清华大学Nature子刊:利用Cas9实现基因克隆
来自清华大学、中科院微生物研究所的研究人员报告称,他们开发出了一种新技术,通过Cas9辅助靶向染色体片段(CATCH),可一步靶向克隆出大基因簇。这一重要的研究成果发布在9月1日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。 清华大学的朱听(Ting Zhu)研究员、特拉维夫大学的Yuval Ebenstein,以及中科院微生物研究所的娄春波(Chunbo Lou)研究员是这篇论文的共同通讯作者。 在工程改造生物体以生成高附加价值的生物分子,诸如药物制剂和生物燃料的相关研究工作中,克隆大基因簇的长基因组片段是其中一个重要的步骤。传统基于PCR的克隆方法往往受到序列长度和DNA模板GC含量的限制:标准PCR反应常规可生成长度为10kb的片段,而获得更长的PCR产物则需要繁琐地去优化反应条件,即便在理想的条件下通常也限制在35 kb。或者,可以通过组装多个短片段,如重叠PCR产物或化学合成的DNA......阅读全文
比较原核生物和真核生物基因组的结构特征
异:1、原核生物基因组很小,一般只有一条染色体;而真核生物基因组结构庞大。2、原核dna分子的绝大部分是用来编码蛋白质的,只有非常小的一部分不转录,这与真核dna的冗余现象不同。3、原核生物dna序列中功能相关的rna和蛋白质基因,往往丛集在基因组的一个或几个特定部位,形成功能单位或转录单位,它们可
《基因组生物学》:一种超级细菌的基因组测序完成
最近,英国桑格研究所(Wellcome Trust Sanger Institute)和布里斯托尔大学的研究者们共同完成了一种名为Steno的超级细菌的基因测序工作,研究结果显示,这是一种具有显著抗药性的生物体。对这种细菌基因组的了解将有助于研究者们发现如何应对这种具有独特抗药性的生物体。这一研究论
生物学术语基因组当量的概念
基因组当量是基因组文库容量的度量单位。基因组文库容量的度量单位,指文库中所有载体的插入片段总长度相当于基因组的总长度。
基因组重编码生物体“赭石”诞生
美国耶鲁大学合成生物学家创建了一种新型基因组重新编码生物体(GRO),并命名为“赭石”(Ochre),实现了对生物体遗传密码的重写。这一成果发表在最新一期《自然》杂志上,不仅促进了人类对遗传密码可塑性的理解,也为未来合成生物学的应用提供了更多可能。在这项研究中,科学家成功将DNA或RNA中的冗余密码
迄今最久微生物基因组草图出炉
英国《自然》杂志日前在线发表的一项演化学研究报告,近乎完整地构建出了一种口腔细菌的基因组,这个有48000年历史的微生物的基因组,是迄今为止历史最悠久的微生物基因组草图,研究同时揭示了尼安德特人的饮食结构。 尼安德特人的DNA序列和现代人类的DNA序列非常相似。他们是现代欧洲人祖先的近亲,从1
人类生物基因组DNA可以分为哪几类?
1、蛋白编码序列。以三联体密码方式进行编码。编码DNA在基因组中所占比例随生物而异,在人类细胞基因组中,这一比例只有1.5%左右。这类编码序列主要是非重复的单一DNA序列,一般在基因组中只有一个拷贝(单一基因),然而,也有可能有两个或几个拷贝甚至多达上千个拷贝的情况,这些都来自于从基因家族里派生出来
天津生物芯片参与绘制海参基因组
海参属于棘皮动物,是其中体型与形态最为特殊的种类,且处于从无脊椎向脊椎动物分化的独特进化地位,也是国内外重要的海产经济物种,具有极高的营养与医用价值。 10月12号,国际学术期刊PLoS Biology在线刊发了天津生物芯片参与的海参全基因组精细参考图谱项目文章-“The sea cucumb
生物学术语基因组扫描的概念
中文名称基因组扫描英文名称genome scanning定 义从全基因组的遗传标记中寻找与特定性状或基因紧密连锁的标记,并在染色体上定位相关基因的方法。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
离心力下的微生物,生长会受限制吗
会有影响的,你想下如果没有影响 那太空的生物实验不就是没意义了。其实容器中的营养物质会因为离心力的作用而分成不同的区域,营养物质的不同分布是会影响微生物的生长的。
贫穷不仅限制了想象力-还会影响肠道微生物?
