科学家发明单碱基分辨率测序技术：CeUSeq
2015年6月15日，北京大学生命科学学院伊成器研究组在《Nature Chemical Biology》杂志在线发表题为“Chemical pulldown reveals dynamic pseudouridylation of the mammalian transcriptome”的研究论文(DOI:10.1038/nchembio.1836)。文章报道了一种通过化学标记和富集手段实现全转录组水平上假尿嘧啶RNA修饰的单碱基分辨率测序技术CeU-Seq，并绘制了人和小鼠细胞转录组中假尿嘧啶RNA修饰的谱图。 CeU-Seq绘制人及小鼠全转录组假尿嘧啶RNA修饰谱图。 （a）CeU-seq流程图；（b）人细胞系及小鼠大脑和肝脏组织全转录组水平假尿嘧啶修饰分布；（c）转录组中假尿嘧啶修饰呈现出“刺激条件特异性”的特点。 转录后修饰在生命体中广泛存在（已发现100多种），而假尿嘧啶RNA修饰就是其中最主要的......阅读全文
伊成器教授Nature子刊：人基因组脱氧尿嘧啶修饰图谱
来自北大-清华生命联合中心的研究人员发表了题为“Genome-wide mapping reveals that deoxyuridine is enriched in the human centromeric DNA”的研究论文，解析了人类基因组上脱氧尿嘧啶的图谱，发现该修饰在染色体的着丝
m6A修饰新功能——调控染色质状态和转录活性
m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰，能够在多种生物过程中发挥重要作用，包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。2020年1月17日，美国芝加哥大学何川，中科院北京基因组研究所韩大力和同济
tRNA转录加工过程
主要加工方式是切断和碱基修饰。真核生物tRNA前体一般无生物学特性，需要进行加工修饰。加工过程包括：（1）剪切和拼接tRNA前体在tRNA剪切酶作用下，切成一定大小的分子。大肠杆菌RnaseP特异切割tRNA前体5′旁侧序列，3′－核酸内切酶如RnaseF可将tRNA前体3′端一段序列切下来。Rna
关于tRNA转录加工的基本介绍
主要加工方式是切断和碱基修饰。真核生物tRNA前体一般无生物学特性，需要进行加工修饰。加工过程包括： （1）剪切和拼接 tRNA前体在tRNA剪切酶作用下，切成一定大小的分子。大肠杆菌RnaseP特异切割tRNA前体5′旁侧序列，3′－核酸内切酶如RnaseF可将tRNA前体3′端一段序列切
Nature：RNA－修饰研究有助表观转录组学进一步发展
这是一个与 mRNA 结合的细菌核糖体的分子模式图，该核酸蛋白复合体正在合成蛋白质。 随着科研人员逐渐揭开 RNA 修饰的奥秘，帮助我们了解表观转录组学（epitranscriptomics）的工具也变得越来越多了。 2004 年，以色列特拉维夫大学（Tel Aviv University
揭示肠道细菌调控表观转录组修饰促进结直肠癌转移机制
结直肠癌是常见恶性肿瘤之一，是全世界发病人数第三、死亡人数第二的恶性肿瘤。结直肠癌在我国同样不容乐观。尽管结直肠癌的治疗手段不断发展，但晚期转移性结直肠癌患者的预后生存仍然不理想，我们需要对结直肠癌的转移机制有更深刻的认识。 近年来，随着宏基因组测序等研究手段的不断进展，人们发现肠道菌群能广泛
揭秘m6A修饰新功能－－－－调控染色质状态和转录活性
m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰，能够在多种生物过程中发挥重要作用，包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。 2020年1月17日，美国芝加哥大学何川，中科院北京基因组研究所
揭秘m6A修饰新功能－－－－调控染色质状态和转录活性
文章导读 m6A是真核生物中最常见的一类化学修饰，能够在多种生物过程中发挥重要作用，包括癌症发生发展、细胞分化、压力应答、免疫反应以及神经发育等方面。目前大部分研究主要探究m6A对蛋白编码基因的调控——即影响mRNA稳定性或翻译效率。 2020年1月17日，美国芝加哥大学何川，中科院
