Cell综述：染色质和转录动力学
组蛋白能帮助古细菌和真核生物维持其基因组的紧凑性和稳定性，形成类似核小体之类的结构也能调控DNA结合转录调控元件，以及顺式调控DNA元件的作用方式。不同类型的蛋白，比如ATP依赖性重塑酶能促进组蛋白与转录因子之间的动态竞争，从而调控染色质的组装，结合以及编辑。 5月14日最新一期Cell杂志发表了题为“Genesis of Chromatin and Transcription Dynamics in the Origin of Species”的综述文章，总结介绍了自物种起源以来，我们对于染色质以及转录过程动力学的了解，尤其是那些染色质结构上的ATP依赖性酶，以及TATA结合蛋白活性。这些知识帮助研究人员理清了分析转录调控进化，和染色质动力学进化未来的研究方向。 “模式生物DNA元件百科全书” 2003年美国启动了ENCODE计划(ENCyclopedia Of DNA Elements)，主要目的是建立人类基因组中......阅读全文
北京基因组所单细胞中识别染色质类染色质拓扑的算法
基因组DNA和组蛋白以特定的形式高度折叠在细胞核中，这一高级结构即三维基因组学，对细胞核内的诸多生命活动至关重要。基于染色质构象捕获（3C），尤其是高通量技术（Hi-C，ChIA-PET）的发展推动了三维基因组的研究，发现了包括染色质拓扑相关结构域（TAD），染色质环等一系列层次化的结构特征。近
研究揭示染色质修饰调控植物基因表达新机制
8月6日，中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所植物逆境生物学研究中心植物分子遗传国家重点实验室何跃辉研究组（与刘仁义研究组合作）和杜嘉木研究组（与美国威斯康辛大学钟雪花研究组合作）在《自然-遗传学》背靠背分别发表题为Polycomb-mediated gene silencin
染色质高级结构调控细胞命运机制研究中获进展
真核生物基因组DNA缠绕在组蛋白八聚体上形成染色质，并在染色质架构蛋白的作用下逐级折叠形成远距离的染色质相互作用（或染色质环）、拓扑相关结构域和染色质区室等染色质高级结构。远距离染色质互作可以调控基因表达，在细胞命运决定过程中具有关键作用。CCCTC结合因子（简称CTCF）最早被认为是绝缘子结合蛋白
关于细胞染色质的详述
人体内各种细胞，虽然大小不一，形态各异，功能也不相同，但它们都是生命活动的基本场所，其基本结构是一样的，细胞是由细胞核、细胞质和细胞膜组成，在细胞核中，有一种易被碱性染料染上颜色的物质，叫做染色质。其在细胞的有丝分裂期螺旋化形成染色体。它是由脱氧核糖核酸(DNA)和组蛋白组成。是 调节生物体新陈
染色质的研究发展历史
1879年，W. Flemming提出了染色质（chromatin）这一术语，用以描述细胞核中能被碱性染料强烈着色的物质。1888年，Waldeyer正式提出染色体的命名。经过一个多世纪的研究，人们认识到，染色质和染色体是在细胞周期不同阶段可以相互转变的形态结构。
染色质免疫共沉淀研究
真核生物的基因组DNA以染色质的形式存在，研究蛋白质与DNA在染色质环境下的相互作用是阐明真核生物基因表达机制的基本途径。与传统的EMSA技术相比，染色质免疫沉淀技术（ChIP）能真实完整地反映结合在DNA序列上的调控蛋白，是目前研究体内DNA与蛋白质相互作用的最佳方法。染色质免疫沉淀技术（chro
染色质基因分析可识别癌症起源
近日，美国杰克逊实验室(JAX)的研究人员开发出一种新方法，通过对开放染色质进行全基因组分析，来确定导致既定类型白血病的细胞类型。这一方法对白血病的诊疗具有重要作用。相关研究发表在《自然—通讯》杂志上。 每种癌症都始于一个单细胞的异变。知道了癌细胞的起源细胞，研究人员就可以分析出癌症的亚型
染色质DNA基因组的介绍
凡是具有细胞形态的生物其遗传物质都是DNA,只有少数病毒的遗传物质是RNA。在真核细胞中,每条未复制的染色体包含一条纵向贯穿的DNA分子。狭义而言,某一生物的细胞中储存于单倍染色体组中的总遗传信息,组成该生物的基因组。真核生物基因组DNA的含量比原核生物高得多。 突变分析结果表明,并非所有基因
染色质基因分析可识别癌症起源确定白血病源头细胞类型
美国杰克逊实验室(JAX)的研究人员开发出一种新方法，通过对开放染色质进行全基因组分析，来确定导致既定类型白血病的细胞类型。这一方法对白血病的诊疗具有重要作用。相关研究11日发表在《自然—通讯》杂志上。 每种癌症都始于一个单细胞的异变。知道了癌细胞的起源细胞，研究人员就可以分析出癌症的亚型，进
揭示基因“无用”序列稳定染色质三维结构及细胞稳态机制