贫穷会限制人们获得健康食品,健康环境和“无压力”生活的可能,从而增加了他们患多种疾病的风险。此外,俄勒冈大学的Suzanne Ishaq及其同事在11月26日发表在开放获取期刊《PLOS Biology》上的一篇新文章中指出,贫困还会通过降低有益微生物的稳态平衡而损害健康。 生活在低收入社区的
欧盟计划在运输行业限制使用粮食为基础生物燃料
国际能源网讯:据希腊媒体9月17日布鲁塞尔报道,欧洲联盟的执行机构欧洲委员会周一在布鲁塞尔表示,欧盟计划把来自用粮食作物制造的生物燃料在运输燃料中所占的比例限制在5%,欧盟计划对其生物燃料政策作根本的修改。 欧盟气候变化专员康妮・赫泽高和欧盟能源专员贡特尔・厄廷格周一表示,他们希望把运输领
衰老研究得出新结论:限制热量可减缓生物“时钟”运转
英国《自然·通讯》杂志9月17日发表的一篇小鼠和灵长类研究论文提出,热量限制能放缓“表观遗传时钟”。此前,科学家对蠕虫、小鼠和灵长类动物等进行研究后均得出结论:热量限制可延长寿命,而新研究将寿命与“表观遗传时钟”关联,并显示该“时钟”是研究衰老的重要生物标记。 如果说,我们的基因组是体内所有基
中美倡议启动“地球生物基因组计划”-对所有真核生物测序
在美国斯密森尼生物多样性基因组学项目组与中国华大基因公司近日联合主办的生物基因组学会议(BioGenomics2017)闭幕论坛上,加州大学戴维斯分校基因组学家哈瑞斯·莱文等人和华大基因生物学家张国捷等组成的科研团队联合倡议,全球科学家合作开启另一项与人类基因组计划(HGP)类似的项目——地球生
氧气限制假说
氧气限制假说氧气限制(CO2限制一 自养生物)假说(oxygen or carbon dioxide restriction)认为增加温度会减少水中溶解氧的数量,同时也增加了呼吸活动因而需要更多的氧气。
限制点的概念
限制点(restriction point)或者称为启动点(initiating point)是G0期进入G1早期的一个检查点,也是是哺乳动物细胞周期G1晚期控制进入S期的调节点,相当于酵母的START点。主要是通过体外细胞培养实验发现的。
基因组测序揭示多细胞生物进化之谜
最近,研究人员通过对各种绿藻进行基因组测序,已经接近于解开了“引起多细胞生物的遗传变化”的谜团。 从单细胞生物到多细胞生物的过渡,是地球上生命进化的关键进步;在不同的系统发育谱系中,这种改变已经独立地发生了多次。了解“有多少基因以及有哪些基因,对单细胞祖先成为多细胞来说是必要的”,是一个有趣的
推进后基因组时代物理生物学探索
5月7日~8日,科学与技术前沿论坛在中科院学术会堂召开,此次论坛的主题为“后基因组时代的物理生物学”。欧阳钟灿、郝柏林、陈润生、欧阳颀等多名来自全国各大高校和科研院所的院士和学者出席了此次论坛,并发表了主题演讲。 本次论坛召集人中科院院士杨玉良表示,上世纪末以来,生命科学获得了飞速发展,积累了
真核生物基因组的结构特点有哪些
1、真核生物基因组DNA与蛋白质结合形成染色体,储存在细胞核中。除了配子外,体细胞中的基因基因组是二倍体,即有两个同源的基因组。2、真核细胞基因的转录产物为单顺反式。结构基因被转录并翻译成mRNA分子和多肽链。3、有重复,重复次数可以超过一百万次。4、在基因组中,非编码区多于编码区。5、大多数基因含
于军:从基因组生物学到精准医学
今年是“人类基因组计划”宣布完成10周年。选择2003年结束这个计划是为了纪念美国沃森和英国克里克两位生物学家发现DNA双螺旋结构50周年,而沃森博士正是这个宏大计划早期的实际推动者之一。 科学界往往以重要人物和他们的重要科学发现及技术发明为里程碑。基因组学应属于分子生物学范畴,其学科的真
宏基因组如何指导微生物分离培养
近日,中国农业科学院北京畜牧兽医研究所奶产品质量与风险评估科技创新团队受邀撰写综述文章,阐述了宏基因组指导未培养微生物分离培养的机遇与挑战,系统总结了基于宏基因组分离培养未培养微生物的方法。相关综述文章发表在《微生物》(Microbiome)。 随着宏基因组测序技
