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基于单细胞数据理解细胞变化过程—拟时间序列分..(一)

单细胞检测技术的发展为我们理解复杂生命体中细胞的组成与各自功能及变化过程提供了强有力的工具。基于单细胞基因表达谱数据,我们可以窥探发育过程中细胞内的调控变化,发现肿瘤微环境中的各类细胞及它们的细胞间交流,理解器官组织中复杂多样的细胞类型。现有单细胞研究是一个从整体到个体,再由个体特征重建整体的过程。在这个过程中,有一些非常有意思的问题是我们希望通过单细胞数据加以理解的,比如,某个组织中,某类细胞的发育生成过程;在不同条件下,细胞的改变过程和命运等等。因此,我们需要通过特定的分析手段实现对数据的分类和还原,并通过数据来勾画出细胞间的变化过程。在这样的背景下,拟时间序列分析(Pseudotime分析)为我们提供了来解决该问题的工具。拟时间序列分析(Pseudotime分析)的字面意思是通过构建细胞间的变化轨迹来重塑细胞随着时间的变化过程。从具体的分类分析和复杂程度来说,可以分为细胞轨迹分析和细胞谱系分析。细胞轨迹分析指的是简单模型的......阅读全文

质谱技术及其应用

21世纪的最前沿科学之一,随着人类第一张基因序列草图的完成和发展,生命科学的研究也将进入一个崭新的后基因组学,即蛋白质组学时代。正如基因草图的提前绘制得益于大规模全自动毛细管测序技术一样,后基因组研究也将会借助于现代生物质谱技术等得到迅猛发展。本文拟简述生物质谱技术及其在生命科学领域研究中的应用。1

深部真菌感染实验室检验方法的比较

张珩1   柳洋2(1. 天津市大港医院检验科   2. 德州市中心血站)关键词:1-3-β-D-葡聚糖,真菌感染,实验室,检验方法key words: 1-3-β-D- Glucan, Fungus infection, Laboratory,Testing

现场同步直播 目击中国化学会第31届学术年会全过程

  分析测试百科网讯 2018年5月5日,中国化学会第31届学术年会在浙江省杭州市杭州国际博览中心盛大开幕。  在全国化学工作者的支持和积极参与下,中国化学会学术年会规模不断扩大,影响力不断提升,已经成为化学及相关领域门类最全、规模最大、水平最高的学术交流平台。中国化学会第 31 届学术 年会设

一文看全!史上59家测序仪公司的“争霸战”

  要谈测序,首先要向华人生物学家、DNA测序技术的奠基人吴瑞先生致敬。大家大多都听过桑格,但很少有人知道吴瑞。其实吴瑞早在1968年就发表第一篇论文测定了DNA的碱基组成,1970年的新文章既测定DNA碱基组成又测定出顺序,是真正的DNA测序第一人。而在吴瑞先生工作的启发下,Sanger深入研究,

基因克隆(gene clone)的几种常用方法介绍-1

基因(gene)是遗传物质的最基本单位,也是所有生命活动的基础。不论要揭示某个基因的功能,还是要改变某个基因的功能,都必须首先将所要研究的基因克隆出来。特定基因的克隆是整个基因工程或分子生物学的起点。本文就基因克隆的几种常用方法介绍如下。1 根据已知序列克隆基因对已知序列的基因克隆是基因克隆方法中最

高通量测序技术在肠道菌群多样性研究中的应用

在人体肠道中生活着数以万亿的共生菌群,它们的种类繁多,可达上千种,数量也很惊人,是人体细胞总量的10倍以上,迄今为止,仍有80%以上的微生物不为人知。这些肠道微生物和人体存在着互利共生的关系,对于维持人类的健康发挥着重要的作用。它们在肠道中保持着一种动态的平衡,能够合成维生素、帮助人体从食物中吸收

高通量测序技术在肠道菌群多样性研究中的应用(二)

二、肠道菌群与疾病发生之间的关联1.  Gut Microbiota in Human Adults with Type 2 Diabetes Differs from Non-Diabetic Adults——2010《PLoS One》以往文献报道肠道菌群与人类代谢疾病之间存在着某种关

几种基因克隆的常用方法介绍(一)

基因(gene)是遗传物质的最基本单位,也是所有生命活动的基础。不论要揭示某个基因的功能,还是要改变某个基因的功能,都必须首先将所要研究的基因克隆出来。特定基因的克隆是整个基因工程或分子生物学的起点。本文就基因克隆的几种常用方法介绍如下。1 根据已知序列克隆基因对已知序列的基因克隆是基因克隆方法中最