人类基因组中的非编码序列在多种生物学过程中发挥着至关重要的作用，如非编码RNA、启动子、增强子和转座子等。作为在基因组中占比约98%的非编码区域，仍有大量是功能未知的，这些曾被认为是基因组中“垃圾”的区域，已被逐渐证实存在重要功能。基因组的三维结构会影响基因的转录调控或其他细胞生命活动，然而，除
由染色质调控的基因隐秘转录参与哺乳动物干细胞衰老
细胞老化有其独特而明显的分子表型特征，但其诱导机制尚不完全清楚，基因隐秘转录 (cryptic transcription) 便是其中之一。基因隐秘转录现象是指基因在某些突变体中或应激情况下，开始从本应该被抑制的下游“类启动子 (promoter-like) ”区域起始转录，并产生与基因原功能不
由染色质调控的基因隐秘转录参与哺乳动物干细胞衰老
细胞老化有其独特而明显的分子表型特征，但其诱导机制尚不完全清楚，基因隐秘转录 (cryptic transcription) 便是其中之一。基因隐秘转录现象是指基因在某些突变体中或应激情况下，开始从本应该被抑制的下游“类启动子 (promoter-like) ”区域起始转录，并产生与基因原功能不
研究揭示拟南芥基因组加倍导致的三维染色质结构
6月11日，《核酸研究》（Nucleic Acids Research）杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所植物分子遗传国家重点实验室方玉达研究组题为The effects of Arabidopsis genome duplication on the chro
中性粒细胞染色质异常凝集现象
2016年8月27日辽宁蒙医院江丽艳老师在全国形态学诊断学术交流群与大家分享的一个精彩病例，引起群内专家、老师们的极大兴趣。现将讨论精华整理成章，方便大家收藏与学习。简要病史：患者，女性，35岁，三个月前因乏力、胃疼，入住当地医院，以胃痛治疗1个月，贫血待查，输血治疗，病情未见好转；现病情加重，因头
细胞化学词汇染色质组装因子1
中文名称：染色质组装因子1英文名称：chromatin assembly factor-1;CAF-1定 义：与新生DNA链结合，特异地识别组蛋白H3和H4及H3/H4组成的四聚体。定位结合于复制叉之后，可增加H3/H4四聚体的稳定性。需经磷酸化后才有活性，其缺失将严重影响细胞周期进程，使其阻滞在
染色质的研究方法及实验依据
1、用温和的方法裂解细胞核，将染色质铺展在电镜铜网上，通过电镜观察，未经处理的染色质自然结构为30nm的纤丝，经盐溶液处理后解聚的染色质呈现一系列核小体彼此连接的串珠状结构，串珠的直径为10nm。2、用非特异性微球菌核酸酶消化染色质时，经过蔗糖梯度离心及琼脂糖凝胶电泳分析，发现绝大多数DNA被降解成
研究发现Klotho基因影响细胞衰老
众所周知，生活中经历的压力事件会让大脑提前衰老。近日，一项研究发现，基因突变与多种类型的精神压力相互作用。这些精神压力包括与细胞老化相关的创伤后应激障碍（PTSD）、疼痛和睡眠障碍。 Klotho基因（以负责纺织生命之线的希腊女神Clotho命名）被认为与长寿和各种与年龄相关的疾病有关。这是第
北京基因组所解释了细胞在热刺激反应中染色质构象改变
热刺激是细胞经常面对的环境刺激，热刺激反应是所有细胞普遍具有的刺激反应机制。热刺激诱导的广泛的转录调控是热刺激反应的重要组成部分。近年来，科学家从表观遗传学的各层面对其机制开展了研究。当前，针对染色质空间构象这一重要的表观遗传学层次，是否在热刺激反应中发挥作用以及可能的具体作用形式存在争议。此外
新技术分析单细胞的染色质构象
分析染色质构象的技术不少，但有的需要大量细胞，有的则分辨率太低。这阻碍了我们对于单细胞中染色质构象的了解。近日，瑞典卡罗林斯卡学院的研究人员在《Biotechniques》上介绍了一种新方法，能够高分辨率地分析单细胞中染色质的接近程度。 对于理解基因调控、DNA复制和修复来说，研究染色体的
羊水细胞性染色质检查的相关疾病
两性畸形，血小板型假性血管性血友病，获得性血友病，血友病乙，血友病甲，先天性睾丸发育不全，非肾上腺素增生性假两性畸形，小儿葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症，小儿血管性血友病，小儿血友病
研究揭示染色质结构和折叠机制
中国科学院生物物理研究所朱平研究组和李国红研究组合作，揭示了连接组蛋白H5介导的核小体结合和染色质折叠和高级结构形成机制。相关论文近期发表于《细胞研究》。在真核生物中，基因组DNA被分层包装到细胞核内不同层次的染色质组织中。其中，DNA缠绕在核心组蛋白组成的八聚体上组成核小体，多个核小体组成的串珠状
染色质架构蛋白CTCF结合人类基因组位点的机制研究取得..
