科学家发明单碱基分辨率测序技术：CeUSeq
2015年6月15日，北京大学生命科学学院伊成器研究组在《Nature Chemical Biology》杂志在线发表题为“Chemical pulldown reveals dynamic pseudouridylation of the mammalian transcriptome”的研究论文(DOI:10.1038/nchembio.1836)。文章报道了一种通过化学标记和富集手段实现全转录组水平上假尿嘧啶RNA修饰的单碱基分辨率测序技术CeU-Seq，并绘制了人和小鼠细胞转录组中假尿嘧啶RNA修饰的谱图。 CeU-Seq绘制人及小鼠全转录组假尿嘧啶RNA修饰谱图。 （a）CeU-seq流程图；（b）人细胞系及小鼠大脑和肝脏组织全转录组水平假尿嘧啶修饰分布；（c）转录组中假尿嘧啶修饰呈现出“刺激条件特异性”的特点。 转录后修饰在生命体中广泛存在（已发现100多种），而假尿嘧啶RNA修饰就是其中最主要的......阅读全文
科学家发明单碱基分辨率测序技术：CeUSeq
2015年6月15日，北京大学生命科学学院伊成器研究组在《Nature Chemical Biology》杂志在线发表题为“Chemical pulldown reveals dynamic pseudouridylation of the mammalian transcriptome
假尿嘧啶核苷的用途
假尿嘧啶核苷的用途：检测其含量可诊断胃癌，肿瘤等恶疾。生化研究。制药。
中国学者发表Nature－Methods综述：表观转录组分析新技术
12月29日的Nature Methods杂志公布了2016年度技术：Epitranscriptome analysis（表观转录组分析），来自北京大学生命科学学院的伊成器研究员受邀发表了题为“Epitranscriptome sequencing technologies: decoding
PUS7和假尿嘧啶修饰在多形性胶质母细胞瘤中的促癌机制
多形性胶质母细胞瘤（Glioblastoma multiforme, GBM, 以下简称GBM）是成年人原发性脑瘤中最常见也是最恶性的肿瘤。遗憾的是，在目前的治疗下(包括手术切除，放射治疗和化疗)，患者的中位生存期短于16个月，因此目前亟需对此类疾病的发病机制进一步了解，以寻找更有效的治疗方案。
假尿嘧啶核苷的基本用途
用途：检测其含量可诊断胃癌，肿瘤等恶疾。生化研究。制药。
细胞化学词汇假尿嘧啶核苷
中文名称：假尿嘧啶核苷英文名称：PseudouricdineIUPAC命名：5-[(2S,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-1H-pyrimidine-2,4-dione分 子 式：C9H12N2O6分 子 量：244.20
Cell：表观遗传新关注点—mRNA修饰
表观遗传学研究关键点是修饰DNA及其蛋白质支架的化学标记，越来越多的研究表明这些化学标记能告诉细胞，哪些基因是表达，哪些是沉默的，因而也决定了个体的表型性状。 mRNA即信使RNA，在中心法则中扮演了重要角色，但此前一些科学家们认为这种RNA只是完成传递的作用，把细胞核中编码的信息传递给蛋白翻
Cell：出人意料的mRNA修饰
Cell：出人意料的mRNA修饰 根据分子生物学的中心法则，遗传信息是从DNA传递给RNA，再从RNA传递给蛋白质，其为活体生物中遗传信息的解码和翻译提供了一种简单的解释。 当然在现实中，这一过程比近60年前DNA双螺旋结构的共同发现者、诺贝尔奖得主Francis Crick
Cell颠覆传统认知：出人意料的mRNA修饰
