当宏基因组遇上单细胞测序
日前，科学家们通过宏基因组测序和单细胞测序鉴定了一类新细菌。 16S rRNA基因序列的保守性和普遍性，使其成为了微生物检测和分类鉴定的强有力工具。这种方法为科学家们揭示了微生物群体的高度复杂性，但它还是有所遗漏。美国能源部联合基因组研究所上周的一次会议上，研究者人员向人们展示了在四个温泉样本（北美和亚洲）中发现的一类新细菌Candidatus Kryptonia。这项研究共测序了22个Kryptonia基因组。 基因组分析显示，Kryptonia属于拟杆菌门。拟杆菌门的成员一般生存在肠道或海洋中，而Kryptonia是其中首个极端嗜热菌。研究人员指出，Kryptonia可能是通过水平基因转移从古生菌获得这种能力的。 16s rRNA检测无法发现这种细菌，这是因为在通用引物的结合处发生了删除事件。Nikos Kyrpides领导团队通过宏基因组测序和单细胞测序证实了这种细菌的存在，并将其命名为Kryptonia。 研......阅读全文
研究人员绘出苹果基因组草图
一个国际科研小组8月29日在英国《自然—遗传学》（Nature Genetics）杂志上报告说，他们绘出了苹果的基因组草图，这将有助于从基因水平上分析苹果性状，培育更多苹果新品种。 意大利、美国、新西兰等国研究人员报告说，他们绘出的是广受人们喜爱的“金冠苹果”的基因组草图。结果
癌症研究人员联手汇集肿瘤基因组数据
研究人员希望，数据分享将为利用诸如这些脑部腺癌细胞等肿瘤的基因组信息带来更好的方法。 这是为大型癌症研究中心的很多病人提供的最新希望：“让我们测序你的肿瘤，或许我们能将其同击败这种恶性疾病的药物匹配。”不过，现实是基因组分析仍然仅为癌症病人提供了一小部分帮助。“我们多半时候不知道如何处理这些
研究人员破译香蕉“美食蕉”品种香蕉基因组
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/512730.shtm广东省农业科学院研究员易干军领衔的香蕉遗传改良团队与广西大学教授陈玲玲团队合作，破译了香蕉“美食蕉”品种香蕉基因组，首次在国际上组装染色体级别的异源三倍体香蕉栽培种（AAB）参考基因
研究人员成功构建首个圭亚那柱花草基因组
在国家自然科学基金等项目的资助下，华南农业大学副教授陈曙团队成功完成首个圭亚那柱花草染色体水平基因组组装，从基因组、转录组及表观遗传组多维度解析其抗逆分子机制，为热带牧草分子育种与抗逆研究提供关键理论支撑与基因资源。相关成果近日发表于《植物杂志》（The Plant Journal）。圭亚那柱花草比
研究人员发现：霍乱正改变人类基因组
生命演化到今天，人类似乎已经进入最完美的状态。我们的基因组是否已经稳定?改变是否还在发生?科学家们一直在寻找答案。一项新研究表明，当代人类也在进化，而引发这种进化的，竟然是霍乱。研究人员发现的证据证明：在霍乱流行的孟加拉国，人们的基因已经找到了对抗霍乱的办法。这是发生在当代的人类进化案
研究人员首次破译艾滋病病毒完整基因组
新华网华盛顿8月6日电 美国北卡罗来纳大学6日报告说，该校的一个科研小组成功破译了艾滋病病毒的完整基因组。这对于人类理解艾滋病病毒感染人体的机制，寻找抗“艾”新疗法提供了有力帮助。 相关论文发表在6日出版的英国《自然》杂志上。研究小组负责人凯文·威克斯介绍说，艾滋病病毒的遗传信息由单链核糖
研究人员构建人类阴道微生物基因组库
6月21日，深圳市宝安中医院（集团）副院长黄链莎、转化医学中心助理研究员孙文与大连医科大学副教授鄢秋龙等课题组的最新合作成果发表于《自然—微生物学》。人类女性阴道是一个包括细菌、真菌和病毒在内的复杂微生态系统，各微生物之间是相互制约、相互作用、相互依赖、对立统一的关系，其间的平衡关乎女性生殖健康及胎
研究人员发布最新版树鼩基因组注释
树鼩是一种与实验大鼠差不多大小的小型哺乳动物，是灵长类的近亲。由于其繁殖周期短（约6周），饲养成本低，单胎产仔数较高（每胎2-5只）等特点，在某些方面有望替代非人灵长类用于生物医学研究和应用。目前，树鼩已被用于多种感染性疾病模型创建，是研究视觉系统与功能的很好的动物。中国科学院昆明动物研究所研究
日本研究人员首次成功绘制日本人基因组图谱