近日，国际著名学术期刊《Cell Research》杂志在线发表了上海交通大学系统生物医学研究院比较生物医学中心吴强课题组和中科院北京生物物理所王艳丽课题组合作研究成果，“Molecular mechanism of directional CTCF recognition of a diver
羊水细胞性染色质检查的注意事项
羊水检查一般在孕中期(妊娠16-21周)进行。术前要排空尿液，两手叉腰，轻轻转动腰腹部。然后仰卧，用B超探测定位，选择好穿刺点，在严格的无菌操作条件下进行穿刺。一般抽取羊水20ml左右，放入洁净灭菌的离心管内，立即送检。
果蝇细胞中发现五种主要染色质类型
该发现构成了描述表观基因组的新框架荷兰科学家在果蝇细胞中发现五种主要染色质类型 转录活性常染色质与受阻遏异染色质的染色质传统分类曾是一个有用的模型，但它应该进行升级，以适应人们日益增加的有关染色质功能域的知识。一项在果蝇中对与蛋白质有关的53种染色质进行的大规模综合性全基
羊水细胞性染色质检查的临床意义
对有X性连锁隐性遗传病家族史者来说，父母表型正常，如母亲为致病基因携带者，其子女中儿子患病的概率是50%；女儿则表型正常，当有一半可能是携带者。当父亲为患者时，儿子全部正常，而女儿全部为携带者，如血友病A，血友病B、葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症、红绿色盲、假肥大性肌营养不良、先天性丙种球蛋白缺乏
CRISPR触发的内源Oct4或Sox2基因位点染色质重塑激活细胞
题目：CRISPR-Based Chromatin Remodeling of the Endogenous Oct4 or Sox2 Locus Enables Reprogramming to Pluripotency 期刊：Cell stem cell 影响因子：23.3
CRISPR触发的内源Oct4或Sox2基因位点染色质重塑激活细胞
题目：CRISPR-Based Chromatin Remodeling of the Endogenous Oct4 or Sox2 Locus Enables Reprogramming to Pluripotency 期刊：Cell stem cell 影响因子：23.3
徕卡LMD在研究冠状病毒对细胞NFκB信号通路和染色质...1
徕卡LMD在研究冠状病毒对细胞NF-κB信号通路和染色质分布的使用冠状病毒因为包膜上密布着类似日冕的棘突而得名，属于冠状病毒科，正冠状病毒亚科的冠状病毒属。根据血清学和基因组学特点，该属名代表了α、β、γ和δ四个属。目前已知感染人的冠状病毒包括7种，即α属的普通冠状病毒HCoV‑229E和HCoV‑
徕卡LMD在研究冠状病毒对细胞NFκB信号通路和染色质...2
他们分离了表达冠状病毒N蛋白的细胞，并提取了整个RNA。图4 借助免疫荧光和激光显微切割分离细胞株Laser microdissection实验过程：细胞接种在加入2μm 青霉素（PEN）的30mm的圆形培养皿中。免疫染色和LMD按照预定方案*进行，并进行如下修改。处理结束时，细胞用Hank'
研究发现白血病细胞也有基因弱点
英国、美国和中国香港的研究人员在美国《癌细胞》杂志上发表报告说，他们发现急性髓细胞性白血病细胞内一对基因对控制病情发展具有重要作用。研究人员未来在此基础上可开发出更有效的疗法。 急性髓细胞性白血病是白血病中的一种，以骨髓与外周血中原始和幼稚髓性细胞异常增生为主要特征，临床表现为贫血、出血、感