根据分子生物学的中心教条（又称中心法则），遗传信息是从DNA传递给RNA，再从RNA传递给蛋白质，其为活体生物中遗传信息的解码和翻译提供了一种简单的解释。 当然在现实中，这一过程比近60年前DNA双螺旋结构的共同发现者、诺贝尔奖得主Francis Crick首次提出的要远远复杂得多。其一，有多
北京大学Nature子刊解析表观遗传修饰
来自北京大学的研究人员报道称，他们采用化学下拉（pulldown）方法揭示出了哺乳动物转录组的动态假尿嘧啶化 (pseudouridylation)。这一重要的研究成果发布在6月15日的《自然化学生物学》（Nature Chemical Biology）杂志上。 领导这一研究的是北京大学生命科
假尿嘧啶核苷的基本信息
中文名称：假尿嘧啶核苷英文名称：PseudouricdineIUPAC命名：5-[(2S,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-1H-pyrimidine-2,4-dione分 子 式：C9H12N2O6分 子 量：244.20
假尿嘧啶核苷的计算化学数据
1、疏水参数计算参考值（logP）：-3.772、氢键供体数量：53、氢键受体数量：84、可旋转化学键数量：26、拓扑分子极性表面积（TPSA）：128 Ų /136 Ų 8、表面电荷：09、复杂度：38210、同位素原子数量：011、确定原子立构中心数量：412、不确定原子立构中心数量：013
假尿嘧啶核苷的计算化学数据
1、疏水参数计算参考值（logP）：-3.772、氢键供体数量：53、氢键受体数量：84、可旋转化学键数量：26、拓扑分子极性表面积（TPSA）：128 Ų [1] /136 Ų [4] 8、表面电荷：09、复杂度：38210、同位素原子数量：011、确定原子立构中心数量：412、不确定原子立
假尿嘧啶核苷的计算化学数据
1、疏水参数计算参考值（logP）：-3.772、氢键供体数量：53、氢键受体数量：84、可旋转化学键数量：26、拓扑分子极性表面积（TPSA）：128 Ų [1] /136 Ų 8、表面电荷：09、复杂度：38210、同位素原子数量：011、确定原子立构中心数量：412、不确定原子立构中心数
假尿嘧啶核苷的分子结构数据
1、摩尔折射率：53.9±0.3 cm32、摩尔体积（m3/mol）：139.8±3.0 cm33、表面张力（dyne/cm）：108.3±3.0 dyne/cm4、极化率（10-24cm3）：21.3±0.5 10-24cm3
假尿嘧啶核苷的分子结构数据
1、摩尔折射率：53.9±0.3 cm32、摩尔体积（m3/mol）：139.8±3.0 cm33、表面张力（dyne/cm）：108.3±3.0 dyne/cm4、极化率（10-24cm3）：21.3±0.5 10-24cm3
假尿嘧啶核苷的分子结构数据
1、摩尔折射率：53.9±0.3 cm32、摩尔体积（m3/mol）：139.8±3.0 cm33、表面张力（dyne/cm）：108.3±3.0 dyne/cm4、极化率（10-24cm3）：21.3±0.5 10-24cm3
《Cell》揭秘人类细胞假尿嘧啶化新功能
成熟的血细胞来自造血干细胞（hematopoietic stem cells），血液生产需要精密的蛋白质表达调节，然而，对某些侵袭性血癌来说，造血干细胞的蛋白质生产调节缺陷显而易见。瑞典隆德大学发现了一种全新的蛋白生产调节机制，该机制直接影响干细胞功能。这项研究成果发表在4月6日的《Cell》期
生物物理所揭示古菌中假尿嘧啶分布和合成的全局图谱