据日本共同社报道，日本理化学研究所基因组医科学研究中心日前通过新一代DNA测序仪成功绘制出首份日本人基因组图谱。该成果10月24日发表在美国《自然—遗传学》杂志网络版上。 DNA一共有4种碱基排列组合，人类大约有30亿对碱基对。新一代测序仪可将DNA进行极其精细的切片，对大量切片同时
研究人员成功测序蒙特莫朗西酸樱桃基因组
密歇根州的酸樱桃产量在全美名列前茅，密歇根州立大学的一个研究小组启动了一个项目，旨在确定与酸樱桃树晚开有关的基因，以满足不断变化的气候的需要。他们首先将晚开的樱桃树的DNA序列与一个相关物种--桃子的基因组测序进行了比较。他们首先将开花迟缓的酸樱桃树的DNA序列与它们的亲戚桃子的基因组序列进行比较。
安捷伦授予临床基因组研究人员Peter－Robinson“思想领袖奖”
分析测试百科网讯 2016年11月29日，安捷伦科技宣布将安捷伦思想领袖奖授予给Peter Robinson, M.D., MSC，以表彰其对临床基因组学和计算生物学的贡献。在今年早些时候，中国中医科学院中药研究所所长陈士林（详见本网报道：中药研究所所长陈士林获得“安捷伦思想领袖奖”）和癌症研究
研究人员完成枣和酸枣单倍型基因组组装
近日，西北农林科技大学林学院红枣团队黄建研究员课题组以我国制干枣主栽品种‘骏枣’和著名“秦药”代表清涧酸枣为研究材料，整合了PacBio HiFi、ONT ultra-long和Hi-C等多种先进测序技术以及多种组装策略完成了枣和酸枣T2T gap-free和T2T gap-free单倍型基因组的组
研究人员解析人类基因组计划的赢利奥秘
人类基因组计划(genome project)为美带来1万亿美元经济增长。 美国巴特尔纪念研究所6月12日发布的一份颇具争议的报告指出，解码人类基因组项目的经济收益持续增长。该项目结束10年后，目前其带来的收益已接近1万亿美元。 1988~2003 年进行的人类基因组计划(genom
研究人员观测到人类基因组新的“暗物质”
人类对基因组变异的认识又向前推进一大步：西安交通大学日前传出消息，该校叶凯青年科学家工作室团队与荷兰、美国、德国的20个科研机构，通过开发新的计算机算法和分析处理流程，分析并报道了在250个健康家庭的基因组中的所有类型变异，其中包括以前从未观测到的大量复杂型变异，即基因组中的“暗物质”。 据介
研究人员提出基因组结构变异检测和分型新方法
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519653.shtm
全球研究人员致力于创造首个合成真核生物基因组
10年前，当遗传学家Ronald Davis首次提出，他的同事正在尝试创造人工酵母染色体，并将其放入活细胞时，Jef Boeke并没有太多想法。Davis就职于美国加州斯坦福大学医学院，是一个有远见的人。他提出，实验室酵母是当时合成生物学领域的下一个发展方向。不过，Boeke并不理
研究人员发布全基因组单核苷酸变异数据库
10月22日，国际学术期刊Genome Biology 以PGG.SNV： understanding the evolutionary and medical implications of human single nucleotide variations in diverse popul
研究人员从从基因组水平揭示食肉目染色体进化规律
染色体进化是物种形成和演化的重要驱动因素。具有显着核型差异的食肉目动物为染色体进化研究提供了很好的研究素材。虽然前人通过比较染色体涂色法建立了食肉目内许多物种的染色体比较图谱，但这些研究的分辨率比较低，尚没有深入到精细的核苷酸水平，也不能在核苷酸水平研究不同食肉目物种间的共线性区块、染色体重排以
科研人员完成血吸虫基因组测序
新华网伦敦7月16日电 两个国际科研小组16日在英国《自然》杂志上发表了两篇论文，分别报告其研究人员完成了对亚洲血吸虫和非洲血吸虫的基因组测序，这些成果将有助于研发相关药物。 在16日最新一期《自然》杂志的封面上，是曾让人视为“瘟神”的血吸虫的图像，但这一次它引起注意却是因为其基因组被完全
中外科研人员绘出老虎基因组图谱
