创新计算框架揭示癌症“进化策略”
西班牙巴塞罗那生物医学研究所团队开发出一种名为DiffInvex的创新计算框架,其可追踪健康细胞转变为肿瘤,以及肿瘤在化疗过程中的基因进化压力。DiffInvex被应用于超过11000个样本,涵盖了大约30种不同组织类型的人类癌症和健康组织的基因组数据,成功识别出导致肿瘤对治疗“负隅顽抗”的路径,并指出了哪些基因可能引发耐药性。该研究结果发表于最新一期《自然·通讯》杂志。 正如物种在世代间适应环境一样,人体内的细胞在其生命周期中也会积累DNA变化。虽然大多数变化是无害的,但某些“驱动”突变会赋予细胞生长优势,可能导致癌症的发生。而化疗本身作为一种选择压力,促使细胞进一步发生基因改变,最终可能导致肿瘤复发。 尽管化疗仍然是当前癌症治疗的核心手段之一,但许多肿瘤最终都会产生耐药性。由于化疗会引起新的DNA损伤,并且患者往往需要接受多种药物联合治疗,因此要明确究竟是什么原因让癌细胞在化疗中存活下来。这一直是非常巨大的挑战。 ......阅读全文
创新计算框架揭示癌症“进化策略”
西班牙巴塞罗那生物医学研究所团队开发出一种名为DiffInvex的创新计算框架,其可追踪健康细胞转变为肿瘤,以及肿瘤在化疗过程中的基因进化压力。DiffInvex被应用于超过11000个样本,涵盖了大约30种不同组织类型的人类癌症和健康组织的基因组数据,成功识别出导致肿瘤对治疗“负隅顽抗”的路径
研究创新性提出了癌症免疫调控框架
近日,四川大学华西医院泌尿外科教授杨璐团队以创新性视角系统梳理肠道菌群代谢物在肿瘤免疫调控中的作用机制,首次提出“代谢物–免疫通路–肿瘤”的整合框架。该研究为寻找新的免疫调节靶点、设计代谢物导向的联合治疗策略提供了系统的理论支撑和图谱式参考。相关综述文章于12月3日发表于《分子癌》上。综述围绕“肠道
研究提出跨物种全脑精准映射计算框架
中国科学院生物物理研究所李昂研究组联合王晓群研究组开发了名为TransBrain的计算框架,首次实现了人类和小鼠全脑表型的高精度映射。相关论文近日发表于《自然-方法学》,并以研究简报形式进行了专题报道和评价。在长达数千万年的进化历程中,灵长类大脑相比于啮齿类动物发生了大规模的重组,特别是皮层区域经历
无人驾驶测试验证计算框架系统问世
近日,西安交通大学与清华大学、中科院自动化所等单位合作,在《科学—机器人学》上发表论文,报道了该联合研究团队历经10年实现的一种无人驾驶测试与验证的平行计算框架及其系统。 实现无人驾驶是人工智能领域面临的重大挑战之一,应对这一挑战需要发展一种新的图灵测试方法,以测试和验证无人车对复杂交通场景的
量子计算机与超级计算机“协同学习”框架发布
记者13日从安徽省量子计算工程研究中心获悉,支持量子计算机和超级计算机“协同学习”的量子机器学习框架——VQNet2.0发布,该框架可与量子计算操作系统深度结合,支持同时调度量子和经典计算资源进行机器学习的训练与预测。 本次发布的量子机器学习框架由合肥本源量子计算科技有限责任公司开发。据安
创新计算框架在蛋白质设计方面获突破
在今年诺贝尔化学奖表彰计算蛋白质设计领域的重大进展后,美国能源部阿贡国家实验室团队宣布开发出一种名为MProt-DPO的创新计算框架,该框架利用人工智能(AI)和世界顶尖的超级计算机,推动蛋白质设计取得新突破。这一成就标志着向AI自主科学发现迈出了重要一步。利用MProt-DPO框架,科学家设计了一
癌症基因组——癌症研究和云计算的里程碑
图片来源:https://www.nature.com/articles/d41586-020-00308-w 2001年,人类基因组计划完成,整个计划花费约30亿美元,1985年提出,1990年正式启动,历经十余年。肿瘤是最热门的研究领域之一,该领域的研究者们一直希望可以借助测序手段去表征肿瘤的
科学家提出深度学习框架用于发现癌症中的新突变
全基因组染色质构象捕获技术(Hi-C技术)已被证明是检测人类基因组中结构变异(SVs)的一种有效方法。然而,目前能够使用Hi-C数据进行全范围检测SVs的算法一直缺乏。目前的方法只能在不太理想的分辨率下,识别染色体间易位和长距离染色体内SVs(>1 Mb)。美国西北大学范伯格医学院研究人员基于深
siRNA表达框架
