Nature发布基因组测序重要发现

由科隆大学Roman Thomas领导的一个国际研究小组,对110个小细胞肺癌(SCLC)样本进行了测序,发现除了两个样本其余所有的均包含失活的TP53和RB1基因。通过调查这一疾病的基因组景观,他们还发现有不少的肿瘤具有与TP73基因相关的基因组重排或突变,以及激酶基因突变和Notch家族基因失活突变。他们将这些研究结果发布在7月13日的《自然》(Nature)杂志上。 Thomas和同事们在论文中写道:“就我们所知,这是第一次对SCLC进行全面的基因组分析,我们揭示出了这一疾病发病机制中从前未知的几个基因和生物学过程,为开发出更有效的靶向治疗干预来对抗这种致命的癌症提供了一些潜在的靶点。” 研究人员收集了152个新鲜冷冻的肿瘤以及匹配的正常样本进行测序,由于DNA低质量排除了42个样本。他们生成了110个样本其中71个的转录组图谱。 并采用SNP微阵列(SNP Array)对其中103个样本及另外的37个样本进行了分析......阅读全文

基因定点突变知识

实验原理基因定点突变是指通过聚合酶链式反应(PCR)等方法改变目的基因的序列,包括碱基的插入、缺失、点突变等。基因定点突变是基因研究中比较常用的方法,可以短时间内研究目的DNA所表达的目的蛋白的性状及表征。定点突变需要设计特定的突变引物。引物长度一般为25-45 bp,建议选择30-35bp长度

《Nature-Genetics》携带这种基因突变的肿瘤对免疫治疗很敏感

2022年7月11日,克利夫兰的最新研究克利夫兰诊所正在证明致病性聚合酶epsilon和delta (POLE/POLD1)基因突变可以改善对免疫检查点封锁的反应,这是一种强大的免疫治疗药物。研究结果发表在《Nature Genetics》。在肿瘤的基因构成——而不是肿瘤的类型或来源——应该决定治疗

基因突变的诱变机制移码突变

诱发移码突变的诱变剂种类较少,主要是吖啶类染料(图6)。这些染料分子能够嵌入DNA分子中,从而使DNA复制发生差错而造成移码突变。

基因突变的诱变机制自发突变

所谓自发突变是指未经诱变剂处理而出现的突变。从诱变机制的研究结果来看,自发突变的原因不外乎以下几种。①背景辐射和环境诱变。短波辐射在宇宙中随时都有,实验说明辐射的诱变作用不存在阈效应,即任何微弱剂量的辐射都具有某种程度的诱变作用,因此自发突变中可能有一小部分是短波辐射所诱发的突变,有人估计果蝇的这部

癌症研究人员联手汇集肿瘤基因组数据

   研究人员希望,数据分享将为利用诸如这些脑部腺癌细胞等肿瘤的基因组信息带来更好的方法。  这是为大型癌症研究中心的很多病人提供的最新希望:“让我们测序你的肿瘤,或许我们能将其同击败这种恶性疾病的药物匹配。”不过,现实是基因组分析仍然仅为癌症病人提供了一小部分帮助。“我们多半时候不知道如何处理这些

Life-Tech一天完成肿瘤研究样本突变的完整筛查

        使用Ion AmpliSeqTM Cancer Panel试剂盒能检测肿瘤研究样本中更多的突变位点  Ion AmpliSeqTM Cancer Panel使科学家能够在简单快速的流程中同时对46个关键肿瘤基因的最相关区域内的739个突变进行测序。整个突变筛查

基因重组和基因突变区别

1、基因突变是基因的从无到有,突变产生新基因。基因重组是原有基因的重新组合,产生的是新基因型。2、发生的时间:基因重组发生的时期是:减数分裂中四分体时期同源染色体的非姐妹染色单体之间的局部交换和减数diyi次分裂后期非同源染色体的而重新组合;基因突变发生的时间是在有丝分裂和减数分裂的间期。

研究发现5种新的睾丸癌基因突变

  睾丸癌多出现在某一特定家族。这意味着,遗传因素对肿瘤产生起到促进作用。   日前,德国汉诺威医学院等机构的研究人员发现了促使睾丸肿瘤形成的 5 种基因突变。这一发现将有助于今后睾丸癌的防治。相关研究报告发表在了近期出版的《自然—遗传学》和《人类分子遗传学》杂志上。   在这项最新研究中,

