实验的可重复性差都有哪些原因?
在上个月末的《Science》杂志上,美国弗吉尼亚大学的Brian Nosek作为通讯作者,发表了题为《Estimating the reproducibility of psychological science》的研究文章。文中,研究者们提到,尽管他们能够重复出最近的100项心理学研究的原始实验,但是其中仅有不到一半的重复实验结果与原研究结果一致。这项研究的作者还给出了为什么重复实验会与原始结果不同的原因分析。 该文章发表之后,英国牛津大学的发育神经心理学教授Dorothy Bishop给出了对该研究的评论。他首先首先提到,研究者需要知道有些因素会导致“文章灌水”,以至于实验不可重复。一般的“文章灌水”有三种原因,一种是有倾向性地发表支持猜想的数据,然后是只发表有显著统计学意义的数据,最后是研究样本数量不够。这篇发表在《Science》上的研究,还给出了其他原因,即实验样品的差异、实验设定的差异以及实验完成的质量差异等......阅读全文
重复基因的概念
重复基因指染色体上存在多数拷贝基因,重复基因往往是生命活动最基本,最重要的功能相关的基因。
基因重复的概念
基因重复(英语:Geneduplication)是指含有基因的DNA片段发生重复,可能因同源重组作用出错而发生,或是因为反转录转座(retrotransposition)与整个染色体发生重复所导致。这些基因的复制品通常可幸免于选择压力,也就是说,这类突变在生物体中一般无负面的影响。也因此突变的速度高
如何诊断重复肾?
1.如无异位开口及并发症,常无症状,不易发现。 2.如女性患者有正常排尿,兼有尿失禁,应考虑输尿管异位开口而作进一步检查。 3.膀胱镜检查在完全型者常可看到患侧多一个输尿管口,位于外上方的常是低位肾盂来的输尿管。 4.静脉尿路造影,如重复肾有功能,造影时可显示两个肾盂肾盏;如无功能,则仅显
重复基因的分类
重复基因经常被分为两种类型:(1):中等重复DNA序列(moderately repetitive DNA)。由相对较短的序列组成。在基因组中,其重复次数一般在10~1000次。这些序列遍布整个基因组,并负责mRNA前体剪接时二级结构的形成(这是内含子中的反向重复序列配对形成双链体区域)。(2):高
山西将优化重组省重点实验室-杜绝重复建设
8月10日,记者从山西省科技厅获悉,山西省将通过充实提升、调整优化、整合强化、撤销、新建等方式,优化重组山西省重点实验室。按照进度安排,首先在能源领域省重点实验室开展优化重组工作。 经过多年建设发展,山西省重点实验室已经成为山西省推动原始创新、引领学科发展、解决经济社会需求的战略科技力量,但也
科学家关注心理学实验可重复性
Brian Nosek 目前,人类基因组技术、火星车和大脑创新计划等大型研究合作正变得越来越常见,但是这种大型合作在心理学上并不常见。大部分心理学实验是由单一实验室进行的,通常只有数个研究人员参与。不过,涉及全世界数十个心理学实验室的几个合作项目最近已经形成。它们的目标是测试心理科学的再现性。
韩春雨就“重复实验失败”答科技日报记者问
10月8日,在河北科技大学那间实验室里再见到韩春雨时,虽然身处“论文造假”“多人重复实验失败”的争议旋涡,但他看起来十分平静,依然侃侃而谈,并不时反问记者:“你觉得我要是造假了,我还能这么淡定?”他说,有人在网上说,韩春雨现在怎么睡得着?“我告诉你,我睡得很好”。 当日下午,科技日报记者在石家
鲁晓:科学实验的可重复性原则及挑战
随着多学科和交叉新兴学科的快速发展,科学实验可重复性原则在科学实践中遇到一定的困难和挑战。特别是在生物医学、心理学等领域问题比较突出,引起了持续增长的关注。 2013年,癌症生物学领域重复性研究项目正式发起,目标在于重复2010~2012年间在《自然》《科学》《细胞》等期刊上发表的50篇癌症
电泳前蛋白煮沸-重复实验时还需要煮吗