一个国际科研团队最近报告说，他们完成了对一只东北虎的基因组测序。这是人类首次获得老虎的全基因组图谱，有助研究大型猫科动物的遗传多样性和保护濒危动物。 这项研究由韩国、中国、俄罗斯、蒙古国等国科研人员共同完成，测序目标是韩国首尔一家动物园中一只9岁的雄性东北虎，历时三年绘制出它的完整基因组图
科研人员获取首个纯种绿孔雀基因组
红外相机在恐龙河自然保护区拍到的绿孔雀。受访者供图2021年，吴飞在高黎贡山进行鸟类考察。受访者供图 《生物多样性公约》缔约方大会第十五次会议（COP15）海报近日发布，和亚洲象、大熊猫等明星动物一起亮相的，还有漂亮的绿孔雀。 与大家经常在动物园中看到的蓝孔雀不同，绿孔雀是原生在中国境内的孔雀，
北京基因组研究所Plant－cell基因组研究新成果
来自中科院北京基因组研究所、荷兰瓦赫宁根大学和中科院/马普学会等10多家机构的研究人员组成的一个研究小组，通过测序及分析醉蝶花(Tarenaya hassleriana)的基因组提供了关于十字花科植物繁殖性状和基因组进化的新认识。相关研究发表在植物学权威期刊The Plant Cell杂志上
多国科研人员完成“珍珠鸟”基因组测序
测序结果将有助于研究人类语言的基因基础 4月1日出版的英国《自然》杂志刊登报告说，一个国际科研小组已完成对别称“珍珠鸟”的斑胸草雀的基因组测序，由于这种歌声动听的鸟儿学习鸣叫的过程与人类学习语言过程颇为相似，测序结果将有助于研究人类语言的基因基础。 该科研小组由美国、英国、德国等多国
科研人员建立植物基因组引导编辑技术体系
基因组编辑技术可以定向修饰植物基因组，从而大大加速植物育种的进程，是实现作物精准育种的重要技术突破。然而，作物的许多重要农艺性状是由基因组中的单个或少数核苷酸的改变或突变造成的。基于CRISPR/Cas系统的基因组编辑，可利用外源修复模板通过同源重组介导的修复方式（HDR）实现目标基因特定核苷酸
GenomeResearch发表基因组研究新发现基因组
多伦多大学的科学家们发现，作为基因组看门人的C2H2-锌指蛋白（C2H2-ZF）实际上肩负着更加多样化的职责。这项发表在Genome Research杂志上的研究，有助于我们更准确地解读个人基因组。C2H2-ZF有大约七百个成员，是规模最大的一种人类蛋白。然而，人们对这些蛋白一直知之甚少。C2H2-
荷兰科研人员首次绘出女性个人基因组图谱
荷兰科研人员5月26日说，他们首次绘出女性的个人基因组图谱，这将有助于深入研究人的遗传多样性。 荷兰莱顿大学医学中心发表的一份声明说，科研人员已测定该中心一位女性临床遗传学家的基因组序列，她是基因组被完整测序的首位女性和首位欧洲人。 基因组是指包含在生物DNA（脱氧核糖核酸）中的全部遗传信息。此前科
研究人员对蚊子蛋白探索
美国国立卫生研究院(NIH)的国家环境健康科学研究所(NIEHS)的科学家使用X射线晶体学解决了AEG12的结构。NIEHS核磁共振小组负责人，资深作者Geoffrey Mueller博士说，在分子水平上，AEG12可以将脂质或膜上的类似脂肪的部分分离出来，从而将病毒结合在一起。穆勒说：“仿佛AEG
研究人员呼吁男性接种疫苗
与人乳头瘤病毒（HPV）相关的喉癌在全球范围内惊人地上升，影响到的男性人数是女性的三倍。许多国家已经制定了疫苗接种计划，以保护女性免受与HPV相关的宫颈癌的侵害；现在是否也是男性接种疫苗的时候了？ HPV是一种常见的、通常没有症状的病毒，通过皮肤间的性接触传播。症状可能需要数年才能出现，因此人
研究人员成功改变肾脏血型
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/8/484572.shtm 目前的器官移植，除了组织相容性抗原要匹配外，还要考虑一个问题——血型匹配。如果能改造出通用血型器官，就能消除器官移植时的血型障碍，从而减少器官浪费、缩短等待时间，最终挽救更多生命
意大利研究人员集会捍卫科学
图片来源: Italia Unita per la corretta informazione scientifica 旅游者在参观罗马著名的西班牙阶梯时，同时还看到不同寻常的场面：大约30名科研人员突然出现，展开用不同语言书写的横幅和布告，静止站立在台阶上数分钟。他们的快闪行动是贯穿意大利的