扩张型心肌病相关基因突变研究概要

  目前,家庭成员中有心肌病的人可以通过超声心动图进行筛查,但这种疾病通常在40多岁的时候才显现出来。其他的筛查方法,与该疾病连锁的5种基因(LMNA、MYH7、TNNT2、SCN5A和MYBPC3)突变的遗传学检测的检出率较低,只有20%.    蒙特利尔心脏研究所Guillaume Lettre

体细胞突变研究

体细胞突变发生在体细胞中的突变,即在体细胞发生了基因突变或染色体畸变。体细胞突变率一般为 0.1~1×10-6/代。其突变性状一般不能传给下一代个体,除非突变部分可以由无性繁殖方式传给后代或者突变部分以后能产生生殖细胞。但突变细胞的突变性状能通过有丝分裂传给子细胞。例如许多芽变就是体细胞突变,若发现

如何快速发现肿瘤中的热点突变

  去年10月,Ion Torrent推出了Ion AmpliSeq™ Cancer Panel,它覆盖了46个癌基因的相关区域。如今,Ion AmpliSeq™ Cancer Hotspot Panel v2如今经过扩展,靶定50个癌基因和肿瘤抑制

AJRCCM:利用唾液也能检测肿瘤突变?

AJRCCM:利用唾液也能检测肿瘤突变?   目前筛选肺癌突变是利用血浆或血液来进行测试,但血液成分复杂。近日一项科学研究证实电场诱导释放和测量(electric field-induced release and measurement,EFIRM)是一种新的

基因测序肿瘤检测

临床医生在肿瘤治疗中发现,人体肿瘤千差万别,即使是同一个部位的肿瘤,治疗效果和方法也应因人而异,这种因人、因病而采取的不同疾病治疗方法称为“个体化治疗”。因此在癌症治疗过程中,只有同病异治,因人而异,实施个体化治疗,才能针对不同类型的病人选择合适他们的药物。下图中给出的是在乳腺癌中HER2基因的表达

肿瘤NGS基因检测

⑴ 随着肿瘤分子检测领域的发展,临床药效的分子标志物将不再局限于单基因或单位点,包含更多基因和位点的NGS检测已逐渐成为肿瘤基因检测主流技术;⑵ 2018年11月,JCO发表了一项美国肿瘤NGS基因检测调研报告,报告显示:75.6%的美国肿瘤医生都在使用NGS基因检测技术指导肿瘤治疗,超50%的美国

肿瘤研究,从认识肿瘤细胞开始

  最近一段时间我们一直围绕着肿瘤动物模型的构建,为大家介绍了肿瘤研究中各种实用动物模型的建立方法,相信大家应该收获颇多。动物水平的研究为我们提供了更接近临床的数据分析,与此同时,肿瘤细胞的实验研究也同样重要,它是肿瘤研究的初级阶段,可以更加快捷地提供在体外水平的研究结果。本期我们就开启肿瘤细胞学新

基因定点突变step-by-step

本贴先讲最简单的一个点的定点突变技术,其它较长片段的突变,删除,插入技术以后会慢慢奉上:在做实验之前,我们首先要搞清楚实验的目的和实验的原理。实验的目的应该比较明确吧:就是要把自己的基因上面的一个碱基换成另外一个碱基。一般情况下我们会有几种可能使我们需要这样去做:第一:我们吊出来的基因有点突变,相信

基因定点突变step-by-step

本贴先讲最简单的一个点的定点突变技术,其它较长片段的突变,删除,插入技术以后会慢慢奉上:在做实验之前,我们首先要搞清楚实验的目的和实验的原理。实验的目的应该比较明确吧:就是要把自己的基因上面的一个碱基换成另外一个碱基。一般情况下我们会有几种可能使我们需要这样去做:第一:我们吊出来的基因有点突变,相信

吸烟导致基因突变

  吸烟有害健康是不争事实,然而,香烟如何对人体造成伤害?英国研究人员发现,香烟中的致癌物直接导致脱氧核糖核酸(DNA)突变,估计烟民平均每吸15支烟,DNA就发生一次突变。   研究结果刊载于最新一期英国《自然》杂志网络版。     译癌症基因   英国韦尔科姆基金会桑格研究所分别对肺癌患

基因突变-萨摩耶牙疼

   SCL24A4基因的突变,能导致萨摩耶牙釉质发育不良。美国加州大学伴侣动物健康中心科学家近日将相关论文刊登于开放获取期刊《犬类遗传学与流行病学》。  携带这一突变的狗狗牙齿会褪色、变形,并可能牙齿脱落、牙齿严重侵蚀和牙根感染。于是,研究人员设计了一个检测,让狗育种者可以在育种过程中有选择性地剔