稀有碱基的基本信息
中文名稀有碱基外文名Rare base过 程甲基化、乙酰化、氢化主要碱基甲基衍生物多半是主要碱基的甲基衍生物。如：5-甲基胞苷、5，6-双氢脲苷等。另外有一种比较特殊的的核苷：假尿嘧啶核苷是由于碱基与核糖连接方式的与众不同，即尿嘧啶5位碳与核苷形成的C-C糖苷键。tRNA中含有修饰碱基比较多，
何川教授新发Nature综述：mRNA修饰介导的基因调控
在分子生物学的中心法则中，遗传信息从DNA、RNA流向蛋白。基因组DNA和组蛋白上都存在可逆的表观遗传学修饰，这些修饰可以调控基因的表达，并由此决定细胞的状态，影响细胞的分化和发育。近年来人们发现，mRNA和其他RNA上也存在类似的调控机制。 N6-methyladenosine（m6A）是真
核仁小RNA的功能及其在癌症研究中的作用（一）
为什么研究snoRNAs?引言核仁小RNA(snoRNAs)是一类中等长度的非编码小RNA,它们的长度在60-300nt不等，能与核仁核糖核蛋白结合形成snoRNPs 复合物[1]。在脊椎动物中编码核仁小RNA的基因主要存在于蛋白编码基因或非蛋白编码基因的内含子区域，并且经过进一步的转录后加
北京基因组所揭示共转录m6A修饰建立机制及功能
4月2日，中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）任捷团队和杨运桂团队，在《分子细胞》（Molecular Cell）上在线发表了题为DDX21 mediates co-transcriptional RNA m6A modification to promote transcription
上海生科院阐明ADAR1调控人源胚胎干细胞神经分化的新机制
2月24日，国际学术期刊《细胞研究》（Cell Research）在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究组和计算生物学研究所杨力研究组的最新研究论文ADAR1 is required for differentiation and neural inducti
何川教授最新Nature文章：基因调控新领域的最新发现
N6-methyladenosine（m6A）是真核生物mRNA上最常见的一种转录后修饰，介导了超过80%的RNA碱基甲基化。这种可逆的mRNA甲基化修饰非常普遍，出现频率大约是3-5个残基/mRNA。m6A的研究发现开辟了真核生物转录后基因调控的新领域。 芝加哥大学的何川（Chuan He）
mRNA疫苗可能会产生意想不到的蛋白质
即使在新冠疫情期间接种了数十亿剂疫苗后，信使核糖核酸（mRNA）疫苗仍令人惊讶。近日，《自然》发表的一项研究表明，mRNA疫苗可能会促使细胞产生少量意想不到的蛋白质。研究人员提出一种解决方案，有助于使未来基于mRNA的疫苗或药物更安全、更有效。 mRNA引导细胞的核糖体产生新的蛋白质。 英国
PCR实验中的污染预防及处理（三）
1. 原理：在PCR 产物或引物中用dU 代替dT。这种dU 化的PCR 产物与UNG 一起孵育，因UDG 可裂解尿嘧啶碱基和糖磷酸骨架间的N-糖基键，可除去dU 而阻止TaqDNA 聚合酶的延伸，从而失去被再扩增的能力。UNG 对不含dU 的模板无任何影响。UNG 可从单或双
怎样认清假柴油和假汽油？
提炼出来的“柴油” 一些黑炼油厂会从修理厂廉价收购废旧轮胎，运用轮胎炼制“柴油”。把废旧轮胎放进锅炉里，经过8-10个小时的常压高温熬制后，轮胎里的钢丝、杂质等会沉淀到炉底，较轻的油会浮在上面。通过架设的管道，油会顺着出口流出，流到油罐冷却后就成了“柴油”。这种油由于没有经过精细加工和提炼
刘默芳组：LARP7介导U6修饰及在生精细胞mRNA精准剪接功能
在较高等的真核生物中，大部分基因都含有内含子，在转录完成后需经过剪接（splicing）从mRNA前体移除内含子，以产生成熟、有翻译活性的mRNA，这个过程由剪接体（spliceosome）催化完成。经典的剪接体包括五种snRNA（small nuclear RNA），即U1、U2、U4、U5和
基因表达调控的基本规律是什么
