西班牙女教授被指控论文造假《细胞》展开调查
《细胞》出版社（Cell Press）接到匿名举报，声称西班牙巴塞罗那基因调控中心（Centre for Genomic Regulation）Maria Pia Cosma教授发表的三篇《细胞》系列论文数据造假。随后，《细胞》出版社展开一系列调查。 3月份，有网友在Pubpeer上指控Maria Pia Cosma发表在《细胞》旗下的三个杂志《细胞》（Cell），《分子细胞》（Molecular Cell ），《分子与细胞生物学》（Molecular and Cellular Biology）上的三篇文章中关于蛋白印迹和染色质免疫沉淀的数据出现重复利用，随后便引起网友激烈讨论。 澳大利亚墨尔本Walter—Eliza Hall 医学研究所细胞生物学家David Vaux称，通过仔细研究这三篇文章中的数据，他个人认为文章中数据有太大相似的地方，但不排除编辑原始数据时出现问题的可能。 论文的第二作者，英国牛津大学Kim ......阅读全文
单细胞数据细胞分类与功能挖掘的基因分析法介绍
接触过单细胞转录组数据的小伙伴们都知道，数据的核心结果在于根据每个细胞的基因表达数据，来对细胞进行分群分类。现有通用的分析思路如下：首先根据转录组稀疏矩阵，通过计算和分析，找到不同的细胞Cluster，并找到每一类集群的Marker基因。根据已有对细胞特定Marker基因的认识，来对细胞可能的集
基于单细胞数据理解细胞变化过程—拟时间序列分..（三）
此外，根据细胞类型分类，我们也可以将差异基因沿着拟时间轨迹绘制不同类型细胞基因表达散点图：图8差异基因拟时间表达轨迹图最后，根据拟时间序列轨迹，我们把特征差异基因表达变化进行聚类，以热图形式展示基因的变化过程： 图9 差异基因聚类热图因此，通过拟时间序列分析，我们可实现构建细胞变化轨迹途径，并能找到
基于单细胞数据理解细胞变化过程—拟时间序列分..（一）
单细胞检测技术的发展为我们理解复杂生命体中细胞的组成与各自功能及变化过程提供了强有力的工具。基于单细胞基因表达谱数据，我们可以窥探发育过程中细胞内的调控变化，发现肿瘤微环境中的各类细胞及它们的细胞间交流，理解器官组织中复杂多样的细胞类型。现有单细胞研究是一个从整体到个体，再由个体特征重建整体的过程。
单细胞数据细胞分类与功能挖掘的基因分析法介绍
接触过单细胞转录组数据的小伙伴们都知道，数据的核心结果在于根据每个细胞的基因表达数据，来对细胞进行分群分类。现有通用的分析思路如下：首先根据转录组稀疏矩阵，通过计算和分析，找到不同的细胞Cluster，并找到每一类集群的Marker基因。根据已有对细胞特定Marker基因的认识，来对细胞可能的集群进
流式细胞仪检测细胞ros直接测的是哪些数据
某些荧光染料可以相对特异的被超氧化物或者过氧化物激发，产生荧光。通过比较不同样板的荧光强度的高低，可以比较样板间相对的ros浓度。不过这些检测的特异性不是很强
基于单细胞数据理解细胞变化过程——拟时间序列分析详解
单细胞检测技术的发展为我们理解复杂生命体中细胞的组成与各自功能及变化过程提供了强有力的工具。基于单细胞基因表达谱数据，我们可以窥探发育过程中细胞内的调控变化，发现肿瘤微环境中的各类细胞及它们的细胞间交流，理解器官组织中复杂多样的细胞类型。现有单细胞研究是一个从整体到个体，再由个体特征重建整体的过
揭示整合单细胞和群体细胞转录组数据推断细胞分化时间
近日，中国科学院上海生命科学研究院（人口健康领域）马普计算生物学伙伴研究所韩敬东研究组，中科院生物化学与细胞生物学研究所景乃禾研究组，与清华大学沈沁研究组合作发表的论文，以Inference of differentiation time for single cell transcriptom
细胞化学基础腺苷一磷酸毒理学数据
急性毒性：小鼠腹腔LD50:大于1mg/kg
全球首个活人脑细胞数据库公布