电泳前蛋白煮沸,重复实验时当然需要煮电泳前蛋白煮沸是为了能让蛋白和上样缓冲液中的SDS更好的结合,已消除蛋白本身电荷的影响。重复实验要跑电泳,当然也需要在电泳前将蛋白煮沸。一般重复实验就是要重复各个实验步骤,以免最终结果出现差异
DNA重复元件维持神经元功能研究新进展
我们基因组的一半以上由DNA中的重复元件组成。在极少数情况下,这些重复序列会变得不稳定并发生扩增。这些重复元件的“扩增”会导致神经退行性疾病,例如ALS和痴呆症,以及脆弱X综合征和自闭症等的发生。 迄今为止,很多研究集中于这些扩增的重复序列如何引起疾病,但是很少关注重复序列本身以及它们在基因中
关于脱氧核糖核酸重复顺序的研究史介绍
脱氧核糖核酸重复顺序的研究史,美国学者R·J·布里顿于1968年提出突变复制假说,认为用进化的时间表来衡量,某种DNA顺序的倍增是一种突发的事件,重复顺序传给后代,并可能通过自然选择在种群中扩散。美国学者G·P·史密斯在1973年提出交换固定假说,它的基本前提是在姊妹染色单体间的不对等交换。他通
研究揭示多态性重复基因的基因组演化机制
近百年来,进化遗传学工作致力于探索重复基因的起源机制和功能演化过程。经典观点认为,基因重复后产生两个完全等同的拷贝,其中一个冗余拷贝在自然选择作用下获得新功能。也有观点认为,剂量效应和不完整基因重复等因素使重复基因并非是等同的冗余拷贝。剂量敏感基因(满足剂量平衡效应的蛋白复合体成员基因或X染色体
Science:新研究揭示短串联重复序列如何影响基因表达
几十年来,科学家们已经知道,“垃圾 DNA(junk DNA)”实际上起着至关重要的作用:尽管基因组中的蛋白编码基因提供了构建蛋白的蓝图,但是基因组中的一些非编码部分,包括以前被认为是 “垃圾DNA”的基因组区域,似乎可以提高或降低这些基因的表达。但人们一直不清楚某些非编码区域如何影响基因表达水
Nature:抗体标准化生产方法被开发-解决实验重复性
近日,发表于国际杂志Nature上的一项研究报告中,来自新墨西哥州洛萨拉摩斯国家实验所(Los Alamos National Laboratory)的研究者开发出了一种制造抗体的标准化方法;研究者表示,当前并没有标准的质量控制和标准方法来生产抗体,这就使得很多实验在重复性上会出现很多问题,有些
韩春雨回应“13位学者实名宣布无法重复他的NgAgo实验”
11日,河北科技大学副教授韩春雨接受科技日报记者采访,回应13位学者实名宣布无法重复他的NgAgo实验。他依然认为,别人重复不了,细胞污染的可能性最大。 韩春雨此前曾表示,有人成功重复了他的实验。至于到底是谁重复成功,他仍说暂不方便透露。“请求大家再有一点耐心。我还是之前的说法,很快将会有新的
硝酸银摩尔质量实验数据重复性差的改进措施
针对硝酸银摩尔质量实验数据重复性差的一些具体改进措施:优化实验流程:制定详细且标准化的实验操作手册,明确每个步骤的具体操作方法和注意事项。对实验人员进行充分的培训和预实验,让其熟悉整个流程。仪器选择与校准:选用精度高、稳定性好的温度计、天平、容量瓶等仪器。按照规定的周期对仪器进行校准和维护,实验前再
怼声再起!韩春雨向《自然》提交实验可重复性数据
韩春雨无疑是2016年最受公众关注的中国研究者之一。从在《自然-生物技术》杂志论文发表的一鸣惊人,到被质疑学术造假的声讨笔伐,他所经历的舆论如过山车一样跌宕起伏。 近日,《自然-生物技术》发表关于“利用NgAgo进行DNA引导的基因组编辑”论文的最新声明。声明中称期刊已经获得了与NgAgo系统
报告称美国每年有280亿美元生物医学研究不可重复
6月9号发表在《PLoS生物学》上的一篇论文称,美国科学家每年在不能重复的基础生物医学研究上花费280亿美元。 斯坦福大学流行病学家John Ioannidis称,该项研究推动了不可重复性研究问题的进一步讨论,但这个结论带有不确定性。论文第一作者,非营利性组织全球生物标准协会会长 Len F
研究发现简单重复序列对虾适应性进化的关键作用