基因突变的发展

  基因突变首先由T.H.摩尔根于1910年在果蝇中发现。H.J.马勒于1927年、L.J.斯塔德勒于1928年分别用X射线等在果蝇、玉米中最先诱发了突变。1947年C.奥尔巴克首次使用了化学诱变剂,用氮芥诱发了果蝇的突变。1943年S.E.卢里亚和M.德尔布吕克最早在大肠杆菌中证明对噬菌体抗性的出

基因突变的特性

不论是真核生物还是原核生物的突变,也不论是什么类型的突变,都具有随机性、低频性和可逆性等共同的特性。普遍性基因突变在自然界各物种中普遍存在。随机性T.H.摩尔根在饲养的许多红色复眼的果蝇中偶然发现了一只白色复眼的果蝇。这一事实说明基因突变的发生在时间上、在发生这一突变的个体上、在发生突变的基因上,都

egfr基因突变阳性

说明EGFR基因的第19外显子有缺失。这通常意味着这是导致癌症的原因,可以适用于EGFR-TKI类靶向药治疗(如吉非替尼、厄洛替尼等)。

基因突变的概念

基因组DNA分子发生的突然的、可遗传的变异现象(gene mutation)。从分子水平上看,基因突变是指基因在结构上发生碱基对组成或排列顺序的改变。基因虽然十分稳定,能在细胞分裂时精确地复制自己,但这种稳定性是相对的。在一定的条件下基因也可以从原来的存在形式突然改变成另一种新的存在形式,就是在一个

基因突变的种类

基因突变可以是自发的也可以是诱发的。自发产生的基因突变型和诱发产生的基因突变型之间没有本质上的不同,基因突变诱变剂的作用也只是提高了基因的突变率。按照表型效应,突变型可以区分为形态突变型、生化突变型以及致死突变型等。这样的区分并不涉及突变的本质,而且也不严格。因为形态的突变和致死的突变必然有它们的生

基因定点突变step-by-step

本文先讲最简单的一个点的定点突变技术,其它较长片段的突变,删除,插入技术以后会慢慢奉上: 在做实验之前,我们首先要搞清楚实验的目的和实验的原理。 实验的目的应该比较明确吧:就是要把自己的基因上面的一个碱基换成另外一个碱基。一般情况下我们会有几种可能使我们需要这样去做: 第一 我们吊出来的基因有点突变

基因突变检测方法

基因突变检测方法:1.PCR-SSCP法是在非这性聚丙烯酰胺凝胶上,短的单链DNA和RNA分子依其大街基序列不同而形成不同构象,一个碱基的改变将影响其构象而导致其在凝胶上的移动速度改变。其基本原理为单链DNA在中性条件下会形成二级结构,这种二级结构依赖于其碱基组成,即使一个碱基的不同,也会形成不同的

知识分享:基因定点突变

  实验原理   基因定点突变是指通过聚合酶链式反应(PCR)等方法改变目的基因的序列,包括碱基的插入、缺失、点突变等。基因定点突变是基因研究中比较常用的方法,可以短时间内研究目的DNA所表达的目的蛋白的性状及表征。   定点突变需要设计特定的突变引物。引物长度一般为25-45 bp,建议选择3

基因突变概述(二)

  (二)移码突变  移码突变(frame-shift mutation)是指DNA链上插入或丢失1个、2个甚至多个碱基(但不是三联体密码子及其倍数),在读码时,由于原来的密码子移位,导致在插入或丢失碱基部位以后的编码都发生了相应改变。移码突变造成的肽链延长或缩短,取决于移码终止密码子推后或提前

基因突变碱基变化

  基因突变可分为碱基置换突变和移码突变两大类。  碱基置换突变——也称为点突变,指DNA分子中一个碱基对被另一个不同的碱基对取代所引起的突变。点突变分转换和颠换两种形式。如果一种嘌呤被另一种嘌呤取代或一种嘧啶被另一种嘧啶取代则称为转换嘌呤取代嘧啶或嘧啶取代嘌呤的突变则称为颠换(transversi

基因突变概述(一)

   1.突变 突变(mutation)是指遗传物质发生的可遗传的变异。广义的突变可以分两类:①染色体畸变(chromosome aberration),即染色体数目和结构的改变;②基因突变(gene mutation)。狭义的突变,即一般所指的突变仅指基因突变。基因突变是指基因的核苷酸