Cell推出免费综述特辑：癌症的72变
阿 癌症一直被认为是一种逃离正常状态的急速增长疾病，其细胞的生长已经发生了变化。然而尽管这么多年来，科学家们已经发现了这种疾病会随着时间的推进，出现新的突变，但是近期基因组测序研究，以及单细胞分辨率技术却帮助我们解决了癌症是如何变化发展这一谜题。 Biological and Therapeutic Impact of Intratumor Heterogeneity in Cancer Evolution Perspective Nicholas McGranahan, Charles Swanton Cancer Cell 推荐理由：免疫治疗为个体化癌症治疗带来了许多希望，但这一方法要取得成功，需要考虑到肿瘤的变化过程。两位学者在一篇综述中探讨了整合肿瘤异质性信息与治疗方案发展带来的挑战。大家可以从这篇综述中了解到基因组稳定性如何影响癌症发展，以及这对于药物研发意味着什么。 Lessons from the C......阅读全文
－Nature：基因组复制或为解析癌症进化提供线索
有机体细胞中的基因组拷贝数越多，细胞或越易于从生长和适应中获益。近日，一篇刊登于国际杂志Nature上的研究论文中，来自克瑞顿大学（Creighton University）的研究人员通过对酵母菌的研究发现，多倍体或许可以极大地帮助细胞去适应周围的环境，多倍体即有机体细胞中的基因组拷贝数超过2倍
什么是基因组进化？
基因组不仅仅是生物体基因的总和，基因组还含有其它可以考虑特定基因及其产物的特征。复制在基因组的塑造过程中起了重要作用。复制的范围包括短串联重复序列的延伸、基因簇的复制、整个染色体甚至整个基因组的复制。这种复制可能是创造遗传新性状的基础。
基因组的进化特征
基因组不仅仅是生物体基因的总和，基因组还含有其它可以考虑特定基因及其产物的特征。复制在基因组的塑造过程中起了重要作用。复制的范围包括短串联重复序列的延伸、基因簇的复制、整个染色体甚至整个基因组的复制。这种复制可能是创造遗传新性状的基础。
创新计算框架揭示癌症“进化策略”
西班牙巴塞罗那生物医学研究所团队开发出一种名为DiffInvex的创新计算框架，其可追踪健康细胞转变为肿瘤，以及肿瘤在化疗过程中的基因进化压力。DiffInvex被应用于超过11000个样本，涵盖了大约30种不同组织类型的人类癌症和健康组织的基因组数据，成功识别出导致肿瘤对治疗“负隅顽抗”的路径
癌症不可能被治愈：新研究揭示癌症进化根源
将癌症追溯到多细胞生物起源的时期，有助于了解癌症的神秘特性和转换治疗癌症的思维方式。 美国亚利桑那州立大学Paul Davies及澳大利亚国立大学的Charles Lineweaver近日提出一种新的看待癌症的角度，即将癌症进化的根源追溯到多细胞生物数十亿年前的起源时期。如果他们的理论
《Nature－Genetics》解读肿瘤利器，预测癌症进化
伦敦玛丽王后大学的研究人员开发了一款计算分析模型，可用于预测肿瘤进展。这项研究发表在《Nature Genetics》，目的是让临床医生具备预测肿瘤生长轨迹的能力，从而先发制人地控制病程和选择相应治疗方案。 研究人员采用亚克隆选择计算模型和适用于高通量测序数据的理论种群遗传学来监测人类癌症克隆
关于基因组的大小和进化介绍
1、基因组大小： 基因组大小是一个拷贝的单倍体基因组中DNA碱基对的总数。 基因组大小与原核生物和低等真核生物的形态复杂性呈正相关 [8]。然而，在软体动物和上述所有其它高等真核生物之后，这种相关性已不再存在 [8]，主要是因为重复DNA的缘故。 2、基因组进化： 基因组不仅仅是生物体基
蝴蝶基因组大小进化进展－发现表型多样性进化遗传基础
蝴蝶因其丰富的形态多样性，自达尔文时代就作为研究物种适应性进化的重要类群之一，近几年更被认为是研究形态遗传、进化和发育的理想模型，已成为发育生物学、进化生物学、种群遗传学、保护生物学和生态学等研究领域的重要模式生物之一。 中国科学院昆明动物研究所科研团队在2015年完成所有蝴蝶模式种金凤蝶及其
国际癌症基因组联盟公布逾1万个癌症基因组数据