siRNA表达框架(siRNA expression cassettes,SECs)是一种由PCR得到的siRNA表达模版,能够直接导入细胞进行表达而无需事前克隆到载体中。这个方法最早是由Castanotto和其同事采用,包括一个RNA polⅢ启动子,一段发夹结构siRNA,一个RNA pol I
科学报告:化学计算能够预测癌症的发生
最近,赖斯大学的科学家们开发出了一种鉴别癌前体细胞何时会变成成熟的癌症的方法。 血液中的生物标记物可能会揭示出突变的细胞是否已转向形成肿瘤,以及这一过程可能需要多长时间(取决于癌症类型)。这可以使患者意识到他们生病之前面临的风险。 在最近一项研究中,Anatoly Kolomeisky与博士
左小磊等合作开发基于DNA框架的多维癌症诊断分子分类器
准确反映临床行为的疾病分子分类奠定了精准医疗的基础。计算机内分类器的发展加上基于DNA反应的分子实现标志着更强大的分子分类的关键进步,但处理多种分子数据类型仍然是一个挑战。 2023年3月27日,上海交通大学左小磊作为通讯作者在Nature Nanotechnology在线发表题为“DNA-f
计算机技术还能帮助揭示癌症恶化的分子机制!
近日,费城儿童医院(CHOP)领导的一项研究揭示了蛋白质可变剪切与促癌基因之间的联系。相关结果发表在《PNAS》杂志上。 文章作者,计算与基因组学中心主任Xing博士说:“我们的研究为癌症驱动基因与选择性剪接之间的关系提供了见解,这些发现可用于指导靶向可变剪接的癌症疗法的发展”。 选择性剪接
计算机程序可以诊断和定位血液样本中的癌症
美国研究人员开发了一种计算机程序,可以在检测癌症的同时从患者的血液样本中识别癌症病灶在身体中的位置。该研究项目公开发表在近期出版的《基因生物学》期刊上。 来自加利福尼亚大学洛杉矶分校的联合作者周茉莉教授表示:“癌症的非侵入性诊断很重要,因为它能够诊断早期癌症,癌症越早被确诊,病人被治愈的几率就
大脑组织的新框架
“功能性磁共振成像显示大脑有一个全球一致的空间结构,但科学家们还没有就正确的方式来编目这种结构达成共识。我们证明,少量的时空模式可以完成这项工作,”加州大学洛杉矶分校神经科学和人类行为研究所大脑连接与认知实验室主任、精神病学和生物行为科学教授 Lucina Uddin说。该实验室的统计学家、该研究的
人类激酶计算机模型有望帮助开发新型癌症疗方法
近日,一项刊登在国际杂志Journal of Chemical Information and Modeling上的研究报告中,来自加州理工州立大学的科学家们通过研究开发了一种人类MEK1蛋白计算机模型,MEK1是科学家们有望开发多种人类癌症疗法的潜在药物靶点。图片来源:theconversat
siRNA表达框架的技术特点
siRNA表达框架(siRNA expression cassettes,SECs)是一种由PCR得到的siRNA表达模版,包括一个RNA pol Ⅲ启动子,一段发夹结构siRNA,一个RNA pol Ⅲ终止位点,能够直接导入细胞进行表达而无需事前克隆到载体中。和siRNA表达载体不同的是,SECs
框架断路器机构故障
框架断路器机构故障往往由于机构不紧凑,弹簧和连杆配合不好,或者弹簧错位,甚至掉落,造成手动电动都合不上闸,在检查时仔细观察各机械部件有没有脱落、变形损坏,进行相应的复位调整修复。如连杆大件损坏无法修复的,只能联系厂家派技术人员修理或更换相关部件。
关于siRNA表达框架的介绍
siRNA表达框架(siRNA expression cassettes,SECs)是一种由PCR得到的siRNA表达模版,包括一个RNA pol Ⅲ启动子,一段发夹结构siRNA,一个RNA pol Ⅲ终止位点,能够直接导入细胞进行表达而无需事前克隆到载体中。和siRNA表达载体不同的是,SE
新型计算模型有望向癌症个体化疗法迈进一步
-近日,一项刊登在国际杂志EbioMedicine上的研究报告中,来自赫尔辛基大学等机构的科学家们通过研究开发了一种新型计算模型—结合重要性评分(CES,Combined Essentiality Scoring)模型,其能准确识别出癌细胞中必要的基因,从而帮助开发新型抗癌药物。 图片来源:U
