染色质基因分析可识别癌症起源
近日,美国杰克逊实验室(JAX)的研究人员开发出一种新方法,通过对开放染色质进行全基因组分析,来确定导致既定类型白血病的细胞类型。这一方法对白血病的诊疗具有重要作用。相关研究发表在《自然—通讯》杂志上。 每种癌症都始于一个单细胞的异变。知道了癌细胞的起源细胞,研究人员就可以分析出癌症的亚型,进而开发出新的诊疗手段,但现有方法很难从大量肿瘤细胞样本中识别出其起源细胞。 染色质是细胞核内的重要成分,由DNA、组蛋白、RNA组成,在细胞进行分裂的特定阶段会聚缩成染色体。每种类型的细胞都有一个独特的染色质结构,封闭染色质会紧紧缠绕在核小体周围,相对不活跃;开放染色质与核小体的联系程度则相对松散,也更活跃。杰克逊实验室的助理教授珍妮弗·特罗布里奇博士通过分析肿瘤细胞中的开放染色质,改进了目前识别肿瘤细胞的起源细胞的方法。 特罗布里奇带领实验室同事构建了一个急性髓系白血病(AML)的小鼠模型。他们从人类和小鼠的骨髓中找出5......阅读全文
染色质基因分析可识别癌症起源
近日,美国杰克逊实验室(JAX)的研究人员开发出一种新方法,通过对开放染色质进行全基因组分析,来确定导致既定类型白血病的细胞类型。这一方法对白血病的诊疗具有重要作用。相关研究发表在《自然—通讯》杂志上。 每种癌症都始于一个单细胞的异变。知道了癌细胞的起源细胞,研究人员就可以分析出癌症的亚型
染色质基因分析可识别癌症起源确定白血病源头细胞类型
美国杰克逊实验室(JAX)的研究人员开发出一种新方法,通过对开放染色质进行全基因组分析,来确定导致既定类型白血病的细胞类型。这一方法对白血病的诊疗具有重要作用。相关研究11日发表在《自然—通讯》杂志上。 每种癌症都始于一个单细胞的异变。知道了癌细胞的起源细胞,研究人员就可以分析出癌症的亚型,进
全基因组测序可识别癌症相关变异-有助预防护理
美国德州大学(UT)西南医学中心研究人员证明,全基因组测序可识别病人患遗传性癌症的风险,有望改善癌症的预防、诊断和护理。这项研究首次用全基因组测序评估了258个癌症病人的基因组,提高了诊断出有癌变倾向的基因变异的能力。相关论文在线发表于最近的《E生物医学》杂志上。 “全基因组测序是一种新的基因
Nat-Commun:癌症——基因突变的起源
DNA的复制是细胞分裂的前提。但是,在存在某些破坏性成分的情况下,细胞将无法很好地执行相关操作,复制过程将变得更加缓慢且效率较低,这种现象称为“复制压力”。虽然已知“复制压力”与遗传突变的增加有关,但至今仍不清楚起作用的确切机制。 最近,日内瓦大学(UNIGE)的研究人员阐明了在“复制压力”下
新算法比较分析可搜索癌症基因突变
桑福德伯翰医学研究所(Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute,SBP)承担了前所未有的对一个新兴算法类别的比较分析,该算法通过聚焦内部基因结构,在癌症数据库中挖掘遗传信息(即亚基因像素算法),这与专注于基因视其为单个单元的经典方法形成
JBC:验血可检测癌症基因
Texas大学MD Anderson癌症中心的科学家们发现,癌细胞释放到血液中的胞外体(Exosome),包含了癌细胞的整个遗传学蓝图。这一基因组数据可以用于检测癌症相关的突变,帮助医生尽早诊断癌症,以便对患者进行有效治疗。文章发表在本期的Journal of Biological Ch
Cell:新基因条码技术-识别关键癌症免疫基因
西奈山医学研究院的科学家开发了一项可以同时分析数百种基因功能的新技术,分辨率可达单细胞水平。该技术依赖于以一种新蛋白为基础的条形码技术,文章发表在《Cell》杂志。21世纪初,人类基因组计划测序了超过20000个蛋白质编码基因,至今科学家们还没能表征完所有单个基因的许多功能。人类基因组如何工作,如何
基因测试可精确判定居民先祖起源
不同国家的人群之间存在基因差异,这一点已被科学家证实,而英国的一项最新研究显示,即使同一国家不同地区的居民,其基因也存在差异。通过简单的基因测试,即可准确地测定今日城市居民的先祖起源。 世界上每个人的指纹都不尽相同,这种“唯一性”成为其身份的标志。不同人之间基因也不相同,这种差异可像
癌症耐药的起源