国际癌症基因组联盟(International Cancer Genome Consortium，简称"ICGC")近日向科研界公布了超过1万个癌症基因组的数据。这些数据能更好地帮助全世界的癌症研究者从基因方面了解癌症，加快对癌症的研究并帮助更多癌症靶向治疗的发展。 安大略癌症研究所所
BBC：癌症是进化过程的副产品
人类能够最终打赢“癌症战争”吗？ 最新的数据表明，人类离赢得“癌症战争”还有太远的距离。根据美国癌症协会(American Cancer Society)的最新数据统计，在美国，一个男性一生中患癌症的风险是42%，女性是38%。在英国，这一数字甚至更糟。根据英国癌症研究所（Cancer Res
基因组研究揭示欧洲马铃薯进化史
近日，来自德国、秘鲁、英国和西班牙的一个国际研究团队，对大量的马铃薯品种进行了测序，以了解更多关于现代欧洲马铃薯的历史。在他们6月24日发表在Nature Ecology and Evolution上的论文中，该团队描述了他们对马铃薯历史的研究以及新发现。 过去的研究表明，马铃薯是在17世纪被
最新果蝇基因组测序，展现奇妙的进化
对真核生物进行全基因组测序在二十世纪还是一项了不起的大工程，直到2000年末人们还只完成了四项这样的研究。不过自那以后，测序技术的飞速进步使全基因组测序对于许多研究团队来说触手可及，现在每隔不久就会涌现出一项新的测序成果。日前，维也纳兽医大学Christian Schlötterer研究组的
基因组测序揭示须鲸的罕见进化模式
单一物种如何演化成两个新物种？进化学家给出的答案通常是地理隔离。不过，有时没有地理隔离也能产生新的物种，这种罕见的情况被称为同地物种形成（sympatric speciation）。根据瑞典和德国的最新研究成果，须鲸正是经历了这种同地物种形成。 文章的共同第一作者、德国法兰克福大学的Fritj
Nature：科学家成功追踪癌症的进化机制
近日，一项刊登在国际杂志Nature上的研究报告中，来自德国Max Delbruck分子医学中心的科学家们通过研究发现，癌症会在某些细胞中获得或失去大量染色体，而在另一些细胞中则不会，这一过程或许就提示癌症正在发生进化或对某些偏好特征会进行选择，研究者指出，这种现象在包括乳腺癌、结直肠癌和肺癌等
实体瘤3D模型展现癌症“进化之路”
近日，来自美国的研究人员在著名国际学术期刊nature上发表了一项最新研究进展，他们开发了一种计算机模型能够同时反映实体瘤的3D形状和遗传进化。这一新模型的建立对于解释癌细胞中为什么存在很多遗传突变，驱动性突变如何在整个肿瘤中传播以及肿瘤的药物抗性如何进化等疑难问题具有重要意义。 虽然之前一些
The－Lancet－HIV：新研究揭示HIV基因组进化历程
美国的每个地区都跟踪艾滋病毒病例，并对病毒的基因组进行测序以观察其是否对目前的药物有抗药性的做法。最近，当地卫生部门和疾病控制和预防中心（CDC）已开始使用这些HIV基因序列来追踪病毒的传播史。 这些信息使研究人员和公共卫生官员能够建立传播网络，即具有遗传相似HIV的人群。传播网络有助于确定哪
基因组测序揭示多细胞生物进化之谜
最近，研究人员通过对各种绿藻进行基因组测序，已经接近于解开了“引起多细胞生物的遗传变化”的谜团。 从单细胞生物到多细胞生物的过渡，是地球上生命进化的关键进步；在不同的系统发育谱系中，这种改变已经独立地发生了多次。了解“有多少基因以及有哪些基因，对单细胞祖先成为多细胞来说是必要的”，是一个有趣的
基因组测序揭示龟鳖躯体发育及进化机制
龟鳖类有着漫长且成功的演化历史，是形态学上最为特化的爬行动物之一。全球共有龟鳖类动物13科、89属、270余种，被分为两个特征明确的支系 ——侧颈龟亚目和曲颈龟亚目。中华鳖和绿海龟分别是曲颈龟中鳖类和海龟类的典型代表，对其进行基因组学研究，有助于理清龟鳖类系统发育及其躯体进化机制。 日
基因组测序挑战由来已久的进化理论
在Lewis Carroll写的《爱丽丝魔镜之旅》（Through the Looking-Glass）这本书中，红皇后向爱丽丝解释说：“你必须尽力地不停奔跑，才能使你保持在原地。”用中国话说就是“逆水行舟，不进则退”。 在逆水中要保持在原来的地方，也要不停地尽力地划。或者更形象地比喻为鱼儿在急
海马基因组及环境适应进化机制获揭示