北京基因组所召开生物计算研讨会
10月27日下午,中国科学院北京基因组所组织召开了“北京基因组研究所计算生物学研讨会”,会议由所长吴仲义主持,书记杨卫平、副所长李俊雄、基因组所生物信息研究人员以及科技处相关人员参加了会议。 研讨会上,与会学者就目前计算生物学领域中涉及如何运用大规模高效的理论模型和数
单分子测序改善微生物基因组组装
美国国家生物防卫分析和反制中心的研究人员近日在《Genome Biology》上发表文章,介绍了SMRT技术在微生物基因组组装上的应用。他们认为,单分子测序数据能降低测序费用,并带来更多完整的基因组,改善微生物基因组数据库的质量。 随着测序费用的不断下降,测序项目的数量也在不断上升。G
美国农业部加入地球生物基因组计划
美国农业部(USDA)近日宣布,将正式加入“地球生物基因组计划”(EBP)的合作研究。USDA认为通过加入这个生物学领域的“登月计划”,必将给未来农业发展带来数百万个强大的、全新的应对挑战解决方案。 EBP是一项国际合作倡议,将在未来10年内对超过150万种物种的DNA进行测序。2018年
美国农业部加入地球生物基因组计划
美国农业部(USDA)近日宣布,将正式加入“地球生物基因组计划”(EBP)的合作研究。USDA认为通过加入这个生物学领域的“登月计划”,必将给未来农业发展带来数百万个强大的、全新的应对挑战解决方案。 EBP是一项国际合作倡议,将在未来10年内对超过150万种物种的DNA进行测序。2018年4月
万种原生生物基因组计划启动
“万种原生生物基因组计划”30日在武汉启动。该计划由中国科学院水生生物研究所联合西藏大学、河南农业大学、中国农业科学院兰州兽医研究所、中国科学院北京基因组研究所和华中科技大学等单位共同发起,旨在绘制万种代表性原生生物基因组图谱,建立一个大规模的原生生物遗传资源数据库。 原生生物主要是由单细胞真
宏基因组如何指导微生物分离培养
近日,中国农业科学院北京畜牧兽医研究所奶产品质量与风险评估科技创新团队受邀撰写综述文章,阐述了宏基因组指导未培养微生物分离培养的机遇与挑战,系统总结了基于宏基因组分离培养未培养微生物的方法。相关综述文章发表在《微生物》(Microbiome)。 随着宏基因组测序技
研究指出基因组学引领生物育种变革
记者从近日举行的第五届国际农业基因组会议暨深圳国际食品谷研讨会上获悉,现代农业研究已迈入生物组学大数据时代,特别是基因组学及其衍生技术在生物育种中发挥着重要的引领作用。 基因组学是对生物体所有基因进行集体表征、定量研究及不同基因组比较研究的一门交叉生物学学科。基因组学主要研究基因组的结构、功能
于军:从基因组生物学到精准医学
今年是“人类基因组计划”宣布完成10周年。选择2003年结束这个计划是为了纪念美国沃森和英国克里克两位生物学家发现DNA双螺旋结构50周年,而沃森博士正是这个宏大计划早期的实际推动者之一。 科学界往往以重要人物和他们的重要科学发现及技术发明为里程碑。基因组学应属于分子生物学范畴,其学科的真
全基因组重测序的生物信息分析内容
1.数据量产出总碱基数量、Totally mapped reads、Uniquely mapped reads统计,测序深度分析。2.一致性序列组装与参考基因组序列(Reference genome sequence)的比对分析,利用贝叶斯统计模型检测出每个碱基位点的最大可能性基因型,并组装出该个体
黄连基因组公布,黄连生物碱生物合成机制被公开
2021年6月,湖北中医药大学刘义飞研究组联合中国中医科学院中药所陈士林团队、湖北省药品监督检验研究院汪波、聂晶团队、华中农业大学王学奎团队等单位合作在Nature Communications杂志在线发表了题为“Analysis of the Coptis chinensis genome r