在过去几十年癌症治疗中,对肿瘤高特异性的靶向药物对癌症治疗起到了非常重要的作用。目前, EGFR突变肺癌是一种常见的家族遗传癌症(白血病和恶性黑色素瘤也是家族遗传癌症,这些癌症都基于在患者体内一些抑癌基因失活或突变而导致肿瘤的发生、发展)。所以,开发出有针对性的靶向药物可以有效地控制这些遗传癌症
北京基因组所单细胞中识别染色质类染色质拓扑的算法
基因组DNA和组蛋白以特定的形式高度折叠在细胞核中,这一高级结构即三维基因组学,对细胞核内的诸多生命活动至关重要。基于染色质构象捕获(3C),尤其是高通量技术(Hi-C,ChIA-PET)的发展推动了三维基因组的研究,发现了包括染色质拓扑相关结构域(TAD),染色质环等一系列层次化的结构特征。近
基因分析揭示印度人起源
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/518475.shtm南亚是世界上人口最多样化的地区之一。生活在这里的15亿人有着不同的种族身份、语言、宗教、种姓和习俗。近日,一项迄今规模最大的南亚现代全基因组分析,揭示了这个种群是如何形成的,以及有关印
EBioMedicine:全基因组测序高效识别癌症相关基因突变
UT西南医学中心癌症研究人员已经证明,全基因组测序可用于识别癌症的遗传性风险,其可以潜在地改善癌症的预防,诊断和治疗。 这是首次研究使用了全基因组测序以评估一系列258癌症患者的基因组,诊断其癌症倾向性突变情况。这项研究发表在杂志EBioMedicine上。全基因组测序是新的基因工具,能够确定
基因检测可提高癌症治愈率?
据报道,三年前,弗雷德-巴克(Fred Barker)被诊断出患有一种罕见的肾上腺恶性癌症,多数患上此病的人寿命将少于半年。而高度复杂的基因测试改变了癌症的治疗方式,也使得弗雷德的生命延续了将近三年。 这项测试的目的是寻找特定的肿瘤基因,之后便可以对病人进行针对性的药物治疗。这个月初,美国临床
JBC:染色质重塑与癌症
染色质的结构变化又称为染色质重塑(Chromatin remodeling),染色质重塑调节着基因转录、DNA修复、程序性细胞死亡等多种细胞基础过程。Stowers医学研究所的科学家们在前期研究的基础上深入解析了染色质重构的调控机制。 Stowers 研究所的研究人员进行了一系列生化实
Science揭示惊人的癌症起源
波士顿儿童医院的研究人员第一次在活体动物中,显影了癌症起源于第一个受累细胞的过程并观察了它的扩散。他们的研究工作有可能会改变科学家们认识黑色素瘤及其他癌症的方式,促使开发出一些新的早期治疗方法阻止癌症扎根。相关论文发表在1月29日的《科学》(Science)杂志上。 论文的第一作者、波士顿儿童
一种全新肿瘤发生机制:增强子劫持
肿瘤细胞中有着大量的基因组结构变异(Structural Variation/SV),比如基因组的缺失、重复、倒位、异位等。一些很重要的结构变异已被证明和肿瘤的发生息息相关,并被用于肿瘤的分型与预后诊断,成为设计靶向治疗药物的重要依据。然而过去的研究大多数集中在SV介导的融合基因,比如由白血病中
研究发现一基因变异可致多种癌症
日本自治医科大学的研究小组2月5日在美国《国家科学院院刊》网络版上报告说,他们发现了一种会导致乳腺癌、皮肤恶性黑素瘤等多种癌症的基因,这一发现将促进研发以这种基因为靶点的新型抗癌药物。 研究小组利用独立研发的手法,观察了一名30多岁的纤维肉瘤患者的癌细胞,发现基因RAC1发生变异后,会作为
单倍体基因的起源
人类基因组中的单倍型源于人类有性生殖的分子机制和我们作为一个物种的历史。除性细胞外,染色体在人类细胞中成对出现。其中一条染色体来自父方,另一条来自母方。但染色体在一代代的传递过程中并不是一成不变的。在精子和卵细胞形成的过程中,染色体对发生重组,即一对染色体中聚集到一起并交换片段。由此产生的杂合染色体
研究提出可用于癌症驱动基因识别的图机器学习模型
当前,全球癌症患者数量呈逐年上升趋势。癌症驱动基因识别在探讨癌症的发生机制中扮演着重要角色,能够为个性化精准治疗提供策略。而现有方法在泛化性和可解释性方面面临挑战。中国科学院新疆理化技术研究所科研团队与合作者,提出了可用于癌症驱动基因识别的图机器学习模型。这一模型融合人工智能与生物医学的优势,具备可
一滴血可测出癌症驱动基因
