费和无条件使用数据的重要性,另一方面还未能解决这种重要性与数据生产者首次发布数据的“权利”之间的关系。  在美国能源部联合基因组研究所负责人Nikos Kyrpides看来,这种自相矛盾导致了数据生产者和数据使用

数据应用环境项目“数据资源中心建设”子项目通过验收

  12月30日,中科院计算机网络信息中心在北京召开了中科院“十一五”信息化专项“数据应用环境建设与服务”项目的“数据资源中心建设”子项目验收会议。来自北京航空航天大学、清华大学、中国地震局、中科院相关院所等单位的7名专家组成专家组。   网络中心科学数据中心主任、中科院数据应用环境建设与服务项目

德国基因组研究资源中心将关闭

德国基因组研究资源中心(RZPD)日前宣布,将在7月底终止服务,并且ImaGenes和Atlas生物实验室(Biolabs)将会结果它的大部分服务内容。关闭的原因尚未公布。 这个以柏林和海德尔堡为大本营的非营利性机构通过Affy公司的欧洲代理商NimbleGen提供Affy公司芯片服务。该中心宣布

多部门联合开展全国数据资源调查

  国家数据局19日发布消息,为摸清数据资源底数,加快数据资源开发利用,更好发挥数据要素价值,国家数据局、中央网信办等部门联合开展全国数据资源情况调查,调研各单位数据资源生产存储、流通交易、开发利用、安全等情况,为相关政策制定、试点示范等工作提供数据支持。  据了解,调查对象为省级数据管理机构、工业

我国2022数据产量占全球10.5% 加速数据资源优势转化-推动数据要素价值释放

  随着数据基础制度的逐一落实,我国迎来了数据要素政策和环境的黄金发展期,从“数据大国”向“数据强国”加速迈进。  国家互联网信息办公室发布的《数字中国发展报告(2022年)》显示,2022年,我国大数据产业规模达1.57万亿元,同比增长18%;数据产量达8.1ZB,同比增长22.7%,占全球数据总

基因组数据分析的“金标准”

  五月十八日,美国安大略癌症研究所、俄勒冈健康与科学大学、赛智生物网络(Sage Bionetworks)、分布式DREAM 团体(Dialog for Reverse Engineering Assessment and Methods)和加州大学圣克鲁兹分校的癌症研究人员,在《Nature M

自然资源部总工程利伟:数据驱动资源治理走向精准化

  当代信息技术与经济社会的交汇融合引发了数据迅猛增长,数据已成为国家基础性战略资源。党中央、国务院高度重视大数据技术的发展,提出要建立健全大数据辅助科学决策和社会治理的机制,推进政府管理和社会治理模式创新,实现政府决策科学化、社会治理精准化、公共服务高效化。  我国正面临从“数据大国”向“数据强国

大数据协同安全技术国家工程实验室-将共享数据资源

  2017年7月4日,大数据协同安全技术国家工程实验室授牌仪式暨第二次工作会议在京举行。360企业安全集团、中电长城网际系统应用有限公司、中国信息安全测评中心、国家互联网应急中心、公安部第三研究所、国家信息中心、中国信息通信研究院、北京中测安华科技有限公司、中国科学院信息工程研究所、哈尔滨安天科技

孙九林院士:科学数据是重要战略资源

  国务院办公厅日前印发《科学数据管理办法》(以下简称《办法》),我非常高兴。作为科技工作者,我为科学数据共享鼓与呼了几十年,相信《办法》对其他科技工作者也是极大鼓舞。  数据共享应用是国际通行经验。比如美国,20世纪70年代就开始建立数据自由方面的法规,90年代开始提出数据开放共享的概念,建了9个

中国盐湖资源与环境科学数据库建成

  9日,中国科学院青海盐湖研究所历时6年建成的中国盐湖资源与环境科学数据库通过科技部验收,这也是中国唯一数据量最大的盐湖资源与环境科学基础数据共享系统。  盐湖资源是中国西部地区特色资源之一,也是中国具有相对国际优势的无机矿产资源,其中的钾、锂、硼、铷、铯等资源成分关系国家的资源安全和战略安全,对

中国盐湖资源与环境科学数据库建成

  9日,中国科学院青海盐湖研究所历时6年建成的中国盐湖资源与环境科学数据库通过科技部验收,这也是中国唯一数据量最大的盐湖资源与环境科学基础数据共享系统。           盐湖资源是中国西部地区特色资源之一,也是中国具有相对国际优势的无机矿产资源,其中的钾、锂、硼、铷、铯等资源

北京基因组所发布表观基因组数据库MethBank-3.0

  中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0,并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题,在线发表在Nucleic Acids Rese

北京基因组所发布表观基因组数据库MethBank-3.0

  中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0,并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题,在线发表在Nucleic Acids Rese

生物物理所女娲基因组资源研究取得进展

  遗传变异图谱是研究人群演化史、医学遗传学、基因型-表型关联的基础。此前,大多数全基因组测序相关研究主要集中在欧洲血统人群。已有研究表明,罕见和低频的变异往往特定于人群或样本,尤其是与疾病相关的变异。针对特定人群的基因组数据可以为全基因组关联研究、区域适应性研究、用药指导等提供更准确的参考。  单

北京基因组所资源建设取得阶段性进展

  近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队以Database Resources of the BIG Data Center in 2018为题的研究论文,在线发表Nucleic Acids Research上。这是继去年首次在该期刊发布我国生命组学数据资源建设成果The BIG

专家解读-|-健全数据资源统计调查制度-助推数据要素价值创造进程

  近年来,国家数据局等部门探索制定数据资源统计调查制度,健全数据资源协同调查机制,发布数据资源调查年度报告,初步形成动态监测我国数据资源的调查方法和工作机制。2025年4月29日,《全国数据资源调查报告(2024年)》(以下简称《报告》)在第八届数字中国建设峰会正式发布,对全国数据资源发展态势进行

推荐一些评估-Immune-Cell-Atlas-基准数据集的数据偏差的资源

以下是一些可能有助于评估 Immune Cell Atlas 基准数据集的数据偏差的资源:  1. 相关的学术文献:在学术数据库(如 PubMed、Web of Science 等)中搜索关于 Immune Cell Atlas 数据集的研究论文,特别是那些专注于数据质量评估和偏差分析的研究。 2.

国际癌症基因组联盟公布逾1万个癌症基因组数据

  国际癌症基因组联盟(International Cancer Genome Consortium,简称"ICGC")近日向科研界公布了超过1万个癌症基因组的数据。这些数据能更好地帮助全世界的癌症研究者从基因方面了解癌症,加快对癌症的研究并帮助更多癌症靶向治疗的发展。   安大略癌症研究所所

基因组所完成开发RiceWiki数据库

  近日,中国科学院北京基因组研究所章张研究员课题组与北京理工大学、中国林业科学研究院及华中农业大学合作开发完成RiceWiki数据库。该数据库是基于维基百科的水稻基因信息平台,是可编辑且内容公开的公众注释系统。研究成果在Nucleic Acids Research杂志发表。   水稻是人类重