3月9日,记者从中国科学院海洋研究所获悉,由该所李富花课题组主导完成的科研论文《简单重复序列促进对虾基因组可塑性和适应性进化》在Nature子刊《通讯-生物学》(《Communications Biology》)在线发表。该研究成果为阐明生物体内SSR的功能和甲壳动物对环境的适应进化研究提供了新
要减少研究不可重复性,就必须解决学术欺诈的诱惑
Donald S. Kornfeld和Sandra L. Titus认为,减少研究中的不可重复性的努力必须同时解决欺骗的诱惑。 科学史表明,不可重复性并非当代的产物。大约350年前,化学家 Robert Boyle 就写过一篇关于“实验不成功性”的文章,警告读者不可尽信研究报告。“你可能会碰到
研究揭示苔藓植物古多倍化历史及重复基因保留特征
藓类植物,作为陆地植物早期演化中的重要分支,在陆地植物的演化谱系中占有重要位置,但是学界对该类群本身演化历史的研究有限.此前,科学家研究对植物基因组发现,古多倍化事件广泛存在于种子植物和蕨类植物类群中,且此类事件多伴随植物类群的迅速扩张和对古气候剧烈变化的适应.然而,在过去四亿多年的演化历史中,
细胞化学词汇重复DNA
中文名称:重复DNA英文名称:repetitive DNA定 义:真核生物染色体基因组中含有不同拷贝数的核苷酸序列。这些序列一般不编码多肽,在基因组内可成簇排布,也可散布于基因组。按序列的重复程度和特点可分为低度重复DNA、中度重复DNA和高度重复DNA。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科)
细胞化学词汇基因重复
中文名称:基因重复外文名称:Geneduplication意 义:含有基因的DNA片段发生重复原 因:因同源重组作用
什么是重复子?
中文名称重复子英文名称duplicon定 义发生重复性畸变的染色体所具有的最小重复单位。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
中度重复DNA的定义
中文名称中度重复DNA英文名称middle repetitive DNA;moderately repetitive DNA定 义在真核细胞中存在的,以含有大量拷贝的不同核苷酸序列为特征的重复DNA的一种,其重复度为10个至几千个,通常占整个单倍体基因组的1%~30%。如核糖体核糖核酸(rRNA)
关于基因重复的简介
基因重复在演化过程中扮演重要角色,近百年中受到科学界中许多成员的支持。大野干在1970年的著作《基因重复造成的演化》(Evolutionbygeneduplication)中发展了这个理论。此外科学家认为,酵母菌的整个基因组,在1亿年前经历了重复作用。植物体内也常见基因组的完整重复现象,例如小麦
串联重复[序列]的定义
中文名称串联重复[序列]英文名称tandem repeat定 义首尾相连的重复序列。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)
小肠重复畸形的诊断
患儿多因肠梗阻、消化道出血或腹膜炎来就诊。患儿反复腹痛、便血、腹部包块或原因不明的肠梗阻考虑肠道重复畸形。钡餐检查或钡剂灌肠可显示肠腔有钡剂充盈缺损,或肠壁有受压切迹。有时钡剂进入异常囊腔,显示其形状、部位和范围,正常肠管受压移位。B超也能判断重复畸形的部位、大小和性质,了解囊肿内有无分泌物充盈
简单重复序列的概念
简单重复序列(Simple Sequence Repeat,简称SSR),是指重复单位长度和碱基组成基本一致,只 有少数基因出现微小的差异的一类短串联重复序列。
顶级癌症论文能否重复?
2013年10月,Richard Young收到了一封措辞礼貌,但态度强硬的邮件。寄信人是“调查癌症生物学领域近期一些论文可重复性的研究者团队”中的一员。Young是麻省理工学院(Massachusetts Institute of Technology)的生物学家,他于2012年在《细胞》(C