过表达，即表达过度，当基因表达（转录）的严格控制被打乱时，基因可能不恰当被“关闭”，或以高速度进行转录。高速转录导致大量mRNA产生，大量蛋白质（protein）产物出现。在RNA聚合酶的催化下，以DNA为模板合成mRNA的过程称为转录。在双链DNA中，作为转录模板的链称为模板链或反义链；而不作为转
生物物理所揭示N端乙酰化修饰促进Sir3的转录沉默功能
8月11日，Nature structural & Molecular Biology 在线发表了中科院生物物理研究所生物大分子国家重点实验室许瑞明课题组的最新研究成果。该文章题为Nα-acetylated Sir3 stabilizes the conformation of a nu
氟尿嘧啶的用途
本品为嘧啶类的氟化物，属于抗代谢抗肿瘤药，能抑制胸腺嘧啶核苷酸合成酶，阻断脱氧嘧啶核苷酸转换成胸腺嘧啶核苷核，干扰DNA合成。对RNA的合成也有一定的抑制作用。 临床用于结肠癌、直肠癌、胃癌、乳腺癌、卵巢癌、绒毛膜上皮癌、恶性葡萄胎、头颈部鳞癌、皮肤癌、肝癌、膀胱癌等。
尿嘧啶的物理参数
熔点： 162.0～171.0℃比旋度：+6.0°～ +10.0°干燥失重：≤0.5%炽灼残渣：≤0.1%重金属：≤10ppm纯度（HPLC）：≥99.0%含量（UV）：98.0~102.0%
尿嘧啶的用途说明
尿苷是一种药物，如抗巨型红血球贫血，治疗肝；脑血管；心血管等疾病，也是制造氟尿嘧啶(S-FC)；脱氧核苷；碘苷(IDUR)；溴苷(BUDR)；氟苷(FUDR)等药物的主要原料。
氟尿嘧啶如何使用？
氟尿嘧啶的使用方法和剂量因个体差异和治疗目标而异。 氟尿嘧啶是一种抗肿瘤药物，其使用方式包括静脉注射和静脉滴注。对于10ml/0.25g/支的氟尿嘧啶注射液，常见的用法和剂量如下： 单药静脉注射时，剂量通常为按体重一日10～20mg/kg，连续使用5～10天，一个疗程的总剂量约为5～7克，有
ELISA假阳性结果和细胞假阴性结果
假阳性结果和假阴性结果1、标本的采集与保存ELISA试剂盒当标本采集保存不当产生溶血时，红细胞中的血红蛋白释放到血清中，血红蛋白具有过氧化物酶的性质，其通过吸附或“PP效应"（蛋白质间相互吸附的现象）结合后，可催化A、B液显色而造成假阳性标本采集保存不当致细菌污染，菌体中可能含有内源性HRP，会产生
PEG修饰及其修饰GLP1的意义
PEG修饰是一个使多肽或蛋白质在治疗或生物技术方面的效力得以提高的重要过程。当PEG以适当的方式连接在蛋白质或多肽上时，它能改变许多的特征，而主要的生物活性功能，如酶活性或特异结合位点，可以保留下来。PEG修饰通过如下几种途径改善药物的性能。首先，PEG连接在蛋白质或多肽的表面上，提高了它的分子大小
多肽荧光标记——FITC修饰和AMC修饰
荧光标记所依赖的化合物称为荧光物质。荧光物质是指具有共轭双键体系化学结构的化合物，受到紫外光或蓝紫光照射时，可激发成为激发态，当从激发态恢复基态时，发出荧光。荧光标记技术指利用荧光物质共价结合或物理吸附在所要研究分子的某个基团上，利用它的荧光特性来提供被研究对象的信息。荧光标记的无放射物污染，操
多肽荧光标记——FITC修饰和AMC修饰
荧光标记所依赖的化合物称为荧光物质。荧光物质是指具有共轭双键体系化学结构的化合物，受到紫外光或蓝紫光照射时，可激发成为激发态，当从激发态恢复基态时，发出荧光。荧光标记技术指利用荧光物质共价结合或物理吸附在所要研究分子的某个基团上，利用它的荧光特性来提供被研究对象的信息。荧光标记的无放射物污染，操
假Auer小体
Auer小体有真假之分，这里所说真假是指形态相同而性质不同者。 Auer小体是细胞形态学判断髓系还是淋系急性白血病的重要特征，然而，有文献报道慢性淋巴细胞白血病／小淋巴细胞淋巴瘤（图1 、2 ）、B细胞急性淋巴性白血病、滤泡淋巴瘤、幼淋巴细胞白血病、边缘区淋巴瘤以及文献早有记载
RNA复制、转录与逆转录
转录是以DNA为模板合成RNA的过程，经过转录DNA分子中的贮存信息传递到RNA分子中，再由mRNA做为模板合成蛋白质分子。逆转录也是从RNA的一个特定位置开始的，以RNA分子中的一条链为模板，在逆转录酶的作用下，以四种脱氧核苷酸为原料，合成方向仍是5'→3'，完成cDNA的合成。大