癌症为何可以轻易打倒我们?我们又该如何反击?科学界和医学界一直在努力探索。昨天,由南京医科大学第一附属医院(暨江苏省人民医院)肿瘤中心主办的第七届“南京肿瘤临床与转化医学论坛暨金陵肿瘤学高峰论坛”在宁召开。参会专家认为,现代癌症高发,除了老龄化的实际问题,和现代人的生活习惯和心态有着很大关系。据
16种常见癌症可做预测性基因检测
研究人员正在进行肿瘤组织基因组提取。 随着癌症发病率逐年上升,癌症基因检测愈发流行。基于自身健康的考虑,一些高危人群开始主动进行癌症基因检测。目前,癌症基因检测还处于发展阶段,多数用于肿瘤的靶向治疗以及临床疾病的药物治疗,不过我国现在已有16种常见癌症变异基因被破译,可做预测性基因检测。 精
研究发现与癌症发生有关的可靶向基因
由乔治城大学伦巴狄综合癌症中心(Georgetown Lombardi Comprehensive Cancer Center,Georgetown Lombardi)研究人员领导的一个研究小组完成了对一种新基因融合的分析,这是目前为止对该基因最大型的分析。他们认为这种基因融合会导致患多种类型癌
NEJM:免疫系统如何识别癌症
近日,一项发表于国际杂志New England Journal of Medicine上的研究报告中,来自英国癌症研究中心的研究人员在癌细胞表面鉴别出了一种新型分子,其可以使得机体免疫系统对癌细胞进行识别并且破坏,该研究或为开发新一代有效的免疫疗法来治疗癌症患者提供一定的思路。 研究者Serg
Illumina发布癌症临床研究新品,可检测170个基因
Illumina公司(纳斯达克股票代码:ILMN)近日发布TruSight® Tumor 170,这是一个可以检测170个基因的新一代测序解决方案,标志着肿瘤谱分析从一系列单基因检测向多基因检测的方法转变,为肿瘤基因组提供了更加全面的视图。 TruSight Tumor 170提供了一套整合D
日发现一种可致多种癌症的基因
日本自治医科大学的研究小组5日在美国《国家科学院学报》网络版上报告说,他们发现了一种会导致乳腺癌、皮肤恶性黑素瘤等多种癌症的基因,这一发现将促进研发以这种基因为靶点的新型抗癌药物。 研究小组利用独立研发的手法,观察了一名30多岁的纤维肉瘤患者的癌细胞,发现基因RAC1发生变异后,会作为癌症
Illumina发布癌症临床研究新品,可检测170个基因
llumina公司(纳斯达克股票代码:ILMN)近日发布TruSight® Tumor 170,这是一个可以检测170个基因的新一代测序解决方案,标志着肿瘤谱分析从一系列单基因检测向多基因检测的方法转变,为肿瘤基因组提供了更加全面的视图。 TruSight Tumor 170提供了一套整合DN
靶向|研究称基因检测可提高癌症治愈率
三年前,弗雷德-巴克(Fred Barker)被诊断出患有一种罕见的肾上腺恶性癌症,多数患上此病的人寿命将少于半年。而高度复杂的基因测试改变了癌症的治疗方式,也使得弗雷德的生命延续了将近三年。 这项测试的目的是寻找特定的肿瘤基因,之后便可以对病人进行针对性的药物治疗。这个月初,美国临床肿瘤年会
破解全新基因起源之谜
近日,中国科学院植物研究所研究员郭亚龙与合作者提出了一个“全新基因通过与复制产生的新基因协作整合到已有的基因调控网络中”的实例。相关成果发表于国际学术期刊Molecular Biology and Evolution。全新基因指起源于非编码序列的基因,是新基因的重要来源。全新基因的起源及其生物学功能
基因的历史和起源
基因是控制生物性状的基本遗传单位。19世纪60年代,奥地利遗传学家格雷戈尔·孟德尔就提出了生物的性状是由遗传因子控制的观点,但这仅仅是一种逻辑推理。20世纪初期,遗传学家摩尔根通过果蝇的遗传实验,认识到基因存在于染色体上,并且在染色体上是呈线性排列,从而得出了染色体是基因载体的结论。1909年丹麦遗
一滴血检测癌症靠谱吗?基因检测可预测癌症风险
“一滴血检测癌症”的新闻近日在朋友圈刷了屏,已经有多家媒体和机构出来强力辟谣。但是,一滴血虽然无法检测癌症,却能预测癌症。记者从中山大学孙逸仙纪念医院获悉,该院细胞分子诊断中心在广东省率先正式开展BRCA1/2基因高通量测序检测服务。普通人群可以据此“查三代”,看看自己以及后代是否有乳腺癌或卵巢