卫生部印发《全国流感监测方案(2010年版)》

卫办疾控发〔2010〕150号各省、自治区、直辖市卫生厅局,新疆生产建设兵团卫生局,中国疾病预防控制中心:  为进一步加强全国流感监测工作,完善流感监测网络,提高监测水平,更好地为流感防控工作服务,我部组织起草了《全国流感监测方案(2010年版)》(见附件)。现印发你们,请参照执行,相关技术指南由中

《Science》12月最受关注的文章

  美国的《Science》杂志由爱迪生投资创办,是国际上著名的自然科学综合类学术期刊,与英国的《Nature》杂志被誉为世界上两大自然科学顶级杂志。Science杂志主要发表原始性科学成果、新闻和评论,许多世界上重要的科学报道都是首先出现在Science杂志上的,比如艾滋病与人类免疫缺陷病毒之间的

Science杂志最受关注的文章(1月)

  美国的《Science》杂志由爱迪生投资创办,是国际上著名的自然科学综合类学术期刊,与英国的《Nature》杂志被誉为世界上两大自然科学顶级杂志。Science杂志主要发表原始性科学成果、新闻和评论,许多世界上重要的科学报道都是首先出现在Science杂志上的,比如艾滋病与人类免疫缺陷病毒之间的

基因测序市场发展现状分析 下一个万亿市场在哪里?

  一项新技术或产品的问世,给人们带来欣喜的同时,也必然会引起担忧,基因测序技术便是其中之一。基因测序技术被看作自疫苗问世以来疾病预防最重要的科技突破,它不仅可以大大降低遗传相关的疾病发生率,减少出生缺陷,还可以实现对疾病预测、预防、预警以及个体化诊疗;但目前,国内的基因测序市场却并不让人满意,甚至

Science首次证实全新基因的非编码来源

  在过去的几年里,科学家们已逐渐认识到基因组中本来是非编码的区域,确实有可能形成新基因。事实上,相关物种基因组的比较也甚至指出,这种从头形成基因的方式也许是一种普遍模式。   来自加州大学戴维斯分校的研究人员近期发现了在6种果蝇株系中全部或部分表达的142个转录子,对应于果蝇参考基因组(refe

解密“全球最大测序机构”华大基因

  在深圳,背靠盐田青翠的北山,有这样的一家基因测序机构,基因测序规模在全球达到最大。  它是华大基因。有人说它会是下一个华为,下一个腾讯。  它的员工平均年龄不到27岁,每个月平均却有3份学术论文登上“CNNS(即《Cell(细胞)》、《Nature(自然)》、《NEJM(新英格兰医学杂志)》、《

ICP-MS使用过程中常见的70个问题解答!

  都是经验的结晶啊!  还在为ICP-MS使用当中遇到的各种问题烦心吗?有热心网友总结了网上一些有关ICP-MS的问题,与广大网友分享。70个问题的回答,不知道这位网友花了多少时间,对于这种“辛苦我一人,幸福千万家”的无私奉献精神,让我们致以崇高的敬意。  一、请教各位检测比如检测完高浓度的Al中

基因克隆的常用方法

基因克隆的常用方法 基因(gene)是遗传物质的最基本单位,也是所有生命活动的基础。不论要揭示某个基因的功能,还是要改变某个基因的功能,都必须首先将所要研究的基因克隆出来。特定基因的克隆是整个基因工程或分子生物学的起点。本文就基因克隆的几种常用方法介绍如下。

科学家系统性研究——揭示家族性腺瘤性息肉病的发病机制

  结直肠癌在全球范围内是发病率第三、致死人数第四的恶性肿瘤(Beattie et al., 2005)(Carey, 2017; Church, 2016)。结直肠腺瘤是结直肠癌的癌前病变,根据组织学形态可以分为低级别腺瘤和高级别腺瘤,从低级别腺瘤到腺癌的序列发生需要10年以上时间。因此,深入解析

“十三五”第一批26个重大项目指南正式发布

  近日,国家自然科学基金委员会发布了《关于发布“十三五”第一批重大项目指南及申请注意事项的通告》。《通告》表示,国家自然科学基金委员根据6月发布的《国家自然科学基金“十三五”发展规划》优先发展领域,发布了“十三五”第一批26个重大项目指南。  6月,《自然科学基金委“十三五”发展规划》(以下简称“