假尿嘧啶修饰是RNA中频率最高的修饰之一，存在于rRNA、tRNA、snRNA和mRNA等RNA中，能影响它们的结构和功能。假尿嘧啶是由属于六大家族的假尿嘧啶合成酶转化RNA上的尿嘧啶而来。其中属于TruB家族的Cbf5是个特殊的假尿嘧啶合成酶，它和其他三个蛋白质以及H/ACA RNA结合形成复
premRNA中存在的修饰及其对剪接影响
2018年10月7日 讯 /生物谷BIOON/--日前，作为“诺贝尔奖风向标”的拉斯克奖——拉斯克·科什兰医学特殊成就奖颁给了Joan Argetsinger Steitz教授（致敬Joan Steitz！2018年拉斯克特别成就奖获得者），以表彰她在生物医学领域，尤其是RNA生物学领域中所发挥
假包膜型反转录病毒载体的制备实验
实验材料反转录病毒载体质粒试剂、试剂盒293GP 和 NIH3T3 细胞的培养物仪器、耗材超速离心机细胞培养皿聚丙烯管灭菌无热原的注射器式滤器超干净的离心管宽嘴离心瓶超速离心机G S A 转子实验步骤展开
修饰碱基的基本信息
又称稀有碱基，这些碱基在核酸分子中含量比较少，但他们是天然存在不是人工合成的，是核酸转录之后经甲基化、乙酰化、氢化、氟化以及硫化而成。多半是主要碱基的甲基衍生物。如：5-甲基胞苷、5，6-双氢脲苷等。另外有一种比较特殊的的核苷：假尿嘧啶核苷是由于碱基与核糖连接方式的与众不同，即尿嘧啶5位碳与核苷形成
稀有碱基是天然还是人工合成？
又称稀有碱基，这些碱基在核酸分子中含量比较少，但他们是天然存在不是人工合成的，是核酸转录之后经甲基化、乙酰化、氢化、氟化以及硫化而成。多半是主要碱基的甲基衍生物。如：5-甲基胞苷、5，6-双氢脲苷等。另外有一种比较特殊的的核苷：假尿嘧啶核苷是由于碱基与核糖连接方式的与众不同，即尿嘧啶5位碳与核苷形成
细胞化学基础修饰碱基
又称稀有碱基，这些碱基在核酸分子中含量比较少，但他们是天然存在不是人工合成的，是核酸转录之后经甲基化、乙酰化、氢化、氟化以及硫化而成。多半是主要碱基的甲基衍生物。如：5-甲基胞苷、5，6-双氢脲苷等。另外有一种比较特殊的的核苷：假尿嘧啶核苷是由于碱基与核糖连接方式的与众不同，即尿嘧啶5位碳与核苷形成
假尿嘧啶核苷的生物化学性质
一种尿嘧啶核苷的天然结构类似物，核糖不是与尿嘧啶N1相连，而是与嘧啶环的C5连接。是存在于tRNA中的稀有核苷酸。
假尿嘧啶核苷的生物化学性质
一种尿嘧啶核苷的天然结构类似物，核糖不是与尿嘧啶N1相连，而是与嘧啶环的C5连接。是存在于tRNA中的稀有核苷酸。
北京大学Nature子刊发布表观遗传新成果
来自北京大学的研究人员报告称，他们通过全转录组绘图揭示出了可逆及动态的N1甲基腺苷(N1 methyladenosine,m1A)甲基化组。这一重要的研究成果发布在2月10日的《自然化学生物学》（Nature Chemical Biology）杂志上。 北京大学生命科学学院伊成器(Chengq
中国科学家首次揭示古菌中假尿嘧啶全局图谱
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/2/518082.shtm
假尿嘧啶核苷生物化学性质和用途
生物化学性质：一种尿嘧啶核苷的天然结构类似物，核糖不是与尿嘧啶N1相连，而是与嘧啶环的C5连接。是存在于tRNA中的稀有核苷酸。用途：检测其含量可诊断胃癌，肿瘤等恶疾。生化研究。制药。
南京大学在RNA表观遗传修饰鉴定方面取得进展
图 （a）高分辨工程化纳米孔检测RNA表观遗传修饰原理示意图;（b）RNA主要表观遗传修饰的结构及其单分子纳米孔指纹信号；（c）—（e）酵母苯丙氨酸tRNA（tRNAphe）修饰图谱检测 在国家自然科学基金项目（批准号：21675083、91753108、31972917）等资助下，南京大学化