据美国《科学》杂志在线版29日消息称，艾伦脑科学研究所日前公布了全球首个活人大脑细胞数据库，该数据库信息可公开获取。在人类理解大脑的道路上，这一成就为科学家提供了深入探究人脑的重要资源，同时以前所未有的独特性，帮助医学界确定健康与患病大脑之间的不同。 2002年，微软公司共同创始人之一保罗·艾
肿瘤基因专家致力挖掘单细胞大数据潜能
近年来，随着测序技术的迅猛发展，单细胞测序技术已逐渐走入人们视野。2013年，单细胞测序技术成为《自然》评选的“Method of the Year”。大多数的基于NGS的基因检测，都是在大量细胞宏观水平上，对整个细胞群进行遗传分析。单细胞测序技术则是在单个细胞的水平上，对其遗传物质进行检测，从
细胞化学基础腺苷一磷酸分子结构数据
摩尔折射率：69.90摩尔体积（m3/mol）：149.6等张比容（90.2K）：515.5表面张力（dyne/cm）：140.9极化率（10-24cm3）：27.71
关于流式细胞仪的数据－分析介绍
数据分析的方法总的可分为参数方法和非参数方法两大类。当被检测的生物学系统能够用某种数学模型技术时则多使用参数方法。数学模型可以是一个方程或方程组，方程的参数产生所需要的信息来自所测的数据。例如在测定老鼠精子的DNA含量时，可以获取细胞频数的尖锐波形分布。如果采用正态分布函数来描述这些数据，则参数
如何通过细胞荧光检测获取全面的数据？
检测细胞荧光实验间差异需要高质量光学元件和智能测定方法提供的高检测灵敏度和可重复性。使用Spark™多功能酶标仪，上述所有目标均可实现。相对于Single Read（48孔板），Optimal Read具有更高的可重复性（低变异系数）。Fusion光学元件让您可快速定位到合适的波长选择最佳激发和发射
盘点干细胞领域研究进展——数据众览
干细胞是一种未充分分化，尚不成熟的细胞，它的神奇之处在于其具有自我更新复制的能力，能够产生高度分化的功能细胞，从而具有再生各种组织器官的潜能。干细胞治疗疾病的基本原理为：1、对组织细胞损伤的修复；2、替代损伤细胞的功能；3、刺激机体自身细胞的再生功能。干细胞对于人类健康、疾病治疗有着巨大的潜能。参考
Nature医学：用大数据解开癌细胞的秘密
最近，英国贝尔法斯特女王大学的一位著名癌症专家指出，将来自世界各地数以百万计的癌症患者的遗传信息进行共享，可能是彻底改变癌症预防和治疗的关键。相关研究结果发表在5月5日《Nature Medicine》杂志。 本文通讯作者是贝尔法斯特女王大学癌症研究和细胞生物学中心的Mark Lawler教授
如何根据－STR－数据判断细胞系的身份？
收到细胞系鉴定结果以及 STR 信息，可以与参考数据库进行比对。如果细胞样本的每个 STR 位点和参考细胞 STR 位点都能重合匹配，即说明该细胞系正确，反之则说明你的细胞系可能被错误标记，交叉污染或发生遗传不稳定。一般说来，匹配度≥80%即可认为该细胞系正确，匹配度＜80%则说明该细胞系的来源需要
有关流式细胞术的数据分析介绍
在数据分析中，百分率、荧光强度、DNA指数（DI）、多少个/ul是我们报告中常用的。百分率主要适用于检验指标集中在细胞有无的数量变化。如T细胞亚群检测、网织红细胞检测等；荧光强度主要适用于检验指标的变化集中在细胞上抗原量的多少。如血小板无力症（GT）的检测、慢性淋巴细胞白血病（CLL）CD20的
流式细胞术数据分析知识汇总（六）
6、Caspase-3法检测细胞凋亡7、PI法检测细胞凋亡凋亡的细胞由于DNA 裂解成许多小片段， 小分子量的 DNA 片段穿过细胞膜进入乙醇溶液中造成流失，仅剩下大片段的 DNA，最终导至凋亡细胞内 DNA 含量减少。经 DNA 荧光染料碘化丙啶(PI)染色后荧光强度明显减小，形成一个 D
流式细胞术数据分析知识汇总（一）
第一章 FCM基础知识1、基本原理：一定波长的激光束直接照射到高压驱动的液流，产生的光信号被多个接收器接受，一个是机关束直线方向上接受的前向角散射光信号。其他是在激光束垂直方向上接受的光信号，包括侧向角散射光信号和荧光信号，这些光信号被相应的接受器接受后，根据接收信号的强弱就能反应出细胞的物理和化学