研究提出“植物菌根协同”新框架
在全球森林退化加剧与气候变化威胁的背景下,以提升地上碳储量为目标的森林恢复策略面临着土壤碳库恢复滞后、生态系统多功能性提升不足等问题。中国科学院华南植物园科研团队联合德国、美国、捷克、荷兰和意大利等国家的研究人员,系统阐述了植物-菌根共生体在地下碳库形成与生态系统多功能性维持中的核心调控作用,并
《公众科学素质测评指标框架》发布
11月30日,以“提升科学素质 共建绿色家园”为主题的2021世界公众科学素质促进大会在京举办。大会发布了世界公众科学素质组织筹委会2021形成的主要工作成果《公众科学素质测评指标框架》,旨在服务、指导不同国家和地区以“开放、信任、合作”的态度,对公众科学素质进行科学测量和精准施策。公众科学素质的测
NFC芯片选型设计及电路框架
RFID 作为一项专业度较高的技术,在一些公司,可能还会专门招聘专业的 RFID 工程师。本篇阐述的涉及到的只是基本选型设计、电路框架,关于 RFID 天线调试、低功耗检卡调试等,后续再其他篇章会继续更新! NFC(Near Field Communication)芯片选型: 主
框架断路器怎么处理13868302777
框架断路器主要用于保护低压电气设备,使之免受过电流、欠电压、短路等不正常情况下的危害,正常条件下也可作为线路的不频繁操作之用。框架断路器也称万能式断路器。这种断路器一般都有一个钢制的框架。所有的零部件均安装在框架内,其容量较大,并可装设多种功能的脱扣器的较多的辅助触头,由不同的脱扣器组合可以构成不同
siRNA表达框架制备方法的特点
siRNA表达框架(siRNA expression cassettes,SECs)是一种由PCR得到的siRNA表达模版,包括一个RNA pol Ⅲ启动子,一段发夹结构siRNA,一个RNA pol Ⅲ终止位点,能够直接导入细胞进行表达而无需事前克隆到载体中。和siRNA表达载体不同的是,SECs
框架式断路器的安装
1安装的环境要求 断路器应安装在干燥、无尘、无侵蚀性气体、无爆炸危险介质的环境中,不能受到撞击。如环境满足不了这种条件,就应相应提高成套设备的防护等级。温度、湿度、海拔环境要求见下表 项目 规范 周围温度 –5℃~+40℃且24h平均值不超过+35℃ 相对湿度 最高温度为+40℃时,空气
探索嵌入式应用框架(EAF)(二)
M2M的应用框架鉴于 M2M 技术的特点, 系统设计者可能不得不从头开始构建整个 M2M 体系结构。其核心是, M2M 技术包括增加一个装置或设备的智能服务, 并将该设备与可以监控或控制该设备的后端基础设施连接起来。 为了实现这一目标, 一个 M2M 设备使用了两个基本元素: 与
郑大制备手性金属有机框架材料
近日,郑州大学化学与分子工程学院麦松威院士实验室制备出一种结构新颖的手性金属有机框架结构(MOF)材料。相关研究内容发表在化学类顶级期刊《美国化学会志》上。 该材料实现了铁电和颜色的双开关行为,并通过精确的晶体结构解析合理解释了这种双开关机理。审稿人一致认为该工作为探索水分子基铁电MOF材
中国岩石圈时空演化框架建立
记者胡其峰2月7日从中国地质科学院获悉,由中科院院士李廷栋等主持的“中国岩石圈三维结构”研究获得重大突破,科学家系统总结和论述了全国及重点区段岩石圈结构构造及其演化、地球物理场及地球化学场的基本特点,划分了中国岩石圈构造单元,初步建立了中国岩石圈的时空演化框架;这一研究成果大幅提高了我国岩石圈的
宁夏食药检验检测框架初步形成
3月16日,在宁夏食品药品监管业务能力建设工作会议上,自治区食药监局局长武晓平表示,我区将下大力气改进食药监管面临的技术能力不足等问题。 据悉,目前全区共有食品药品检验检测机构22家,基本可以涵盖“四品一械”生产、流通、消费等各个环节。同时,新组建的审评认证中心填补了我区食品药品生产经营准入
中德联合研发出蛋白晶体框架材料
近日,德国亥姆霍兹柏林研究中心和复旦大学江明院士课题组将伴刀豆球蛋白A与辅助分子(碳水化合物)以及罗丹明连接起来,帮助蛋白质对称排列,联合研究开发出了一种全新的材料——蛋白质晶体框架材料,形成高度稳定的晶体,而且形成了可控制的互穿网络。在这一过程中,碳水化合物首先与蛋白结合,然后罗丹明开始二聚化