肿瘤免疫治疗新贵——CAR-T

  免疫疗法是当下肿瘤治疗领域最具前景的发展方向之一。随着PD-(L)1等免疫检查点抑制剂应用范围逐渐扩大,CAR-T疗法研究不断出现新的进展,CAR-T疗法作为有别于传统药物的“活药”,不仅对复发、难治性肿瘤患者表现出了突破性疗效,其生产体系和使用场景也有别于普通药物。鉴于当下生物技术的更新速度,

脑微出血与脑缺血性事件相关脑出血研究进展

  “脑微出血(CMBs)”是放射学概念,主要是描述含铁血黄素或吞噬含铁血黄素的巨噬细胞沿血管周围间隙[PVS,亦称Virchow-Robin间隙(VRS)]沉积的现象,提示颅内小血管曾发生局部破裂、红细胞漏出,但不能反映局部潜在的小血管形态改变的病理学基础。  脑微出血的检出仅能依靠对含铁血黄素敏

与时间赛跑!国内外企业/机构新冠病毒疫苗研发纪实

  过去5年间,全世界经历了多次病毒疫情的突然爆发,包括非洲埃博拉病毒疫情,美洲寨卡病毒疫情,中东呼吸综合征疫情和此次新型冠状病毒疫情。  与过历次疫情不同的是,借助先进的技术手段,此次疫情中我国研究团队得以快速分离出病毒并获得了新型冠状病毒的基因序列信息。1月12日,世界卫生组织宣布已收到中国分享

2018年度领军人才和科技新星入选名单公布

  9月21日  北京市科委正式对外发布了2018年度  首都科技领军人才培养工程  和北京市科技新星计划  入选人员名单  领军人才工程  领军人才工程是《首都中长期人才发展规划纲要(2010-2020)年》确定的十二项重点人才工程之一,是针对50周岁以下的中青年科技带头人,突出对领军人才自身发展

环监站2016年水质重金属在线监测仪器适用性检测安排

  分析测试百科网讯 近日,中国环境监测总站发布2016年水质重金属在线监测仪器适用性检测工作安排,于2016年2月16日开始接受水质重金属镉(I、II型)、铅(I、II型)、砷(I、II型)在线监测仪器适用性检测报名。据了解,2016年度中国环境监测总站检测工作拟分三批次进行,开始时间分别为:20

RNAi技术研究进展

RNA干扰(RNA interference,RNAi)是多种生物体内由双链RNA(doublestranded RNA,dsRNA)介导同源mRNA 降解的现象。RNAi现象先后在不同生物中被发现,植物学家称它为共抑制(co-suppression)或转录后基因沉默(post tran

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  RNA干扰(RNA interference,RNAi)是多种生物体内由双链RNA(doublestranded RNA,dsRNA)介导同源mRNA 降解的现象。RNAi现象先后在不同生物中被发现,植物学家称它为共抑制(co-suppression)或转录后基因沉默(post transcri

RNAi技术研究进展

  RNA干扰(RNA interference,RNAi)是多种生物体内由双链RNA(doublestranded RNA,dsRNA)介导同源mRNA 降解的现象。RNAi现象先后在不同生物中被发现,植物学家称它为共抑制(co-suppression)或转录后基因沉默(post transcri

MALDI-TOF-MS 在病原微生物鉴定中的研究进展

       基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(Matrixassisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)技术是近年来发展起来的一种软电离新

这些因素可能会影响后代健康 你知道吗?

  近年来,越来越多的研究证据都表明,父母在很多方面都会给未来后代的健康产生一定影响,比如父母的饮食方式、年龄、体重、是否感染、女性孕期所暴露的物质等等都会对后代的生长发育产生一定效应,本文中,小编整理了近年来的相关研究进展,分享给各位!这些研究报告将告诉各位哪些因素会影响后代的健康!  【1】Fr

8月9日疫情通报:新疆新增15例 美确诊病例或再次增长

  8月8日0—24时,31个省(自治区、直辖市)和新疆生产建设兵团报告新增确诊病例23例,其中境外输入病例8例(广东5例,上海2例,浙江1例),本土病例15例(均在新疆);无新增死亡病例;无新增疑似病例。  当日新增治愈出院病例45例,解除医学观察的密切接触者2102人,重症病例较前一日增加1例。

多聚酶链式反应技术(PCR技术)

多聚酶链式反应即PCR(polymerase chain reaction)技术,应用这一技术可以将微量目的基因(DNA片段)扩增一百万倍以上。PCR反应理论的提出和技术的完善对于分子生物学的发展具有特殊的意义,它以敏感度高、特异性强、产率高、重复性好以及快速简便等优点迅速成为分子生物学研究中应用最