流式细胞术数据分析知识汇总（五）
第四章 FCM数据分析之增殖、周期、凋亡检测1、细胞增殖检测CellTrace细胞增殖试剂盒含有细胞膜通透性非荧光酯，可通过扩散透过细胞膜进入细胞，并与胺基反应形成荧光分子。这种无荧光的酯进入细胞后，可被细胞内酯酶转化为荧光产物。活化的琥珀亚胺酯与蛋白质中的胺基基团共价结合，使染料能够长时间保留在细
流式细胞仪的数据显示方式简介
流式细胞仪的数据显示方式有如下几种： （一）单参数直方图 单参数直方图是一维数据用得最多的图形显示形式，既可用于定性分析，又可用于定量分析，形同一般X-Y平面描图仪给出的曲线。根据选择放大器类型不同，横坐标可以是线性标度或对数标度。用"信道"来表示，实质上是所测的荧光或散射光的强度。纵坐标一
单细胞测序数据的分析有什么意义
单细胞测序可以分析一个细胞里面的基因组序列这个主要适用于受精卵的试管婴儿
流式细胞术数据分析知识汇总（二）
5、常见荧光素根据激光及滤光片选取流式抗体染料6、常见的荧光素染料组合7、举例：8、双或多参数荧光抗体的标记组合1）单染2）双或多染9、流式主要实验对照及作用：空白对照（未染色细胞）：用以区分细胞的自发荧光和特异性荧光，避免假阳性的结果。同型对照：使用与实验抗体相同种属来源、相同剂量及同种免疫球蛋白
流式细胞术数据分析知识汇总（四）
总结门（Gata）设置：指在某一张选定参数的直方图上，根据该图的细胞群分布选定其中想要分析的特定细胞群，并要求该样本所有其他参数组合的直方图只体现这群细胞的分布情况。第三章 FCM数据分析之蛋白检测1、测肿瘤细胞表面PD-L1的表达水平，活细胞获取2、检测肿瘤细胞表面PD-L1的表达水平关于A/W/
流式细胞术数据分析知识汇总（三）
2、二维散点图能够显示两个独立参数与细胞相对数之间的关系，横、纵坐标分别代表两个独立参数，平面上每一个点表示具有相应坐标值的细胞。3、二维等高线图用等高线来代表细胞数，在一条等高线上的细胞数相同，不同的等高线细胞数不同。4、假三维图纵轴与横轴分别代表被测细胞的两个测量参数，Z轴为细胞数。5、三维图任
基因数据表明STAP细胞并不存在
Teruhiko Wakayama 两篇发表于《自然》杂志的关于一种可将成熟细胞转化为干细胞的新方法的争议性论文被指控存在数据篡改和捏造问题。现在，论文共同作者提供的基因数据显示，这种方法所获得的细胞并非研究小组声称的那样。该说法也得到了另一个来源的支持——用这种方法制造的STAP细胞
《细胞系统》：基因数据噪音或可保护患者隐私
大型基因组数据库对于科学家寻找同疾病相关的遗传变异来说是必不可少的。不过，对于贡献了DNA的人来说，这会带来隐私风险。一项2013年的研究显示，黑客能利用网络上公开可用的信息，从被匿名的基因组数据中辨别出人们的身份。 为解决这些担忧，一个由美国麻省理工学院计算机科学家Bonnie B
《细胞系统》：基因数据噪音或可保护患者隐私
大型基因组数据库对于科学家寻找同疾病相关的遗传变异来说是必不可少的。不过，对于贡献了DNA的人来说，这会带来隐私风险。一项2013年的研究显示，黑客能利用网络上公开可用的信息，从被匿名的基因组数据中辨别出人们的身份。 为解决这些担忧，一个由美国麻省理工学院计算机科学家Bonnie Berger
Science：全球首个活人脑细胞数据库公布
据美国《科学》杂志在线版29日消息称，艾伦脑科学研究所日前公布了全球首个活人大脑细胞数据库，该数据库信息可公开获取。在人类理解大脑的道路上，这一成就为科学家提供了深入探究人脑的重要资源，同时以前所未有的独特性，帮助医学界确定健康与患病大脑之间的不同。 2002年，微软公司共同创始人之一保罗·艾
哈佛大学教授因数据问题撤销《细胞》论文
据Retraction Watch网站消息，由于论文结果无法重复，哈佛大学（Harvard University）Richard Losick教授撤销了一篇《细胞》（Cell）论文。 该论文主要研究某物质可以降解生物膜。《细胞》发布称，由于其他科学家发表的论文结论与Richard