记者从中国科学院南海海洋研究所获悉，由该所研究员林强课题组主导，联合德国康斯坦茨大学、新加坡国家科技局和华大基因等共同揭示了海马在海洋近岸和岛礁栖息过程中的体型特化和繁殖适应性进化特征。相关研究12月15日以封面文章的形式发表在《自然》杂志上。 林强团队在国际上率先完成了海马的全基因组研究，揭
高原鱼类进化与功能基因组学科组
青海湖裸鲤（Gymnocypris przewalskii），隶属于鲤科裂腹鱼亚科，是国家二级保护动物，仅分布于典型高原咸水湖泊—青海湖中，是维持青海湖“水-鸟-鱼”生态链稳定的核心物种。青海湖裸鲤是鲤科鱼类中唯一一种适应青海湖高盐碱水环境的自然群体，是研究高原鱼类适应进化的良好素材。青海湖裸鲤
基因组新数据或改写人类进化史
新的人类进化模型表明，人类起源于非洲大陆的多个祖先种群。5月17日发表在《自然》杂志上的一项新研究对主流理论提出了挑战，认为智人是从非洲多个不同的种群进化而来的，在经历了长期的基因混合后，最早可检测到的分裂发生在12万至13.5万年前。 在检测非洲当前种群的遗传物质，并将其与那里早期智人种群的现有
Science专题：癌症基因组学
在2001年完成人类基因组测序后，许多的研究人员立即将目光放到了利用这些信息来更好地了解遗传学上。最近，越来越多的研究确定了表观遗传学在癌症的发生、形成及发展过程中起效应。从鉴别与遗传性癌症相关的单基因变异的前基因组时代转向，测序技术的进步使得研究人员能够利用全基因组方法来检测基因组间的差异，以
Cell年度综述：癌症基因组入选
Cell杂志创刊于1976年，现已成为世界自然科学研究领域最著名的期刊之一，并陆续发行了十几种姊妹刊，在各自专业领域里均占据着举足轻重的地位。近期Cell杂志盘点了2013年度最佳综述及最佳论文，其中热门技术CRISPR也登上了榜单，相关论文描述了利用基因调控系统 CRISPR/Cas，一步
Nature公布800个癌症基因组
来自癌症基因组计划的科学家们近期报告了他们最新的癌症基因组研究成果，他们公布了800个乳腺癌的遗传特征，包括发现了导致乳腺癌最常见的形式的遗传原因，为新的治疗靶点提供线索，并确定乳腺癌和卵巢癌一种亚型之间的分子遗传相似性。 这项研究结果有助于更全面的了解每种乳腺癌亚型背后的分子机制，相关成
科学家掌握了癌症的“进化史”，攻克癌症不再是难题
能够预测肿瘤细胞对药物的耐药性或敏感性是癌症精确治疗的关键成功因素。但是，这样的预测是很难做到的，因为肿瘤的基因改变随着时间的推移而动态变化，而且通常是相互依赖的，这是一种缺乏了解的模式。 瑞士洛桑大学生物信息学研究所最近的一项研究为预测癌症的耐药性提供了一个很有前景的框架，他们预测了大约50
癌症基因组——癌症研究和云计算的里程碑
图片来源：https://www.nature.com/articles/d41586-020-00308-w 2001年，人类基因组计划完成，整个计划花费约30亿美元，1985年提出，1990年正式启动，历经十余年。肿瘤是最热门的研究领域之一，该领域的研究者们一直希望可以借助测序手段去表征肿瘤的
Nature－Methods：科学家成功使用AI预测癌症进化
一个来自英国和美国的联合研究团队已经开发出了一种使用人工智能预测肿瘤可能如何改变以及如何在病人体内传播的方法，相关研究成果于近日发表在《Nature Methods》上，题为“Detecting repeated cancer evolution from multi-region tumor
《癌症：进化的遗产》中文版出版－陈竺作序
《癌症：进化的遗产》，[英]格里夫斯著，闻朝君译，上海科学技术出版社2010年12月出版，定价：48.00元 癌症严重威胁人类健康。尽管近年来癌症研究不断取得新的突破，但尚有许多难题有待破解，癌症治疗总体效果也不尽如人意。英国皇家学会会员、英国医学科学院院士麦尔·格里夫斯从
Nature:实体瘤3D模型展现癌症“进化之路”
近日，来自美国的研究人员在著名国际学术期刊nature上发表了一项最新研究进展，他们开发了一种计算机模型能够同时反映实体瘤的3D形状和遗传进化。这一新模型的建立对于解释癌细胞中为什么存在很多遗传突变，驱动性突变如何在整个肿瘤中传播以及肿瘤的药物抗性如何进化等疑难问题具有重要意义。 虽然之前一些